Input
| Putative repression domain
|
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AT5G13180.1 |
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|
Ortholog
| Putative repression domain
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| Type
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Os012854 |
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AT3G04070.1 |
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0.452736318 |
III |
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III |
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III |
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III |
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III |
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III |
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III |
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DVIREIDLNKLEPWDLKD in 45/359 |
AT1G79580.3 |
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0.410447761 |
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III |
Get sequence file
Get alignment file
Get formatted file made by BOXSHADE
Sequence file prepared (0 sec required). Alignment has started.
CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)
AT5G13180.1 --MDNVKL------------VKNGV----------------LRLPPGFRFHPTDEELVVQ
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Os000052_Os01t0 -------MGEQQQQV-----------------------ERQPDLPPGFRFHPTDEEIITF
: *******: *::
AT5G13180.1 YLKRKVCS-SPLPASI-IPEFDVCRADPWDLPGNL---------EK--ERYFFSTREAKY
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** : : : :: . :**:* : :*: :: **
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.. *.**.: *:**:** *: : .::*:**:: *:.
AT5G13180.1 PHGSRTDWIMHEYRLSSSPPSSMGP-----------------------------------
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Os007248_Os02t0 PHGKKTDWIMHEYRLD-DDNVDVP------------------------------------
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Os000052_Os01t0 PKGDKTNWVMHEYRLADAS---PPP--------PP-----SSAEPPR-------------
..* :: *::**:*
AT5G13180.1 -------------------------TQNWVLCRIFLKKRAGNK-----------------
Os000047_Os01t0 IYPLPYTPSTDRYIYMRNYIHARTQLDEWVLCRIYKKKEANQQLQH---YID--------
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Os039905_Os12t0 LNP----------------------KDEWVVCKVFHKKQGDEAIN---------------
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Os007249_Os02t0 ----RGFD--Q------PDMAA-AADEDEL--RY-QLL--HGA-GMSSSPV---------
Os023187_Os06t0 ----RDSDHDA------PC-----GSWYV----------DEDAPGAFMSPMMITRSSILR
Os010934_Os03t0 -----VVHHHV------EQPQW-M---TSSID---------------RSPTLDVSC----
Os029651_Os07t0 ---------------D-------L---AAKIAQM--------------PP----------
Os013975_Os03t0 -----------------------L---QCHLAKP-------------RPP----------
Os028650_Os07t0 -------QRSM------ECEDS-V---ED--------------AVAAYAP----------
Os007248_Os02t0 ----RGFD--Q------PDMAA-AADEDEL--RY-QLL--HGA-GMSSSPV---------
Os024821_Os06t0 ----GGGGDTSC--FSDSTSAS-V---GGGGGTS--------ASSALRAP----------
Os000052_Os01t0 ----PVAPHQV------PAAAN-YQ-QQQQMAMA--------SAGIIQVPMQM-------
AT5G13180.1 ------------NSSD--------------------------------------------
Os000047_Os01t0 ------------QQQQ--------------------------------------------
Os008451_Os02t0 ----------------------------------------GPS-----------------
Os037858_Os11t0 ----------KVELSDYGFYDQEPE----------------SEML---------------
Os039904_Os12t0 ----------DMNNQQS-DFQPMTA----------------MSMSKS-------------
Os002083_Os01t0 ---------------------------------------QMPSMS---------------
Os036787_Os10t0 ------------EH----FKQEA----AAELDGVAAAAGANAFLR---------------
Os037415_Os11t0 ------------NPQE--------------------------------------------
Os009848_Os02t0 -----------------------------------------PSCH---------------
