Input
| Putative repression domain
|
|
AT4G39250.1 |
not found |
|
Ortholog
| Putative repression domain
| Reverse top hit
| Relation
| Blast score ratio
| Type
|
Os022977 |
not found in 90aa |
AT1G75250.2 |
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III |
Os022978 |
not found in 111aa |
AT1G75250.1 |
not_not |
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III |
Os009479 |
not found in 101aa |
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not_not |
0.446236559 |
III |
Os002917 |
not found in 93aa |
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not_not |
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III |
Sb033118 |
not found in 238aa |
AT1G75250.1 |
not_not |
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III |
Sb019161 |
not found in 77aa |
AT1G75250.2 |
not_not |
0.462365591 |
III |
Sb010972 |
not found in 97aa |
AT1G75250.1 |
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III |
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VTLSQGLQLKLVMHRS in 207/476 |
AT5G08520.1 |
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0.440860215 |
III |
Gm004171 |
not found in 93aa |
AT2G21650.1 |
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0.612903225 |
III |
Gm039273 |
not found in 348aa |
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III |
Gm030637 |
not found in 91aa |
AT1G19510.1 |
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0.580645161 |
III |
Gm008749 |
not found in 91aa |
AT2G21650.1 |
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0.575268817 |
III |
Gm013941 |
not found in 142aa |
AT1G75250.2 |
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0.559139784 |
III |
Gm005042 |
not found in 105aa |
AT1G75250.1 |
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III |
Gm039193 |
not found in 68aa |
AT1G75250.1 |
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III |
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not found in 69aa |
AT1G19510.1 |
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0.494623655 |
III |
Gm008527 |
not found in 72aa |
AT1G75250.1 |
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0.483870967 |
III |
Gm053518 |
not found in 296aa |
AT5G08520.1 |
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0.478494623 |
III |
Gm013939 |
not found in 85aa |
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III |
Gm048593 |
not found in 88aa |
AT1G75250.1 |
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0.473118279 |
III |
Gm018677 |
not found in 296aa |
AT5G08520.1 |
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0.462365591 |
III |
Gm049330 |
not found in 296aa |
AT5G08520.1 |
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0.462365591 |
III |
Gm022828 |
not found in 296aa |
AT5G08520.1 |
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III |
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not found in 91aa |
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III |
Pt021017 |
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III |
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III |
Pt000040 |
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AT1G75250.1 |
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Pt019385 |
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Pt039887 |
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III |
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III |
Pt036887 |
not found in 296aa |
AT5G08520.1 |
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III |
Pt036886 |
not found in 296aa |
AT5G08520.1 |
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III |
Pt036885 |
not found in 296aa |
AT5G08520.1 |
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III |
Pt036657 |
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III |
Pp014545 |
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AT5G08520.1 |
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III |
Pp028020 |
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Pp028019 |
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AT5G08520.1 |
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III |
Get sequence file
Get alignment file
Get formatted file made by BOXSHADE
Sequence file prepared (1 sec required). Alignment has started.
CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)
AT4G39250.1 -----------------------------------------------MASSSMSSQ----
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pt036887_POPTR_ -----------------------------------------------MSVDEGGSG----
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pt039887_POPTR_ -----------------------------------------------MASG---------
pt021017_POPTR_ -----------------------------------------------MASSSMSSR----
gm048593_Glyma1 -----------------------------------------------MASNSLNNSNN--
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gm008749_Glyma0 -----------------------------------------------MAS----------
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pt036886_POPTR_ -----------------------------------------------MSVDEGGSG----
pp014545_Pp1s25 -----------------------------------------------MAESQSSLTT---
pt036888_POPTR_ -----------------------------------------------MSVDEGGSG----
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gm053518_Glyma2 -----------------------------------------------MTVDEVDSS----
Os009479_Os02t0 ------------------------------------------------------------
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gm039193_Glyma1 ------------------------------------------------------------
Os022978_Os05t0 -----------------------------------------------MASAAGSKQQQAM
gm008745_Glyma0 ------------------------------------------------------------
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gm004171_Glyma0 -----------------------------------------------MASSSMSA-----
gm008527_Glyma0 -----------------------------------------------MASSTLSKQK---
gm022828_Glyma0 -----------------------------------------------MTVDEVGSS----
AT4G39250.1 ------------SSGSWTAKQNKAFEQALATY------------------DQD-------
pp028020_Pp1s13 -------ASG----SVWTREQDKEFENALNTY------------------GED-------
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Sb033118_Sorbi1 HACCPINPIYTHVCIFWIIDRSSYYVHHLRRSSDVSACMSGGPVAGGAAVGREGHLAGLD
Sb030230_Sorbi1 -------GGGEEGCGAWTREQEKAFENAVATTM---------------GGEED-------
Os002917_Os01t0 -------SSASAASSEWTKQQNKQFERALAVY------------------DTD-------
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gm018677_Glyma0 --------------SEWSREQDKAFENALATH------------------LED-------
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pt019385_POPTR_ -----------NSSSSWTPRENKLFEKALALF------------------DKD-------
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pt036887_POPTR_ --------------SLWTREHDKAFENALATY------------------PED-------
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pt021017_POPTR_ ------------GSGSWTVQQNKAFERALAVY------------------DRD-------
gm048593_Glyma1 ----------KEHFPSWTRLQNKQFEKALVLY------------------DEH-------
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gm008749_Glyma0 -------------SQGWTPKQNKRFENALAIF------------------DKD-------
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pt036886_POPTR_ --------------SLWTREHDKAFENALATY------------------PED-------
pp014545_Pp1s25 -------ASG----SVWTREQDKEFENALNNF------------------DED-------
pt036888_POPTR_ --------------SLWTREHDKAFENALATY------------------PED-------
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gm008745_Glyma0 --------------MGWTREENRRFEDALAVH------------------GPN-------
pp028019_Pp1s13 -------ASG----SVWTREQDKEFENALNTY------------------GED-------
gm004171_Glyma0 -------------TGSWSAKDNKAFERALAVY------------------DKD-------
gm008527_Glyma0 -----------PYDSCWTPKQNKVFEKALAKY------------------DKD-------
gm022828_Glyma0 --------------SEWSKEQDKAFENALAIH------------------PED-------
. : : .
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pp028020_Pp1s13 -----------TPNRWEEIASQVTG-KDAAEVKR----HYEILQEDINLIDSGRIAL---
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Sb033118_Sorbi1 VADVLLQQVVVAPDVLGGLAAADGAGDVVPPVRRVLVVNGQRLLEQLVLLRR---PL---
Sb030230_Sorbi1 -----------GDARWEKLAEAVEG-KTPEEVRR----HYELLVEDVDGIESGRVPL---
Os002917_Os01t0 -----------APDRWHNVARYMGGAKSAEEVRR----HYERLQADVEQIEAGGVPFSLG
pt000040_POPTR_ -----------TPDRWQNVAKAVGG-KSAEEVKM----HYDRLVEDLTYIESGQAPL---
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Os022977_Os05t0 -----------TPDRWHNIARAVGGGKSAEDVKR----YYEMLEEDIKHIESGKVPF---
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pt036657_POPTR_ -----------SPDRWRNIASFVGE-TTEEEVKK----QYEILLDDIKRIESDQVPL---
