|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Get sequence file Get alignment file Get formatted file made by BOXSHADE Sequence file prepared (0 sec required). Alignment has started. CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475) AT4G38960.1 MRILCDACENAAAIIFCAADEAALCRPCDEKVHMCNKLASRHVRVGLAEPSNAPCCDICE gm032644_Glyma1 MRTLCDVCESAAAIVFCAADEAALCSACDHKIHMCNKLASRHVRVGLADPTDVPRCDICE gm030569_Glyma1 MRTLCDVCESAAAILFCAADEAALCSACDHKIHMCNKLASRHVRVGLADPTDVPRCDICE Sm003937_Selmo1 MRTLCDVCESAPARLFCAADEAALCSKCDEKVHGCNKLASRHVRLQLAEARAVPRCDICE gm030138_Glyma1 MRTLCDACESAAAIVFCAADEAALCRACDEKVHMCNKLASRHVRVGLASPSDVPRCDICE gm030140_Glyma1 MRTLCDACESAAAIVFCAADEAALCRACDEKVHMCNKLASRHVRVGLASPSDVPRCDICE pt022229_POPTR_ MRTICDVCESAAAILFCAADEAALCRSCDEKVHLCNKLASRHVRVGLADPSAVPQCDICE pp004666_Pp1s20 MRTLCDVCEAAPARLFCAADEAALCLKCDEKVHSCNKLANRHVRLELAESRAVPRCDICE Os034540_Os09t0 MRTICDVCESAPAVLFCVADEAALCRSCDEKVHMCNKLARRHVRVGLADPNKVQRCDICE Sb006271_Sorbi1 MRTICDVCESAPAVLFCAADEAALCRSCDEKVHMCNKLASRHVRVGLADPNKLARCDICE pp035016_Pp1s31 MRTLCDVCEAAPARLFCAADEAALCLKCDEKVHSCNKLAYRHVRLELAESRPVPRCDICE gm030137_Glyma1 MRTLCDACESAAAIVFCAADEAALCRACDEKVHMCNKLASRHVRVGLASPSDVPRCDICE gm030139_Glyma1 MRTLCDACESAAAIVFCAADEAALCRACDEKVHMCNKLASRHVRVGLASPSDVPRCDICE pt000227_POPTR_ MRTLCDACESAFAIVFCAADEAALCLACDKKVHMCNKLASRHVRVGLANPSEVPRCDICE pt018983_POPTR_ MRMLCDVCESAAAILFCAADEAALCRSCDEKVHMCNKLASRHVRVGLADPSDVPQCDICE gm001706_Glyma0 MRTLCDACESAAAIVFCAADEAALCRACDEKVHMCNKLASRHVRVGLASPSDVPRCDICE pt037453_POPTR_ MRTLCDACESAAAIVFCAADEAALCLACDEKVHMCNKLASRHVRVGLANPSDVPRCDICE ** :**.** * * :**.******* **.*:* ***** ****: **.. ***** AT4G38960.1 NAPAFFYCEIDGSSLCLQCDMVVHVGGKRTHGRFLLLRQRIEFPGDKP------------ gm032644_Glyma1 NAPAFFYCEIDGSSLCLQCDMIVHVGGKRTHGRYLLLRQRVQFPY--------------- gm030569_Glyma1 NAPAFFYCEIDGSSLCLQCDMIVHVGGKRTHGRYLLLRQRAQFPGDKPAQMEE-----LE Sm003937_Selmo1 SAPAFFYCGIDGTSLCLQCDMDVHTGGKKTHERYLMLGQRVEVIT--------------- gm030138_Glyma1 NAPAFFYCETDGSSLCLQCDMIVHVGGKRTHGRYLLFRQRVEFPGDKSSHAEN-----PA gm030140_Glyma1 NAPAFFYCETDGSSLCLQCDMIVHVGGKRTHGRYLLFRQRVEFPGDKSSHAEN-----PA pt022229_POPTR_ NAPAFFYCEIDGSSLCLQCDMIVHVGGKRTHGRYLLLRQRVEFPGDKPGRMEE-----QG pp004666_Pp1s20 NAPAFFFCGVDGTSLCLQCDMDVHVGGKKAHERYLMMGQRVELPSRKLRFEDNVDTEKLP Os034540_Os09t0 NAPAFFYCEIDGTSLCLSCDMTVHVGGKRTHGRYLLLRQRVEFPGDKPGHMDD-----VA Sb006271_Sorbi1 NSPAFFYCEIDGTSLCLSCDMTVHVGGKRTHGRYLLLRQRVEFPGDKPGHMDDVPMETVP pp035016_Pp1s31 NAPAFFFCGVDGTSLCLQCDMDVHVGGKKAHERYLMMRQRVELPSRKLRFEDTVDTEKPT gm030137_Glyma1 NAPAFFYCETDGSSLCLQCDMIVHVGGKRTHGRYLLFRQRVEFPGDKSSHAEN-----PA gm030139_Glyma1 NAPAFFYCETDGSSLCLQCDMIVHVGGKRTHGRYLLFRQRVEFPGDKSSHAEN-----PA pt000227_POPTR_ NAPAFFYCETDGSSLCLQCDMTVHVGGKRTHGRYLLLRQKIEFPGNQ-PQPED-----PA pt018983_POPTR_ KAPAFFYCEIDGSSLCLQCDMIVHVGGKRTHGRYLLLRQRVEFPGDKPGCTEE-----QG gm001706_Glyma0 NAPAFFYCETDGSSLCLQCDMIVHVGGKRTHGRYLLFRQRVEFPGDKSSHAEN-----PA pt037453_POPTR_ NAPAFFYCETDGSSLCLQCDMTVHVGGKRTHGRYLLLRQRVEFPGDK-PQPDD-----LH .:****:* **:****.*** **.