Os030211_Os08t0 AAPITRWLADRTDNATTNEVNISHMPHHGLDGG----AKASPSAG-------AFPQLIGS
Os027435_Os07t0 ------------ESEV---VDSDAF----------------PEMDYSLPAA---------
Os039905_Os12t0 ----------DIDGGD-DFFQLDDI--------------IDPSIY---------------
Os029809_Os08t0 ANNNNNSVV---DH-SNILSSE-------------------SKLH---------------
Os032093_Os08t0 ------------------FHDLPPVP------------FPNPSLV---------PFHHDL
Os011013_Os03t0 ADPSAAYAQMRRQHRSGRFKQE------AELDG-----AATALLH---------------
Os034288_Os09t0 --------------------DMVP-----------------PLL----------------
Os008987_Os02t0 --------------------RS---------------WSTTTSCR---------------
Os005051_Os01t0 ----------GVNAAVSSPPEQKPV----------------VAGP---------------
Os037857_Os11t0 ----------KVELSDYGFYDQEPE----------------SEML---------------
Os015522_Os03t0 ------------ESEI---VDNDPF----------------PELD-SFPA----------
Os012854_Os03t0 ------------SSSS--------A----------------ASMILQGAAAGAF------
Os007249_Os02t0 ----------DQKH---VLLQEQLVAHGAHGGGFVV-PAFEASMH---------------
Os023187_Os06t0 PH----------QHHAGITLQE---------------QHLHTTYK---------------
Os010934_Os03t0 -----DGRGDDFESSSFSFPTETPM----------------DSMHGGFGMQMSAPHEDGK
Os029651_Os07t0 ------------------------------------------------------------
Os013975_Os03t0 --------HDDVDGDGASPPEMVDA----------------SSLG---------------
Os028650_Os07t0 ------------SSQQ----HATAA----------------AGMAGSDGAGGV-------
Os007248_Os02t0 ----------DQKH---VLLQEQLVAHGAHGGGFVV-PAFEASMH---------------
Os024821_Os06t0 ------------------------------------------------------------
Os000052_Os01t0 ---------------------------------------QMPSMS---------------
AT5G13180.1 --QI-------------------------------------------------EIITTDQ
Os000047_Os01t0 ---------------QAQS----------------------------------HRMPRPP
Os008451_Os02t0 ------------------------------------------------------SMPMAD
Os037858_Os11t0 --------CF-DRSGSADR----------------------------------DSMPRLH
Os039904_Os12t0 -----------------------------------------------------CSL----
Os002083_Os01t0 -----------------------------------------------------DQLQMLD
Os036787_Os10t0 ---------------------------------YS---------------TRLAELPQLE
Os037415_Os11t0 ------------------------------------------------------------
Os009848_Os02t0 -----------------------------------------------------NPLSMID
Os030211_Os08t0 QQNIHDNNELATVSAPMLPHEDFNNFPLGAIGNFDGNMNPRDPVEEF--LNQTIADPDEH
Os027435_Os07t0 --------SFDDA-----------------------------------------LLPKEE
Os039905_Os12t0 ---------------------------------FV-------------------------
Os029809_Os08t0 ---------------------------------FS---------------DM---MPPLE
Os032093_Os08t0 PTSF--HPPLLQHSHANSKNSSSNN------GGFV-----------------FPNEP--N
Os011013_Os03t0 ---------------------------------YS---------------SHLAELPQLE
Os034288_Os09t0 -------PALLQQDP------------------FG-----------------RGHHPYMN
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Os037857_Os11t0 --------CF-DRSGSADR----------------------------------DSMPRLH
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Os012854_Os03t0 -------PSLHAAAAATQR----------------------------------TAMQKIP
Os007249_Os02t0 -------------------------------------------------------LPQLA
Os023187_Os06t0 ---------------------------------HR---------------DLTTKIQQLQ
Os010934_Os03t0 WMQFLSEDAFNATNPFLTNPVSAN---------FSCLPSKVDVALECARLQHRLTLPPLE
Os029651_Os07t0 -----------------------------------------------------PPFPRND
Os013975_Os03t0 --EL----------------------------------GELDVS----------------
Os028650_Os07t0 -----------AAAHGGDY----------------------------------SSLLHHD
Os007248_Os02t0 -------------------------------------------------------LPQLA
Os024821_Os06t0 ---------LAEASL------------------FA-----------------AAAAP---
Os000052_Os01t0 -----------------------------------------------------DQLQMLD
