|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Get sequence file Get alignment file Get formatted file made by BOXSHADE Sequence file prepared (1 sec required). Alignment has started. CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475) AT4G36990.1 MT--------------A------VTAAQRSVPAPFLSKTYQLVDDHSTDDVVSWNEEGTA gm029942_Glyma1 ------------------------MLQQRSVPAPFLTKTYQLVEDPGTDEVISWGESGNT gm024883_Glyma0 MA-KLPVEYNGDCATTASASASAAAESQRSIPTPFLTKTFQLVDDQSIDDVISWNDDGST gm047388_Glyma1 -----------------------MSQQQRSTPAPFLTKTYLLVDDPATDDVVSWSEGGNT gm001890_Glyma0 -------------------------MSQRSVPAPFLTKTYQLVEDQGTDQVISWGESGNT gm029606_Glyma1 MA-PLPAEQTG-------ESAP--TELQRSIPTPFLTKTYQLVDDPSADDLISWNEDGTS gm029607_Glyma1 MA-PLPAEQTG-------ESAP--TELQRSIPTPFLTKTYQLVDDPSADDLISWNEDGTS gm054819_Glyma2 MA--PPLEHNG-------VSTS--GDSQRSIPTPFLTKTYQLVDDHTIDDVISWNDSGSS gm045241_Glyma1 MAPPPPVEHNGDSAATASASAS--AESQRSIPTPFLTKTYQLVDDQSIDDVISWNDDGST *** *:***:**: **:* *:::**.: *.: AT4G36990.1 FVVWKTAEFAKDLLPQYFKHNNFSSFIRQLNTYGFRKTVPDKWEFANDYFRRGGEDLLTD gm029942_Glyma1 FVVWKHADFAKDLLPKYFKHNNFSSFVRQLNTYGFRKIVPDKWEFANEHFKRGQKELLSE gm024883_Glyma0 FIVWNPTVFARDLLPKYFKHNNFSSFVRQLNTYGFRKVVPDRWEFSNEYFRRGEKRLLCE gm047388_Glyma1 FVVWKHADFAKDLLPKYFKHNNFSSFVRQLNTYGFRKTVPDKWEFANEYFKRGQTDLLAE gm001890_Glyma0 FVVWKHADFAKDLLPKYFKHNNFSSFVRQLNTYGFRKIVPDKWEFANEHFKRGQKELLSE gm029606_Glyma1 FIVWRPAEFARDLLPKYFKHNNFSSFVRQLNTYGFRKVVPDRWEFANDCFRRGERALLRD gm029607_Glyma1 FIVWRPAEFARDLLPKYFKHNNFSSFVRQLNTYGFRKVVPDRWEFANDCFRRGERALLRD gm054819_Glyma2 FIVWNTTAFAKDLLPKYFKHNNFSSFVRQLNTYGFRKVVPDRWEFSNEYFRRGEKRLLCE gm045241_Glyma1 FIVWNPTVFARDLLPKFFKHNNFSSFVRQLNTYGFRKVVPDRWEFSNDYFRRGEKRLLCE *:**. : **:****::*********:********** ***:***:*: *:** ** : AT4G36990.1 IRRRKSVI-----ASTAGKCVVVGSP----------------------SESNSGGGDDHG gm029942_Glyma1 IKRRKTVPQSSTHSPDAGKPGAEGN-----------------------SPSNPGGCDDAG gm024883_Glyma0 IQRRKISSPA---SSPT-APA-------TVSVTAPMPLTAI----PIISPSNSG--EEQV gm047388_Glyma1 IRRRKVV------SPVTGKSTGGGVN---------------------ISASHSGG-DDMG gm001890_Glyma0 IKRRKTVPQSSAHPPEAGKSGGDGN-----------------------SPLNSGS-DDAG gm029606_Glyma1 IQRRKLL-PV---PPAAAAPAAVTANTVTVAVAAP----AV----RTVSPTTSG--DEQV gm029607_Glyma1 IQRRKLL-PV---PPAAAAPAAVTANTVTVAVAAP----AV----RTVSPTTSG--DEQV gm054819_Glyma2 IQRRKILSAS---PPPAGATA-------TVAVPSPLPLSAIPTAKPIVSPSNSA--EEQV gm045241_Glyma1 IQRRKISSPA---PSPT-APT-------TVTV--PMPLTAI----PIISPSNSG--EEQV *:*** .. : * .. :: AT4G36990.1 SSSTSSPGS-SKNPGSVENMV---A---DLSGENEKLKRENNNLSSELAAAKKQRDELVT gm029942_Glyma1 STSTSSSSSGSKNQGSVETNT---TPSHQLSSENEKLKKDNETLSCELARARKQCDELVA gm024883_Glyma0 TSSNSS--------------------PAELLDENERLRKENVQLTKELAEMRSLCNNIYS gm047388_Glyma1 STST----------GSMEAAT---AAGADISGENEKLKKDNEKLSGELALAKKQCEELVA gm001890_Glyma0 STSTSSSSSGSKNQGSVETNT---TPSHQLSSENEKLKKDNETLSCELARARKQCDELVA