Input
| Putative repression domain
|
|
AT5G06950.1 |
not found |
|
Ortholog
| Putative repression domain
| Reverse top hit
| Relation
| Blast score ratio
| Type
|
Sb007418 |
not found in 330aa |
AT3G12250.2 |
not_not |
0.777562862 |
III |
Sb003379 |
not found in 316aa |
AT1G68640.1 |
not_not |
0.593810444 |
III |
Sb031426 |
not found in 610aa |
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not_not |
0.582205029 |
III |
Sb028455 |
not found in 635aa |
AT1G08320.3 |
not_not |
0.578336557 |
III |
Sb018850 |
not found in 320aa |
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not_not |
0.568665377 |
III |
Sb026152 |
not found in 711aa |
AT1G08320.3 |
not_not |
0.537717601 |
III |
Sb024379 |
not found in 1126aa |
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not_not |
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III |
Sb021629 |
not found in 2063aa |
AT5G06950.4 |
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0.528046421 |
III |
Sb023083 |
not found in 636aa |
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III |
Sb030559 |
not found in 533aa |
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III |
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not found in 489aa |
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GIKTKGLCLTLVKARR in 351/595 |
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III |
Sb034022 |
not found in 657aa |
AT5G06839.1 |
not_not |
0.400386847 |
III |
Get sequence file
Get alignment file
Get formatted file made by BOXSHADE
Sequence file prepared (0 sec required). Alignment has started.
CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)
AT5G06950.1 ------------------------------------------------------------
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Sb007418_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
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Sb024379_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb030559_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
AT5G06950.1 ------------------------------------------------------------
Sb032677_Sorbi1 ---------------IHGTRTS-VDHG----MIGSDVDTESAGYLAARPP----------
Sb028455_Sorbi1 LR--RTQQQAATVSAPHHGDTKPFP------TAATTTATAATATTAARPP-P--------
Sb031426_Sorbi1 -----------------------FP------TAATVTA----ATTTARPP-P--------
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Sb026935_Sorbi1 ------------SSSVHGSIIE--------------------NVMLRKEPGGGYDM-AEF
Sb007418_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb026152_Sorbi1 LRGLRHQQQL------HSGNSQ---------SVGSTTDSSSAQNTMSQ------------
