fioreDB : Database for Flower Bio-engineering by CRES-T system
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Input Putative repression domain
AT5G18550.1 not found
Ortholog Putative repression domain Reverse top hit Relation Blast score ratio Type
Os001336 not found in 476aa AT2G47850.3 not_not 0.434456928 III
Os001329 not found in 466aa AT2G47850.3 not_not 0.433208489 III
Os001338 not found in 464aa AT2G47850.3 not_not 0.430711610 III

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CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)


AT5G18550.1     MERY--------GGAGEDESRSDPSHEWSAQGTETGIEASMWRLGL------RGGGGGGE
Os001338_Os01t0 MSSCVLVLVLL-----------------------VVVAGPMWRMGLGGGGGGGGGGGGGD
Os001329_Os01t0 MEP---YAAAEGGGGGG-----------GGGSTDTGLEESMWRMGL-----GGGGGGGGE
Os001336_Os01t0 MEQPHAAAAAAGGGEGE-----------GGASPDTGLEGPMWRMGLGGGGGGGGGGGGGD
                *.                                . :  .***:**       ******:

AT5G18550.1     T-----FPERPDEPDCIYYLRTGVCGYGSRCRFNHPRNRAPVL----GGLRTEAGEFPER
Os001338_Os01t0 GDAAGRLPERPGEEDCVYYLRTGACGFGDRCRYNHPRDRGGTE-FGGGARNAAALDYPER
Os001329_Os01t0 AVAAGRLPERPGEADCVYYLRTGACGYGENCRYNHPRDRAAAAVLNGGGKTTHSAEYPER
Os001336_Os01t0 GDAAGRLPERPGEEDCVYYLRTGACGFGDRCRYNHPRDRGGTE-FGGGARNAAALDYPER
                      :****.* **:******.**:*..**:****:*. .     *.  : : ::***

AT5G18550.1     MGQPVCQHFMRTGTCKFGASCKYHHPRQGGGGDSVTPVSLNYMGFPLRPGEKECSYFMRT
Os001338_Os01t0 AGQPICEYYMKTGTCKFGTNCKYHHPKQDG---AVLPVMLNNSGFPIRLGEKECSYYMKT
Os001329_Os01t0 PGQPVCEYYMKNGTCKFGSNCKYDHPRE-G---SVQAVMLNSSGYPLRSGEKDCTYYVKT
Os001336_Os01t0 AGQPICEYYMKTGTCKFGTNCKYHHPKQDG---AVLPVMLNNSGFPIRLGEKECSYYMKT
                 ***:*:::*:.******:.***.**:: *   :* .* **  *:*:* ***:*:*:::*

AT5G18550.1     GQCKFGSTCRYHHPVPPGVQAPSQQQQQQLSAGPTMYPSLQSQTVPSSQQYGVV----LA
Os001338_Os01t0 GQCKFGTTCKFHHPEFGGV-----------PMTPGIYPPLQSPSIASPHPYASLANWQMG
Os001329_Os01t0 GHCKFGSTCKFHHPEIGGV-----------SETPNMYPPVQPQPISSSHPYQHLAGWQMG
Os001336_Os01t0 GQCKFGTTCKFHHPEFGGV-----------PMTPGIYPPLQSPSIASPHPYASLANWQMG
                *:****:**::***   **           .  * :**.:*. .:.*.: *  :    :.

AT5G18550.1     RPQLLPGSYVQSPYGYGQMVLPPGMVPYSGWNPYQASVSAMPSPGTQPSMGTSSVYGITP
Os001338_Os01t0 RPPVVPGSYI--PGSYTPMMLSSGMIPLQGWSPYPASVNPVVSGGAQQNVQAGPVYGMGH
Os001329_Os01t0 RPPVLPGSFL--SGSYPPMMLPSTVVPMQGWNPYISPVNQVASAGGHQTVQAGPFYGLSH
Os001336_Os01t0 RPPVVPGSYI--PGSYTPMMLSSGMIPLQGWSPYPASVNPVVSGGAQQNVQAGPVYGMGH
                ** ::***::  . .*  *:*.. ::* .**.** :.*. : * * : .: :...**:  

AT5G18550.1     LSPSAPAYQSGP-----SSTGVSN---KEQTFPQRPEQPECQYFMRTGDCKFGTSCRFHH
Os001338_Os01t0 HGSSSTIAYGGPYVPYASSTGQSSNNQQEHGFPERPGQPDCQYYMRTGDCKFGATCKYHH
Os001329_Os01t0 QGPSAAVTYGSQYAPLSSSTMPSSSSKQEPAFPARPGQPECQYYLKTGSCKFGSACKYHH
Os001336_Os01t0 HGSSSTIAYGGPYVPYASSTGQSSNNQQEHGFPERPGQPDCQYYMRTGDCKFGATCKYHH
                 ..*:.   ..      ***  *.   :*  ** ** **:***:::**.****::*::**

