fioreDB : Database for Flower Bio-engineering by CRES-T system
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Input Putative repression domain
AT5G06250.1 SSRTVRLFGVNLECQ at 214/267 in AT5G06250.1
SSRTVRLFGVNLECQ at 229/282 in AT5G06250.2
Ortholog Putative repression domain Reverse top hit Relation Blast score ratio Type
Os010946 PSKRVRLFGVNLDCA in 262/311 AT2G46870.1 1st_not 0.440579710 II
GKARCSLNLDL in 306/311
Os037663 PSRRLRLFGVNLDCG in 234/279 AT2G36080.1 not_not 0.437681159 III
Os037664 PSRRLRLFGVNLDCG in 213/258 AT2G36080.2 not_not 0.437681159 III
Os009289 AAKRVRLFGVNLDNP in 330/412 AT1G01030.1 not_not 0.434782608 III
RDAHSALDLDL in 407/412
Os036826 RPKRVRLFGVNLDCP in 256/312 AT3G61970.1 not_not 0.423188405 III
GKKMCSLDLGL in 307/312
Os000364 EPRVVRLFGVDIAGG in 320/365 AT1G25560.1 not_not 0.420289855 III
Os022683 AVKAIRLFGVDLLTA in 194/245 AT1G68840.1 not_not 0.417391304 III
Os003376 PVKAVRLFGVDLLTA in 347/393 AT1G68840.1 not_not 0.411594202 III

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CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)


AT5G06250.1     ---MSVNH----------------------------------------------------
Os037664_Os11t0 ------------------------------------------------------------
Os010946_Os03t0 ---MEFI-----------------------------------------------------
Os000364_Os01t0 MGVVSFSSTSSGASTATTESGGAVRMSPEPVVAVAAAAQQL-PVVKGVDSADEVVTSRPA
Os009289_Os02t0 ---MEFTTSSRFSKEEEDEEQDE------------AGRREI-PF----------MTATAE
Os036826_Os10t0 ---MEF------------------------------------------------------
Os003376_Os01t0 -------MDSSSCLVDDTNSGGS---STDKLRALAAAAAETAPLERMGSGASAVVDAAEP
Os037663_Os11t0 ---MAMNHP---------------------------------------------------
Os022683_Os05t0 ------------------------------------------------------------
                                                                            

AT5G06250.1     ------------------------------------------------YS----------
Os037664_Os11t0 -----------------------------------------------MYA----------
Os010946_Os03t0 ------------------------------------------------------------
Os000364_Os01t0 AAAAQQ----------------------SSRYKGVVPQPNG-RWGAQIYERHARVWLGTF
Os009289_Os02t0 AAPAPTSS--------------------SSS-----------------------------
Os036826_Os10t0 ------------------------------------------------------------
Os003376_Os01t0 GAEADSGSGGRVCGGGGGGAGGAGGKLPSSKFKGVVPQPNG-RWGAQIYERHQRVWLGTF
Os037663_Os11t0 --------------------------LFSQE------QPQSWPWGVAMYA----------
Os022683_Os05t0 ------------------------------------------------------------
                                                                            

AT5G06250.1     -----------------------------------------------------TDHHHTL
Os037664_Os11t0 -----------------------------------------------------NFHYH--
Os010946_Os03t0 ------------------------------------------------------------
Os000364_Os01t0 PDEEAAARAYDVAALRYRGRDAATNF-PGAAA---SAAELAFLAAHSKAEIVDMLRKHTY
Os009289_Os02t0 ---------------------------PAHHA---ASASASASASGS-------------
Os036826_Os10t0 ------------------------------------------------------------
Os003376_Os01t0 AGEDDAARAYDVAAQRFRGRDAVTNFRPLAEADPDAAAELRFLATRSKAEVVDMLRKHTY
Os037663_Os11t0 -----------------------------------------------------NFHYH--
Os022683_Os05t0 -----------------------------------------------------MLRKHTY
                                                                            

AT5G06250.1     LWQQQQHRH-----TTDTSETTTTATW------------LHDDLKESLFEKSLTPSDVGK
Os037664_Os11t0 ----------------------------------------HHYEKEHMFEKPLTPSDVGK
Os010946_Os03t0 --------------TPIVRPASAAAG--GGEVQESGGRSLAAVEKEHMFDKVVTPSDVGK
Os000364_Os01t0 ADELRQGLR-------------------RGRGMGARAQPTPSWAREPLFEKAVTPSDVGK
Os009289_Os02t0 -------------STPFRSDDGAGAS--GSGGGGGGGGEAEVVEKEHMFDKVVTPSDVGK
Os036826_Os10t0 --------------TPI-SPPTRVAG--GEEDSERGAAAWAVVEKEHMFEKVVTPSDVGK
Os003376_Os01t0 FDELAQSKRTFAASTP--SAATTTASLSNGHLSSPRSPFAPAAARDHLFDKTVTPSDVGK
Os037663_Os11t0 ----------------------------------------HHYEKEHMFEKPLTPSDVGK
Os022683_Os05t0 LEELTQNKRAFAAISP--PPPKHPAS----------SPTSSSAAREHLFDKTVTPSDVGK
                                                            :: :*:* :*******

