fioreDB : Database for Flower Bio-engineering by CRES-T system
fioreDB : Database for Flower Bio-engineering by CRES-T system
Input Putative repression domain
AT5G18550.1 not found
Ortholog Putative repression domain Reverse top hit Relation Blast score ratio Type
Gm045766 not found in 484aa AT5G18550.1 1st_1st 0.548064918 Ia
Gm019421 not found in 484aa AT5G18550.1 not_1st 0.539325842 II
Gm036773 not found in 475aa AT3G06410.1 not_not 0.521847690 III
Gm041702 not found in 468aa AT3G06410.1 not_not 0.516853932 III
Gm026533 not found in 460aa AT2G47850.3 not_not 0.485642946 III
Gm004136 not found in 471aa AT2G47850.3 not_not 0.483146067 III
Gm026532 not found in 404aa AT2G47850.3 not_not 0.460674157 III
Gm026534 not found in 343aa AT2G47850.3 not_not 0.439450686 III
Gm004137 not found in 353aa AT2G47850.3 not_not 0.436953807 III
Gm004134 not found in 339aa AT2G47850.3 not_not 0.424469413 III
Gm004135 not found in 309aa AT2G47850.3 not_not 0.411985018 III
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CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)


AT5G18550.1     MERYGGAGEDESRSDP--SHEWS-AQGTETGIEASMWRLGLRGGGGGGETFPERPDEPDC
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                                                    *:* :     * *::* *..  :*

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                 **:***.**:* ***:***::** * ..  *.  *:.***:*:* **::::*  **** 

AT5G18550.1     SCKYHHPRQ-GGGGDSVTPVSLNYMGFPLRPGEKECSYFMRTGQCKFGSTCRYHHPVPPG
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gm026532_Glyma1 SCKFHHPKN---GGEYLSQAPLNVYGYPLRSDEKECSYYLKTGQCKYGISCKFHHPQPAG
gm036773_Glyma1 SCKYHHPRQAGAGGAAATPVSLNYYGYPLRQGEKECSYYVKTGQCKFGATCKFHHPVPAG
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gm026534_Glyma1 SCKFHHPKN---GGGYLTQAPLNIYGYPLRPGEKECSYYLKTGQCKFGISCKFHHPQPAG
gm045766_Glyma1 SCKYHHPRQ--AAGT-ATPVPLNYYGYPLRVAEKECSYYVKTGQCKFGATCKFHHPQPAG
gm004135_Glyma0 SCKFHHPKN---GGGYLSQAPLNIYGYPLRLGEKECSYYLKTGQCKFGISCKFHHPQPAG
                ***:***::    *   :  .*.  *:***  :*****:::*****:* :*::*** *.*

AT5G18550.1     VQAPSQQQQQQLSAGPT-----MYPSLQSQTVPSSQQYG-----VVLARPQLLPGSYVQS
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gm004134_Glyma0 ------------TSLPTSAPQ-FYQQVQSPTVPLPEQYGGASTSLRVARPPVLPGSYVQG
gm026532_Glyma1 ------------TSLPASAAQ-FYQQVQSPTVPLPEQYVGASSSLRVARPPILPGSYVQG
gm036773_Glyma1 IQIP-PSPFAPVSPLPVPVPSPLYSTMQPPPGPSSQQIG-----VLVARPPMLPGSLVQS
gm004136_Glyma0 ------------TSLPASAPQ-FYQQVQSPTVPLPEQYGGASSSLRVARPPILPGSYVQG
gm026534_Glyma1 ------------TSLPTSAPQ-FYQQVQSPTVPLPEQYGGASTSLRVARPPVLPGSYVQG
gm045766_Glyma1 VQALAPSPVPPVSPLPVPVPSPMYPTVQIPSGPSQQQYG-----VLVARPPMLPGSVVQG
gm004135_Glyma0 ------------TSLPTSAPQ-FYQQVQSPTVPLPEQYGGASTSLRVARPPVLPGSYVQG
                            :. *.     :*  ::  . *  :*       : :*** :**** **.