AT5G13180.1 TDDKTK------------------------------------------------------
Os000047_Os01t0 SI-------------------------------------SDYLLDY--------------
Os008451_Os02t0 DV-----------------------------------------VGL--------------
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Os002083_Os01t0 DFSTG--------------------------------------SLM--------------
Os036787_Os10t0 SP----------------------------------------------------------
Os037415_Os11t0 ------------------------------------------------------------
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Os030211_Os08t0 SSTTSK---------AQYDSDTGIIPTEFENHGVMQGEFMDDLSGLENLDFWPDDRNPQL
Os027435_Os07t0 ARDD------------------------------------DWLMGM--------------
Os039905_Os12t0 ------------------------------------SNSSNILS----------------
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Os034288_Os09t0 PVDMAELSRFARG--------T-----------------PGLHPHI--------------
Os008987_Os02t0 APSRRRR--------------------------------------LL-------------
Os005051_Os01t0 ADSSCS------------------------------------------------------
Os037857_Os11t0 TDSSGS------------------------------------------------------
Os015522_Os03t0 SMDDATA--------AAAAAAT-IPR-----------NNSSLFVDL--------------
Os012854_Os03t0 SI-------------------------------------SDLLNEY--------------
Os007249_Os02t0 SADAAPCGGGGGGH-----------------------------VAFA-------------
Os023187_Os06t0 VPAAGHH--------------------------------------LL-------------
Os010934_Os03t0 VEDFPQD--------VSLDTKIGILRS--------NPNEVDILQEFLSV----------A
Os029651_Os07t0 SFDL----------------------------------DLDDFLHL--------------
Os013975_Os03t0 ---------------------------------------SILLGGF--------------
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Os007248_Os02t0 SADAAPCGGGGGGH-----------------------------VAFA-------------
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Os000052_Os01t0 DFSTTAS-----------------------------------LSLM--------------
AT5G13180.1 ------------------------------------------------------------
Os000047_Os01t0 ------------------------------------------------------------
Os008451_Os02t0 ---------APCALPP------------AHVTCF--------SNALEGQ-----------
Os037858_Os11t0 ------------------------------------------------------------
Os039904_Os12t0 -------------------------------DCA-ALSQFLLDGSS--------------
Os002083_Os01t0 ---------APPPPPP------------SYSTLP-GFPLQINGGA--QQ-----------
Os036787_Os10t0 --------------P----------LPSQGSQ----AASAVVDGEE--------------
Os037415_Os11t0 ------------------------------------------------------------
Os009848_Os02t0 ---------ASVPLP---------------------------------------------
Os030211_Os08t0 SALYE----DTPLLPYDSTDQDVLSMDSGAESLQDLFNSMDDSNARNNVWGNEPFLQGTG
Os027435_Os07t0 ----------------------------SLDDLQ-GLGSLLQ------------------
Os039905_Os12t0 -------------APP--------NNNNAVYSVS-ASTTTTNTTAVSFQQQ---------
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Os032093_Os08t0 -------------FP-------------SFSCAS----TVTGKGGPPAQ-----------
Os011013_Os03t0 -------------AP----------LQPNPSQ----LATA---GEDDD------------
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Os023187_Os06t0 -----------NTMPH--------DLESSTSS----FHSLLVSPDHHQ------------
Os010934_Os03t0 TASQELINGSTSSYPEMW----LGASTSSASYVN-ELSSLVEMGGVGTSNHHE-------
Os029651_Os07t0 ----------DADLPP--------------------------------------------
Os013975_Os03t0 ------------------------------------------------------------
Os028650_Os07t0 ----------------------------TAEDAA-GLST----GASSLSQLAA-------
Os007248_Os02t0 -----------SMNPL--------DAAGCGSQNMMTMKMAATSGGE--------------
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Os000052_Os01t0 ---------A----PP------------SYSTLPAGFPLQINSGAHPQQ-----------
AT5G13180.1 ------------------------------------------------------------
