fioreDB : Database for Flower Bio-engineering by CRES-T system
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Input Putative repression domain
AT5G23000.1 not found
Ortholog Putative repression domain Reverse top hit Relation Blast score ratio Type
Gm033972 not found in 340aa AT5G57620.1 1st_not 0.405745062 II
Gm031232 not found in 329aa AT5G57620.1 not_not 0.400359066 III
Gm037890 not found in 326aa AT5G57620.1 not_not 0.400359066 III
Gm033108 not found in 315aa AT2G36890.1 not_not 0.400359066 III

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CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)


AT5G23000.1     MGRAPCCDKTKVKRGPWSPEEDSKLRDYIEKYGNGGNWISFPLKAGLRRCGKSCRLRWLN
gm037890_Glyma1 MGRAPCCDKANVKRGPWSPEEDSKLKDYIEKHGTGGNWIALPQKAGLKRCGKSCRLRWLN
gm033972_Glyma1 MGRAPCCDKANVKRGPWSPEEDSKLKDYIEKHGTGGNWIALPQKAGLKRCGKSCRLRWLN
gm033108_Glyma1 MGRAPCCDKASVKRGPWSPEEDTKLKEYIEKHGTGGNWIALPQKAGLKRCGKSCRLRWLN
gm031232_Glyma1 MGRAPCCDKASVKRGPWSPEEDTKLKEYIEKHGTGGNWIALPQKAGLKRCGKSCRLRWLN
                *********:.***********:**::****:*.*****::* ****:************

AT5G23000.1     YLRPNIKHGDFSEEEDRIIFSLFAAIGSRWSIIAAHLPGRTDNDIKNYWNTKLRKKLLSS
gm037890_Glyma1 YLRPNIKHGEFSDEEDRIICSLYANIGSRWSIIATQLPGRTDNDIKNYWNTKLKRKLMG-
gm033972_Glyma1 YLRPNIKHGEFSDEEDRIICSLYANIGSRWSIIAAQLPGRTDNDIKNYWNTKLKRKLMG-
gm033108_Glyma1 YLRPNIKHGDFSDEEDRIICSLYVNIGSRWSIIAAQLPGRTDNDIKNYWNTKLKKKLMG-
gm031232_Glyma1 YLRPNIKHGDFSDEEDRIICSLYVNIGSRWSIIAAQLPGRTDNDIKNYWNTKLKKKLMG-
                *********:**:****** **:. *********::*****************::**:. 

AT5G23000.1     SSDSSSSAMASPYLNPISQDVKRP------TSPTTIPSS--------------SYNPYAE
gm037890_Glyma1 -------------LLPASHQRIAPFQQSSPQNLSSFPSH-----SHSSSLSSSIYSDYYN
gm033972_Glyma1 -------------LLPSSHQRIAPYQQFSSQNPSSFPSH--------SSLSSSQYRDYYY
gm033108_Glyma1 -------------LLPLSHHRKQP----------SFPSS-TLQNSPPSPSSDQLYGEYCT
gm031232_Glyma1 -------------LLPLSHHRKQP----------SFPSSFTLQNPPLSPSAHQLYGEYCT
                             * * *:.   *          ::**                *  *  

AT5G23000.1     NPNQ--Y---PTKSLISSIN-GFEAGDKQIISYINPNYPQDLYLSDSNNNTSNANGFLLN
gm037890_Glyma1 HNSNHYYMPAPTSSFTC-LE-PISV-------------PSSNYTNTT--TASTLNPFYQN
gm033972_Glyma1 NSSHHYYIPAPTSSFTC-LE-PISA-------------PSSNYTNTT--TTSNSLSFYQH
gm033108_Glyma1 ------YTPLTTTSFTSNIE-PFSL-------------PSSNYASTS--TTSVSHSFYQN
gm031232_Glyma1 ------YTPTTTTSFTSNIEPPFSL-------------PSSNYASTSDITTSVSHPFYQN
                      *   .*.*: . ::  :.              *.. * . :  .:*    *  :

AT5G23000.1     HN--------------MCD----------QYKNHTSFSSDVNGIRS-EIM-----MKQEE
gm037890_Glyma1 QEPLASIISPMQYYP-IKD------SSMLVFGSETSCS-SSDGSCS-QVSLGRE-VKQED
gm033972_Glyma1 QEPLVS-VSPRQYYP-ITD------SSMLVFGSETSCS-SSDGSCS-QVSLGRE-IKQED
gm033108_Glyma1 QDSMQQ-----CYHP-TRD------NNMLMFGSEGSCSTSSDGSCT-Q---GREIIKQEE
gm031232_Glyma1 QDSM-Q-----CYYPIMRDNSSNNNNNMLMFGSEGSCSTSSDGSCTNQ---GREIIKQEE
                ::                *           : .. * * . :*  : :       :***:

