Input
| Putative repression domain
|
|
AT5G13080.1 |
not found |
|
Ortholog
| Putative repression domain
| Reverse top hit
| Relation
| Blast score ratio
| Type
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Os038685 |
not found in 242aa |
AT5G13080.1 |
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not found in 254aa |
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not found in 207aa |
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III |
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not found in 290aa |
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III |
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not found in 529aa |
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0.406844106 |
III |
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AT2G03340.1 |
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III |
Os003133 |
not found in 220aa |
AT1G29860.1 |
not_not |
0.403041825 |
III |
Get sequence file
Get alignment file
Get formatted file made by BOXSHADE
Sequence file prepared (1 sec required). Alignment has started.
CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)
AT5G13080.1 -------------------------------------MEGY-----------D-----NG
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Os002550_Os01t0 --MSSL-------------------------------YPSL------LSLSES-------
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Os038685_Os11t0 -------------------------------------MENFPILFATQPTSSS-----TS
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Os022505_Os05t0 -------------------------------------MDGL------EAAAGD-------
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Os041202_Os12t0 LASALFPSDPDGGGGGGGVMTSSSSSAAGATSFTQLLIGNLSAPPPPPPP----PQQQ--
Os003133_Os01t0 ------------------------------------------------------------
Os018301_Os04t0 ALYAPLCP------------------------YT-----------PPSPPSFLAPLPSLQ
Os022851_Os05t0 ------------------------------------------------------------
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Os022505_Os05t0 ------------------------------------------------------------
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AT5G13080.1 ------------------------------------------------------------
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Os041202_Os12t0 FSPAMFDAFDVLDMFIPDKILPKRATRIKGGFGMSHREALAQVTAQASHSPLRMFDHTEQ
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AT5G13080.1 ------------------------------------------------------------
Os028896_Os07t0 LPFIPLATSALVSQHTGSSSVNVTPLQEILTSPSQISNVNTESIGVLQGLPASSIVL---
Os041202_Os12t0 PSFSAAPTSSEAMQHM-NAAVNMTGISDMVMGPT-----NNENVAF---QPAEASQRYQV
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Os038685_Os11t0 ------------------------------------------------------------
Os023009_Os05t0 -----------------------------------------DGVGLI--TPYSSIT----
Os022505_Os05t0 -PQLPAAYLASSS------------------------------------MAALSPA----
AT5G13080.1 ------------------------------------------------------------
Os028896_Os07t0 ----DRPTDDGYNW-RKYGQKAVKGGEYPKSYYKCTHLNCLVRKNVEHSADGRIVQIIYR
Os041202_Os12t0 NAPVDKPADDGYNW-RKYGQKVVKGSDCPRSYYKCTHPNCPVKKKVEHAEDGQISEIIYK
Os003133_Os01t0 ------------------------------------------------------------
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Os038685_Os11t0 ------------------------------------------LQAGGNGGGG-------G
