|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Get sequence file Get alignment file Get formatted file made by BOXSHADE Sequence file prepared (0 sec required). Alignment has started. CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475) AT5G06250.1 ------------------------------------------------------------ Sb032995_Sorbi1 ----------------PPLLELNLPQSISLSRGGCS-----------DRMDSTSCLLDDA Sb024795_Sorbi1 RRILSITGRRAAAGSRVPKQKSKKPKA-ARLQGAARAVALAHLIMGIESMSPTAAPAEDS Sb016626_Sorbi1 ------------------------------------------------------------ Sb027889_Sorbi1 ---------------------------LLRVSGSS---------------------YMDQ Sb014492_Sorbi1 ---------------------------------------------------------MEF Sb025645_Sorbi1 ------------------------PAS---SSGAL-------------KMDSASSLVDDT Sb001747_Sorbi1 ------------------------------------------------------------ Sb022430_Sorbi1 ----------------------------------------------------------SL AT5G06250.1 -MSVNHYS---------------------------------------------------- Sb032995_Sorbi1 SSGASTG-------NKNPAPAPAAATGGKPLQRVGSGASAV-MDAAEPGAEADSG----- Sb024795_Sorbi1 SSSSSRFSAASTATTESGAAQPRAASAAP-----GGGAVVVGRDASLADEQAVTSQ-PLA Sb016626_Sorbi1 ------------------------------------------------------------ Sb027889_Sorbi1 FAASGRFSRE--------------------------------EEADE--EHEDASNSMRE Sb014492_Sorbi1 ASSSSRFSKE--------------------------------EDEEEEGEEEDEEASPRE Sb025645_Sorbi1 SSGSGGGGGAS--TDKLRALAVAAAASGPPLERMGSGASAV-LDAAEPGAEADS------ Sb001747_Sorbi1 ------------------------------------------------------------ Sb022430_Sorbi1 KGSSSR-------------------------------------------SEASSIDRPAD AT5G06250.1 ----------------------------------------------------------TD Sb032995_Sorbi1 -SGGAGRATGGCGVVSGNGKLPSSKYKGVVPQPNGRWGAQIYERHQRVWLGTFTGEAEAA Sb024795_Sorbi1 ASTAAAVAQG------------SSRFKGVVPQPNGRWGAQIYERHARVWLGTFADEEAAA Sb016626_Sorbi1 ------MAMH-----------------------------------------------HLA Sb027889_Sorbi1 ISFMPAAAAA-----------------------------------------------GTA Sb014492_Sorbi1 IPFMTAAAA-------------------------------------------------TA Sb025645_Sorbi1 ---AAAAAPGAVGV---GGKLPSSRYKGVVPQPNGRWGAQIYERHQRVWLGTFAGEADAA Sb001747_Sorbi1 ------------------------------------------------------------ Sb022430_Sorbi1 LPYLPTLADG-----------------------------------------------RTA AT5G06250.1 HHHTLLWQQ-------------------QQHRHTTDTSETTTTATW-------------- Sb032995_Sorbi1 RAYDVAAQRFRGRDAVTNFRPLAESDPEAAVELRFLASRTKAEVVDMLRKHTYGEELAQN Sb024795_Sorbi1 RAYDVAALRYRGREAATNF-PGAGA---SAPELTFLAAHSKAEIVDMLRKHTYADELRQG Sb016626_Sorbi1 QGHPQAWPW-------------------GMAMYTNLHYHQH------------------- Sb027889_Sorbi1 PSSSAAASA-------------------ASTSASASAASGSSSATAPFRS---------- Sb014492_Sorbi1 DTGPAAASS-------------------SSPSAAGASASASGSAAA-LR----------- Sb025645_Sorbi1 