Os000047_Os01t0 ------------------------------------------------------------
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Os030211_Os08t0 FPMSWPLQPNSAFPNQGTANRRLMLQLSESLSPDFDVSMTRDEC----------------
Os027435_Os07t0 ------------------------------------------------------------
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Os007249_Os02t0 ------------------------------------------------------------
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Os010934_Os03t0 -------------------SARLQVEIA-------DMEVFKDEKKRVENLRGVKLVNNDL
Os029651_Os07t0 ------------------------------------------------------------
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Os028650_Os07t0 -------------------AAR--------------------------------------
Os007248_Os02t0 ------------------------------------------------------------
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Os000052_Os01t0 ------------------------------------------------------------
AT5G13180.1 -------------------------PI---------------------------------
Os000047_Os01t0 ------------------------------------------------------------
Os008451_Os02t0 -------FLDTP------YLLPAADPAD--------------------------------
Os037858_Os11t0 ------------------EHVLSPSPS---------------------------------
Os039904_Os12t0 ---------------DAIAELPAP-PS---------------------------------
Os002083_Os01t0 -------FVGNP------------------------------------------------
Os036787_Os10t0 -----------------DNADSSRRP---------------------GGGG---------
Os037415_Os11t0 ------------------------------------------------------------
Os009848_Os02t0 ----------SPVAEHQTMGILSAIPLDIT-----------------AGIDIASMVFNAS
Os030211_Os08t0 -------EDEEP-GIVVTSKYVNEAPEESTAEK----------DMPSDGDD--------A
Os027435_Os07t0 ------------------------------------------------------------
Os039905_Os12t0 -------------------------PNYYSLIN---------------------------
Os029809_Os08t0 ------------------------------------------------------------
Os032093_Os08t0 -------LGVNA------GQQEPPPPTW--------------------------------
Os011013_Os03t0 --------------CKGDNGGRRAKK---------------------ARAA---------
Os034288_Os09t0 -------LGSSP------AMPPPPPPPP--------------------------------
Os008987_Os02t0 -----------P-PLLLTTTKPPAPP----------------------------------
Os005051_Os01t0 ------------------EQVLSP------------------------------------
Os037857_Os11t0 ------------------EHVLSPSPS---------------------------------
Os015522_Os03t0 ------------------------------------------------------------
Os012854_Os03t0 -------AAAAP------LQEMARQP----------------------------------
Os007249_Os02t0 --------------MLLMSG---------------------------GGVD---------
Os023187_Os06t0 ----------------INMHHAQADPF-------------------FDDMH---------
Os010934_Os03t0 GEIVVEGDESNP-----TEDIIAQYPIKVTADNSGEAGHRMTDPTDVGGIDTAP-IFSQS
Os029651_Os07t0 -------LIDDPFASTSTLKTEPPPPA---------------------------------
Os013975_Os03t0 ----------AP-------------PS-------GELCH--------GG----------G
Os028650_Os07t0 -------AAATPC--DATKQLLAPSPT---------------------------------
Os007248_Os02t0 --------------MLLMSG---------------------------GGVD---------
Os024821_Os06t0 ---------PAP------LAVEPPPPPPA-------------------------------
Os000052_Os01t0 -------FVGNP------------------------------------------------
AT5G13180.1 -----------F----------------------FDFMRKERTTD---------------
Os000047_Os01t0 --------------SDDLPPST-------------DQTPSL--H---LGFTAVNEGNNKR
Os008451_Os02t0 --------------HLAMSSAS-------------PFLEALQMQY---------------
Os037858_Os11t0 -P-------------DDFPGGGD-----------HDYA---ESQP---------------
Os039904_Os12t0 -PLIYPNQTLNYNINNNMPHA---------------FESRLDHH---DGYVNNYNVNGLR
Os002083_Os01t0 ---------------------S-------------MYYQQQQQQQ---------------
Os036787_Os10t0 --------------GAAAAVTTDWR-------AFDKFVASQLS-----------------