Sb018850_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb024379_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb030559_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
AT5G06950.1 ---------------------------------------------------MADTSPRTD
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Sb031426_Sorbi1 -------------------------TLDIFPAWPMRSLH-TPKEGSN---VTADSTDDSE
Sb034022_Sorbi1 DQ-ALLLYF-DGQQAKTSIQEQQPQTLNIFPSQPMHHIEPSPK-GSMASSSVV--AAQVA
Sb021629_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb003379_Sorbi1 -----------------------------------------------------------G
Sb023083_Sorbi1 DQSAIFLYLEDGHD-----QEQQRQTLNIFPSQPMHVAEPIPAKGVSMGMVTASMLPNGN
Sb026935_Sorbi1 DQ-ALFLYL-NSQDQASVIQD-QPQTLNIFPSQPMHVVEPAPKGGSMGTNNTASNAAAVA
Sb007418_Sorbi1 ---------------------------------------------------MADASPRTE
Sb026152_Sorbi1 --------------------------MELVS--------------------PASSAPRQE
Sb018850_Sorbi1 ---------------------------------------------------MAYASPGTD
Sb024379_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb030559_Sorbi1 -------------------------------------LRPRPR-----------------
AT5G06950.1 VSTDDDTDH-------PDLGSEGALVN-----------------------------TAAS
Sb032677_Sorbi1 -SVGSTTDSS-------------------------------------------------S
Sb028455_Sorbi1 SSSKNNSNHS-----SDQLGAAANMATQFDQAS---QQQQLQ------------HKNMAT
Sb031426_Sorbi1 SSSKNNSNH------SDQHGAAADMQSQFGQGSQQQQQQQLQ------------HKNMAT
Sb034022_Sorbi1 AAPSKNSQAPSL------MGGGGPLAAA-----GKSSKAAIKREGGTAGGKHGA--VGAS
Sb021629_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb003379_Sorbi1 VAITRSVDGH-------------------------------------------------E
Sb023083_Sorbi1 SSSPKRQEQGGQ--HRSVAAPAGPVVPLPSNNLAKDNRNSLTKKEETSG-------GKGA
Sb026935_Sorbi1 GSSSKQQQQPPPPPPPPNKDGGKP--------------AAVKREGSGGGAAMGS--GTPS
Sb007418_Sorbi1 TSTDDTDDNHG---LEPGPGALG----------------------------------VAS
Sb026152_Sorbi1 VMMVTTDDYS----YKPGLAAAPAAAAAPPPSFQQHHPLPLQLHGGDGGGGGGDH-DKRK
Sb018850_Sorbi1 TSTDLDTDE------KNQMLELGQLVS-----------------------------LTAS
Sb024379_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb030559_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
AT5G06950.1 DSSDRSKG--KM-DQKTLRRLAQNREAARKSRLRKKAYVQQLENSRLKLTQLEQELQ-RA
Sb032677_Sorbi1 GQNSMPQT--ELVSPGSMRADSGQRQEVLMVTVDDYNYEQGL-GAAATTAQIFQQHA-AG
Sb028455_Sorbi1 SSTPRTGK--PL-DPKVIRRLAQNREAARKSRLRKKAYIQQLESCKLKLSQMEQDMQ-RA
Sb031426_Sorbi1 SFTPRTGK--TP-DPKTIRRLAQNREAARKSRLRKKAYIQQLESSKLKLAQIEQDMQ-RA
Sb034022_Sorbi1 SSD--QEG-PRTPDPKTLRRLAQNREAARKSRLRKKAYIQQLESGRIRLAQLEQEMQ---
Sb021629_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb003379_Sorbi1 NSLPVCKV--ESRDHKAQRRLAQNREAARKSRMRKKAYIVELENSRSKLAQLEQELQ-RA