gm029606_Glyma1 LSSNSSPIAGNNNNNTVHRTTSCTTAP-ELLEENERLRKENIQLSNELSQLKGLCNNILS gm029607_Glyma1 LSSNSSPIAGNNNNNTVHRTTSCTTAP-ELLEENERLRKENIQLSNELSQLKGLCNNILS gm054819_Glyma2 LSSNSSPA----------------RAPVELLDENERLRKENILLTKELVKMRSLCNNIFN gm045241_Glyma1 ISSNSSPL----------------RAPAELLDENERLRKENVQLTKELAEMRSLCNNIYS :*. :: ***:*:::* *: ** : ::: AT4G36990.1 FLTGHLKVRPEQIDKMIKGGKFKP--------------------------------VE-- gm029942_Glyma1 FLRDRLMVGPDQIDRIMRQGSCGS------------------------------------ gm024883_Glyma0 LMSNYANA----------NGKGNS--NGSYKT----KGGAG--------------LLDLM gm047388_Glyma1 FLRDSLNVSPDVIERIIRQGTCVSSNNDAVRF----DAIINN-------------DLD-- gm001890_Glyma0 FLRDRLMVGPDQIDRIMRQGSCGS------------------------------------ gm029606_Glyma1 LMTNYASGFS-------RQQLESS--TSAVRTVPVPDGKA---------------PLELL gm029607_Glyma1 LMTNYASGFS-------RQQLESS--TSAVRTVPVPDGKA---------------PLELL gm054819_Glyma2 LMSNYANA----------QADGSS--AAA------------------------------- gm045241_Glyma1 LMSSYGNK----------N--GNS--NGSYQT----DGGAGGAQGSRESGMTAVKPLDLM :: . . AT4G36990.1 -----SDEE---S--ECEGCD---GGGGAEEGVGEG-----LKLFGVWLKGER------- gm029942_Glyma1 -------EN---AVGE--------GGGG-----GHC-----LKLFGVWLKGDTLTDKRNN gm024883_Glyma0 PVMRSSDED------------------AAEMAPEEM----NPKLFGVAIG---------- gm047388_Glyma1 -----DDEN---AVGECEPQQPPPKGDN-----GES-----LKLFGVWLKGQ--NGKENS gm001890_Glyma0 -------EN---VVGE---------GGG-----GDC-----LKLFGVWLKGDTLTDKRNN gm029606_Glyma1 PAKHVSSADDALHVGGAAGAAACATGNAAEA---EV-----PKLFGVSIG---------- gm029607_Glyma1 PAKHVSSADDALHVGGAAGAAACATGNAAEA---EV-----PKLFGVSIG---------- gm054819_Glyma2 -AKRCSGED------------------AVE----EM----NPKLFGVAIG---------- gm045241_Glyma1 PVKRSSGED------------------AADTVPKEINLIPNPKLFGVAIG---------- : . ***** : AT4G36990.1 ----KKRDRDEK-NYVVSGS----------RMTEIKN-VDFHAP---------------- gm029942_Glyma1 ----HKRGREDQMGF--GGP----------RLKESKPVVDFSRNR--------------- gm024883_Glyma0 ----AKRAREGG-----GGG----DC---GGGGEEDTLLRLHHAGSADVKSEPLDFQNHR gm047388_Glyma1 IGKCRKRGRQDY-------PIA-------ATAKELKTLV--------------------- gm001890_Glyma0 ----HKRGREDQMGF--GGP----------RLKESKPVVDFGAVN--------------- gm029606_Glyma1 ----LKRCRTEC-----EAEPEGEDQNQMQTRAQTQSQSSQEPDHGSDVKSEPLDGDDSD gm029607_Glyma1 ----LKRCRTEC-----EAEPEGEDQNQMQTRAQTQSQSSQEPDHGSDVKSEPLDGDDSD gm054819_Glyma2 ----KKRAREEE-----------------GHGAKYDTALSLHQPFHADVKSEALDLPGRG gm045241_Glyma1 ----AKRAREGG-----GGSGSGRDCGGGGGGGEEDTLLRLHHVGSADVKSEPLDCQNHR ** * : . AT4G36990.1 --------LWK----SSKVCN gm029942_Glyma1 -------MMMI----NEKGKG gm024883_Glyma0 ENQKTP-WLSPCYRTNQRVCN gm047388_Glyma1 --------------------- gm001890_Glyma0 -------IMMK----SNRVCN gm029606_Glyma1 YQDHDPHWLEL---------- gm029607_Glyma1 YQDHDPHWLEL---------- gm054819_Glyma2 ENKKTP-WLNQCHRANQRVCN gm045241_Glyma1 ENQETP-WLSPCHRTNQRVCN
|