|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Get sequence file Get alignment file Get formatted file made by BOXSHADE Sequence file prepared (0 sec required). Alignment has started. CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475) AT5G06250.1 ------------------------------------------------------------ gm007617_Glyma0 ------------------------------------------------------------ gm001006_Glyma0 -----------MDAISCLDESTTT-ESLSIS--------QAKPSSTIMSSEKASPSPPPP gm055124_Glyma2 -----------MDGGSVTDETTTTSNSLSVP---------------------ANLSPPP- gm053391_Glyma1 MELMQQVKGNYSDSR---EEEEAAAE---------------------------------- gm008337_Glyma0 ------------------------------------------------------------ gm052668_Glyma1 ------------------------------------------------------------ gm017484_Glyma0 ------------------------------------------------------------ gm003570_Glyma0 -----------MDAISCMDESTTT-ESLSISLSPTSSSEKAKPSSMITSSEKVSLSPPPS gm043561_Glyma1 MELMQEVKG-YSDSREEEEEEEGAAEEESSR------KHHYYPFSSSPSNLYLSSSSAPS gm028283_Glyma1 -----------MDGGCVTDETTTSSDSLSV--------------------------PPP- AT5G06250.1 ------------------------------------------------------------ gm007617_Glyma0 ------------------------------------------------------------ gm001006_Glyma0 NRLCRVGSGASAVVDS------------DGGGGGGS--------TEVESRKLPSSKYKGV gm055124_Glyma2 --LSLVGSGATAVVYP------------DGCCVSG----------EAESRKLPSSKYKGV gm053391_Glyma1 ---------------------IITI------------------TREPESSR--------- gm008337_Glyma0 ------------------------------------------------------------ gm052668_Glyma1 ------------------------------------------------------------ gm017484_Glyma0 ------------------------------------------------------------ gm003570_Glyma0 NRLCRVGSGASAVVDP------------DGGGSGA----------EVESRKLPSSKYKGV gm043561_Glyma1 ISSNYTSTTTSAVARPLHHHHVINIPYQQNPWLGMNIVHHDHLIQSPESHN--SSSGLGL gm028283_Glyma1 ---SRVGSVASAVVDP------------DGCCVSG----------EAESRKLPSSKYKGV AT5G06250.1 -------------------------------MSVNHYSTD-------------------- gm007617_Glyma0 ------------------------------------------------------------ gm001006_Glyma0 VPQPNGRWGSQI------YEKH---------QRVWLGTFN-EEDEAARAYDVAVQRFRGK gm055124_Glyma2 VPQPNGRWGAQI------YEKH---------QRVWLGTFN-EEDEAARAYDIAAHRFRGR gm053391_Glyma1 LHQ-QDAA-SNF-------------GKKLDLMDLSLGSSK-EEEEG-------------- gm008337_Glyma0 -------------------------------MDLSLGSSKEEEEEG-------------- gm052668_Glyma1 ------------------------------------------------------------ gm017484_Glyma0 -------------------------------MDLSLGSSK---DEG-------------- gm003570_Glyma0 VPQPNGRWGAQI------YEKH---------QRVWLGTFN-EEDEAARAYDIAAQRFRGK gm043561_Glyma1 LHQHQDAAGSNFIINNNQHHQHHHTTKQLDFMDLSLGSSK---DEG-------------- gm028283_Glyma1 