Sb023083_Sorbi1 ASAGIVQE--RVKDPKTLRRLAQNREAARKSRLRKKAYIQQLETSRIRLSQLEQQVQ-VA
Sb026935_Sorbi1 TSNNRQEGRPRTSDAKTLRRLAQNREAARKSRLRKKAYIQNLETSRIRLTQLEQDLHYRS
Sb007418_Sorbi1 DSSDRSKD--KHGDQKTLRRLAQNREAARKSRLRKKAYVQQLENSRLKLTQLEQELQ-RA
Sb026152_Sorbi1 HGSTRKDG--KLVDAKTERRLAQNREAARKSRLRKKAYVQQLETSRIRLQQVEHELQ-RA
Sb018850_Sorbi1 DSGNKSKD--KL-GQKT--SLVTDL----------MAYVEQLENSRLKLSQLEQELQ-RA
Sb024379_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb030559_Sorbi1 -------------------------------RRRRPAKRQDSETPRAEQRGSSEE---PA
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Sb032677_Sorbi1 QDKGLFPGGG-------GAPGDLSSG----AVIFDMEYARWLEDDTKH--------MTEL
Sb028455_Sorbi1 RSQGLFLGGG--------TGANTSSG----AAMFDVEYARWLDDHSRR--------LAEL
Sb031426_Sorbi1 HSQGIFLGGA--------PGANSSSG----AAMFDVEYARWLDDHGRR--------MAEL
Sb034022_Sorbi1 ------MARTHQG-ALWGAGTLSPD-----AALFNLEYERWLGEHSKV--------VARL
Sb021629_Sorbi1 ----------------------ASKG----AMTFDLEYSRWQEDQNKQ--------MNEL
Sb003379_Sorbi1 RQQGMFIASGRS-----GDHGGSTGG----ALAFDLEYARWLDEHQHH--------MNDL
Sb023083_Sorbi1 RVQGVFLGTGEQ-----PGFSSAPSP----AAVFDVEYGRWVEEHSKL--------MFQL
Sb026935_Sorbi1 RTQVTFLRKKQQH-RL-----IIKDGK--KAAWFDMEHARWQEEHGKM--------MRHL
Sb007418_Sorbi1 RQQGIFISSSVD-----QSHSMSGNG----ALAFDMEYARWLEEHNRQ--------ISEL
Sb026152_Sorbi1 RSQGLFVGGC-------SAAGDMSSG----AAMFDMEYARWLDDDSKR--------LAEL
Sb018850_Sorbi1 RQQGIFIPTPGD-----QPNSTTENG----ALAFDMDYARWQDDHNKQ--------INEL
Sb024379_Sorbi1 ----------------------TFKG----ALTFDIEYARWLEDQNKQ--------INEL
Sb030559_Sorbi1 PEEGVHPESRDEPDEAGAAGAGAHHGQAPAAAAAARRVRRWRRRRRSRGGGGRGPAGGRV
* ** :
AT5G06950.1 RSALNA------HAGDSE----------LRIIVDGVMAHYEELFRIKSNAAKNDVFHLLS
Sb032677_Sorbi1 QAVLQP------QIIDAN----------LGAIVEECMRHYDELFHLRAMLARSDVFHLMT
Sb028455_Sorbi1 NGALHA------HLADGD----------LRAIVDDALTHHDELFQLKAMAAKSDVFHLIT
Sb031426_Sorbi1 HGALHA------HLPDGD----------LRAIVDDTLTHHDELFQLKASAAKSDVFHLIT
Sb034022_Sorbi1 RAAAEE-----HHRPDGE----------LRAYVDEAAAHYGALMGHKARVAGADPLHLLS
Sb021629_Sorbi1 RTAVNA------HASDSD----------LRLIVDGIMAHYDEIFRLKGIAAKADVFHILS
Sb003379_Sorbi1 RVALSA------QIGDDD----------LGVLVDGVMLHYDEMFRLKGVATRTDVFHVLS
Sb023083_Sorbi1 RAALSE------HLADEQ----------LQSFVNGGMAQHEELLNLKGAMARADVFHLLS
Sb026935_Sorbi1 RAALEA-----EHAASAASTSTAAEAQLLRQLVDAAAAHHGVLAELKAVAARADAFHLVS
Sb007418_Sorbi1 RAGVSA------HASDTD----------LRSVVDKIMSHYDEIFRLKGNAAKADVFHVLS
Sb026152_Sorbi1 RAGLQA------QLLDGN----------LGLIVEECMQHYDELFQLKAALARSDVFHLLT
Sb018850_Sorbi1 RAALNA------HASDDD----------LRHMIDSIMAYYSEAFRLKRVAAKADAFHVLS
Sb024379_Sorbi1 RTAVNA------HASDSD----------LRLIVDGIMAHYDEIFKVKGVAAKADVFHILS
Sb030559_Sorbi1 RAGVRALGGGAGEAGDGAAG--------GAAVARAGGAAAGARRRRAGALRRA-----VP
. . . :.