AT5G18550.1     PMEAASPEAS-TLSHIGLPLRPGAVPCTHFAQHGICKFGPACKFDHSLGSSSLSYSPSPS
Os001338_Os01t0 PRELSAPKSGYMVNSLCLPLRPGAQPCAYYAQNGYCRYGVACKYDHPMG--TLGYSPSAL
Os001329_Os01t0 PQYLNTPKSNCMLSPLGLPLRPGSQPCAYYTQHGFCKFGPTCKFDHPMG--TLSYSPSAS
Os001336_Os01t0 PRELSAPKSGYMVNSLCLPLRPGAQPCAYYAQNGYCRYGVACKYDHPMG--TLGYSPSAL
                *    :*::.  :. : ******: **::::*:* *::* :**:**.:*  :*.****. 

AT5G18550.1     SLTDMPVAPYP--SSLGTLAPSS-SSDQCTELISSS--SIEPITTTTGGSETVAAGVS--
Os001338_Os01t0 PLSDMPIAPYPIGFSIATLAPSSPSPDLRPEYISTKDQSVNQVTSPVAASEPVGSILPKG
Os001329_Os01t0 SITDLPIAPYPLNYAVAPVAPPSSSSDLRPEYLLTKEFSANQSASPGTTCGPAGAMLK--
Os001336_Os01t0 PLSDMPIAPYPIGFSIATLAPSSPSPDLRPEYISTKDQSVNQVTSPVAASEPVGSILPKG
                .::*:*:****   ::..:**.* *.*  .* : :.  * :  ::.   . ...: :   

AT5G18550.1     SMTSDVSHPEPAETNKGDSASNEAKTSS
Os001338_Os01t0 VFPADTMMRAQTNTTSGGSSSPGGGR--
Os001329_Os01t0 AYAPHMLIRPQT-SGAGGMVTTHGGEL-
Os001336_Os01t0 VFPADTMMRAQTNTTSGGSSSPGGGR--
                  ...      : :  *.  :  .    


BoxShade v3.31 C (beta, 970507) Output
AT5G18550.1     M E R Y - - - - - - - - G G A G E D E S R S D P S H E W S A Q G T E T G I E A S M W R L G L - - - - - - R G G G G G G E
Os001338_Os01t0    M S S C V L V L V L L - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - V V V A G P M W R M G L G G G G G G G G G G G G G D
Os001329_Os01t0    M E P - - - Y A A A E G G G G G G - - - - - - - - - - - G G G S T D T G L E E S M W R M G L - - - - - G G G G G G G G E
Os001336_Os01t0    M E Q P H A A A A A A G G G E G E - - - - - - - - - - - G G A S P D T G L E G P M W R M G L G G G G G G G G G G G G G D
 
AT5G18550.1     T - - - - - F P E R P D E P D C I Y Y L R T G V C G Y G S R C R F N H P R N R A P V L - - - - G G L R T E A G E F P E R
Os001338_Os01t0    G D A A G R L P E R P G E E D C V Y Y L R T G A C G F G D R C R Y N H P R D R G G T E - F G G G A R N A A A L D Y P E R
Os001329_Os01t0    A V A A G R L P E R P G E A D C V Y Y L R T G A C G Y G E N C R Y N H P R D R A A A A V L N G G G K T T H S A E Y P E R
Os001336_Os01t0    G D A A G R L P E R P G E E D C V Y Y L R T G A C G F G D R C R Y N H P R D R G G T E - F G G G A R N A A A L D Y P E R
 
AT5G18550.1     M G Q P V C Q H F M R T G T C K F G A S C K Y H H P R Q G G G G D S V T P V S L N Y M G F P L R P G E K E C S Y F M R T
Os001338_Os01t0    A G Q P I C E Y Y M K T G T C K F G T N C K Y H H P K Q D G - - - A V L P V M L N N S G F P I R L G E K E C S Y Y M K T
Os001329_Os01t0    P G Q P V C E Y Y M K N G T C K F G S N C K Y D H P R E - G - - - S V Q A V M L N S S G Y P L R S G E K D C T Y Y V K T
Os001336_Os01t0    A G Q P I C E Y Y M K T G T C K F G T N C K Y H H P K Q D G - - - A V L P V M L N N S G F P I R L G E K E C S Y Y M K T
 