VPQPNGRWGAQI------YEKH---------QRVWLGTFN-EEDEAARAYDIAALRFRGP AT5G06250.1 ----------------------------------HHHT------------------LLWQ gm007617_Glyma0 ------------------------------------------------------------ gm001006_Glyma0 DAVTNFKPLSGTDDDDGESEFLNSHSKSEIVDMLRKHT------------------YNDE gm055124_Glyma2 DAVTNFKPLAGA--DDAEAEFLSTHSKSEIVDMLRKHT------------------YDNE gm053391_Glyma1 ----KLQQGGGG---------------GGVV----HHA---------------------- gm008337_Glyma0 ----NLQQ--GG---------------GGVV----HHA---------------------- gm052668_Glyma1 ------------------------------------------------------------ gm017484_Glyma0 ----NLQ---GS---------------SSSVYAHHHHAASASSSANGNNNNSSSSNLQQQ gm003570_Glyma0 DAVTNFKPLAGADDDDGESEFLNSHSKPEIVDMLRKHT------------------YNDE gm043561_Glyma1 ----NLP---GS---------------SSSVYA-HHHAASGSSSVNGNNN-------LQQ gm028283_Glyma1 DAVTNFKPPAAS--DDAESEFLNSHSKFEIVDMLRKHT------------------YDDE AT5G06250.1 QQQHRHTT------DTSETTTT----ATWLHDDLKESLFEKSLTPSDVGKLNRLVIPKQH gm007617_Glyma0 -------------------------------------MFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQH gm001006_Glyma0 LEQSKRSRGFVRRRGSAAGAGNGNSISGACVMKAREQLFQKAVTPSDVGKLNRLVIPKQH gm055124_Glyma2 LQQSTRGG---RRRRDAETAS-----SGAFDAKAREQLFEKTVTQSDVGKLNRLVIPKQH gm053391_Glyma1 -HEIVE----------------------------KENMFEKVVTPSDVGKLNRLVIPKQH gm008337_Glyma0 -HQVVE----------------------------KEHMFEKVATPSDVGKLNRLVIPKQH gm052668_Glyma1 -------------------------------------MFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQH gm017484_Glyma0 QQQPAE----------------------------KEHMFDKVVTPSDVGKLNRLVIPKQH gm003570_Glyma0 LEQSKRSRGVVRRRGSAA-AGTANSISGACFTKAREQLFEKAVTPSDVGKLNRLVIPKQH gm043561_Glyma1 QQQPAE----------------------------KEHMFDKVVTPSDVGKLNRLVIPKQH gm028283_Glyma1 LQQSTRGG---RRRLDADTAS-----SGVFDAKAREQLFEKTVTPSDVGKLNRLVIPKQH :*:* * *************** AT5G06250.1 AEKYFPLNA-VLVSSAAADTS-----SSEKGMLLSFEDESGKSWRFRYSYWNSSQSYVLT gm007617_Glyma0 AEKHFPLDS-S-----AA-----------KGLLLSFEDESGKCWRFRYSYWNSSQSYVLT gm001006_Glyma0 AEKHFPLQSAANGVSATA--------TAAKGVLLNFEDVGGKVWRFRYSYWNSSQSYVLT gm055124_Glyma2 AEKHFPLSG-SGGGALPCMAAA----AGAKGMLLNFEDVGGKVWRFRYSYWNSSQSYVLT gm053391_Glyma1 AEKYFPLDS-S---------------SNEKGLLLNFEDRNGKVWRFRYSYWNSSQSYVMT gm008337_Glyma0 AEKYFPLDS-S---------------TNEKGLLLNFEDRNGKVWRFRYSYWNSSQSYVMT gm052668_Glyma1 AEKYFPLDS-SGGDSAAA-----------KGLLLSFEDESGKCWRFRYSYWNSSQSYVLT gm017484_Glyma0 AEKYFPLDS-S---------------ANEKGLLLNFEDRNGKLWRFRYSYWNSSQSYVMT gm003570_Glyma0 AEKHFPLQS-SNGVSATTIAAVTATPTAAKGVLLNFEDVGGKVWRFRYSYWNSSQSYVLT gm043561_Glyma1 AEKYFPLDS-S---------------ANEKGLLLNFEDRNGKLWRFRYSYWNSSQSYVMT gm028283_Glyma1 AEKHFPLSG-SGDESSPCVAGA----SAAKGMLLNFEDVGGKVWRFRYSYWNSSQSYVLT ***:***.. **:**.*** .