AT5G06950.1 GMWKTPAERCFL-WLGGFR-SSELL----------------------------KLLANQL
Sb032677_Sorbi1 GLWATTAERCFL-WMGGFR-PSEIL----------------------------KMLIPQL
Sb028455_Sorbi1 GVWTTPAERCFL-WMGGFR-PSDLL----------------------------KTLLPQL
Sb031426_Sorbi1 GVWTTPAERCFL-WMGGFR-PSDLV----------------------------KTLLPQL
Sb034022_Sorbi1 GLWKGAAERCFL-WIGGFR-PSELV----------------------------KVVVRHV
Sb021629_Sorbi1 GMWKTPAERCFL-WLGGFR-SSELL----------------------------KLLVNQL
Sb003379_Sorbi1 GMWMSPAERFFM-WLGGFR-SSELL----------------------------KVVARQV
Sb023083_Sorbi1 GVWVSPAERCFL-WLGGFR-PSEVI----------------------------KVMLKHV
Sb026935_Sorbi1 GAWASAAERCFL-WIGGFR-PSELIKNLAKLEIYGIKTKGLCLTLVKARRVLLKIAARHA
Sb007418_Sorbi1 GMWKTPAERCFL-WLGGFR-PSEVL----------------------------KLLSTQL
Sb026152_Sorbi1 GAWATAAERCFF-WMGGFR-PSELL----------------------------KILIPQL
Sb018850_Sorbi1 GMWKTPVERCFM-WFGGLR-PSEIL----------------------------KLLASHL
Sb024379_Sorbi1 GMWKTPAERCFL-WLGGFR-PSELL----------------------------KLLANHL
Sb030559_Sorbi1 GQGAGGAVRRLLRAVGGVAGPRGAV----------------------------LPLDRRV
* . * :: .**. . : :
AT5G06950.1 EP-M-TERQLMGINNL----------QQTSQQAEDALSQGMESLQQSLADT---------
Sb032677_Sorbi1 DP-L-TEPQLLGMYNL----------QRSSEQTEEALGQGLQQLHQSLADA---------
Sb028455_Sorbi1 DP-L-TEQQVIGICNL----------QQSSQQAEEALSQGLEQLHQSLADT---------
Sb031426_Sorbi1 DP-L-TEQQLVGICNL----------QQSSQQAEEALSQGLDQLHQSLADT---------
Sb034022_Sorbi1 EP-LAAEQQAAGARDV----------EQAARRAEEALDAELEALLRSLSEV---------
Sb021629_Sorbi1 EP-L-TEQQLMGLSNL----------QQSSQQAEDALSQGMEALQQSLAET---------
Sb003379_Sorbi1 EPQL-TEQQLVGICSL----------QQSLQQAEDALSQGMEALQQGLGDT---------
Sb023083_Sorbi1 EP-L-SEGQILGIYQL----------QQLVQEREEALNHSMEATQQNISDI---------
Sb026935_Sorbi1 EP-L-TEQQAMGVCGV----------QQWARDAEAALDHELQAMHRSVSEA---------
Sb007418_Sorbi1 EP-L-TEQQLSGIGNL----------QQSSQQAEDALSQGMEALQQSLAET---------
Sb026152_Sorbi1 DP-L-TEQQLLGICNL----------QQSSEQAEEALAQGLHQLHQSLADT---------
Sb018850_Sorbi1 EP-L-TEQQLASIYSL----------QQSSEQAEEDLSQGVRALQQSVAET---------
Sb024379_Sorbi1 EP-L-TEQQMLGLNNL----------QQSSQQAEDALSQGMEALQQSLAET---------
Sb030559_Sorbi1 PP-L-RAAQGAGAAAEPAHGPPGGRGAQAAEHGEAAGGRAVAGHEQAAADARRRPHDRRR
* : * . : . * : : .:
AT5G06950.1 -LS-------------SGTL----------------------------------------
Sb032677_Sorbi1 -VGA------------SPLS----------------------------------------
Sb028455_Sorbi1 -MAG------------GSLI----------------------------------------
Sb031426_Sorbi1 -MAG------------GSLI----------------------------------------
Sb034022_Sorbi1 -VSSDAQPPPPGMMYGGQLY----------------------------------------
Sb021629_Sorbi1 -LA-------------GSLGPSGSSGNVANYMGQMAMAMGKLGTLENFLRQLLVNQLEPL
Sb003379_Sorbi1 -LAA------------AAPA----------------------------------------
Sb023083_Sorbi1 -VA---------------------------------------------------------
Sb026935_Sorbi1 -VSSDA----------AALL----------------------------------------
Sb007418_Sorbi1 -LA-------------GSLS----------------------------------------
Sb026152_Sorbi1 -VAT------------GTLN----------------------------------------
Sb018850_Sorbi1 -LAS------------GSLC----------------------------------------
Sb024379_Sorbi1 -LA-------------GSLG----------------------------------------
Sb030559_Sorbi1 RLAARRRRRVR-----GAAD----------------------------------------
:.