AT5G18550.1     PYGYGQMVLPPGMVPYSGWNPYQASVSAMPSPGTQPS-MGTSSVYGITPLSPSAPA----
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gm004137_Glyma0 A--YGPVLLSPGVVQFPGWSHYSAPVSPVPSPGAQPA-VGATSLYGVTQLSSPTSAFARP
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gm026532_Glyma1 A--YGPVFLSPGVVQFPGWNHYSA------LPGTQPG-VGATSLYGVTQLSSPTSAFARP
gm036773_Glyma1 P--YGPVVLSPAMVPISGWGPYQASASGAVLPSGTPSNVGSAQLYGITQLPSPAAAYPGP
gm004136_Glyma0 A--YGPVLLSPGVVQFPGWSHYSAPVSPVPSPGAQPA-VGATSLYGVTQLSSPTSAFARP
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gm045766_Glyma1 P--YGPMVVSPAMVPFSGWSPYQAPATNPVLPSSNTSNAGSTQFYGISQLPSSPATFTGP
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                .  ** :.:.* :*  .**. *.*       *.  .   *:...**:: *... .:    

AT5G18550.1     YQSGPSSTGVSN---KEQTFPQRPEQPECQYFMRTGDCKFGTSCRFHHP-----MEAASP
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gm019421_Glyma0 YQPSGSSIGPSGASQKEHPFPERPDQPECHHYMKTGDCKFGPLCRYHHP-----PDKSAP
gm004134_Glyma0 YTPLSSTTGPSGSSLKDRFFPERPGEPECQYYLRTGDCKFGLACRYHHP-----RDHIV-
gm026532_Glyma1 YTLLPSSTGLSGSNLKEQLYPKRPGEPDCQYYLRTGDCKFGLACQYHHP-----QDHVV-
gm036773_Glyma1 YPPSGSPVGPPSSSQKEQAFPERSNQPEYQYYLKTGEVKFGPSYRYNPPPDMSVPDMSTP
gm004136_Glyma0 YTPLPSTTDPSRSNPKEQLYPERPGEPECQYYLRTGDCKFGLACRYHHP-----RDHIV-
gm026534_Glyma1 YTPLSSTTGPSGSNLKDQFFPERPGEPECQYYLRTGDCKFGLACRYHHP-----RDHIV-
gm045766_Glyma1 YQPSGSSIGPSGASQKEHPFPERPDQPECHHYMKTGECKFGLSCRYHHP-----PDKSAP
gm004135_Glyma0 YTPLSSTTGPSGSSLKDRFFPERPGEPECQYYLRTGDCKFGLACRYHHP-----RDHIV-
                *    *. . .    *:: :*:*. :*: ::: :**: ***   ::: *      :    

AT5G18550.1     EAS-TLSHIGLPLRPG-AVPCTHFAQHGICKFGPACKFDHSLGSSSLSYSPSPSSLTDMP
gm026533_Glyma1 -ARPLLSPVGLPLRPG-VQPCAFYLQNGHCKFGSTCKFDHPLG--STRYTPWVSSFIDVP
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gm004137_Glyma0 -ARPLLSPVGLPLRPN--------------------NWIH--------------------
gm019421_Glyma0 KANVTLSPVGLPLRPG-APPCTHYTQRGVCKFGSACKFDHPMG--SLSYSPSASSLADMP
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gm026532_Glyma1 -AQPLLSPVGLPLRPG-LQPCAFYLQNGHCKFGSTCKFDHSLG--SMRYSPSASSLIDVP
gm036773_Glyma1 KANVILSPAGLPLRPG-APACTHYAQHGVCKFGSACKFDHPMG--SMSYSPSASSLADMP
gm004136_Glyma0 -ARPLLSPVGLPLRPG-LQPCAFYLQNGHCKFGSTCKFDHPLG--SMRYSPSASSLIDVP
gm026534_Glyma1 -ARPLLSPVGLPLRP-----------------------VH--------------------
gm045766_Glyma1 KATVTLSPVGLPLRPG-APPCTHYTQRGVCKFGSACKFDHPMG--SLSYSPSASSLADMP
gm004135_Glyma0 -A-PLLSPVGLPLRP-----------------------VH--------------------
                 *   **  ******                        *                    