AT5G18550.1     G Q C K F G S T C R Y H H P V P P G V Q A P S Q Q Q Q Q Q L S A G P T M Y P S L Q S Q T V P S S Q Q Y G V V - - - - L A
Os001338_Os01t0    G Q C K F G T T C K F H H P E F G G V - - - - - - - - - - - P M T P G I Y P P L Q S P S I A S P H P Y A S L A N W Q M G
Os001329_Os01t0    G H C K F G S T C K F H H P E I G G V - - - - - - - - - - - S E T P N M Y P P V Q P Q P I S S S H P Y Q H L A G W Q M G
Os001336_Os01t0    G Q C K F G T T C K F H H P E F G G V - - - - - - - - - - - P M T P G I Y P P L Q S P S I A S P H P Y A S L A N W Q M G
 
AT5G18550.1     R P Q L L P G S Y V Q S P Y G Y G Q M V L P P G M V P Y S G W N P Y Q A S V S A M P S P G T Q P S M G T S S V Y G I T P
Os001338_Os01t0    R P P V V P G S Y I - - P G S Y T P M M L S S G M I P L Q G W S P Y P A S V N P V V S G G A Q Q N V Q A G P V Y G M G H
Os001329_Os01t0    R P P V L P G S F L - - S G S Y P P M M L P S T V V P M Q G W N P Y I S P V N Q V A S A G G H Q T V Q A G P F Y G L S H
Os001336_Os01t0    R P P V V P G S Y I - - P G S Y T P M M L S S G M I P L Q G W S P Y P A S V N P V V S G G A Q Q N V Q A G P V Y G M G H
 
AT5G18550.1     L S P S A P A Y Q S G P - - - - - S S T G V S N - - - K E Q T F P Q R P E Q P E C Q Y F M R T G D C K F G T S C R F H H
Os001338_Os01t0    H G S S S T I A Y G G P Y V P Y A S S T G Q S S N N Q Q E H G F P E R P G Q P D C Q Y Y M R T G D C K F G A T C K Y H H
Os001329_Os01t0    Q G P S A A V T Y G S Q Y A P L S S S T M P S S S S K Q E P A F P A R P G Q P E C Q Y Y L K T G S C K F G S A C K Y H H
Os001336_Os01t0    H G S S S T I A Y G G P Y V P Y A S S T G Q S S N N Q Q E H G F P E R P G Q P D C Q Y Y M R T G D C K F G A T C K Y H H
 
AT5G18550.1     P M E A A S P E A S - T L S H I G L P L R P G A V P C T H F A Q H G I C K F G P A C K F D H S L G S S S L S Y S P S P S
Os001338_Os01t0    P R E L S A P K S G Y M V N S L C L P L R P G A Q P C A Y Y A Q N G Y C R Y G V A C K Y D H P M G - - T L G Y S P S A L
Os001329_Os01t0    P Q Y L N T P K S N C M L S P L G L P L R P G S Q P C A Y Y T Q H G F C K F G P T C K F D H P M G - - T L S Y S P S A S
Os001336_Os01t0    P R E L S A P K S G Y M V N S L C L P L R P G A Q P C A Y Y A Q N G Y C R Y G V A C K Y D H P M G - - T L G Y S P S A L
 
AT5G18550.1     S L T D M P V A P Y P - - S S L G T L A P S S - S S D Q C T E L I S S S - - S I E P I T T T T G G S E T V A A G V S - -
Os001338_Os01t0    P L S D M P I A P Y P I G F S I A T L A P S S P S P D L R P E Y I S T K D Q S V N Q V T S P V A A S E P V G S I L P K G
Os001329_Os01t0    S I T D L P I A P Y P L N Y A V A P V A P P S S S S D L R P E Y L L T K E F S A N Q S A S P G T T C G P A G A M L K - -
Os001336_Os01t0    P L S D M P I A P Y P I G F S I A T L A P S S P S P D L R P E Y I S T K D Q S V N Q V T S P V A A S E P V G S I L P K G
 
AT5G18550.1     S M T S D V S H P E P A E T N K G D S A S N E A K T S S
Os001338_Os01t0    V F P A D T M M R A Q T N T T S G G S S S P G G G R - -
Os001329_Os01t0    A Y A P H M L I R P Q T - S G A G G M V T T H G G E L -
Os001336_Os01t0    V F P A D T M M R A Q T N T T S G G S S S P G G G R - -
 
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