AT5G06950.1 ------------------------------------------------------------
Sb032677_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb028455_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb031426_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb034022_Sorbi1 -----------------------------------------HP-----------------
Sb021629_Sorbi1 TEQQLMGLSNLQQSSQQAEDALSQGMEALQQSLAETLAGSLGPSGSSGNVANYMGQMAMA
Sb003379_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb023083_Sorbi1 -----------------------------------------AP-----------------
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Sb007418_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
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Sb024379_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb030559_Sorbi1 -----------GQRRRQAR----------------------RP-----------------
AT5G06950.1 ------------------------------------------------------------
Sb032677_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb028455_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb031426_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb034022_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb021629_Sorbi1 MGKLGTLENFLRQLLVNQLEPLTEQQLMGLSNLQQSSQQAEDALSQGMEALQQSLAETLA
Sb003379_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb023083_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
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Sb024379_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb030559_Sorbi1 ------------------------RRLRG-------------------------------
AT5G06950.1 ----GSSSSGNVAS----------------------------------------------
Sb032677_Sorbi1 ----------DGAN----------------------------------------------
Sb028455_Sorbi1 ----------DDAN------MS--------------------------------------
Sb031426_Sorbi1 ----------DDTN------MS--------------------------------------
Sb034022_Sorbi1 ------------AD----------------------------------------------
Sb021629_Sorbi1 GSLGPSGSSGNVANYMGQMAMAMGKLGTLENFLRQLLVNQLEPLTEQQLMGLSNLQQSSQ
Sb003379_Sorbi1 ----APGPSASAADS---------------------------------------------
Sb023083_Sorbi1 ----------DVAP----------------------------------------------
Sb026935_Sorbi1 -----------YSD----------------------------------------------
Sb007418_Sorbi1 ----SSGSTGNVAN----------------------------------------------
Sb026152_Sorbi1 ----------DGAA----------------------------------------------
Sb018850_Sorbi1 ----PAGSSGNAAD----------------------------------------------
Sb024379_Sorbi1 ----PSGSSGNVANYMGQMAMAMGKLGTLENFLRQLLANHLEPLTEQQMLGLNNLQQSSQ
Sb030559_Sorbi1 --QGGPSPAADAAE----------------------------------------------
:
AT5G06950.1 -------------------------------------YMGQ----MAMAMGKLGTLEGFI
Sb032677_Sorbi1 ----------------------------------VANYTAL----MALALDRLDTLESFY
Sb028455_Sorbi1 -------------------------------------FMSQ----MALALGKLANLEGFV
Sb031426_Sorbi1 -------------------------------------FMGQ----MALALGKLSNLEGFV
Sb034022_Sorbi1 ----------------------------------VAGYMGMGHMHVAVAMDKVASLGTIL
Sb021629_Sorbi1 QAEDALSQGMEALQQSLAETLAGSLGPSGSSG-NVANYMGQ----MAMAMGKLGTLENFL
Sb003379_Sorbi1 ----------------------------------VTNYMGQ----MAVAMSKLATVENFL
Sb023083_Sorbi1 -----------------------------------ATFMGH----MSLAMNKVAAMESFV
Sb026935_Sorbi1 ----------------------------------VPGFMAT----MSLAISKLASLEAFV
Sb007418_Sorbi1 -------------------------------------YMGQ----MAMAMGKLGTLENFL
Sb026152_Sorbi1 ----------------------------------TPNYMNI----MAVAIDKLACLENFY
Sb018850_Sorbi1 -------------------------------------CSGQ----MAVAVGKLGTLESFL
Sb024379_Sorbi1 QAEDALSQGMEALQQSLAETLAGSLGPSGSSG-NVANYMGQ----MAMAMGKLGTLENFL
Sb030559_Sorbi1 HAQD-------------PDAAAGGAGPARARGLRPAAARAQ----LALGGAPAGAGVSVT
:::. .
