Input
| Putative repression domain
|
|
AT5G13080.1 |
not found |
|
Ortholog
| Putative repression domain
| Reverse top hit
| Relation
| Blast score ratio
| Type
|
Pt004653 |
not found in 186aa |
AT5G13080.1 |
1st_1st |
0.665399239 |
Ia |
Pt027916 |
not found in 186aa |
AT5G13080.1 |
not_1st |
0.653992395 |
II |
Pt010645 |
not found in 157aa |
AT5G13080.1 |
not_1st |
0.638783269 |
II |
Pt023442 |
not found in 186aa |
AT5G13080.1 |
not_1st |
0.600760456 |
II |
Pt026972 |
not found in 178aa |
AT5G13080.1 |
not_1st |
0.581749049 |
II |
Pt038469 |
not found in 193aa |
AT1G64000.1 |
not_not |
0.528517110 |
III |
Pt017333 |
not found in 189aa |
AT5G41570.1 |
not_not |
0.528517110 |
III |
Pt039726 |
not found in 318aa |
AT2G47260.1 |
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0.433460076 |
III |
Pt016839 |
not found in 290aa |
AT2G47260.1 |
not_not |
0.433460076 |
III |
Pt041044 |
not found in 368aa |
AT5G49520.1 |
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0.433460076 |
III |
Pt016526 |
not found in 228aa |
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not_not |
0.433460076 |
III |
Pt038514 |
not found in 203aa |
AT2G44745.1 |
not_not |
0.429657794 |
III |
Pt034664 |
not found in 374aa |
AT5G49520.1 |
not_not |
0.429657794 |
III |
Pt030519 |
not found in 312aa |
AT4G18170.1 |
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0.418250950 |
III |
Pt025488 |
not found in 315aa |
AT4G18170.1 |
not_not |
0.414448669 |
III |
Pt040780 |
HLQGYNLTLSLPSSSD in 264/303 |
AT4G18170.1 |
not_not |
0.414448669 |
III |
Pt003239 |
not found in 535aa |
AT2G03340.1 |
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0.410646387 |
III |
Pt041962 |
not found in 293aa |
AT1G69310.2 |
not_not |
0.410646387 |
III |
Pt034483 |
not found in 293aa |
AT1G69310.2 |
not_not |
0.410646387 |
III |
Pt019362 |
not found in 482aa |
AT2G03340.1 |
not_not |
0.406844106 |
III |
Pt028618 |
not found in 731aa |
AT5G56270.1 |
not_not |
0.406844106 |
III |
Pt025074 |
not found in 725aa |
AT5G56270.1 |
not_not |
0.406844106 |
III |
Pt037066 |
not found in 233aa |
AT4G39410.1 |
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III |
Pt037065 |
not found in 233aa |
AT4G39410.1 |
not_not |
0.403041825 |
III |
Pt000454 |
not found in 232aa |
AT4G39410.1 |
not_not |
0.403041825 |
III |
Get sequence file
Get alignment file
Get formatted file made by BOXSHADE
Sequence file prepared (1 sec required). Alignment has started.
CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)
AT5G13080.1 ------------------------------------------------------------
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pt028618_POPTR_ -----------------MAGIDDNVAII------GDWVPPSPSPRAFFSVMLGDDINSST
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pt034483_POPTR_ -----------------MDDRDN----------------LDPGTE---------------
pt038514_POPTR_ ------------------------------------------------------------
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pt040780_POPTR_ ---------------MSNEHRD--------------------------------------
pt000454_POPTR_ -----------------MATTSQAT-----------------------------------
pt003239_POPTR_ -----------------MAEKQQNLTTAPAPARPTITLPPRPSMETLFTGGL--------
pt038469_POPTR_ -----------------MEGHEA-------P-------PPPPQLPQLA------------
pt041962_POPTR_ -----------------MDDTEN----------------PDPGTE---------------
pt039726_POPTR_ -----------------MERKE--------------------------------------
pt019362_POPTR_ -----------------MAEKQENPTTA-APAKPTITLPPRPSMETLFTGGL--------
pt026972_POPTR_ ---------------MPMEKYQI-------------------------------------
pt041044_POPTR_ MNEMKQNHNISIVRINSVEKREE----------------KKELTR---------------
pt037065_POPTR_ -----------------MAAAPQATV----------------------------------
AT5G13080.1 ------------------------------------------------------------
pt025074_POPTR_ IPESPGEKRNEGLYL-GQ-------PEQMATGNSEKKDGAQTSGVQLTELGTFSEQ---K
pt027916_POPTR_ ------------------------------------------------------------