Os037415_Os11t0 -------------------------------------EQRL-------------------
Os009848_Os02t0 --------------SFTLPNMDRMT-------ANIEFGQPQKCNSS--------------
Os030211_Os08t0 EPTGITILR-----RRHAPTASSFSDGDDAESTGITILRQHQAPNA--------------
Os027435_Os07t0 --------------------AD-------------DL--SMLAP----------------
Os039905_Os12t0 --------------KSSSSSSS-------------NYSAPLQQHVS--------------
Os029809_Os08t0 ------------------AGIVDW-----------NLLTSLLP-----------------
Os032093_Os08t0 --------------------MD-------------AYLQH--------------------
Os011013_Os03t0 --------------GDKVATTTDWR-------ALDKFVASQLS-----------------
Os034288_Os09t0 ---------------------Q-------------SILQAMSMP----------------
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Os015522_Os03t0 ----------------MLPPGD-------------DFYSSLFAS----------------
Os012854_Os03t0 ----------------DHHHHQ-------------QQQHALFGHPVMNHFIANNSMVQLA
Os007249_Os02t0 --------------GGRFGAAADWS-------ILDKLLASHQNLD---------------
Os023187_Os06t0 --------------AVDQATTTDWR-------VLDKFVASQLSND---------------
Os010934_Os03t0 QPDDFAAGF-----DDVNPNAS------------FDLYEKVDVNH--RLFVSRVAAAKTF
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Os007248_Os02t0 --------------GGRFGAAADWS-------ILDKLLASHQNLD---------------
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Os000052_Os01t0 ---------------------S-------------MYY-----HQ---------------
AT5G13180.1 ------------------------------------------------------------
Os000047_Os01t0 HKTMEEYYSISISTADMLHASSST-------------------SNNKSTQINFS-SI---
Os008451_Os02t0 --------------------------VQDAAAAGGAGMVHELLMGGGWY-----------
Os037858_Os11t0 ---------------------------------SGGC------GGWPGVD--WA-AVGDD
Os039904_Os12t0 RKRMMACSATSFDDGSSSSSSDFLH-VAKKPL----------------------------
Os002083_Os01t0 --------------------------QQQMDMAAGGFVV---------------------
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Os009848_Os02t0 ------------------SSMTNRC-VVDMPDVAN-----NINSGPRSINFNLQGTLSDD
Os030211_Os08t0 --------SLLSDGDDAESTGITILRRRQAPTASSASSF--TQQGAAVQRVRLQ------
Os027435_Os07t0 ------------------------------PPAAK-------------------------
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Os029809_Os08t0 ------------------------------PPAHQLFH----------------------
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Os034288_Os09t0 ---MNQPRSTTNQVMVTEQMIPGLA-NGVIPQGTDGGFTTDVVVGGTGIRYQ---NLDVE
Os008987_Os02t0 ----------------------------TWPAP---------------------------
Os005051_Os01t0 ---ISEWERTFATVGPINPAASIL-----DPAGSGGL------GGLGG------------
Os037857_Os11t0 ---------------------------------SGGC------GGWPGVD--WA-AVGDD
Os015522_Os03t0 ------------------------------PRVKG-------------------------
Os012854_Os03t0 H----------LDPSSSAAASTSAG-AVVEPPAVTGKRKRSSDGGEPTIQ----------
Os007249_Os02t0 ----------------------------------QLFHG--KVAGAHQQQQQM-------
Os023187_Os06t0 --------------------------ATNKPADHYTDEG--DILQVSDKQQEVA------
Os010934_Os03t0 FHRIEPSKKVSFHSNPAATAVSKATEKFHFPVTTK-------VSGRVSIFSKFK-ALIRD
Os029651_Os07t0 ------------------------------------------------------------
Os013975_Os03t0 -------------------AAANQG-MFQWPAATQAG----LVGG---------------
Os028650_Os07t0 DRSLSEAGAVAIDTGDAANGANTMP-AFINPLGVQGA----------TYQQHQA-IMG--
Os007248_Os02t0 ----------------------------------QLFHG--KVAGAHQQQQQM-------
Os024821_Os06t0 ---L------------------------FLSGGMQAGVSSQPLSGGGAFHWQSGMDVKVE
Os000052_Os01t0 --------------------------QQQMDMAGGGFVV---------------------
AT5G13180.1 -------LNLLPSSPSSD--------------------HASSGVTT--------------
Os000047_Os01t0 ---------FEPQTPAAA------------------------------------------
Os008451_Os02t0 ------CNKGERERLSGA--------------------SQDTGLTSSE------------
Os037858_Os11t0 GFVIDSSLFELPSPAAFS---------------------RAAGD----------------
