Input
| Putative repression domain
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AT5G06960.1 |
not found |
|
Ortholog
| Putative repression domain
| Reverse top hit
| Relation
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| Type
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Sb007418 |
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not found in 468aa |
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not found in 635aa |
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III |
Get sequence file
Get alignment file
Get formatted file made by BOXSHADE
Sequence file prepared (0 sec required). Alignment has started.
CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)
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Sb003379_Sorbi1 -------------------------------------------NSLPVCKVESRDHKAQR
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Sb018850_Sorbi1 SLVTDL-------------------MAYVEQLENSRLKLSQLEQELQRARQQGIFIPT--
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Sb007418_Sorbi1 SVDQSH-SMSGNGALAFDMEYARWLEEHNRQISELRAGVSAHASDTDLRSVVDKIMSHYD
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Sb026152_Sorbi1 ---SAA-GDMSSGAAMFDMEYARWLDDDSKRLAELRAGLQAQLLDGNLGLIVEECMQHYD
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Sb028455_Sorbi1 ----TG-ANTSSGAAMFDVEYARWLDDHSRRLAELNGALHAHLADGDLRAIVDDALTHHD
Sb021629_Sorbi1 ---------ASKGAMTFDLEYSRWQEDQNKQMNELRTAVNAHASDSDLRLIVDGIMAHYD
. . : * .: : . :
AT5G06960.1 ELYRIKGNAAKSDVFHLLSGMWKTPAERCFLWLGGFR-SSELLKLIASQLEP-LTEQQSL
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Sb023083_Sorbi1 ELLNLKGAMARADVFHLLSGVWVSPAERCFLWLGGFR-PSEVIKVMLKHVEP-LSEGQIL
Sb026152_Sorbi1 ELFQLKAALARSDVFHLLTGAWATAAERCFFWMGGFR-PSELLKILIPQLDP-LTEQQLL
Sb018850_Sorbi1 EAFRLKRVAAKADAFHVLSGMWKTPVERCFMWFGGLR-PSEILKLLASHLEP-LTEQQLA
Sb028455_Sorbi1 ELFQLKAMAAKSDVFHLITGVWTTPAERCFLWMGGFR-PSDLLKTLLPQLDP-LTEQQVI
Sb021629_Sorbi1 EIFRLKGIAAKADVFHILSGMWKTPAERCFLWLGGFR-SSELLKLLVNQLEP-LTEQQLM
* : .**. . : : :: * * *
AT5G06960.1 DINNL----------QQSSQQAEDALSQGMDNLQQSLADTLS------------------
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Sb021629_Sorbi1 GLSNL----------QQSSQQAEDALSQGMEALQQSLAETLAGSLGPSGSSGNVANYMGQ
. * :. * :.: .* .:
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Sb023083_Sorbi1 -----------------------------------------------APDVAPA------
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Sb007418_Sorbi1 A----NYMGQMAMAMGKLGTLENFLRQADNLRLQTLQQMQRILTTRQSARALLVIS----
Sb031426_Sorbi1 S-----FMGQMALALGKLSNLEGFVIQADNLRQQTLHQMHRILTVRQAARCFLAIG----
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Sb023083_Sorbi1 -----TFMGHMSLAMNKVAAMESFVMQADGLRQQTLHKLHHILTTRQAARCLLAIA----
Sb026152_Sorbi1 T---PNYMNIMAVAIDKLACLENFYQQADNLRQQTLHQMRRILTTRQAARCFLSIG----
Sb018850_Sorbi1 A----DCSGQMAVAVGKLGTLESFLQEADDLRRRILEQMQHILTTRQSARALLAIS----
Sb028455_Sorbi1 S-----FMSQMALALGKLANLEGFVIQADNLRQQTLHQMHRILTVRQAARCFLAIG----
Sb021629_Sorbi1 A----NYMGQMAMAMGKLGTLENFLRQADNLRQQTLHQMQRILTIRQAARALLAIH----
* . . .* ** ::*. * :
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Sb021629_Sorbi1 ---------------------DYFSRLRALSSLWLARPRE--------------------
: : ** : **
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BoxShade v3.31 C (beta, 970507) Output
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Sb008905_Sorbi1 |
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Sb007418_Sorbi1 |
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Sb031426_Sorbi1 |
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Sb024379_Sorbi1 |
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Sb003379_Sorbi1 |
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Sb023083_Sorbi1 |
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Sb026152_Sorbi1 |
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Sb018850_Sorbi1 |
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Sb028455_Sorbi1 |
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Sb021629_Sorbi1 |
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