Input
| Putative repression domain
|
|
AT5G13080.1 |
not found |
|
Ortholog
| Putative repression domain
| Reverse top hit
| Relation
| Blast score ratio
| Type
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Os003720 |
not found in 254aa |
AT5G41570.1 |
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not found in 207aa |
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not found in 250aa |
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not_not |
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III |
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not found in 290aa |
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0.418250950 |
III |
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not found in 529aa |
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not_not |
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III |
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not found in 337aa |
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0.406844106 |
III |
Os022851 |
not found in 228aa |
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not_not |
0.406844106 |
III |
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AT2G03340.1 |
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III |
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0.403041825 |
III |
Os003133 |
not found in 220aa |
AT1G29860.1 |
not_not |
0.403041825 |
III |
Get sequence file
Get alignment file
Get formatted file made by BOXSHADE
Sequence file prepared (0 sec required). Alignment has started.
CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)
AT5G13080.1 ----MEG-----------------------------------------------------
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Os028896_Os07t0 ----MAAARRVAGGGGGSLWGPPQPPPSTGGGIPQLPAAAAAPVEGLLD-----------
Os041202_Os12t0 ----MSA--------------RPPPPPRPRLALP--PRSAA---ESLFTGAGDASPGPLT
AT5G13080.1 ------------------------------------------------------------
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Os018301_Os04t0 YAPL--------------------------------------CPYTPPSPPS--------
Os003720_Os01t0 ----------------------------------------------PSPPPL--------
Os028896_Os07t0 -APF----SSSSGGGGGG---------------------------WPPPPP---------
Os041202_Os12t0 LASALFPSDPDGGGGGGGVMTSSSSSAAGATSFTQLLIGNLSAPPPPPPPPQQQQQREAA
AT5G13080.1 -------------------------------------------YDNGSLYA---------
Os023009_Os05t0 -------------------AGAG----------------AGAGDDDGVGLI---------
Os026670_Os07t0 --------------AYADSSAIF----------------AELGWANGLAVVDAVGE----
Os022851_Os05t0 ------------------------------------------------------------
Os003133_Os01t0 ------------------------------------------------------------
Os022505_Os05t0 -------------------------------------------QQHGRLLI---------
Os002550_Os01t0 -----------------------------EDVVDDDDDMAAVADAVSSYLSFDMDDV---
Os018301_Os04t0 --------------FLAPLPSLQHKLPQLPQLV--HDHAAATGTNHGVMFSSDHGC----
Os003720_Os01t0 --------------AVAPAASAT----------------TSDGHQHGPLEVLEQ------
Os028896_Os07t0 -----------------PLSGTA----------------VLIGYPQGNFETFPQQD----
Os041202_Os12t0 RGGGVARAGPALSVAPPPTAGSVFTVP--PGL-----SPSGLLDSPGLLFSPAMFDAFDV
AT5G13080.1 ----------P--------------------FLSLKSHSK----------PEL-------
Os023009_Os05t0 ---------TP--------------------YSSITDYLQGFL-----QDP---------
Os026670_Os07t0 --------LLP---------------------------------------PLDPPGELA-
Os022851_Os05t0 ------------------------------------------------------------