AT5G18550.1     VAPYP--SSLGTLAPSSSSDQCTELISSSSIEPITTTTGGSETVAAGVSSMTSDVSHP--
gm026533_Glyma1 VTPYPVGSLLSQLAPST---------TSSELRPELMSGSKKESLAARISSSGNSSGTSVG
gm041702_Glyma1 VAPYPVGSTISTLAPSS---------SSSELRPELTSGSSKESVPSRMSS-STLTGT---
gm004137_Glyma0 ---------------------------------------DRTSYSS--------------
gm019421_Glyma0 VAPYPVGSSIGTLALSS---------LSSELRPELGAGSNKESVASRMSSMSTSTGSV-G
gm004134_Glyma0 ------------------------------------------------------------
gm026532_Glyma1 VTPYLVGSLLSQLVPS----------TSADLRPELA------------------------
gm036773_Glyma1 VAPYPVGSTIATLAPSS---------SSSELRPEPSSGSSKESVPSRMPS-STLTGT---
gm004136_Glyma0 VTPYPVGSLLSQLAPST---------TSSDLRPELMSGSKKESFSARIPSSGNSSGTSVG
gm026534_Glyma1 ------------------------------------------------------------
gm045766_Glyma1 VAPYPVGSSIGTLAPSS---------SSSELRPELA-----------LDPFLTQAPN---
gm004135_Glyma0 ------------------------------------------------------------
                                                                            

AT5G18550.1     --------------EPAETNKGDSASN-EAKTSS------------------------
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gm041702_Glyma1 --------------QPPSQSSGPLATV-ISTTSSNVSPTST-----------------
gm004137_Glyma0 ----------------------------------------------------------
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gm004136_Glyma0 LIFSQGGSVSLSDVQLSSQSNAPPNSSRSTRQSGEIR---------------------
gm026534_Glyma1 ----------------------------------------------------------
gm045766_Glyma1 -HLLRVPVLQQLPVLPQVALSLTPQ----AKQCECIPHYYSFLSQFFNWPSLLKEVLK
gm004135_Glyma0 ----------------------------------------------------------
BoxShade v3.31 C (beta, 970507) Output
AT5G18550.1     M E R Y G G A G E D E S R S D P - - S H E W S - A Q G T E T G I E A S M W R L G L R G G G G G G E T F P E R P D E P D C
gm026533_Glyma1    M D L Y G R G Q A - R N G S N P V N Q P E W R - S P G T D T G L E E S M W H L T L - - - - G G G E S Y P E R P G V P N C
gm041702_Glyma1    M E Q Y G R S S E - G S R S D P - - S P E W A - G P E A Q T G L E E P M W Q L G M - - G G A G E E S Y P Q R P D E V D C
gm004137_Glyma0    M D L Y G R S P A - R N G P N P V N Q P E W S - S P G T D T A L E E S M W H L T L - - - - G G G E S Y P E R S G V P N C
gm019421_Glyma0    M E R Y G R A S E - G S Q S D P - - S P E W T V A A D V D A G L E E S S W Q L G L - - - - P G A E S Y P M R P D E A D C
gm004134_Glyma0    M D L Y G R A P A - R N G S N P L N Q P E W - - - - G T D T A L E E S M W H L T L - - - - G G V E S Y P E R P G V P N C
gm026532_Glyma1    M D L Y G R G P A - R N V H N P V N Q P E W R - S P G T D T G L E E S M W H L T L - - - G G G G E S Y P E R P G V P N C
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gm045766_Glyma1    M E R Y G R A S E - G S Q S D P - - S P E W T L A A G A D A G L E E S S W Q L G L - - - - A G A E S Y P M R P D E A D C
gm004135_Glyma0    - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - M W H L T L - - - - G G V E S Y P E R P G V P N C
 
