Input
| Putative repression domain
|
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AT5G43410.1 |
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|
Ortholog
| Putative repression domain
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Gm028119 |
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III |
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III |
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0.537037037 |
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III |
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Get alignment file
Get formatted file made by BOXSHADE
Sequence file prepared (1 sec required). Alignment has started.
CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)
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gm011460_Glyma0 --LSPLATPQNKFDQTNPSPSESSNSESSSISLNHYF-------TDLL--EPEIEFP---
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gm053254_Glyma1 ----------------------------------------------VL------------
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gm042339_Glyma1 ---------------------------------------------------EQ-------
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gm035754_Glyma1 ------------------------------------------------------------
gm028117_Glyma1 --------FNENDPEEM--------------LLYGMIAGAT-----TEEHSGERASS---
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gm055217_Glyma2 G-LDMGSNFSEQ---SSFCKFLECFDFEA--EVVGLTSHHK---VQSSIATSPPQNF-NF
gm036964_Glyma1 RWISMGADFWEE-------------------VLDGIILPNT-----SNREDS-SHNN---
gm025872_Glyma0 --------FSDP-KCDG--------------DLENIIVFRS---E---------------
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gm050324_Glyma1 --------FSDPNKCDG--------------DSGN-IAFRS---E---------------
gm055290_Glyma2 ---------------------------------------------------QK-------
gm053963_Glyma2 S--GLTTTMSQTT-TTT--------------TIATTMYNNN---QVTS---SS-------
gm053254_Glyma1 ------------------------------------------------TQAGATSSV--S
gm026693_Glyma1 ---------------------------------------------------KR-------
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gm007220_Glyma0 ------------------------------------------------------------
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gm035755_Glyma1 NSSGSLV--ST--ESQLEVSSNLTHAS-HQL-ETHAS--PQPPKEGNKDKRPFRGVRRRP
gm002627_Glyma0 -----------------NKDED-------------------------QEHVKYRGVRRRP
gm027426_Glyma1 PEEQPMVSSSS------EEKPTMKKSEHY------------------DEAKRYRGVRRRP
gm026696_Glyma1 NSSGSLV--SSTESSQLEVSSNLTHAS-HQLKETHASPQPQPPKETNKDKRPFRGVRRRP
gm011460_Glyma0 -----LI--AVP-----KKTEWIQFGN-----PEVAAP------ENQPEKKHYRGVRQRP
