fioreDB : Database for Flower Bio-engineering by CRES-T system
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Input Putative repression domain
AT4G39250.1 not found
Ortholog Putative repression domain Reverse top hit Relation Blast score ratio Type
Sb008392 not found in 98aa AT2G21650.1 1st_not 0.537634408 II
Sb033118 not found in 238aa AT1G75250.1 not_not 0.510752688 III
Sb008471 not found in 87aa AT4G39250.1 not_1st 0.478494623 II
Sb019115 not found in 109aa AT4G39250.1 not_1st 0.478494623 II
Sb019161 not found in 77aa AT1G75250.2 not_not 0.462365591 III
Sb010972 not found in 97aa AT1G75250.1 not_not 0.440860215 III
Sb030230 VTLSQGLQLKLVMHRS in 207/476 AT5G08520.1 not_not 0.440860215 III
Get sequence file
Get alignment file
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Sequence file prepared (0 sec required). Alignment has started.

CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)


AT4G39250.1     -----------------------------------------------------MASSSMS
Sb008392_Sorbi1 -----------------------------------------------------MAT--MS
Sb030230_Sorbi1 ----HSSYLAAPPPLHFRSPPKPRNPTRGI--PRGRRLLRVHPPRGVSSGSASMAVEEAS
Sb010972_Sorbi1 -----------------------------------------------------MS-----
Sb019115_Sorbi1 -----------------------------------------------------MSASRSS
Sb008471_Sorbi1 -----------------------------------------------------MSGSRNS
Sb019161_Sorbi1 ----------------------------------------------------QMASGGSS
Sb033118_Sorbi1 FLLSHHYLQLQLGPLHACCPINPIYTHVCIFWIIDRSSYYVHHLRRSSDVSACMSGGPVA
                                                                     *:     

AT4G39250.1     SQSS------GSWTAKQNKAFEQALATY---DQDTPNRWQNVAKVVGG-KTTEEVKRHYE
Sb008392_Sorbi1 LSSTR-----AQWTAKQNKLFEQALAVY---DRDTPDRWHNIARAVGGGKSADEVRRYYE
Sb030230_Sorbi1 SSGGGGEEGCGAWTREQEKAFENAVATTMGGEEDGDARWEKLAEAVEG-KTPEEVRRHYE
Sb010972_Sorbi1 ----------SSWTDSQNKLFERALAVY---DKDTPDRWHNIARAVGCGKTAEDVKRHYR
Sb019115_Sorbi1 SPNSM-----SKWSPKENKMFEQALAYY---GEGTPNRWDKVSSAMGGIKSAEEVRCHYE
Sb008471_Sorbi1 SRNVNI---DSNWSKKENKLFEEALACY---GEGTPDRWHKVARAMGGIKTADEVRRHYE
Sb019161_Sorbi1 SSSSR-----A-WTQRQNKQFECALAVY---DRETPDRWHNIARYMGGTKSADEVRRHFE
Sb033118_Sorbi1 GGAAVGREGHLAGLDVADVLLQQVVV--------APDVLGGLAAADGAGDVVPPVRR--V
                                 :  :: .:.               ::      .    *:    

AT4G39250.1     LLVQDINSIENGHVPFPNYRTSGGCTNGRLS-----------------------------
Sb008392_Sorbi1 LLVKDVEHIEAGKVPFPAYRCPAGYD----------------------------------
Sb030230_Sorbi1 LLVEDVDGIESGRVPLPTYAADGAAEEGGGGGGGGKKGGGGGGTHGDKGSAKSAEQERRK
Sb010972_Sorbi1 WLKRDVQQIESGEGGQGSHSSNSSGS-GSSSNSCGR------------------------
Sb019115_Sorbi1 DLDYDVKMIESGHVPYPQYKTQGFWTRGSLM-----------------------------
Sb008471_Sorbi1 ILNDDVTLIESGGVPFPNYNTQGAWN----------------------------------
Sb019161_Sorbi1 QLVHDVTQIEAGRVPFPR------------------------------------------
Sb033118_Sorbi1 LVVNGQRLLEQ-------------------------------------------------
                 :  .   :*                                                  

AT4G39250.1     ----------------------------------------------------QEEKRMRN
Sb008392_Sorbi1 -----------------------------------------------------ADRIDRS
Sb030230_Sorbi1 GIAWTEDEHRLFLLGLEKYGKGDWRSISRNFVISRTPTQVASHAQKYFIRLNSMNRERRR
Sb010972_Sorbi1 ---------------------------------------------------NNDDKRMRH
Sb019115_Sorbi1 ----------------------------------------------------PTNYVGSN
Sb008471_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb019161_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb033118_Sorbi1 ------------------------------LVLLRRPLRA---------RRCARHRLHRR
                                                                            

AT4G39250.1     MRLQ--------------------------------------------------------
Sb008392_Sorbi1 PALKHLKI----------------------------------------------------
Sb030230_Sorbi1 SSIH--DITSVNNGDASTAQGPITGQTNGQAANPGKPSKQSPQPANTPPGVDAYGTTIGQ
Sb010972_Sorbi1 PKPQ--------------------------------------------------------
Sb019115_Sorbi1 PSIM-TKISYFQ------------------------------------------------
Sb008471_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb019161_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb033118_Sorbi1 HSVAFLELAREEGS----------------------------------------------
                                                                            