Os003133_Os01t0 ------------------------------------------------------------
Os022505_Os05t0 --------------------------------------------------PQLPAAYLAS
Os002550_Os01t0 ------EYYTP------EVGF----------------HSK------QHNPPPVAAAPLE-
Os018301_Os04t0 --------LYP-------------------------------------LLPGIPF-----
Os003720_Os01t0 ----------P--------------------PCSNNLHPDGLV-----DGPQLAATTAVP
Os028896_Os07t0 --------LVP--------------------LTAQEVHSKCITFGRAENLPFIPLATSAL
Os041202_Os12t0 LDMFIPDKILPKRATRIKGGFGMSHREALAQVTAQASHSPLRMFDHT-EQPSFSAAPTSS
AT5G13080.1 ------------------------------------------------------------
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Os026670_Os07t0 --------------------------------------TPPPPPLD--------------
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Os028896_Os07t0 VSQHTGSSSVNVTPLQEILTSPSQISNVNTESIGVLQGLPASSIVLDRPTDDGYNWRKYG
Os041202_Os12t0 EAMQHMNAAVNMTGISDMVMGPTNNENVAFQPAEASQRYQVNAPVD-KPADDGYNWRKYG
AT5G13080.1 ------------------------------------------------------------
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Os028896_Os07t0 QKAVKGGEYPKSYYKCTHLNCLVRKNVEHSADGRIVQIIYRGQHTHERPSKRRFKDCGGI
Os041202_Os12t0 QKVVKGSDCPRSYYKCTHPNCPVKKKVEHAEDGQISEIIYKGKHNHQRPPNKRAK-----
AT5G13080.1 -------------------------------------------HQGEEE-----------
Os023009_Os05t0 ----GDAAVKHETVVDHPSQAGGVAAAPATPNSSVLSSSSE--AAGGDDLRR---CKKGR
Os026670_Os07t0 --------------------------LPETPAGSSADGAAS--SCSTDDADGGK------
Os022851_Os05t0 ------------------------------------------------------------
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Os022505_Os05t0 ----DDWAASL-----------------ILPDGGSAAAG-----VGEDDLGGGVMAAAAA
Os002550_Os01t0 -------------------------------------------AGGGREQSR--------
Os018301_Os04t0 ----------------------------CLDSGCGAA------ACDDDKPAGFAHLGSAE
Os003720_Os01t0 -----DWQSLLQTCLQVPP--------PVLEQQQPAAAAQADQYSGENDHGD----LQAA
Os028896_Os07t0 SDDLDDFSGTTGTSVRSQPDYDDYCRKPIIPSGTMVAPLVKKIEDGDDQLSG--------
Os041202_Os12t0 -------------------------------DGSSSAADQN--EQSNDTVSGLSGIKRDQ
AT5G13080.1 ----------------SSKVRSEGCS--------KSVESSKKKGK---------------
Os023009_Os05t0 RPEDEEEEEID-----DEGSAVQSCK--------TNKMKNKKGAK------------KER
Os026670_Os07t0 ----------------PAAASTEAAS--------KSLTPGKKRAR---------------
Os022851_Os05t0 ------------------------------------------------------------
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Os022505_Os05t0 ESSCGGSSTVTSSGVTEAAAAAATTT--------RRGRGNGKKAGG-----------GGR
Os002550_Os01t0 ----------------REAAVNLGKMDRGP----APVSGGAATGG---------VPRSKN
Os018301_Os04t0 ADTSAAAARVDS----EIAAAATATTCHGPNSWWKGTEKGKMKVR-----------RKMR
Os003720_Os01t0 ESSGAGNK--------EKQVMAKGGA--------GRPSGTKKKAS---------------
Os028896_Os07t0 -SSDNQDEHD------DEVRTSDGAS--------GDASANERNVP-------------AP
Os041202_Os12t0 EAIYGMSEQLS--GLSEGDDMDDGES--------RPHEADDKESDSKKRNIQISSQRTSA
AT5G13080.1 KQRYAFQTRSQVDILDDGYRWRKYGQKAVKNNKFPRSYYRCTYGGCNVKKQVQRLTVDQE
Os023009_Os05t0 EPRVAFMTKSEVDHLEDGYRWRKYGQKAVKNSSYPRSYYRCTAPRCGVKKRVERSEQDPS
Os026670_Os07t0 QPRFAFMTKSEIDHLEDGYRWRKYGQKAVKNSPFPRSYYRCTNSKCTVKKRVERSSDDPS
Os022851_Os05t0 ------MTKSEVDHLEDGYRWRKYGQKAVKNSPFPRSYYRCTTQKCPVKKRVERSYQDAA
Os003133_Os01t0 ------MTKSEVDHLEDGYRWRKYGQKAVKNSPYPRSYYRCTTQKCPVKKRVERSYQDPA
Os022505_Os05t0 TPRFAFHTRSENDILDDGYRWRKYGQKAVKNSDFPRSYYRCTHHTCNVKKQVQRLAKDRG
Os002550_Os01t0 GSKIAFKTRSEVDVLDDGYRWRKYGKKMVKNSPNPRNYYRCSSEGCRVKKRVERARDDAR
Os018301_Os04t0 EPRFCFQTRSDVDVLDDGYKWRKYGQKVVKNSLHPRSYYRCTHNNCRVKKRVERLSEDCR
