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Get sequence file Get alignment file Get formatted file made by BOXSHADE Sequence file prepared (1 sec required). Alignment has started. CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475) AT5G06250.1 --------MSVNHYSTDHHHTLLWQ----------------------------------- Sm007128_Selmo1 ----------MN--ST-------------------------------------------- pp021776_Pp1s13 --------MCLN--AKDEKAVGMWSKPASRSSSEPHHGPDVTLRLNNFDTLVASSSDSDV Os010946_Os03t0 --------MEF------------------------------------------------- gm004534_Glyma0 --------MSTNHYTMDLPEPTLWW----------------------------------- gm027089_Glyma1 --------MSINHYSMDLPEPTLC------------------------------------ Sb028463_Sorbi1 LFLSSSRRMAMNHLSQEHPQAWPW------------------------------------ pt007927_POPTR_ --------MSINHFSTDLQETLSWW----------------------------------- AT5G06250.1 ------------------------------------------------------------ Sm007128_Selmo1 ------------------------------------------------------------ pp021776_Pp1s13 SSFKIVECPSQGREEASTSVVIRETNPASPIPKFYTIEEKTAMLGVAEAAAANTLQVHGI Os010946_Os03t0 ------------------------------------------------------------ gm004534_Glyma0 ------------------------------------------------------------ gm027089_Glyma1 ------------------------------------------------------------ Sb028463_Sorbi1 ------------------------------------------------------------ pt007927_POPTR_ ------------------------------------------------------------ AT5G06250.1 ----------------------------------QQQHR--------------------- Sm007128_Selmo1 ------------------------------------------------------------ pp021776_Pp1s13 PRFQRHIDHDRSRLHDSSMLRTSGKDSENCFRADAEEHRAYVASNLESFGERSHPLDLLG Os010946_Os03t0 ------------------------------------------------------------ gm004534_Glyma0 ----------------------------------PHPHQ--------------------- gm027089_Glyma1 ------------------------------------------------------------ Sb028463_Sorbi1 ------------------------------------------------------------ pt007927_POPTR_ ----------------------------------AQQHQ--------------------- AT5G06250.1 ------------------------------------------------------------ Sm007128_Selmo1 ----------------------------------------------------------TK pp021776_Pp1s13 SRLEAEFSRGANLKQWPLGSRNVGQRCGSGELERTQSGPSAFLGSGSLDTEQRGSLERTH Os010946_Os03t0 --------------ITPI----------------------------------------VR gm004534_Glyma0 -------------QQLTL----------------------------------------ID gm027089_Glyma1 ------------------------------------------------------------ Sb028463_Sorbi1 ------------------------------------------------------------ pt007927_POPTR_ -------------QQQPI----------------------------------------ME AT5G06250.1 ------------------------------------------------------------ Sm007128_Selmo1 SGGGGGGGGAMVLSSESG----------KLPSSQYKGVVPQPNGRWGAQIYEKHQRVWLG pp021776_Pp1s13 SGPSFSGSG----DSEYGDDRGREQSNSKLPSSQFRGVVPQSNGRWGAQIYEKHQRIWLG Os010946_Os03t0 PASAAAGGG--------------------------------------------------- gm004534_Glyma0 PDP--------------------------------------------------------- gm027089_Glyma1 ------------------------------------------------------------ Sb028463_Sorbi1 ------------------------------------------------------------ pt007927_POPTR_ PNPNASSSTP-----------------NEPPN------ISNPNSSW-----PPHHS-WLN AT5G06250.1 ---------------------------------------------------------HTT Sm007128_Selmo1 TFNKEEEAARAYDRAAIKFRGRDAMTNFRPVHDSDPEASFLRLHSKEQVVDMLRRHTYDE pp021776_Pp1s13 TFNTEEEAARAYDTAAIKFRGRDAMTNFRPVTDSEYESEFLRSFSKEQIVEMLRRHTYDE Os010946_Os03t0 ------------------------------------------------------------ gm004534_Glyma0 -------------------LP------LNLNNDDND-------------------NGDDN gm027089_Glyma1 ---------------------------------DDG-------------------NGNDN Sb028463_Sorbi1 --GVAM---------------------------------------------------YTN pt007927_POPTR_ PYNTAQQPSSM-------FLPQNPTLNFNLNEEDD----------------------EDQ AT5G06250.1 DTSETT-----------------------------------------------TTATW-- Sm007128_Selmo1 ELDQSRKITHARAMMIHHPASA-------------------------------------A pp021776_Pp1s13 ELDQCKKVFNMDAAA--NPVSARRRVLEMCRSSNPGTRLSVGSFSLLQNTFSADTSTTLA Os010946_Os03t0 -----------------------------------------------------EVQES-- gm004534_Glyma0 DNDENQTV--------------------------------------------TTTTTG-- gm027089_Glyma1 DNDENQ-----------------------------------------------TTTTG-- Sb028463_Sorbi1 LHYQHHY----------------------------------------------------- pt007927_POPTR_ DHEQQQ-----------------------------------------------QDETQ-- AT5G06250.1 ------LHDDL----KESLFEKSLTPSDVGKLNRLVIPKQHAEKYFPLNAVLVSSAAADT Sm007128_Selmo1 PPAKP-SATAASAVHREHLFDKAVTPSDVGKLNRLVIPKQHAERCFPLD--------LSA pp021776_Pp1s13 PPNLPRDEPRESSPTREHLFDKAVTPSDVGKLNRLVIPKQHAERCFPLD--------LSA Os010946_Os03t0 ------GGRSLAAVEKEHMFDKVVTPSDVGKLNRLVIPKQHAEKYFPLD--------AAS gm004534_Glyma0 ------GEEEIIN-NKEPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQHAEKYFPLS-------GGDS gm027089_Glyma1 ------GEQEILD-DKEPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQHAEKYFPLS--------GDS Sb028463_Sorbi1 --------------EKEHLFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQHAERYFPLS--------GDS pt007927_POPTR_ ------QEQEVLVLDKEPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQHAEKYFPLS--------GDS :* :*:* :*******************: ***. : AT5G06250.1 SSSE-KGMLLSFEDESGKSWRFRYSYWNSSQSYVLTKGWSRFVKDKQLDPGDVVFFQRHR Sm007128_Selmo1 NE---KGLLLSFEDITGKVWRFRYSYWNSSQSYVLTKGWSRFVKEKKLDAGDIVTFERGP pp021776_Pp1s13 NS---PGQTLSFEDVSGKHWRFRYSYWNSSQSYVLTKGWSRFVKEKKLDAGDIVSFERGR Os010946_Os03t0 NE---KGLLLSFEDRTGKPWRFRYSYWNSSQSYVMTKGWSRFVKEKRLDAGDTVSFGRGV gm004534_Glyma0 GSSECKGLLLSFEDESGKCWRFRYSYWNSSQSYVLTKGWSRYVKDKRLDAGDVVLFQRHR gm027089_Glyma1 GGSECKGLLLSFEDESGKCWRFRYSYWNSSQSYVLTKGWSRYVKDKRLDAGDVVLFERHR Sb028463_Sorbi1 GE---KGLILSFEDEAGKPWRFRYSYWTSSQSYVLTKGWSRYVKEKQLDAGDVVHFERMR pt007927_POPTR_ VD---KGLLLSFEDESGRYWKFRYSYWNSSQSYVLTKGWSRYVKEKQLDAGDVVLFERHR * ***** :*: *:******.******:******:**:*:**.** * * * AT5G06250.1 S--DSRRLFIGWRRRGQGSSS--------SVAAT-----------------------NSA Sm007128_Selmo1 G----QELYISWRR---------------------------------------------- pp021776_Pp1s13 N----HELYIDFRRKQITAGGT-------STSDRSSFRSA-----------WS----GPC Os010946_Os03t0 GEAARGRLFIDWRRRPDVVAAL-------QPPTH---RFAHHLPSSIPFAPWAHHHGHGA gm004534_Glyma0 A--DAQRLFIGWRRRRQSDAL--------PPPAHVSSRKSG-------------GDGNSS gm027089_Glyma1 V--DAQRLFIGWRRRRQSDAA--------LPPAH-------------------------- Sb028463_Sorbi1 SFGMGDRLFISYRRHGESATVAAAPPPPPPPPAV---RVV-----------------APA pt007927_POPTR_ T--DGDRLFIGWRRRGESGS---------------------------------------- .*:*.:** AT5G06250.1 VNT-----------SSMG-----------------------------------ALSYHQ- Sm007128_Selmo1 ------------------------------------------------------------ pp021776_Pp1s13 NNAYAPSNGPVSPLNSRM-WQPFSFSVP----HVTVTSSGIQ----------PSSMYGSI Os010946_Os03t0 AAAAAAAAGAR--------FLLPPSSTPIYD-HHRRHAHAVGYDAYAAATSRQVLFYRPL gm004534_Glyma0 KNEGDVGVG-----WTRG-FYPAHHPYPT---HHHHPS-----------------PYHHQ gm027089_Glyma1 -NE-----G-----WTRG-FYSAHHPYPTHHLHHHQPS-----------------PY-QQ Sb028463_Sorbi1 QSTG----GGEQQPWSPM-CYSTSGSYPT------SPAN--------------SHAYRH- pt007927_POPTR_ -NSGVMVQGSGGGVWSRGILYPSSSSGP----HHLSSSNI-QHDLGANVTA-ANVPY--- AT5G06250.1 ----IHATRAAVATAAET---------------------------------------HS- Sm007128_Selmo1 ---------------------------------------------------------RP- pp021776_Pp1s13 YNQMMQSARGTSAASGDLGSVQDSAIPSMAGSCLNLDLQHSPLKCHAATEDFILHIDRPL Os010946_Os03t0 PPQQQHH-PAVVLESVPV---------------------------------------RM- gm004534_Glyma0 QDDSLHAVRGSQGQNQRT---------------------------------------RP- gm027089_Glyma1 QHDCLHA----------------------------------------------------- Sb028463_Sorbi1 SVDHDHSNMQHAGESQSD---------------------------------------RD- pt007927_POPTR_ QPYCLHA--GSIAQNQ-T---------------------------------------TP- AT5G06250.1 -----------------------TPSSS--VVGSSRTVRLFGVNLE------CQM----- Sm007128_Selmo1 ------------------------------------------------------------ pp021776_Pp1s13 RQSADMDGGSNIHDRSLVASSSSTSSQSEEAPSTSSGTRLFGVDLERAAPLACKVSPLQS Os010946_Os03t0 -----------------------TAGHAEPPSAPSKRVRLFGVNLD------CA------ gm004534_Glyma0 -----------------------VGNSSSSSSSSSRVLRLFGVNME------CQP----- gm027089_Glyma1 ------------------------GLSSIYLSISS------------------------- Sb028463_Sorbi1 -----------------------NRSCSAASAPSSRQLRLFGVNLD------CGP----- pt007927_POPTR_ -----------------------LGNSK--------RLRLFGVNLE------CQ------ AT5G06250.1 ------------------------------------------------------------ Sm007128_Selmo1 ------------------------------------------------------------ pp021776_Pp1s13 IPSFTSSALQSKLSEGHESSQGNLKTIHDGGNIPPSASLSALTSGEFLSFRLGNAFKSLQ Os010946_Os03t0 ------------------------------------------------------------ gm004534_Glyma0 ------------------------------------------------------------ gm027089_Glyma1 ------------------------------------------------------------ Sb028463_Sorbi1 ------------------------------------------------------------ pt007927_POPTR_ ------------------------------------------------------------ AT5G06250.1 -----------------------------------------DENDGDDSVAVATT----- Sm007128_Selmo1 ------------------------------------------------------------ pp021776_Pp1s13 CKHPVEQSSPENGGAPVRLSLQASTSSSSGHRGSSPLKSTAMTEGEDPKARSSTESVASA Os010946_Os03t0 ------------------------------------------NSEQDHAGVVGKTAPPP- gm004534_Glyma0 -----------------------------------------EHDDSGPSTPQCSYNTNNI gm027089_Glyma1 ------------------------------------------------------------ Sb028463_Sorbi1 ------------------------------------------GPELEPETPTAMYG---- pt007927_POPTR_ ------------------------------------------LDGSEPSTPDGSS----- AT5G06250.1 VESPDGY-----------------------------------YGQNMYYY---------- Sm007128_Selmo1 --------------------------------------VP-------------------- pp021776_Pp1s13 LDSNSSRSSPMLLEKRKRENSNRDYMQGCSDQADGAANVPLTLAHSEFRSSLEQARHAWH Os010946_Os03t0 LPSPPS------------------------------------------------------ gm004534_Glyma0 LPSTQGTD---------------------------------IHSHLNFYQQ--------- gm027089_Glyma1 -------------------------------------------IHVNFLC---------- Sb028463_Sorbi1 ------------------------------------------YMHQSPYT---------- pt007927_POPTR_ VSSLQGP------------------------------------GHPQFYS---------- AT5G06250.1 ------YSHPHNMVILTLL---------------------------------------- Sm007128_Selmo1 ----------------------------------------------------------- pp021776_Pp1s13 KHEDDASAEVQTSVKRHCSPIQASLLRQGSGTTEQSDFLPKPDLVQEKQKPQYDSSNLR Os010946_Os03t0 -SSSSSSGKARCSLNLDL----------------------------------------- gm004534_Glyma0 QQTSNSKPPPHHMMIRHQPYYY------------------------------------- gm027089_Glyma1 ----------------------------------------------------------- Sb028463_Sorbi1 -SNNWSALKIHQNLTHHI----------------------------------------- pt007927_POPTR_ -QSSYSSNSTHGQMVSHMTL---------------------------------------
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