***::* *:*:: *: :. AT4G38960.1 ----KENNT-----------------RDNLQNQRV------S----TNGNGE-ANGK--- gm032644_Glyma1 ----------------------------SQQNHSV------SPVPRQENNID-GHGK--- gm030569_Glyma1 LQPMDQNESRRDESQ---S--LKLKTRDSQQNHSV------SPFPRQENNID-GHGK--- Sm003937_Selmo1 ------------------------------------------GLLASR------------ gm030138_Glyma1 SQALEPGEAKRGQNP---L--PKLKMGEKQQNHRM------PMVPTPGPDAD-GQTK--- gm030140_Glyma1 SQALEPGEAKRGQNP---L--PKLKMGEKQQNHRM------PMVPTPGPDAD-GQTK--- pt022229_POPTR_ QQPLDHNETRRDQNQ---P--LKLTARENKQNHRA------SPVPMVENNTD-SDGK--- pp004666_Pp1s20 AE---PSNAPTDKNG-VLPDHHHHHHYHHHHHHHHHEDEVRAGLPAPKQSCDRDASNAPA Os034540_Os09t0 MQQKDPENRTDQKKA---P---HSVTKEQMANHHNVSDD-----PASDGNCD-DQGN--- Sb006271_Sorbi1 METKDPENQRDQKKA---P-------KEQMANHHN-GDH-----PACDGNCD-DQGN--- pp035016_Pp1s31 AE---PNSVPADKNGTLLPDQHHHHHYHHHHHHHHHEDELRAGLPASKPSCDRDNSNAPA gm030137_Glyma1 SQALEPGEAKRGQNP---L--PKLKMGEKQQNHRM------PMVPTPGPDAD-GQTK--- gm030139_Glyma1 SQALEPGEAKRGQNP---L--PKLKMGEKQQNHRM------PMVPTPGPDAD-GQTK--- pt000227_POPTR_ PQPMYPGETRRGQNR---P--QKATSGENRQNRQA------SPVLMSVTNSD-GHDK--- pt018983_POPTR_ QQPLDDNETRRDQNQ---P--PKLTARENQQNHRA------SPVPMVENNTD-SDGK--- gm001706_Glyma0 SQPLEPGEAKRGQNP---L--PKLKMGEKQQNHKM------PMVPTPGPDAD-GHAK--- pt037453_POPTR_ SQPMHPGETRKGQNQ---P--PKATAEEKRQNRQV------SPAPMSLSNSD-GHDK--- AT4G38960.1 ------------ID-------DEMIDLNANPQRV-HEPSSNNNG--IDVNNENNHEPAGL gm032644_Glyma1 ------------MD-------KKLIDLNTRPLRL-NGAAPNNQERGMDILRGNNHKSASV gm030569_Glyma1 ------------MD-------KKLIDLNTRPLRL-NGSAPNNQEQCMDILRGNNHESASV Sm003937_Selmo1 ------------------------------------------------------------ gm030138_Glyma1 ------------ME-------TKMIDLNMKPNRI-HEQASNNQP---------------- gm030140_Glyma1 ------------ME-------TKMIDLNMKPNRI-HEQASNNQVRVHGK----------- pt022229_POPTR_ ------------MD-------NNLIDLNARPQRI-HGQNSTNQE---------NHESSSA pp004666_Pp1s20 IAITAGDEESLLIDGCIHQNQPRMIDLNSRPKRL-QSQAS-------------------- Os034540_Os09t0 ------------ID-------SKMIDLNMRPVRT-HGQGSNSQTQGVDVS-VNNHDSPGV Sb006271_Sorbi1 ------------ID-------SKMIDLNMRPVRT-HGQGSNSQTQGVDLS-VNNHDSPGV pp035016_Pp1s31 IAIAAGDEESLLLDDCLVQNQSRMIDLNSRPKRL-QNQAS-------------------- gm030137_Glyma1 ------------ME-------TKMIDLNMKPNRI-HEQASNNQCSWMKVE---------- gm030139_Glyma1 ------------ME-------TKMIDLNMKPNRI-HEQASNNQP---------------- pt000227_POPTR_ ------------VD-------KNMIDLNMKPHRI-HEHASNNQEQ--------------- pt018983_POPTR_ ------------MD-------NKLIDLNARPQRV-HGKNPTNQE---------NHESSSL gm001706_Glyma0 ------------ME-------SKMIDLNMKPNRI-HEQASNNQP---------------- pt037453_POPTR_ ------------VD-------KKMIDLNMKPQRTDHEQASNNQEL--------------- AT4G38960.1 VPVGPFKRESEK gm032644_Glyma1 PPVESFKQESEK gm030569_Glyma1 PPVESFKQESEK Sm003937_Selmo1 ------------ gm030138_Glyma1 ------------ gm030140_Glyma1 ------------ pt022229_POPTR_ VPVGSFKREPQK pp004666_Pp1s20 VPDKG------- Os034540_Os09t0 VPTCNFEREANK Sb006271_Sorbi1 VPTSNSERDASK pp035016_Pp1s31 VPDKG------- gm030137_Glyma1 ----PFP----- gm030139_Glyma1 ------------ pt000227_POPTR_ ------------ pt018983_POPTR_ APFGFFKGEPQK gm001706_Glyma0 ------------ pt037453_POPTR_ ------------
|