AT5G06250.1     LNRLVIPKQHAEKYFPLNAV--------LVSS----AAADTSSSEKGMLLSFEDESGKSW
Os037664_Os11t0 LNRLVIPKQHAERYFPLGA------------G----DAAD-----KGLILSFEDEAGAPW
Os010946_Os03t0 LNRLVIPKQHAEKYFPLDAA---------SNE-------------KGLLLSFEDRTGKPW
Os000364_Os01t0 LNRLVVPKQHAEKHFPLRRA---------ASS----DSASAAATGKGVLLNFEDGEGKVW
Os009289_Os02t0 LNRLVIPKQYAEKYFPLDAA---------ANE-------------KGLLLNFEDRAGKPW
Os036826_Os10t0 LNRLVIPKQHAERYFPLDAA---------AGAGGGGGGGGGGGGGKGLVLSFEDRTGKAW
Os003376_Os01t0 LNRLVIPKQHAEKHFPLQLP-------------------SAGGESKGVLLNFEDAAGKVW
Os037663_Os11t0 LNRLVIPKQHAERYFPLGA------------G----DAAD-----KGLILSFEDEAGAPW
Os022683_Os05t0 LNRLVIPKQHAEKHFPLQLPPPTTTSSVAAAA----DAAAGGGDCKGVLLNFEDAAGKVW
                *****:***:**::***                            **::*.***  *  *

AT5G06250.1     RFRYSYWNSSQSYVLTKGWSRFVKDKQLDPGDVVFFQRHRSD---SRRLFIGWR-RRGQG
Os037664_Os11t0 RFRYSYWTSSQSYVLTKGWSRYVKEKRLDAGDVVHFERVRGSFGVGDRLFIGCR-RRGDA
Os010946_Os03t0 RFRYSYWNSSQSYVMTKGWSRFVKEKRLDAGDTVSFGRGVGE-AARGRLFIDWR-RR---
Os000364_Os01t0 RFRYSYWNSSQSYVLTKGWSRFVREKGLRAGDTIVFSRS--AYGPDKLLFIDCK----K-
Os009289_Os02t0 RFRYSYWNSSQSYVMTKGWSRFVKEKRLDAGDTVSFSRGIGDEAARHRLFIDWK-RR---
Os036826_Os10t0 RFRYSYWNSSQSYVMTKGWSRFVKEKRLGAGDTVSFGRGLGD-AARGRLFIDFR-RRRQD
Os003376_Os01t0 RFRYSYWNSSQSYVLTKGWSRFVKEKGLHAGDVVGFYRSAASAGDDGKLFIDCKLVR---
Os037663_Os11t0 RFRYSYWTSSQSYVLTKGWSRYVKEKRLDAGDVVHFERVRGSFGVGDRLFIGCR-RRGDA
Os022683_Os05t0 KFRYSYWNSSQSYVLTKGWSRFVKEKGLHAGDAVGFYR---AAGKNAQLFIDCK-VRAK-
                :******.******:******:*::* * .**.: * *          ***. :      

AT5G06250.1     SS----SSVAAT--NSAVNT---------------------------------SSMGA--
Os037664_Os11t0 AA----AQTPAP--PPAVRVA------P-AAQNAGEQQPWSPM--------CYSTSGG--
Os010946_Os03t0 ------PDVVAALQPPTHRFAHH-------LPSSIPFAPW-----AHHHGHGAAAAAAAA
Os000364_Os01t0 ------NNAAAA------------------------------------------------
Os009289_Os02t0 ------ADTRDPLRLP--------RGLPLPMPLTSHYAPW-----------GIGGGGG--
Os036826_Os10t0 AGSFMFPPTAA---PPSHSHHHHQRHHP-PLP-SVPLCPWRDYTTAYGGGYGYGYGGG--
Os003376_Os01t0 -------STGAA------------------------------------------------
Os037663_Os11t0 AA----AQTPAP--PPAVRVA------P-AAQNAGEQQPWSPM--------CYSTSGG--
Os022683_Os05t0 ------PTTAAAA-----------------------------------------------
                        .                                                   