AT5G23000.1     IM----------MMMMIDH-------HID-QRTKGY-NGEFTQ---GY----------YN
gm037890_Glyma1 -MGFQ-------NFMFGDHQNMN---NINHDGGEEY---------------TQQTAMDYD
gm033972_Glyma1 -MGFQ-------NFMFGDHQNMNKFMNINHDGGEEY-VNQWTQRPNGYIFQTQQTALDYD
gm033108_Glyma1 -IGYHSYNNDY-NFML-NHSN-----NIN-DGEKSC-FGEWFS-------QTLLTPLDYD
gm031232_Glyma1 RIGCHSYNNNNDNFML-SHSN-----NIN-DGEKSCAAGEWFS-------QTLLAPLGYD
                 :           :*: .*       :*: :  :                        *:

AT5G23000.1     YYNGHGDLKQMISGTGTNSNINMGGSGSSSSSISN----LAENKSSGSLLLEYKCLPYFY
gm037890_Glyma1 LE----VIRNLIS------------SNSNSSNSNNEYLSVDENKT------EEKGVYYNY
gm033972_Glyma1 LE----VIKNLIC------------SNS-SSNSNNGYLSVDENKT------EEKGVYYNY
gm033108_Glyma1 LE----DIKQLIS------------SSSSTASFNN----VDENKT------EEKAMYYYY
gm031232_Glyma1 IE----DIKQLIS------------SSSSTTIFNN----VDENKT------EEKAMYYYY
                       ::::*.            *.* ::  .*    : ***:      * * : * *

AT5G23000.1     S-
gm037890_Glyma1 --
gm033972_Glyma1 CN
gm033108_Glyma1 Y-
gm031232_Glyma1 Y-
                  


BoxShade v3.31 C (beta, 970507) Output
AT5G23000.1     M G R A P C C D K T K V K R G P W S P E E D S K L R D Y I E K Y G N G G N W I S F P L K A G L R R C G K S C R L R W L N
gm037890_Glyma1    M G R A P C C D K A N V K R G P W S P E E D S K L K D Y I E K H G T G G N W I A L P Q K A G L K R C G K S C R L R W L N
gm033972_Glyma1    M G R A P C C D K A N V K R G P W S P E E D S K L K D Y I E K H G T G G N W I A L P Q K A G L K R C G K S C R L R W L N
gm033108_Glyma1    M G R A P C C D K A S V K R G P W S P E E D T K L K E Y I E K H G T G G N W I A L P Q K A G L K R C G K S C R L R W L N
gm031232_Glyma1    M G R A P C C D K A S V K R G P W S P E E D T K L K E Y I E K H G T G G N W I A L P Q K A G L K R C G K S C R L R W L N
 
AT5G23000.1     Y L R P N I K H G D F S E E E D R I I F S L F A A I G S R W S I I A A H L P G R T D N D I K N Y W N T K L R K K L L S S
gm037890_Glyma1    Y L R P N I K H G E F S D E E D R I I C S L Y A N I G S R W S I I A T Q L P G R T D N D I K N Y W N T K L K R K L M G -
gm033972_Glyma1    Y L R P N I K H G E F S D E E D R I I C S L Y A N I G S R W S I I A A Q L P G R T D N D I K N Y W N T K L K R K L M G -
gm033108_Glyma1    Y L R P N I K H G D F S D E E D R I I C S L Y V N I G S R W S I I A A Q L P G R T D N D I K N Y W N T K L K K K L M G -
gm031232_Glyma1    Y L R P N I K H G D F S D E E D R I I C S L Y V N I G S R W S I I A A Q L P G R T D N D I K N Y W N T K L K K K L M G -
 
AT5G23000.1     S S D S S S S A M A S P Y L N P I S Q D V K R P - - - - - - T S P T T I P S S - - - - - - - - - - - - - - S Y N P Y A E
gm037890_Glyma1    - - - - - - - - - - - - - L L P A S H Q R I A P F Q Q S S P Q N L S S F P S H - - - - - S H S S S L S S S I Y S D Y Y N
gm033972_Glyma1    - - - - - - - - - - - - - L L P S S H Q R I A P Y Q Q F S S Q N P S S F P S H - - - - - - - - S S L S S S Q Y R D Y Y Y
gm033108_Glyma1    - - - - - - - - - - - - - L L P L S H H R K Q P - - - - - - - - - - S F P S S - T L Q N S P P S P S S D Q L Y G E Y C T
gm031232_Glyma1    - - - - - - - - - - - - - L L P L S H H R K Q P - - - - - - - - - - S F P S S F T L Q N P P L S P S A H Q L Y G E Y C T
 