Os023009_Os05t0 ------------DYLQGFLQDPV---------YASSPLG---------------------
Os022505_Os05t0 ----------GDDW-AASL----------------------ILPDGGSAAAG-------V
AT5G13080.1 GE--------------------------------EESSKVRSEG---------CSKSV--
Os028896_Os07t0 GQHTHER------PSKRRFKDCGGISDDLDDFSGTTGTSVRSQPDYDDYCRKPIIPSGTM
Os041202_Os12t0 GKHNHQRP-----PNKR-------------AKDGSSSAADQNEQSND-------TVSGL-
Os003133_Os01t0 ------------------------------------------------------------
Os018301_Os04t0 GAAACDDDKP------------AGFAH-LGSAEADTSAAAARVDS---------------
Os022851_Os05t0 ------------------------------------------------------------
Os026670_Os07t0 GELATPPPPPLDLPETP-----AG----SSADGAASS----CSTD---------------
Os002550_Os01t0 GFHSKQHNPP---PVAAAPLEAGGG----------------REQSRR-------------
Os003720_Os01t0 GENDH-----------------GD-------LQAAESSGAGNK-----------------
Os038685_Os11t0 GSLSH-----------------GL-------FMGSSSSSIRMEE---------LSNSK--
Os023009_Os05t0 GDAAVKHETVVDHPSQA-----GG----VAAAPATPNSSVLSSSS---------------
Os022505_Os05t0 GEDDL-----------------GGG---VMAAAAAESSCGGSST---------VTSSGV-
AT5G13080.1 --------ES------------------------------------------------SK
Os028896_Os07t0 VAPLVKKIEDG---DDQLSGSS----------------DNQDEHD---DEVRTSDGASGD
Os041202_Os12t0 -SGIKRDQEAIYGMSEQLSGLS----------------EGDDMDD---GESRPHEADDKE
Os003133_Os01t0 ------------------------------------------------------------
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Os026670_Os07t0 --------DA--------DGG----------KP---------------AAASTEAASKSL
Os002550_Os01t0 --------EAAVN-----LGKMD-------RGP---------------APVSGGAATGGV
Os003720_Os01t0 --------EK----------------------------------------QVMAKGGAGR
Os038685_Os11t0 --------QAG---DVVVDGGAT-------RSPHGGDGDGAAGDD---GGDAQAAAAGGR
Os023009_Os05t0 --------EA--------AGGDDLRRCKKGRRPE--DEEEEEIDDEGSAVQSCKTNKMKN
Os022505_Os05t0 -------TEA----------------------------------------AAAAATTTRR
AT5G13080.1 KKGKKQ-------------RYAFQTRSQVDILDDGYRWRKYGQKAVKNNKFPRSYYRCTY
Os028896_Os07t0 ASANERNVP------APGQKIIVSTTSEIDLLDDGYRWRKYGQKVVKGNPYPRSYYKCTY
Os041202_Os12t0 SDSKKRNIQISSQRTSAEAKIIVQTTSEVDLLDDGYRWRKYGQKVVKGNPHPRSYYKCTY
Os003133_Os01t0 -----------------------MTKSEVDHLEDGYRWRKYGQKAVKNSPYPRSYYRCTT
Os018301_Os04t0 WKGTEKGKMK-VRRKMREPRFCFQTRSDVDVLDDGYKWRKYGQKVVKNSLHPRSYYRCTH
Os022851_Os05t0 -----------------------MTKSEVDHLEDGYRWRKYGQKAVKNSPFPRSYYRCTT
Os026670_Os07t0 TPGKKRA---------RQPRFAFMTKSEIDHLEDGYRWRKYGQKAVKNSPFPRSYYRCTN
Os002550_Os01t0 PRSKNGS------------KIAFKTRSEVDVLDDGYRWRKYGKKMVKNSPNPRNYYRCSS
Os003720_Os01t0 PSGTKKKAS--------RPRFAFQTRSDNDILDDGYRWRKYGQKAVKNSKHPRSYYRCTH
Os038685_Os11t0 KKGEKKE---------RRPRFAFQTRSQVDILDDGYRWRKYGQKAVKNNKFPRSYYRCTH
Os023009_Os05t0 KKGAKKE---------REPRVAFMTKSEVDHLEDGYRWRKYGQKAVKNSSYPRSYYRCTA
Os022505_Os05t0 GRGNGKKAGG----GGRTPRFAFHTRSENDILDDGYRWRKYGQKAVKNSDFPRSYYRCTH
* *: * *:***:*****:* **.. **.**:*:
AT5G13080.1 GGCNVKKQVQRLTVDQEVVVTTYEGVHSH---PIE-----KSTENFEHIL----------
Os028896_Os07t0 LGCDVKKQVERSVEEPNAVITTYEGKHIH---DVP-----AA-RNKSHVV----------
Os041202_Os12t0 AGCNVRKHIERASSDPKAVITTYEGKHNHEP-PVGRG---------------NNQNAGNA
Os003133_Os01t0 QKCPVKKRVERSYQDPAVVITTYEGKHTH---PIP-----ATLRGSTHLLAAHAQAAAAA
Os018301_Os04t0 NNCRVKKRVERLSEDCRMVITTYEGRHTHT--PCS-------------------------