AT5G06250.1     --LSYHQIHATRA-----------------AVATAA------------------------
Os037664_Os11t0 --GSYPTSPANSY-----------------AYRRAAD-----------------------
Os010946_Os03t0 AGARFLLPPSSTPI--YDHHRRHAHAVGYDAY--AAATSRQVLFY-----RPLPPQQ---
Os000364_Os01t0 -----TTTCAGDE-------------------------------------RPTTSG----
Os009289_Os02t0 ----FFVQP-SPPATLYEHRLR--QGLDFRAFNPAAAMGRQVLLFGSARIPPQAPLLARA
Os036826_Os10t0 ----------STP-----------------------ASSRHVLFL-----RPQVPA----
Os003376_Os01t0 -----LASPADQP-------------------------------------APS-------
Os037663_Os11t0 --GSYPTSPANSY-----------------AYRRAAD-----------------------
Os022683_Os05t0 --AAFLSAVAAAA-------------------------------------APP-------
                                                                            

AT5G06250.1     ------------------------ETHSTP-----------SSSVVGSSRTVRLFGVNLE
Os037664_Os11t0 ----HDH------GDMHHADESPRDTDSPS-----------FSAGSAPSRRLRLFGVNLD
Os010946_Os03t0 ----QHH--------------PAVVLESVP-VRMTAGHAEPPSAPS---KRVRLFGVNLD
Os000364_Os01t0 ---------------------------AEP-------------------RVVRLFGVDI-
Os009289_Os02t0 PSPLHHHYTLQPSGDGVRAAGSPVVLDSVP-V---------IESPTTAAKRVRLFGVNLD
Os036826_Os10t0 ----------------------AVVLKSVP-VHVAATSAVQEAATTTRPKRVRLFGVNLD
Os003376_Os01t0 -----------------------------P-V-----------------KAVRLFGVDLL
Os037663_Os11t0 ----HDH------GDMHHADESPRDTDSPS-----------FSAGSAPSRRLRLFGVNLD
Os022683_Os05t0 -----------------------------PAV-----------------KAIRLFGVDLL
                                             .                   : :*****:: 

AT5G06250.1     CQ-----------MDENDG-----------------------------DDSVAVATTVES
Os037664_Os11t0 C-----------------G-----------------------------PEPEADTTAAAT
Os010946_Os03t0 CA----------NSEQDHAGVVGKTAPPP-----------LP------------SPPSSS
Os000364_Os01t0 -----------------AGGDC-RKRERAV------------------------EMGQEV
Os009289_Os02t0 NPHAGGGGGAAAGESSNHGNALSLQTPAWMRRDPTLRLLELPPHHHHGAESSAASSPSSS
Os036826_Os10t0 CP-------AAMDDDDDIAGAASRTAASSL--------LQLP------------SPSSST
Os003376_Os01t0 TA--------PAPVEQMAG------CKRAR------------------------DLAATT
Os037663_Os11t0 C-----------------G-----------------------------PEPEADTTAAAT
Os022683_Os05t0 TA--------AAPELQDAGGAAMTKSKRAM------------------------DAMAES
                                  .                                         

AT5G06250.1     PDGYYGQNMYY------------YYSHPHNMVILTLL
Os037664_Os11t0 MYGYMHQQSSYAAMSAV----PSYWGNS---------
Os010946_Os03t0 -----SSSS-GKARCSL---------------NLDL-
Os000364_Os01t0 --------FLLKRQCVVHQRTP-------ALGALLL-
Os009289_Os02t0 -----SSSK-RDAHSAL---------------DLDL-
Os036826_Os10t0 -----SSSTAGKKMCSL---------------DLGL-
Os003376_Os01t0 P---PQA-AAFKKQCI----------------ELALV
Os037663_Os11t0 MYGYMHQQSSYAAMSAV----PSYWGNS---------
Os022683_Os05t0 -----QAHVVFKKQCI----------------ELALT
                                                     


BoxShade v3.31 C (beta, 970507) Output
AT5G06250.1     - - - M S V N H - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Os037664_Os11t0    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Os010946_Os03t0    - - - M E F I - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Os000364_Os01t0    M G V V S F S S T S S G A S T A T T E S G G A V R M S P E P V V A V A A A A Q Q L - P V V K G V D S A D E V V T S R P A
Os009289_Os02t0    - - - M E F T T S S R F S K E E E D E E Q D E - - - - - - - - - - - - A G R R E I - P F - - - - - - - - - - M T A T A E
Os036826_Os10t0    - - - M E F - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Os003376_Os01t0    - - - - - - - M D S S S C L V D D T N S G G S - - - S T D K L R A L A A A A A E T A P L E R M G S G A S A V V D A A E P
Os037663_Os11t0    - - - M A M N H P - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Os022683_Os05t0    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
 