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gm007221_Glyma0 NVSSCIG--SV--ELQ-EVSSNTTYKEVKKVRPPPPSP-PLPSQQVAKEPRMYRGVRKRP
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gm035754_Glyma1 -----------------SASNG-------------------------NCEVRYRGIRRRP
gm028117_Glyma1 -----------------EESAAARK------------------------EKSYRGVRRRP
gm052299_Glyma1 S----------------------------------SLP-LLPSQQ-AKEQKMYRGVRKRP
gm053964_Glyma2 PE--PLV--SS------KEKP--KKLE-Y------------------DKAKRYRGVRRRP
gm055217_Glyma2 PEE-PMV--SM------K-----KEATCY-------------------ATRHYRGVRRRP
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gm041539_Glyma1 ---LEIG--SA------NETHNKVGDA---------------VRIEKSVTKHYRGVRRRP
gm006738_Glyma0 NVSVAVK--ME------NEGQNSKTTA------------ARGTRTPPKKGLSYRGVRRRP
gm028190_Glyma1 PEE-PMV--ST------K-----KEATCY-------------------ATRRYRGVRRRP
gm050324_Glyma1 -----------------DATAVVARD------------------HAPPTWKHYRGVRRRP
gm055290_Glyma2 ----------------AGKLQG-------------------------KEEVRYRGVRRRP
gm053963_Glyma2 -----------------DETNN------------------------IKENKHYRGVRRRP
gm053254_Glyma1 HGSGSVV--EA------EVSVS------------------------------YRGVRRRP
gm026693_Glyma1 -----------------DTK----------------------------GEPRYRGVRRRP
gm002626_Glyma0 -----------------EENNNKNKK--------------------NNNKSSFRGVRSRP
gm007220_Glyma0 -----------------GVVNGN----------------------PSNADVRYRGIRRRP
: *:* **
AT5G43410.1 WGKYAAEIRDSRKHGERVWLGTFDTAEEAARAYDQAAYSMRGQAAILNFPHEYN-MGSG-
gm035755_Glyma1 WGKFAAEIRDSTRNGVRVWIGTFDTAEAAALAYDQAALSTRGSMAVLNFPEEVVRESLKD
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gm027426_Glyma1 WGKFAAEIRDPTRKGTRVWLGTFDSEIDAAKAYDCAAFKMRGQKAILNFPLEAGESDPK-
gm026696_Glyma1 WGKFAAEIRDSTRNGVRVWIGTFDTAEAAALAYDQAALSTRGSMAVLNFPEEVVRESLKD
gm011460_Glyma0 WGKFAAEIRDPNKRGSRVWLGTFDTAIEAAKAYDRAAFRLRGSKAILNFPLEVNTAAET-
gm036965_Glyma1 WGKYAAEIRDSARHGARIWLGTFQTAEEAAMAYDRAAFKMRGSKALLNFPAEIVAAATAT
gm035752_Glyma1 WGKYAAEIRDTTRNGTRVWLGTFDTAEAAALAYDQAAFSMRGHNAVLNFPIKRVKDSLQE
gm028118_Glyma1 WGKYAAEIRDPSKQGSRLWLGTFDTAEEAARAYDRAAFNLRGHLAILNFPSEYYSQIRG-
gm026694_Glyma1 WGKFAAEIRDTTRNGTRVWLGTFDTAEAAALAYDQAAFSMRGQSAVLNFPVKRVKESLQE
gm007221_Glyma0 WGKFAAEIRDSTRNGVRVWIGTFDTAEAAALAYDQAAFSTRGSLAVLNFPEEVVRESLKD
gm028119_Glyma1 WGKFAAEIRDSTRQGQRVWLGTFNTAEEAARAYDRAAYTMRGPFAILNFPDEYPVTAAG-
gm026388_Glyma1 WGKFAAEIRDSTRHGVRVWLGTFDNAEAAALAYDQAAFSMRGSGAVLNFPVEKVKESLRD
gm035749_Glyma1 WGKFAAEIRDPARHGARVWLGTFLTAEEAARAYDRAAYEMRGALAVLNFPNEYPSCSSM-
gm027425_Glyma1 WGKYAAEIRDPNRKGSRVWLGTFDTAIEAAKAYDKAAFKMRGSKAILNFPLEIGSDQSKE
gm026695_Glyma1 WGKFAAEIRDPTRKGTRIWLGTFDTAEQAARAYDAAAFHFRGHRAILNFPNEYQSHNPN-
gm042339_Glyma1 WGKFGAEIRDPTKSTGRQWLGTFDTAEEAARAYDRAAIELRGALAILNFPDEYYAHLPF-