Os022851_Os05t0 QKCPVKKRVERSYQDAAVVITTYEGKHTH---PIP-----ATLRGTAHLL-------GAA
Os026670_Os07t0 SKCTVKKRVERSSDDPSVVITTYEGQHSHHTVTFPRA--AATAAGFSHI---HAMAALAA
Os002550_Os01t0 EGCRVKKRVERARDDARFVVTTYDGVHNH---PAP-----------LHLR----------
Os003720_Os01t0 HTCNVKKQVQRLAKDTSIVVTTYEGVHNH---PCE-----KLMEALTPIL----------
Os038685_Os11t0 QGCNVKKQVQRLSRDETVVVTTYEGTHTH---PIE-----KSNDNFEHIL----------
Os023009_Os05t0 PRCGVKKRVERSEQDPSMVITTYEGQHTH---PSPVSYHMHRQQGLMHVSARGVMPGAAG
Os022505_Os05t0 HTCNVKKQVQRLAKDRGIVVTTYEGVHNH---PCE-----KLMEALSPIL----------
* *:*:::* : *:***:* * *
AT5G13080.1 ------------------------------------------------------------
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Os041202_Os12t0 APSSSAQ-----------------------------------------------------
Os003133_Os01t0 A--AAHQLHHHHG----HH-GHHGMA-----PPLP---LGSGAAAQFGRSSGIDVLSSFL
Os018301_Os04t0 ------------------------------------------------------------
Os022851_Os05t0 A--AA----HHHGGLQYHHPGHFAAAVGHRLPPQPHDALGGGLLAP--------------
Os026670_Os07t0 APFSAHQ--QLYSNLQ---------------PPPP-------------------------
Os002550_Os01t0 ----------------------------PQLPPPGGYSIAGA------------------
Os003720_Os01t0 ------------------------------------------------------------
Os038685_Os11t0 ------------------------------------------------------------
Os023009_Os05t0 A--------YQFGA-----------------PPPP--LLG--------------------
Os022505_Os05t0 ------------------------------------------------------------
AT5G13080.1 ------------TQMQIYSSF---------------------------------------
Os028896_Os07t0 ------------ANASLLQNTKSNTYCTE------------------------QSYTTIT
Os041202_Os12t0 ------------QNMQNLSSNQASLTMADFNNINQRP-----------------------
Os003133_Os01t0 PRAAAAH-----HGMTTMGGAAATTTTSH-------------GLNSAISGGGGVSSETTS
Os018301_Os04t0 ------------DDATTGAAGDHTASCAF-------------------------------
Os022851_Os05t0 PHAQHLHAM--QHQMQLAAAAAASGGSLHAAAMQQMPQPDHAGLVAIIASTTGASTTPPP
Os026670_Os07t0 -------------TMPLAATTPASSSSLL-----QLPLHCNHELQVVASCGGYPSSSSSP
Os002550_Os01t0 PAVVAPHGRLGLEEAEVIALFRGTTATSL-------------------------------
Os003720_Os01t0 ------------KQLQFLSQF---------------------------------------
Os038685_Os11t0 ------------TQMHIYSGLTPSSAAHA------------------------SSSSPLF
Os023009_Os05t0 ------------FDEALAARVRMTMNQQQ---QQQ-------QLGFVPSIHAAAARPTMP
Os022505_Os05t0 ------------RQLQLLSQL---------------------------------------
AT5G13080.1 --------------------------------------------------
Os028896_Os07t0 C-------------------------------------------------
Os041202_Os12t0 ---------------IGVLQFKSEE-------------------------
Os003133_Os01t0 AVTVAASAQPSSPAALQMQHFMAQDLGLLQDMLLPS-FIHGTNQP-----
Os018301_Os04t0 ------------------TSF-----------------------------
Os022851_Os05t0 PPATGSAAAATTP--LRMQHFMAQDYGLLQDMFIPSPFLHNDDANNNNHR
Os026670_Os07t0 PASV-----------------LPVDKGLLDDM-VPRAMRHDG--------
Os002550_Os01t0 --------------------------------LLP---------------
Os003720_Os01t0 --------------------------------------------------
Os038685_Os11t0 PSAAAAAS------------HMFQ--------------------------
Os023009_Os05t0 PLHL----------------YTAQ-----QDLFLP---------------
Os022505_Os05t0 --------------------------------------------------
BoxShade v3.31 C (beta, 970507) Output
AT5G13080.1 |
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