AT5G23000.1     N P N Q - - Y - - - P T K S L I S S I N - G F E A G D K Q I I S Y I N P N Y P Q D L Y L S D S N N N T S N A N G F L L N
gm037890_Glyma1    H N S N H Y Y M P A P T S S F T C - L E - P I S V - - - - - - - - - - - - - P S S N Y T N T T - - T A S T L N P F Y Q N
gm033972_Glyma1    N S S H H Y Y I P A P T S S F T C - L E - P I S A - - - - - - - - - - - - - P S S N Y T N T T - - T T S N S L S F Y Q H
gm033108_Glyma1    - - - - - - Y T P L T T T S F T S N I E - P F S L - - - - - - - - - - - - - P S S N Y A S T S - - T T S V S H S F Y Q N
gm031232_Glyma1    - - - - - - Y T P T T T T S F T S N I E P P F S L - - - - - - - - - - - - - P S S N Y A S T S D I T T S V S H P F Y Q N
 
AT5G23000.1     H N - - - - - - - - - - - - - - M C D - - - - - - - - - - Q Y K N H T S F S S D V N G I R S - E I M - - - - - M K Q E E
gm037890_Glyma1    Q E P L A S I I S P M Q Y Y P - I K D - - - - - - S S M L V F G S E T S C S - S S D G S C S - Q V S L G R E - V K Q E D
gm033972_Glyma1    Q E P L V S - V S P R Q Y Y P - I T D - - - - - - S S M L V F G S E T S C S - S S D G S C S - Q V S L G R E - I K Q E D
gm033108_Glyma1    Q D S M Q Q - - - - - C Y H P - T R D - - - - - - N N M L M F G S E G S C S T S S D G S C T - Q - - - G R E I I K Q E E
gm031232_Glyma1    Q D S M - Q - - - - - C Y Y P I M R D N S S N N N N N M L M F G S E G S C S T S S D G S C T N Q - - - G R E I I K Q E E
 
AT5G23000.1     I M - - - - - - - - - - M M M M I D H - - - - - - - H I D - Q R T K G Y - N G E F T Q - - - G Y - - - - - - - - - - Y N
gm037890_Glyma1    - M G F Q - - - - - - - N F M F G D H Q N M N - - - N I N H D G G E E Y - - - - - - - - - - - - - - - T Q Q T A M D Y D
gm033972_Glyma1    - M G F Q - - - - - - - N F M F G D H Q N M N K F M N I N H D G G E E Y - V N Q W T Q R P N G Y I F Q T Q Q T A L D Y D
gm033108_Glyma1    - I G Y H S Y N N D Y - N F M L - N H S N - - - - - N I N - D G E K S C - F G E W F S - - - - - - - Q T L L T P L D Y D
gm031232_Glyma1    R I G C H S Y N N N N D N F M L - S H S N - - - - - N I N - D G E K S C A A G E W F S - - - - - - - Q T L L A P L G Y D
 
AT5G23000.1     Y Y N G H G D L K Q M I S G T G T N S N I N M G G S G S S S S S I S N - - - - L A E N K S S G S L L L E Y K C L P Y F Y
gm037890_Glyma1    L E - - - - V I R N L I S - - - - - - - - - - - - S N S N S S N S N N E Y L S V D E N K T - - - - - - E E K G V Y Y N Y
gm033972_Glyma1    L E - - - - V I K N L I C - - - - - - - - - - - - S N S - S S N S N N G Y L S V D E N K T - - - - - - E E K G V Y Y N Y
gm033108_Glyma1    L E - - - - D I K Q L I S - - - - - - - - - - - - S S S S T A S F N N - - - - V D E N K T - - - - - - E E K A M Y Y Y Y
gm031232_Glyma1    I E - - - - D I K Q L I S - - - - - - - - - - - - S S S S T T I F N N - - - - V D E N K T - - - - - - E E K A M Y Y Y Y
 
AT5G23000.1     S -
gm037890_Glyma1    - -
gm033972_Glyma1    C N
gm033108_Glyma1    Y -
gm031232_Glyma1    Y -
 
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