AT5G06950.1 RQ-------ADNLRLQTLQQMIRVL--------TTRQ--SARALLAIHDYFSRLRALSSL
Sb032677_Sorbi1 RQ-------ADSLRQQTLHQMRRIL--------TTRQ--TARCFLSISEYHRRLRALSSV
Sb028455_Sorbi1 IQ-------ADNLRQQTLHQMHRIL--------TVRQ--AARCFLAIGEYHNRLRALSSL
Sb031426_Sorbi1 IQ-------ADNLRQQTLHQMHRIL--------TVRQ--AARCFLAIGEYHNRLRALSSL
Sb034022_Sorbi1 RQ-------ADELRMQALHALRQIL--------TARQ--AARCFIAADDYFCRLRTLSTL
Sb021629_Sorbi1 RQ-------ADNLRQQTLHQMQRIL--------TIRQ--AARALLAIHDYFSRLRALSSL
Sb003379_Sorbi1 RQ-------ADLLRQQTLKQVHRIL--------TTRQ--AARALLVVSDYFSRLRALSSL
Sb023083_Sorbi1 MQ-------ADGLRQQTLHKLHHIL--------TTRQ--AARCLLAIADYFHRLRALSTL
Sb026935_Sorbi1 RQ-------ADALRLQALHRLPQIL--------TARQ--SARCFLAIADYSHRLRALSEL
Sb007418_Sorbi1 RQ-------ADNLRLQTLQQMQRIL--------TTRQ--SARALLVISDYSSRLRALSSL
Sb026152_Sorbi1 QQ-------ADNLRQQTLHQMRRIL--------TTRQ--AARCFLSIGEYYSRLRALSNL
Sb018850_Sorbi1 QE-------ADDLRRRILEQMQHIL--------TTRQ--SARALLAISDYLSRLRALSSL
Sb024379_Sorbi1 RQ-------ADNLRQQTLHQMQRIL--------TIRQ--ASRALLAIHDYFSRLRALSSL
Sb030559_Sorbi1 EHPRDGDGDGDGEEEAALQARARVVGFGCRPGRPAEQGCGGQCL-------SLLSFQLCI
. .* . *. ::: . .* .:.: * :
AT5G06950.1 WLARPRE-------------------------------------------
Sb032677_Sorbi1 WASRPPTESSVAAAAAAAGAENVSPATGTTSEQAALRPYNHQSQ-QFPGF
Sb028455_Sorbi1 WASRPREI--------LVNDEG---NCEEISIAA------QPSQSQFSAF
Sb031426_Sorbi1 WVSRPREI--------LGADEG---NCGEISIAA------QASQSQFSSF
Sb034022_Sorbi1 WTTS-------RTANLARGPAG----------------------------
Sb021629_Sorbi1 WLARPRE-------------------------------------------
Sb003379_Sorbi1 WLTRPTD-------------------------------------------
Sb023083_Sorbi1 WVARPRQ------------DDG--PGLQ----------------------
Sb026935_Sorbi1 WHTRPGQD--PAASNLAAGPSSQRP------------P--YQSRDGLL--
Sb007418_Sorbi1 WLARPKE-------------------------------------------
Sb026152_Sorbi1 WASRPRDN--------FIGTESLSPTATELQALH------HQQQNQFTGF
Sb018850_Sorbi1 WIARPRE-------------------------------------------
Sb024379_Sorbi1 WLARPRE-------------------------------------------
Sb030559_Sorbi1 WYSGTGNR-RVLLLALRMKPES-SNGVTVTAVN-----------------
* :
BoxShade v3.31 C (beta, 970507) Output
AT5G06950.1 |
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