RAYDVAAQRFRGRDAVTNFRPLADADPDAAAELRFLASRSKAEVVDMLRKHTYFDELAQN Sb001747_Sorbi1 ------------------------------MEFT--PAHA--------R----------- Sb022430_Sorbi1 RSRSIAGRR-------------------RSMEFTAPPTAARSGGGE-ER----------- AT5G06250.1 ------------------------------------LHDDLKESLFEKSLTPSDVGKLNR Sb032995_Sorbi1 RRAFAAASPAASPPP--------AKNNNPAASSSSPTAVTAREHLFDKTVTPSDVGKLNR Sb024795_Sorbi1 LR-----------------------RGRGMGARAQPTPAWARSLLFEKAVTPSDVGKLNR Sb016626_Sorbi1 ------------------------------------HHQYEREHLFEKPLTPSDVGKLNR Sb027889_Sorbi1 ---------ASGDAAG-------ASGSGGGGGAAADVEAVEKEHMFDKVVTPSDVGKLNR Sb014492_Sorbi1 ----------SGDGAG-------ASGSGGGGGGSDDVEVIEKEHMFDKVVTPSDVGKLNR Sb025645_Sorbi1 KRAFAAAAAAAASSAATTTASSLANNNNNHSSLASPSPATAREHLFDKTVTPSDVGKLNR Sb001747_Sorbi1 ---------VVEDSER-------PRGG---------VAWVEKEHMFEKVVTPSDVGKLNR Sb022430_Sorbi1 ---------AAEHQQQ-------QQQQ---------LAAVEKEHMFDKVVTPSDVGKLNR :. :*:* :********** AT5G06250.1 LVIPKQHAEKYFP-LNAVLVSSAAADTSSSEKGMLLSFEDESGKSWRFRYSYWNSSQSYV Sb032995_Sorbi1 LVIPKQHAEKHFP-LQ-LPAAAAAV-VGGECKGVLLNFEDATGKVWRFRYSYWNSSQSYV Sb024795_Sorbi1 LVVPKQHAEKHFP-LKRAPEASAAA--ATTGKGVLLNFEDGEGKVWRFRYSYWNSSQSYV Sb016626_Sorbi1 LVIPKQHAERYFP-LGGNGAG------DGSDKGLLLAFEDEAGKPWRFRYSYWTSSQSYV Sb027889_Sorbi1 LVIPKQYAEKYFP-LDAAANE----------KGLLLSFEDSAGKHWRFRYSYWNSSQSYV Sb014492_Sorbi1 LVIPKQHAEKYFP-LDAAANE----------KGLLLSFEDRAGKLWRFRYSYWNSSQSYV Sb025645_Sorbi1 LVIPKQHAEKHFP-LQ-LPSA------GGESKGVLLNLEDAAGKVWRFRYSYWNSSQSYV Sb001747_Sorbi1 LVIPKQHAERYFPALDASAAAAAA--AAGGGKGLVLSFEDRAGKAWRFRYSYWNSSQSYV Sb022430_Sorbi1 LVIPKQHAEKYFP-LDAAANE----------KGLLLSFEDRTGKPWRFRYSYWNSSQSYV **:***:**::** * **::* :** ** ********.****** AT5G06250.1 LTKGWSRFVKDKQLDPGDVVFFQRHRSD----SRRLFIGWRRRGQG-------------- Sb032995_Sorbi1 LTKGWSRFVKEKGLHAGDAVGFYRS----AGGKQQFFIDCKLRPKT-------------- Sb024795_Sorbi1 LTKGWSRFVREKGLRAGDTIVFSHST---YSSEKQLFIDCK-KTKT-------------- Sb016626_Sorbi1 LTKGWSRYVKEKRLDAGDVVRFERVRGG-LGTGDRLFICCRRRGES----AAPTPTP--- Sb027889_Sorbi1 MTKGWSRFVKEKRLVAGDTVSFSRAAA--EDARHRLFIDWKRRVDT----RGPLRFS--- Sb014492_Sorbi1 MTKGWSRFVKEKRLDAGDTVSFCRGAG--EAARDRLFIDWKRRADS----RDPHRMP--- Sb025645_Sorbi1 LTKGWSRFVKEKGLQAGDVVGFYRSSAVGAGADTKLFIDCKLRPNS-------------- Sb001747_Sorbi1 MTKGWSRFVKEKRLGAGDTVLFARGAGGEGAPRGRFFIDFRRRRQDLAFLQPPLASA-QR Sb022430_Sorbi1 MTKGWSRFVKEKRLDAGDTVSFGRGVG--DAARGRLFIDWRRRP------DPPVHHQYHH :******:*::* * .**.: * : ::** : : AT5G06250.1 ---------------------------SSSSVAATNSAV------------------NTS Sb032995_Sorbi1 ---------------------------TTTAASF----VN-----------------ATT Sb024795_Sorbi1 ---------------------------TTVATTD------------------------GA Sb016626_Sorbi1 --PLPVRAPAPALNAAGEQQPWSPMCYSTSGSSY-----------------------PTS Sb027889_Sorbi1 GLALPM--PLASHYGPHHYSPWGFG----------IGGVGGGGGGGG------FFMPPSP Sb014492_Sorbi1 RLPLPM-APVASPYG---LGPW-------------------GGGAGG------FFMPPAP