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pp014545_Pp1s25 -----------TPNRWEQIAAVVTG-KDAAEVKR----HYEILQEDVNLIDSGRVAL---
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gm008745_Glyma0 -----------DPNRWQHVANAVGG-KSVQEVKM----HYEILQEDVIRIERDQIPL---
pp028019_Pp1s13 -----------TPNRWEEIASQVTG-KDAAEVKR----HYEILQEDINLIDSGRIAL---
gm004171_Glyma0 -----------TPDRWKDVARAVGG-KTPDEVKS----HYELLLRDISQIESGKVPY---
gm008527_Glyma0 -----------TPDRWHNVAKAIGG-KSEDDVKR----HYQILLEDLRHIESGH------
gm022828_Glyma0 -----------ASDRWEKIAADVPG-KTLEEIKH----HYELLVEDVNQIESGCVPL---
:. :: * :: :
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pt036887_POPTR_ ----PCYSSSS-----EGSTSHAGDEGTGKKG--------------GHLGHHNSESNHGN
pt038744_POPTR_ ----PNYKPSG-------------------------------------------------
pt039887_POPTR_ ----PNYTRRS-------------------------------------------------
pt021017_POPTR_ ----PNYRTTG-------------------------------------------------
gm048593_Glyma1 ----PDYKFSE-------------------------------------------------
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gm008749_Glyma0 ----PNYRSAA-------------------------------------------------
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pt036886_POPTR_ ----PCYSSSS-----EGSTSHAGDEGTGKKG--------------GHLGHHNSESNHGN
pp014545_Pp1s25 ----PNYSLSSLSLSEEGA---ASDSPGVKKGTSFSGQVSGP----SANANGNGNAALGG
pt036888_POPTR_ ----PCYSSSS-----EGSTSHAGDEGTGKKG--------------GHLGHHNSESNHGN
pt000152_POPTR_ ----PNYSSSS-----EGSTSHAIDEGTGKKG--------------GHLGHHNSDSNNGN
gm053518_Glyma2 ----PSYNSSS-----EGSTSHASDEGAGKKG--------------SGPGHYSGESNHGT
Os009479_Os02t0 HQG-SHYNSSN-----------ASSSSSS-------------------------------
gm001766_Glyma0 ----PNYT----------------------------------------------------
gm039193_Glyma1 ----PSYKST--------------------------------------------------
Os022978_Os05t0 ----PRYSSSS-------------------------------------------------
gm008745_Glyma0 ----PSYRGAA-------------------------------------------------
pp028019_Pp1s13 ----PSYRFSSLSLSEEGA---ASDSPGVKKGASFSAQVSGPNVNTNGNANGNGNAASGG
gm004171_Glyma0 ----PNYKKSA-------------------------------------------------
gm008527_Glyma0 ------------------------------------------------------------
gm022828_Glyma0 ----PSYNSSP-----EGSTSHASDEGAGKKG--------------GHSWNSNNESNHGT
AT4G39250.1 ------GCTNGR------LSQEE-------------------------------------
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gm013939_Glyma0 ---------NERQ-----IHNEQR------------------------------------
gm005042_Glyma0 --------DNN--------QEREM------------------------------------
Sb033118_Sorbi1 ----------------------HRL-----------------------------------
Sb030230_Sorbi1 KGSA-KSAEQERRKGIAWTEDEHRL---FLLGLEKYGKGDW----RSISRNFVISRTPTQ
Os002917_Os01t0 ------------------------------------------------------------
pt000040_POPTR_ ------SNST--------------------------------------------------
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pt036885_POPTR_ KAS---RSDQERRKGIAWTEDEHRL---FLLGLDKYGKGDW----RSISRNFVVTRTPTQ
pt019385_POPTR_ ------SYSNT--------NEEE-------------------------------------
gm030637_Glyma1 ------SSTNV--------DEEE-------------------------------------
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pt038744_POPTR_ ------SNGRG-------LVEEQ-------------------------------------
pt039887_POPTR_ ---------GASNKSY--------------------------------------------
pt021017_POPTR_ ------AN-----------GHAR-------------------------------------
gm048593_Glyma1 ------------------------------------------------------------
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pt000152_POPTR_ KAS---RSDQERRKGIAWTEDEHRL---FLLGLDKYGKGDW----RSISRNFVVTRTPTQ
gm053518_Glyma2 KAS---RSDQERRKGIAWTEDEHRL---FLLGLDKYGKGDW----RSISRNFVVTRTPTQ
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gm039193_Glyma1 --------DNN--------EE---------------------------------------
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gm004171_Glyma0 ------EH-----------DEEE-------------------------------------
gm008527_Glyma0 ------------------------------------------------------------
gm022828_Glyma0 KAS---RSDQERRKGIAWTEDEHRL---FLLGLEKYGKGDW----RSISRNFVVTRTPTQ
AT4G39250.1 -------------------------------------------------------KRMRN
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BoxShade v3.31 C (beta, 970507) Output
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