Os003720_Os01t0 RPRFAFQTRSDNDILDDGYRWRKYGQKAVKNSKHPRSYYRCTHHTCNVKKQVQRLAKDTS
Os028896_Os07t0 GQKIIVSTTSEIDLLDDGYRWRKYGQKVVKGNPYPRSYYKCTYLGCDVKKQVERSVEEPN
Os041202_Os12t0 EAKIIVQTTSEVDLLDDGYRWRKYGQKVVKGNPHPRSYYKCTYAGCNVRKHIERASSDPK
* *: * *:***:*****:* **.. **.**:*: * *:*:::* :
AT5G13080.1 VVVTTYEGVHSH---PI-------------------------------------------
Os023009_Os05t0 MVITTYEGQHTH---PSPVSYHMHRQQGLMHVSARGVMPGAAGA--------YQFGA---
Os026670_Os07t0 VVITTYEGQHSHHTVTFPRA--AATAAGFSHI---HAMAALAAAPFSAHQ--QLYSNLQ-
Os022851_Os05t0 VVITTYEGKHTH---PIP-----ATLRGTAHLL-------GAAA--AA----HHHGGLQY
Os003133_Os01t0 VVITTYEGKHTH---PIP-----ATLRGSTHLLAAHAQAAAAAA--AAHQLHHHHG----
Os022505_Os05t0 IVVTTYEGVHNH---PC-------------------------------------------
Os002550_Os01t0 FVVTTYDGVHNH---PAP-----------LHLRP--------------------------
Os018301_Os04t0 MVITTYEGRHTHT--PCS-----------------DDATTGAAGDHTAS-----------
Os003720_Os01t0 IVVTTYEGVHNH---PC-------------------------------------------
Os028896_Os07t0 AVITTYEGKHIH---DV-------------------------------------------
Os041202_Os12t0 AVITTYEGKHNHEP-PVGRG---------------NNQNAGNAAPSSSAQ----------
*:***:* * *
AT5G13080.1 -------------------------------------------EKSTENFEHILTQMQIY
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Os026670_Os07t0 --------------PPPP-------------------------------------TMPLA
Os022851_Os05t0 HHPGHFAAAVGHRLPPQPHDALGGGLLAP---------------PHAQHLHAMQHQMQLA
Os003133_Os01t0 HH-GHHGMA-----PPLP---LGSGAAAQFGRSSGIDVLSSF-LPRAAAAH---HGMTTM
Os022505_Os05t0 -------------------------------------------EKLMEALSPILRQLQLL
Os002550_Os01t0 ------------QLPPPGGYSIAG---AP--------------AVVAPHGRLGLEEAEVI
Os018301_Os04t0 ------------------------------------------------------------
Os003720_Os01t0 -------------------------------------------EKLMEALTPILKQLQFL
Os028896_Os07t0 --------------------------------------------PAARNKSHVVANASLL
Os041202_Os12t0 ------------------------------------------------------QNMQNL
AT5G13080.1 SSF---------------------------------------------------------
Os023009_Os05t0 QQLGFV-PSIHA-----------------------------------AAARPTMPP---L
Os026670_Os07t0 ATTPASSSSLL-----QLPLHCNHELQVVASCGGYPSSSSSPPASV--------------
Os022851_Os05t0 AAAAASGGSLHAAAMQQMPQPDHAGLVAIIASTTGASTTPPPPPATGSAAAATTP--LRM
Os003133_Os01t0 GGAAATTTTSH-------------GLNSAISGGGGVSSETTSAVTVAASAQPSSPAALQM
Os022505_Os05t0 SQL---------------------------------------------------------
Os002550_Os01t0 ALFRGTTA----------------------------------------------------
Os018301_Os04t0 ---------------------------------------------------------CAF
Os003720_Os01t0 SQF---------------------------------------------------------
Os028896_Os07t0 QNTKS-------------------------------------------------------
Os041202_Os12t0 SSNQASLTMADFNNINQRP--------------------------------------IGV
AT5G13080.1 --------------------------------
Os023009_Os05t0 HLYTAQ-----QDLFLP---------------
Os026670_Os07t0 ---LPVDKGLLDDM-VPRAMRHDG--------
Os022851_Os05t0 QHFMAQDYGLLQDMFIPSPFLHNDDANNNNHR
Os003133_Os01t0 QHFMAQDLGLLQDMLLPS-FIHGTNQP-----
Os022505_Os05t0 --------------------------------
Os002550_Os01t0 -----------TSLLLP---------------
Os018301_Os04t0 TSF-----------------------------
Os003720_Os01t0 --------------------------------
Os028896_Os07t0 NTYCTE-----QSYTTITC-------------
Os041202_Os12t0 LQFKSEE-------------------------
BoxShade v3.31 C (beta, 970507) Output
AT5G13080.1 |
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