gm055291_Glyma2 WGKFAAEIRDSTRHGMRVWLGTFDSAEAAALAYDQAAFSMRGSAAILNFPVEIVRESLKE
gm041538_Glyma1 WGKYAAEIRDSARHGARIWLGTFQTAEEAAMAYDRAAFKMRGSKALLNFPAEIVA---AT
gm035754_Glyma1 WGKFAAEIRDPTRKGTRIWLGTFDTAEQAARAYDAAAFHFRGHRAILNFPNEYQSHNPN-
gm028117_Glyma1 WGKFAAEIRDSTRHGMRVWLGTFDSAEAAALAYDQAAFSMRGSAAILNFPAEIVRESLKE
gm052299_Glyma1 WGKFAAEIRDSTRNGVRVWIGTFDTAEAAALAYDQAAFSTRGSLAVLNFPEEVVSESLKD
gm053964_Glyma2 WGKFAAEIRDPTRKGTRVWLGTFDSEIDAAKAYDCAAFKMRGQKAILNFPLEAGLSDPK-
gm055217_Glyma2 WGKFAAEIRDPKKKGSRVWLGTFDTEIDAAKAYDCAAFRMRGHKAVLNFPLEAGMSHPE-
gm036964_Glyma1 WGKYAAEIRDSSKKGARVWLGTFDTAEEAALAYDKAALRIRGPKAYLNFPLERGANALAC
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gm041539_Glyma1 WGKYAAEIRDSSKKGARVWLGTFDTAEEAALSYDKAALRIRGPKAYLNFPLEMVANALAC
gm006738_Glyma0 WGKYAAEIRDTKRNGVRVWLGTYETAEDAALAYDRAAFKMRGSKAKLNFPHLIGSD----
gm028190_Glyma1 WGKFAAEIRDPKKKGSRVWLGTFDTEIDAAKAYDCAAFRMRGHKAVLNFPLEAGMSHPE-
gm050324_Glyma1 WGKFAAEIRDPKKNGARVWLGTYDTEEKAALAYDKAAFKMRGQKAKLNFPHLIDSDNSDE
gm055290_Glyma2 WGKYAAEIRDPSKQGSRLWLGTFDTAEEAARAYDRAAFNLRGHLAILNFPSEYYSQIRG-
gm053963_Glyma2 WGKYAAEIRDPNRKGSRVWLGTFDTAIEAAKAYDKAAFKMRGSKAILNFPLEIG---ESE
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gm026693_Glyma1 WGKFAAEIRDPARHGARVWLGTFLTAEEAARAYDRAAYEMRGALAVLNFPNEYPSCSSM-
gm002626_Glyma0 WGKFAAEIRDSTRHGVRVWLGTFDSAEAAALAYDQAAFSMRGSAAVLNFPVEKVKESLRD
gm007220_Glyma0 WGKFAAEIRDPTRKGARIWLGTFDTAEQAARAYDAAAFHFRGHKAILNFPNEYGNVTPNP
***:.*****. : * *:**: . ** :** ** ** * ****
AT5G43410.1 ---------------VSSSTAMAGSSS----------AS-ASASSSS-------------
gm035755_Glyma1 MQNNNKP--SLEDG-SSPVLALKRKHT------MRRKSKATNKKTKRGHGMELENI-VLS
gm002627_Glyma0 ---------------ASSSSSSSSSSS----------SS-SSSSSSSSSSSSS-------
gm027426_Glyma1 ---------------PNNSCGRKRRRD---------QNH---------------------
gm026696_Glyma1 MQSNNKP-ISLEDG-SSPVLALKRKHT------MRRKSKATNKKNKRDHGMESQNVNIIS
gm011460_Glyma0 -----V---------SVAAVDVERKRR--------REEE------------------EVV
gm036965_Glyma1 ELSF-----------KSSSNNNNNNNN----------NN-PDAVSDSSAGSSCTNN-ST-
gm035752_Glyma1 IQYS-----C-CNG-SSPALALKERHC------IQRKFS-SKAKKCKGKGTSEDPT----
gm028118_Glyma1 ---------------SPPYPPHLATPS----------SS-SHASESTSSAAQQ-------
gm026694_Glyma1 IQYS-----CFFNGSSSPALALKERHC------IQRKLS-SKGKKCKGKETSE-------
gm007221_Glyma0 MPS--KP---WEEG-SSPVLALKRKHT------MRTKSN-SKKKTKVDQREQLDFS-RTS
gm028119_Glyma1 ---------------ATNAATYSSASS----------SS-SLASSSRHADVEA-------
gm026388_Glyma1 M---------KLDG-CSPVVALKRRHS------L----A-AKRKK---------------
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BoxShade v3.31 C (beta, 970507) Output
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