AT4G39250.1     ----------------------------------------------------------
Sb008392_Sorbi1 ----------------------------------------------------------
Sb030230_Sorbi1 PVGGPLVSAVGTPVTLPVSAPPHLAYGMHAPVPGAVVPGAPVNIAPMPYPMPPPSSHG
Sb010972_Sorbi1 ----------------------------------------------------------
Sb019115_Sorbi1 ----------------------------------------------------------
Sb008471_Sorbi1 ----------------------------------------------------------
Sb019161_Sorbi1 ----------------------------------------------------------
Sb033118_Sorbi1 ----------------------------------------------------------
BoxShade v3.31 C (beta, 970507) Output
AT4G39250.1     - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - M A S S S M S
Sb008392_Sorbi1    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - M A T - - M S
Sb030230_Sorbi1    - - - - H S S Y L A A P P P L H F R S P P K P R N P T R G I - - P R G R R L L R V H P P R G V S S G S A S M A V E E A S
Sb010972_Sorbi1    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - M S - - - - -
Sb019115_Sorbi1    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - M S A S R S S
Sb008471_Sorbi1    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - M S G S R N S
Sb019161_Sorbi1    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - Q M A S G G S S
Sb033118_Sorbi1    F L L S H H Y L Q L Q L G P L H A C C P I N P I Y T H V C I F W I I D R S S Y Y V H H L R R S S D V S A C M S G G P V A
 
AT4G39250.1     S Q S S - - - - - - G S W T A K Q N K A F E Q A L A T Y - - - D Q D T P N R W Q N V A K V V G G - K T T E E V K R H Y E
Sb008392_Sorbi1    L S S T R - - - - - A Q W T A K Q N K L F E Q A L A V Y - - - D R D T P D R W H N I A R A V G G G K S A D E V R R Y Y E
Sb030230_Sorbi1    S S G G G G E E G C G A W T R E Q E K A F E N A V A T T M G G E E D G D A R W E K L A E A V E G - K T P E E V R R H Y E
Sb010972_Sorbi1    - - - - - - - - - - S S W T D S Q N K L F E R A L A V Y - - - D K D T P D R W H N I A R A V G C G K T A E D V K R H Y R
Sb019115_Sorbi1    S P N S M - - - - - S K W S P K E N K M F E Q A L A Y Y - - - G E G T P N R W D K V S S A M G G I K S A E E V R C H Y E
Sb008471_Sorbi1    S R N V N I - - - D S N W S K K E N K L F E E A L A C Y - - - G E G T P D R W H K V A R A M G G I K T A D E V R R H Y E
Sb019161_Sorbi1    S S S S R - - - - - A - W T Q R Q N K Q F E C A L A V Y - - - D R E T P D R W H N I A R Y M G G T K S A D E V R R H F E
Sb033118_Sorbi1    G G A A V G R E G H L A G L D V A D V L L Q Q V V V - - - - - - - - A P D V L G G L A A A D G A G D V V P P V R R - - V
 
AT4G39250.1     L L V Q D I N S I E N G H V P F P N Y R T S G G C T N G R L S - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sb008392_Sorbi1    L L V K D V E H I E A G K V P F P A Y R C P A G Y D - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sb030230_Sorbi1    L L V E D V D G I E S G R V P L P T Y A A D G A A E E G G G G G G G G K K G G G G G G T H G D K G S A K S A E Q E R R K
Sb010972_Sorbi1    W L K R D V Q Q I E S G E G G Q G S H S S N S S G S - G S S S N S C G R - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sb019115_Sorbi1    D L D Y D V K M I E S G H V P Y P Q Y K T Q G F W T R G S L M - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sb008471_Sorbi1    I L N D D V T L I E S G G V P F P N Y N T Q G A W N - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sb019161_Sorbi1    Q L V H D V T Q I E A G R V P F P R - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sb033118_Sorbi1    L V V N G Q R L L E Q - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
 
AT4G39250.1     - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - Q E E K R M R N
Sb008392_Sorbi1    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - A D R I D R S
Sb030230_Sorbi1    G I A W T E D E H R L F L L G L E K Y G K G D W R S I S R N F V I S R T P T Q V A S H A Q K Y F I R L N S M N R E R R R
Sb010972_Sorbi1    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - N N D D K R M R H
Sb019115_Sorbi1    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - P T N Y V G S N
Sb008471_Sorbi1    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sb019161_Sorbi1    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sb033118_Sorbi1    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - L V L L R R P L R A - - - - - - - - - R R C A R H R L H R R
 
AT4G39250.1     M R L Q - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sb008392_Sorbi1    P A L K H L K I - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sb030230_Sorbi1    S S I H - - D I T S V N N G D A S T A Q G P I T G Q T N G Q A A N P G K P S K Q S P Q P A N T P P G V D A Y G T T I G Q
Sb010972_Sorbi1    P K P Q - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sb019115_Sorbi1    P S I M - T K I S Y F Q - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sb008471_Sorbi1    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sb019161_Sorbi1    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sb033118_Sorbi1    H S V A F L E L A R E E G S - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
 
AT4G39250.1     - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sb008392_Sorbi1    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sb030230_Sorbi1    P V G G P L V S A V G T P V T L P V S A P P H L A Y G M H A P V P G A V V P G A P V N I A P M P Y P M P P P S S H G
Sb010972_Sorbi1    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sb019115_Sorbi1    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sb008471_Sorbi1    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sb019161_Sorbi1    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Sb033118_Sorbi1    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
 
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