Os039904_Os12t0 ---------LLPSDSRGS--------------------GFGGGYC---NQQLSE------
Os002083_Os01t0 ---------SEPSSLVVS--------------------PQ--------------------
Os036787_Os10t0 ---------AT----------------------------DDDDMAALLLLDG--------
Os037415_Os11t0 ------------------------------------------------------------
Os009848_Os02t0 WRMTL-PWESLPCTTEVS--------------------TNFQSTKCYT------------
Os030211_Os08t0 -----SNLDAAPCSSVDGSSSCIINEGESERTMEKPEIEENAGSTLAE------------
Os027435_Os07t0 ---------TEP-LGA--------------------------------------------
Os039905_Os12t0 ALE---NVIAVPNFGTLL--------------------PSSN------------------
Os029809_Os08t0 ---------HLPSASSSK---------------------NSNNISSSGFID---------
Os032093_Os08t0 ----------PPAVPRGA------------------------------------------
Os011013_Os03t0 ---------ATAEAAAAAVAG-----------VSSPLDHGDDDMAALLFLN---------
Os034288_Os09t0 QLVER----YWP----GS--------------------YQM-------------------
Os008987_Os02t0 ---------ASASASTRR------------------------------------------
Os005051_Os01t0 -----------------------------------------GGS----------------
Os037857_Os11t0 GFVIDSSLFELPSPAAFS---------------------RAAGD----------------
Os015522_Os03t0 ---------TTPRAGAGM------------------------------------------
Os012854_Os03t0 ---------ALPPAAAAA--------------------KKPNGSCVGATFQI--------
Os007249_Os02t0 ---------AMDAASSLQ---------------RLPF-HHYLGLEAADLLK---------
Os023187_Os06t0 -----AADYASTSTSSSQ-------------------------------ID---------
Os010934_Os03t0 KF-----LMMRPSHSYQR--------------------LGSKETTVNELLQIVSLLLAPK
Os029651_Os07t0 --------FSLPASATNY--------------------NHSSGAMADQAIR---------
Os013975_Os03t0 ------TVFAAAHKAAGT--------------------MPFGGGCS--------------
Os028650_Os07t0 --------ASLPSESAAA-----------------------AAAC---NFQ---------
Os007248_Os02t0 ---------AMDAASSLQ---------------RLPF-HHYLGLEAADLLK---------
Os024821_Os06t0 GAVGR----APPQMAVGP--------------------GQLDGAFA--------------
Os000052_Os01t0 ---------SEPSSLVVS--------------------PQDAADQNN-------------
AT5G13180.1 ------------------------------------------------------------
Os000047_Os01t0 --------------------------------------------------------G---
Os008451_Os02t0 ------------------------------------------------------VNPGEI
Os037858_Os11t0 --------------------------------------------------------GAAF
Os039904_Os12t0 -----------------------------------------------------TATGFQF
Os002083_Os01t0 ---------------------------------------------------------ATW
Os036787_Os10t0 -----------------GGQEDDA-----------GRWLGSAGLLSAVAADATTDCGLGT
Os037415_Os11t0 ------------------------------------------------------------
Os009848_Os02t0 ------------------------------------------------------------
Os030211_Os08t0 --GGTCHEDDQKEHDASAANAKSVLRL------------------------RKTAEGSDK
Os027435_Os07t0 ------------------------------------------------------------
Os039905_Os12t0 -----------------------------------------------------KLKGLSK
Os029809_Os08t0 -------------------DRD--------------------------------------
Os032093_Os08t0 ------------------------------------------------------------
Os011013_Os03t0 -----------------SDERDEV-----------DRWTGLLG------------SGAGA
Os034288_Os09t0 ------------------------------------------------------------
Os008987_Os02t0 ------------------------------------------------------------
Os005051_Os01t0 --------------------------------------------------------DPLL
Os037857_Os11t0 --------------------------------------------------------GAAF
Os015522_Os03t0 --------------------------------------------------------GM--
Os012854_Os03t0 --------------------------------------------------------GSAL
Os007249_Os02t0 ------------------------------------------------------------
Os023187_Os06t0 ------------------------------------PWK---------------------
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