pt016526_POPTR_ ----------------GQRSFLI-----------------------------RMDHGERD
pt016839_POPTR_ -------VVKVEKFD-GSPAF-----------------------------STTNDH----
pt017333_POPTR_ -------------------------PS---------------------------------
pt030519_POPTR_ -------------FY-YHTPF-------------------------------QEDH----
pt023442_POPTR_ ------------------------------------------------------------
pt037066_POPTR_ -----------------------------------------------------LNQ----
pt028618_POPTR_ ITEPPGENRTKGLFL-GQ-------PEQMTTGNAEKKDGARTSGAQLTELGSFSEQ---K
pt010645_POPTR_ ------------------------------------------------------------
pt004653_POPTR_ ------------------------------------------------------------
pt034664_POPTR_ ------TTLKTENFNMANTSFITPPPP------------------PPATTTSDIDQ----
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pt038514_POPTR_ -----------------------------------------------------MDQGGRE
pt025488_POPTR_ -------------LY-CHTPF-------------------------------QEDH----
pt040780_POPTR_ -------------LY-CHTPF-------------------------------QEDH----
pt000454_POPTR_ -----------------------------------------------------LNQ----
pt003239_POPTR_ ---SPGPMTLVSSFF-ADSPY----PESDYRSFSQLLAGAMAS--PIASPAFFNDH---S
pt038469_POPTR_ -------------------------PS---------------------------------
pt041962_POPTR_ -------------FT-SESSW---------------------------TLGPDSDR----
pt039726_POPTR_ -------AVKVENFV-GSPTF-----------------------------SSTTDH---V
pt019362_POPTR_ ---SPGPMTLVSSFF-ADTPY----PESDYPSFSQLLA----------------ED---G
pt026972_POPTR_ ------------------------------------------------------------
pt041044_POPTR_ ------TALKTENFNMANSTFITPPP------------------------TSDIDH----
pt037065_POPTR_ -----------------------------------------------------LNQ----
AT5G13080.1 ------------------------------------------------------------
pt025074_POPTR_ S-NFRGGLVERIAARA-----GFNAPRLNTESIRSTESSMNPEI-RSPYLTIPPGLSP-T
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pt010645_POPTR_ ------------------------------------------------------------
pt004653_POPTR_ -------------------------------------------------------LFP-F
pt034664_POPTR_ M------------------PSVFALSTT------------------------ATPPPPLN
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AT5G13080.1 ------------------------------------------------------------
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pt034664_POPTR_ SIFDMMPFDI-IG-GDQKAGSLGFTDLLDINQDFG----------------AAA-SL---
pt034483_POPTR_ SIL----------------SEFGW----NLQSDE------------------PS-RI---
pt038514_POPTR_ GFVQFEEN----QVLS-------F--------------------------LAPSQSS---
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pt040780_POPTR_ SILDSSTYN-SPGQGFDPSPYMSFSEYLHGSLDFN----------------SLA-KA---
pt000454_POPTR_ GFFSFPPHLTYPQSASCHQSLKGF--------------------------IIPP-SL---
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pt037065_POPTR_ GFFSFPSHLTYPQLGSCHQSSKGF--------------------------IIPP-SL---
AT5G13080.1 ------------------------------------------------------------
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pt034483_POPTR_ ----------------------------------KDLDRIEA-E-ER--SDSAGNLEIQR
pt038514_POPTR_ ----------------------------------QISQPLNT-NTTT--NSHMGFSHNDE
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pt040780_POPTR_ ----------------------------------FGLSP------SS--SEVFSSIEGNS
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pt019362_POPTR_ -------------TAAKELLTQYPSFNPGEALQQQQLMPPST-SDAQ--NSMVEPAEFSH
pt026972_POPTR_ -------------------------------------------NMAN-------------
pt041044_POPTR_ ----------------------------------FEWF-------NQ--NPVVGSPQQQQ
pt037065_POPTR_ ----------------------------------AADAPSTT-NIAE--TLLLSSATHKQ
AT5G13080.1 ------------------------------------------------------------
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pt017333_POPTR_ ------------------------------------------------------------
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pt037066_POPTR_ ------------------------------------------------------------
