Input
| Putative repression domain
|
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AT5G13080.1 |
not found |
|
Ortholog
| Putative repression domain
| Reverse top hit
| Relation
| Blast score ratio
| Type
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Sb008695 |
not found in 246aa |
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not found in 547aa |
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0.418250950 |
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III |
Get sequence file
Get alignment file
Get formatted file made by BOXSHADE
Sequence file prepared (0 sec required). Alignment has started.
CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)
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Sb025569_Sorbi1 ---------------QSQHPAASGAPM-------------------------------SS
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Sb031229_Sorbi1 VVH------------QTQSLTKDSQGL---------------------------------
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Sb000370_Sorbi1 GAA---------------------------------------------------------
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Sb029450_Sorbi1 LGQLNQQNHNVQTNMNIGGPHDSKLSRLASGTGACNEHVSPPDYGQTAEEGGDAREDYPP
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Sb011115_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb019174_Sorbi1 -GFFFQQT------------------------------VSPP--CAGEVDGGTAPYASIA
Sb018986_Sorbi1 ----------------------------------------------ACSS-DATTTSLVP
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Sb001846_Sorbi1 -SAPTFDKP--ADDGYNWRKYGQKAVKGGEYPRSYYKCTHASCPVKKK---VERSAEGYI
Sb025569_Sorbi1 DYLHGAGVPG--MGGMDYDLL--CRALDLPLPGDDV--------VKRELLVVDTGGGG--
Sb029450_Sorbi1 -AMAAATAP--AEDGYSWRKYGQKQVKHSEYPRSYFKCTHPNCQVKKK---VERSHEGHI
Sb000370_Sorbi1 GLLASGELP----------------VLDLPDP----------------------------
Sb031229_Sorbi1 -RVNRRGMPL-LDDGYNWRKYGEKQVKKSEHPRSYYKCTHPKCPVKKM---VERSLEGHI
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Sb011115_Sorbi1 ------QMPF----------------------------------VVDQ----EAETENHG
Sb019174_Sorbi1 DYLQGFLDPA--------------------------------------------GLAAHF
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Sb001846_Sorbi1 TQIIYRGQHNH-----QRP-PKRRS------------------------KDGGGLLNEAD
Sb025569_Sorbi1 ------GGLGF-----AAPTPSG-GGT----------------APVTPNTTSSM------
Sb029450_Sorbi1 TEIIYKGAHNH-----PKPTPSRRPGVQ--------------VQPVHPFGDAGG-AQQAD
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Sb011115_Sorbi1 GGGMLSSDHCG-----LYP------------------------LPALPF-----------
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Sb025569_Sorbi1 ------SSSSS-----EAAGGGAAGGGG--------------GG----------------
Sb029450_Sorbi1 AAADN-NLGSQ----SQQANAAAEANHQPWRA--GVQD----GMD--AATSSPSVPGELC
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Sb031229_Sorbi1 G-----NFSSK----PGPGYDSSTSQGIAPKG--QFQDVHSGALE--TKLSGSLTTTEIA
Sb008695_Sorbi1 ------NDGGD-----AGSSSSS-------------------------------------
Sb014373_Sorbi1 -------------CPFSAAADAATCDKTTT----------TGGF-------AALDAGEAG
Sb011115_Sorbi1 -------------GSCSGAAGAATACGGKP----------TAGF-----MPSAIVAEEVC
Sb019174_Sorbi1 AVV---AVKQEMVVQLSDSRRDADADGQ------------MAGA----------------
Sb018986_Sorbi1 ------SGGSSA-VTVAGSSASATAAGE--------------G-----------------
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Sb025569_Sorbi1 ----------------------------------------SFGG----AGEEDSPHQGRC
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Sb000370_Sorbi1 ----------------------------------------APG-----------------
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Sb033068_Sorbi1 ---------ARSGPGAASLAGRG-------RHRHAV------------GSERRRRRRRRP
Sb001846_Sorbi1 DEERDDEQRAGNGDPGYANAN---------RRHVPTPAQ---------------------
Sb025569_Sorbi1 KKEEGDGEESKALDKGEEDADKG-------KKGSPAAAKG---------KGKGEKRQRQP
Sb029450_Sorbi1 --EVDGGDRVTLGSMSHAGADAEGDELESKRRKVEAYAMD---------MSTASRAIREP
Sb000370_Sorbi1 ----NDDDDRKAAPAAEA---AG-------RK--PAAATA---------K-KGQKRPRQP
Sb031229_Sorbi1 ----EKGDRAMNGAVPSTNDMNE-DETESKRRKMEVSVASNTANIVTDMAAMASRTAREP
Sb008695_Sorbi1 ----------KEKVVAKGGGGAG-------R--------------------SGKKKASRP
Sb014373_Sorbi1 NG--PSSCNWWKGPAAA--GEKG-------------------------GRMKVRRKMREP
Sb011115_Sorbi1 ND---SNGTWWKGSAATTIAER--------------------------GKMKVRRKMREP
Sb019174_Sorbi1 ----PANSSVLSSSSCEAGADANDDDEEPSRRRSSKENK----------KRRGEKKAREP
Sb018986_Sorbi1 ------DNNYKAGKAGKAGGG-G-------R---------------------GKKKASRP
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Sb029450_Sorbi1 RVVIQTTS------EVDILDDGYRWRKYGQKVVKGNPNPRSYYKCTHPGCTVRKHVERAS
Sb000370_Sorbi1 RFAFMTKS------EIDHLEDGYRWRKYGQKAVKNSPFPRSYYRCTNSKCTVKKRVERSS
Sb031229_Sorbi1 RIVVQTTS------EVDILDDGYRWRKYGQKVVKGNPNPRSYYKCTYAGCSVRKHVERAS
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Sb011115_Sorbi1 RFCFQTRS------DVDVLDDGYKWRKYGQKVVKNSLHPRSYFRCTHSNCRVKKRVERLS
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Sb018986_Sorbi1 RFAFQTRS------DNDVLDDGYRWRKYGQKAVKNSAFPRSYYRCTHHTCDVKKQVQRLA
: * * * *:: * . . *::: .*
AT5G13080.1 VDQEVVVTTYEGVHSH--------------------------------------------
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Sb011115_Sorbi1 TDCRMVMTTYEGRHTH-SPCS---------DDASSA-----------------------D
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Sb018986_Sorbi1 KDTSIVVTTYEGVHNH--------------------------------------------
* ..:*
AT5G13080.1 ------------------------------PIEK--------------------------
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Sb001846_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
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Sb000370_Sorbi1 HIG---------------------------PFQRGGGGGGG------GAATARYHSAAAV
Sb031229_Sorbi1 --------------PPQF----------SMPHAAAAAAYGS-----LCLPP-------QL
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Sb019174_Sorbi1 YAGT----------PIGFLPLL--------PPGGIGAGGGG-----------RLLHHRAR
Sb018986_Sorbi1 ------------------------------PCEK--------------------------
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Sb025569_Sorbi1 PPAIGLASS-RGMSGG----------GPMSTVAGATAATAAATT----------------
Sb029450_Sorbi1 PMATGNLSAVEGLKLPMLATSSP--LHHQHPLLRHRQAMQAAAL----------------
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Sb018986_Sorbi1 ------------LMEALSPILKQLQLLSQ--LQSCTNQLL--------------
BoxShade v3.31 C (beta, 970507) Output
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Sb025569_Sorbi1 |
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Sb029450_Sorbi1 |
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Sb008695_Sorbi1 |
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Sb014373_Sorbi1 |
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Sb019174_Sorbi1 |
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Sb018986_Sorbi1 |
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