AT5G06250.1     - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - Y S - - - - - - - - - -
Os037664_Os11t0    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - M Y A - - - - - - - - - -
Os010946_Os03t0    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Os000364_Os01t0    A A A A Q Q - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - S S R Y K G V V P Q P N G - R W G A Q I Y E R H A R V W L G T F
Os009289_Os02t0    A A P A P T S S - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - S S S - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Os036826_Os10t0    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Os003376_Os01t0    G A E A D S G S G G R V C G G G G G G A G G A G G K L P S S K F K G V V P Q P N G - R W G A Q I Y E R H Q R V W L G T F
Os037663_Os11t0    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - L F S Q E - - - - - - Q P Q S W P W G V A M Y A - - - - - - - - - -
Os022683_Os05t0    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
 
AT5G06250.1     - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - T D H H H T L
Os037664_Os11t0    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - N F H Y H - -
Os010946_Os03t0    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Os000364_Os01t0    P D E E A A A R A Y D V A A L R Y R G R D A A T N F - P G A A A - - - S A A E L A F L A A H S K A E I V D M L R K H T Y
Os009289_Os02t0    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - P A H H A - - - A S A S A S A S A S G S - - - - - - - - - - - - -
Os036826_Os10t0    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Os003376_Os01t0    A G E D D A A R A Y D V A A Q R F R G R D A V T N F R P L A E A D P D A A A E L R F L A T R S K A E V V D M L R K H T Y
Os037663_Os11t0    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - N F H Y H - -
Os022683_Os05t0    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - M L R K H T Y
 
AT5G06250.1     L W Q Q Q Q H R H - - - - - T T D T S E T T T T A T W - - - - - - - - - - - - L H D D L K E S L F E K S L T P S D V G K
Os037664_Os11t0    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - H H Y E K E H M F E K P L T P S D V G K
Os010946_Os03t0    - - - - - - - - - - - - - - T P I V R P A S A A A G - - G G E V Q E S G G R S L A A V E K E H M F D K V V T P S D V G K
Os000364_Os01t0    A D E L R Q G L R - - - - - - - - - - - - - - - - - - - R G R G M G A R A Q P T P S W A R E P L F E K A V T P S D V G K
Os009289_Os02t0    - - - - - - - - - - - - - S T P F R S D D G A G A S - - G S G G G G G G G G E A E V V E K E H M F D K V V T P S D V G K
Os036826_Os10t0    - - - - - - - - - - - - - - T P I - S P P T R V A G - - G E E D S E R G A A A W A V V E K E H M F E K V V T P S D V G K
Os003376_Os01t0    F D E L A Q S K R T F A A S T P - - S A A T T T A S L S N G H L S S P R S P F A P A A A R D H L F D K T V T P S D V G K
Os037663_Os11t0    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - H H Y E K E H M F E K P L T P S D V G K
Os022683_Os05t0    L E E L T Q N K R A F A A I S P - - P P P K H P A S - - - - - - - - - - S P T S S S A A R E H L F D K T V T P S D V G K
 
AT5G06250.1     L N R L V I P K Q H A E K Y F P L N A V - - - - - - - - L V S S - - - - A A A D T S S S E K G M L L S F E D E S G K S W
Os037664_Os11t0    L N R L V I P K Q H A E R Y F P L G A - - - - - - - - - - - - G - - - - D A A D - - - - - K G L I L S F E D E A G A P W
Os010946_Os03t0    L N R L V I P K Q H A E K Y F P L D A A - - - - - - - - - S N E - - - - - - - - - - - - - K G L L L S F E D R T G K P W
Os000364_Os01t0    L N R L V V P K Q H A E K H F P L R R A - - - - - - - - - A S S - - - - D S A S A A A T G K G V L L N F E D G E G K V W
Os009289_Os02t0    L N R L V I P K Q Y A E K Y F P L D A A - - - - - - - - - A N E - - - - - - - - - - - - - K G L L L N F E D R A G K P W
Os036826_Os10t0    L N R L V I P K Q H A E R Y F P L D A A - - - - - - - - - A G A G G G G G G G G G G G G G K G L V L S F E D R T G K A W
Os003376_Os01t0    L N R L V I P K Q H A E K H F P L Q L P - - - - - - - - - - - - - - - - - - - S A G G E S K G V L L N F E D A A G K V W
Os037663_Os11t0    L N R L V I P K Q H A E R Y F P L G A - - - - - - - - - - - - G - - - - D A A D - - - - - K G L I L S F E D E A G A P W
Os022683_Os05t0    L N R L V I P K Q H A E K H F P L Q L P P P T T T S S V A A A A - - - - D A A A G G G D C K G V L L N F E D A A G K V W
 
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