AT5G18550.1     I Y Y L R T G V C G Y G S R C R F N H P R N R A P V L G G L - R T E A G E F P E R M G Q P V C Q H F M R T G T C K F G A
gm026533_Glyma1    V Y Y M R T G V C G Y G S R C R Y N H P R D R A A V A A A V - R V - T G D Y P E R V G E P P C Q Y Y L K T G T C K F G A
gm041702_Glyma1    T Y Y L R T G F C G F G S R C R F N H P R D R A A V A G A E - R T - T G E Y P E R V G Q P V C Q Y Y M R T R T C K F G S
gm004137_Glyma0    V Y Y M R T G V C G Y G G R C R Y N H P R D R A A V A A A V - R A - T G D Y P E R V G E P P C Q Y Y L K T G T C K F G A
gm019421_Glyma0    I Y Y L R T G F C G Y G T R C R F N H P R D R A A V I G A A P R T - G G E F P E R V G Q P V C Q Y Y M R T G S C K F G A
gm004134_Glyma0    V Y Y M R T G V C G Y G D R C R F N H P R D R A A V A A A V - R A - T G D Y P E R V G E P P C Q Y Y L K T G T C K F G A
gm026532_Glyma1    V Y Y M R T G V C G Y G G R C R Y N H P H D R A A V V A A V - R V - T G D Y P E R L G E P P C Q Y Y L K T G T C K F G A
gm036773_Glyma1    T Y Y L R T G F C G F G S R C R F N H P R D R A V V A G A E - R T - A G E H P E R V G Q P V C Q Y F M R T R T C K F G S
gm004136_Glyma0    V Y Y M R T G V C G Y G G R C R Y N H P R D R A A V A A A V - R A - T G D Y P E R V G E P P C Q Y Y L K T G T C K F G A
gm026534_Glyma1    V Y Y M R T G V C G Y G S R C R Y N H P R D R A A V A A A V - R V - T G D Y P E R V G E P P C Q Y Y L K T G T C K F G A
gm045766_Glyma1    I Y Y L R T G F C G Y G T R C R F N H P R D R A A V I G A A A R T - G G E F P E R V G Q P V C Q Y F M R T G L C K F G V
gm004135_Glyma0    V Y Y M R T G V C G Y G D R C R F N H P R D R A A V A A A V - R A - T G D Y P E R V G E P P C Q Y Y L K T G T C K F G A
 
AT5G18550.1     S C K Y H H P R Q - G G G G D S V T P V S L N Y M G F P L R P G E K E C S Y F M R T G Q C K F G S T C R Y H H P V P P G
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gm041702_Glyma1    S C K Y H H P R Q - - A G G T A A T P M S L S Y Y G Y P L R P G E K E C S Y Y V K T G Q C K F G A T C K F H H P V P A G
gm004137_Glyma0    S C K F H H P K N - - - G G G Y L S Q A P L N V Y G Y P L R P G E K E C S Y Y L K T G Q C K F G I S C K F H H P Q P A G
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gm026532_Glyma1    S C K F H H P K N - - - G G E Y L S Q A P L N V Y G Y P L R S D E K E C S Y Y L K T G Q C K Y G I S C K F H H P Q P A G
gm036773_Glyma1    S C K Y H H P R Q A G A G G A A A T P V S L N Y Y G Y P L R Q G E K E C S Y Y V K T G Q C K F G A T C K F H H P V P A G
gm004136_Glyma0    S C K F H H P K N - - - G G G Y L S Q A P L N V Y G Y P L R P G E K E C S Y Y L K T G Q C K F G I S C K F H H P Q P A G
gm026534_Glyma1    S C K F H H P K N - - - G G G Y L T Q A P L N I Y G Y P L R P G E K E C S Y Y L K T G Q C K F G I S C K F H H P Q P A G
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