** ***************:* AT5G06250.1 KGWSRFVKDKQLDPGDVVFFQRHRSD--SRRLFIGWRRRGQGSSSS-------------- gm007617_Glyma0 KGWSRYVKDKRLHAGDVVLFHRHRSL--PQRFFISCSRR-QPNP-V-------------- gm001006_Glyma0 KGWSRFVKEKNLKAGDTVCFQRSTGP--DRQLYIDWKTR----------N--VV-NEVAL gm055124_Glyma2 KGWSRFVKEKNLRAGDAVQFFKSTGL--DRQLYIDCKAR----------SG--------- gm053391_Glyma1 KGWSRFVKEKKLDAGDIVSFQRGLGDLYRHRLYIDWRKR-SAHPHA---HHHAPD----- gm008337_Glyma0 KGWSRFVKEKKLDAGDIVSFQRGLGDLYRHRLYIDWKRR-PDHAHAHPPHHH--D----- gm052668_Glyma1 KGWSRYVKDKRLHAGDVVLFHRHRAH--PQRFFISCTRH-QPNPNP-------------- gm017484_Glyma0 KGWSRFVKEKKLDAGDMVSFQRGVGE-----------LR-PDHHHH---HHHGPDHSTTL gm003570_Glyma0 KGWSRFVKEKNLKAGDTVCFHRSTGP--DKQLYIDWKTR----------N--VVNNEVAL gm043561_Glyma1 KGWSRFVKEKKLDAGDIVSFQRGVGESYRHRLYIDWKRR-RDHHHH---HHHGP------ gm028283_Glyma1 KGWSRFVKEKNLRAGDAVQFFKSTGP--DRQLYIDCKAR----------SGEVNNNAGGL *****:**:*.* .** * * : . : AT5G06250.1 ---------VAATNSAVNTSSMGAL-SY--------------------H----------- gm007617_Glyma0 ---------PAH------------------------------------------------ gm001006_Glyma0 F---GPVVEPIQM---VRL------FGV---------------------------NIL-- gm055124_Glyma2 -----------KM---VRL------FGV---------------------------DLL-- gm053391_Glyma1 ---------PLFL-PSIRW------YSLPPTMPPRYHHDHHF------HHHLNYNNLFTF gm008337_Glyma0 ---------PLFL-PSIRL------YSLPPTMPPRYHHDHHF------HHHLNYNNLFTF gm052668_Glyma1 ---------PAHV--SIRSSSYSALPAYPT------HHHHHLPFPYQPH----------- gm017484_Glyma0 FTPFLIPNQPHHL-MSIRWGATGR-FGINATT----HHYNNY------H----------- gm003570_Glyma0 FGPVGPVVEPIQM---VRL------FGV---------------------------NIL-- gm043561_Glyma1 ---------PHHL-MSIRWGATDRLYSLPSPTPPR-HHDHLQ------H----------- gm028283_Glyma1 FVPIGPVVEPVQM---VRL------FGV---------------------------NLL-- AT5G06250.1 ------QIHATRAAVATAAETHSTPSSSVVGS---------------------------- gm007617_Glyma0 -----------RGGSQGQNETTPGGNSSSSGS---------------------------- gm001006_Glyma0 ------KL---------------------PGS---------------------------- gm055124_Glyma2 ------KLP-------------------VPGS---------------------------- gm053391_Glyma1 QQHQY-QLGAATAAATAAHH---GDQNSGSGSLYYLRSSM--SMGGGD------------ gm008337_Glyma0 QQHQYQQLG----AATTTHHNNYGYQNSGSGSLYYLRSSM--SMGGGD------------ gm052668_Glyma1 ------SLHAPGGGSQGQNETTPGGNSS---S---------------------------- gm017484_Glyma0 ------EMSS-------------TTTSGSAGSVFYHRSTPPISMPLADHQTLNTR---QQ gm003570_Glyma0 ------KL---------------------PGS---------------------------- gm043561_Glyma1 ------QQPL-------------NYNNNTM-------STPP-SMPLADHQTLNTRQQQQQ gm028283_Glyma1 ------KLP-------------------VPGS---------------------------- AT5G06250.1 ------------------------------------------------------SRTVRL gm007617_Glyma0 ------------------------------------------------------GRVLRL gm001006_Glyma0 --------------------DSI------------ANNNNASGCCNGK------RREMEL gm055124_Glyma2 --------------------DGIGV----------G--------CDGK------RKEMEL gm053391_Glyma1 ----QNLQGRGN-NIVPMIIDSVPVSVGHH-NNRHGNGGITSGGATSS------GKRLRL gm008337_Glyma0 ----QNLQGRGS-NIVPMIIDSVPVNVAHHNNNRHGNGGITSGGTNCS------GKRLRL gm052668_Glyma1 ------------------------------------------------------GRVLRL gm017484_Glyma0 QQQQQQQEGAGNVSLSPMIIDSVPV--AHHLHHQQHHGGKSSGPSSTSTSPSTAGKRLRL gm003570_Glyma0 --------------------DTI-V----------GNNNNASGCCNGK------RREMEL gm043561_Glyma1 QQQQQQQEGGGNVSLPPMIIDSVP------------------------------------ gm028283_Glyma1 --------------------DGV-----------------------GK------RKEMEL AT5G06250.1 FGVNLECQMD------ENDGDDSVAVATTVESPDGYYGQNMYY-YYSHPH--NMVILTLL gm007617_Glyma0 FGVNMECQPDN-----HNDSQNSTPECSYTHL---YHHQTSSYSSSSNPH--HHMVPQQP gm001006_Glyma0 FS--LECSKKPK------------------------------------------------ gm055124_Glyma2 FA--FECSKKLK------------------------------------------------ gm053391_Glyma1 FGVNMECASSA-----EDSKGLSSGSAAHVTT------------AASSSL--HQRLR--- gm008337_Glyma0 FGVNMECASSA-----EDSKELSSGSAAHVTT------------AASSSSLHHQRLRQQQ gm052668_Glyma1 FGVNMECQPDN-----DNDSQNSTHECSYTHL---YHHQTSSY-PSSNPH--HHMLPQQP gm017484_Glyma0 FGVNMECASSTS----EDPKCFSLLSSSSMAN------------SNSQPP--LQLLREDT gm003570_Glyma0 FS--LECSKKPK------------------------------------------------ gm043561_Glyma1 -----HCREKTKAIWGEHGMCF--------FN------------NIRRPP---QMLQLAV gm028283_Glyma1 FA--FECCKKLK------------------------------------------------ .* . AT5G06250.1 ------------------------------------------------------------ gm007617_Glyma0 ------------------------------------------------------------ gm001006_Glyma0 ---------IIGA--------------L-------------------------------- gm055124_Glyma2 ---------VIGA--------------L-------------------------------- gm053391_Glyma1 -------------------LPLPHEDPLSS--------SSARF----------GDHKGGS gm008337_Glyma0 QGLGITKGPVLGLRCCLIWIPLCN---LVSKLVGLATLSFAAFLLTLSLNNWPSGYKGIS gm052668_Glyma1 ------------------------------------------------------------ gm017484_Glyma0 ---------------------------LSS--------SSARF----------GDQRGVG gm003570_Glyma0 ---------IIGA--------------L-------------------------------- gm043561_Glyma1 ---------------------------LIF--------ING------------------- gm028283_Glyma1 ---------VIGA--------------L-------------------------------- AT5G06250.1 ------------------------ gm007617_Glyma0 ------------------------ gm001006_Glyma0 ------------------------ gm055124_Glyma2 ------------------------ gm053391_Glyma1 TGT------SLLFDLDPSLQYHRQ gm008337_Glyma0 SQTLFFFFSSSFFFLSVISTYK-- gm052668_Glyma1 ------------------------ gm017484_Glyma0 EP-------SMLFDLDPSLQYRQ- gm003570_Glyma0 ------------------------ gm043561_Glyma1 ------------------------ gm028283_Glyma1 ------------------------
|