Sb025645_Sorbi1 ---------------------------VATASTTTGPAVG-----------------SSP Sb001747_Sorbi1 LLPLPS-VP---------ICPW-----QDYGAST-----------------------PAP Sb022430_Sorbi1 RLPLPSVVP---------YAPWPHAHHHHYPAAAAAVGVGVGAGAGAARTTTVLHLPPSP . AT5G06250.1 SMGALSYH--------------------------------------------QIHAT--- Sb032995_Sorbi1 TT--------------------------------------------------AAPS---- Sb024795_Sorbi1 PV--------------------------------------------------PAPAEK-- Sb016626_Sorbi1 PASPYAYH-------------------------------------NDTPHAGEADAKSSG Sb027889_Sorbi1 PATLYE-HRLRQGLDFRSM--TNYPAPTVGRQQLLFFGSARMPP-------HHAPAPQPR Sb014492_Sorbi1 PATLYEHHRFRQALDFRNI--NAAAAPA---RQLLFFGSQGMPPRASMPLQQQQPQPQPS Sb025645_Sorbi1 PA--------------------------------------------------PAPA---- Sb001747_Sorbi1 S---------------RHV---------------LFL----------RP---QVPA---- Sb022430_Sorbi1 SS-LYDPH-------LRHVGYDAYGAGT---RQLLFY----------RPLHHQQPST--- . AT5G06250.1 --------------------------RAAVATAAETHS--TP------SSSV--VGSSRT Sb032995_Sorbi1 -----------------------------------------P-------------V--KA Sb024795_Sorbi1 ----------------------------------------KP-------------SEARV Sb016626_Sorbi1 ----------------------------------------TP------------TAPSRK Sb027889_Sorbi1 --PLSLPLHH-FTVQPSAAAGVTAASRPVVLDSVPVIE--SP------------TTAAKR Sb014492_Sorbi1 LPPPPPPLHSIMMVQPGSPA--VTHGLPMVLDSVPLVN--SP------------TAAAKR Sb025645_Sorbi1 -----------------------------------------P-------------VATKA Sb001747_Sorbi1 ---------------------------AVVLTSMPVHV----------AASAVEATRSKR Sb022430_Sorbi1 ---------------------------AVVLDSVPVRLPTTPGQHAEPPAPVVASSASKR : AT5G06250.1 VRLFGVNLECQMD-ENDGDDSV---------------------------------AVATT Sb032995_Sorbi1 VRLFGVDLLTT---------------------------PRPGPAVVA---APEQEEIAMA Sb024795_Sorbi1 VRLFGVDIAGDGC------------------------QKRARPVEIAFEHGPQQE----- Sb016626_Sorbi1 LRLFGVNLDCGPEPEPEPETPTAMYS-------------------YMHQ-SP-----YAA Sb027889_Sorbi1 VRLFGVNLDNNPLSEPDGGVGEASHQGNALSLQMPGWQQRTTPTLRLLE-LPRHGAAESS Sb014492_Sorbi1 VRLFGVNLDN----PQQGSSAESSQDANALSLRMPGW-QRPGP-LRFFE-SPQRGAAESS Sb025645_Sorbi1 VRLFGVDLLT-------------------------------APAATA---AAPAEAMAAG Sb001747_Sorbi1 VRLFGVNLDCPPDAAEDGATVT----------------RRTAS--TLLQ-LP-------- Sb022430_Sorbi1 VRLFGVNLDCAGSEEENGGGGG----------------WRTSAPPTPHG-LP-------- :*****:: AT5G06250.1 -------VESPDGYYGQNMYYYYSHPHNMVILTLL-- Sb032995_Sorbi1 NKRARDAIARVLQYTWFS----RSNAYTSR------- Sb024795_Sorbi1 -------LLKKKQCVGVAH--HRSPALGAFLL----- Sb016626_Sorbi1 -------VSAVPSYWGSS------------------- Sb027889_Sorbi1 -------AASSPSSSSSSK----REARSALDLDL--- Sb014492_Sorbi1 -------AASSPSSSSSSK----REAHSSLDLDL--- Sb025645_Sorbi1 CKRARD-LASPPQ-----------AAFKKQLVELALV Sb001747_Sorbi1 ---------SPSSSTSSST---AGKDACSLDLGL--- Sb022430_Sorbi1 ---------SPPSSSSSSS----GKARCSLNLDL---
|