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pt040780_POPTR_ ------------------------------------------------KPMEAGVLGC--
pt000454_POPTR_ ------------------------------------------------------------
pt003239_POPTR_ --SER--------------------KYQPP------------------AAVDKPTHDGYN
pt038469_POPTR_ ------------------------------------------------------------
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pt039726_POPTR_ ------------------------------------------------EVVDSP------
pt019362_POPTR_ --SER--------------------KYQPP------------------AG-DKPTDDGYN
pt026972_POPTR_ ------------------------------------------------------------
pt041044_POPTR_ ------------------------------------------------SFVPSPASTV--
pt037065_POPTR_ ------------------------------------------------------------
AT5G13080.1 ---------------MEGYDNGSLYA----------------------------------
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pt023442_POPTR_ --------------PLIYFHGENEN-----------------------------------
pt037066_POPTR_ -----------------------------------REGTFASDL----------------
pt028618_POPTR_ FRKYGQKQVKGSEYPRSYYKCTHPNCSVKKKVERSLEGHIT-EIIYKGAHSHPKPLPNRR
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pt038469_POPTR_ ------------------------------------------------------------
pt041962_POPTR_ -------------------------------------GGGA-DV----------------
pt039726_POPTR_ ----------------------------------------P-EVL---------------
pt019362_POPTR_ WRKYGQKPIKGSEYPRSYYKCTHLNCLVKKKVERSSDGQIT-EIIYKGQHNHD--QLNKL
pt026972_POPTR_ --------------PLIYFHGDSEN-----------------------------------
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pt037065_POPTR_ -----------------------------------REGTFASDL----------------
AT5G13080.1 ------------------------------------------------------------
pt025074_POPTR_ SATGSMDTQLDIPEQAGPQVGAVNDSVWAGTQKGTAAGTPDWRNDNVEVSSSASGGLGPE
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pt003239_POPTR_ SKDCN-DSNGSIHLQSKP-----------------------------EVGSQAQAGNAIK
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pt019362_POPTR_ SKDGD-DSNGSIHSQSKP-----------------------------EVVSQA-------
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pt025074_POPTR_ F----------GNPSSSVQGQSGT---------PFESADAVDASSTFSNDEDDDRATHGS
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pt016526_POPTR_ --------KASSDENCTGNANNDGNNSW-W------------RSSSADKN----------
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pt017333_POPTR_ ---------WVGLLSGQSGL-------------GENRPFMDSASMVAENGAEEE------
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pt037066_POPTR_ --------HLLSLQRSRANL-------WAWGEVNECLSR--KRSGSGEDHLGLSSIKM--
pt028618_POPTR_ F----------GNPSSSVQAQSGT---------PFESADAIDASSTFSNDEDDDRATHGS
pt010645_POPTR_ --------GLLGLMQEMQAP-------------ASLNFDDISQNRGF-VGSGIEG-----
pt004653_POPTR_ --------GFSGSKKENYHLVPRT--------SSEINKDLNSQGASFGIGSPTEL-----
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pt034483_POPTR_ -----------STTNYP-SVSSSS---------SEDPPE--KSTDSGGKPPEIPST----
pt038514_POPTR_ --------KPSSDENCTGNANNDGNNSW-W------------RSSSSEKN----------
pt025488_POPTR_ -----------ATPNS--SLSFSS---------SEAGGD--EDSGKTKKETQPSRPEDG-
pt040780_POPTR_ -----------ATPNS--SLSFSS---------SEVGGD--EDSGKTKKETQPSRPEDG-
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pt003239_POPTR_ LTETLPAHSVIGRDQESTQADPSE---------PPGPSDSEEAGDAAVQEEE--------
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pt041962_POPTR_ -----------STSNYP-SVSSSS---------SEDQPD--KSTGSGGKPPEIPST----
pt039726_POPTR_ -----------ATPNSS-SISSAS---------SEGLND--EPANKGVDNEVEEQGK---
pt019362_POPTR_ ------------------HADPSE---------PPGSSDNEEAGNAAVQEEE--------
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pt041044_POPTR_ -----------ATPNSSASISSSS---------NEAGEDAFQQVKAGDQEEEQDQDK---
pt037065_POPTR_ --------HLLSLQRSRANL-------WAWGEVNECLSR--KRSGSGEDHLGLSSIKM--
AT5G13080.1 ---------ESSKK----------------KGKKQ-----RYAFQTRSQVDILDDGYRWR
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