|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Get sequence file Get alignment file Get formatted file made by BOXSHADE Sequence file prepared (0 sec required). Alignment has started. CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475) AT5G47390.1 --------------MTRRCSHCNHNGHNSRTCPNRGVKLFGVRLTEGS-IRKSASMGNLS gm011445_Glyma0 --------------MTRRCSHCSHNGHNSRTCPNRGVKLFGVRLTDGS-IRKSASMGNLT Os037028_Os10t0 --------------MTRRCSHCSHNGHNSRTCPNRGVKIFGVRLTDGS-IRKSASMGNLS pt011546_POPTR_ --------------MTRRCSHCSHNGHNSRTCPNRGVKLFGVRLTDGS-IRKSASMGNLS pp024115_Pp1s70 --------------MARGCSHCGHNGHNSRTCPDRGVRLFGVRLTDGV-MRKSVSMGNLS Sb021158_Sorbi1 LAAGGGGGGGGGGGMTRRCSHCSHNGHNSRTCPNRGVKIFGVRLTDGSAIRKSASMGNLS *:* ****.**********:***::******:* :***.*****: AT5G47390.1 HYT---GSGS--GGHGTGSNTPGSPGDVPDHV----AGDGYASEDFVAG-SSSSRERKKG gm011445_Glyma0 HYA---GSGS--APLHVGLNNPGSPGETPDHA--AAAADGYASEDFVPGSSSSSRERKKG Os037028_Os10t0 LLSSAAGSTS--GG--------ASPADGPDAA--PTAADGYASDDFVQGSSSATRDRKKG pt011546_POPTR_ HYT---GSSNVGGPLTSGPNNPGSPGDTPDHGI-AAAAAGYASEDFVPG-SSSSRERKKG pp024115_Pp1s70 HYA--------------SPNNPSSP---PSHSESGAGGDGYVSDGLVQT-SNNTRERKKG Sb021158_Sorbi1 LLS--AGSTS--GG--------ASPADGPDLA--DGGAGGYASDDFVQGSSSASRERKKG : .** *. .. **.*:.:* *. :*:**** AT5G47390.1 TPWTEEEHRMFLLGLQKLGKGDWRGISRNYVTTRTPTQVASHAQKYFIRQSNVSRRKRRS gm011445_Glyma0 VPWTEEEHRMFLLGLQKLGKGDWRGIARNYVISRTPTQVASHAQKYFIRQSNVSRRKRRS Os037028_Os10t0 VPWTEEEHRRFLLGLQKLGKGDWRGISRNFVVSRTPTQVASHAQKYFIRQSNMTRRKRRS pt011546_POPTR_ VPWTEEEHRMFLLGLQKLGKGDWRGIARNYVISRTPTQVASHAQKYFIRQSNVSRRKRRS pp024115_Pp1s70 VPWTEEEHRLFLLGLQKLGKGDWRGISRNFVQTRTPTQVASHAQKYFIRQSNINKRKRRS Sb021158_Sorbi1 VPWTEEEHRRFLLGLQKLGKGDWRGISRNFVVSRTPTQVASHAQKYFIRQSNMSRRKRRS .******** ****************:**:* :*******************:.:***** AT5G47390.1 SLFDMVPDEVGDIPMDLQEPEEDNIPVETEMQGADSIHQTLAPSSLH------------- gm011445_Glyma0 SLFDIVADEAADTAMVQQD-FLSANELPTETEGNNPL-----PA---------------- Os037028_Os10t0 SLFDMVPDESMDLP-----PLPGGQEPETQVLNQPAL-----P----------------- pt011546_POPTR_ SLFDIVADEPGDTPMESQD-FLSTIEQESEAQSENPV-----PV---------------- pp024115_Pp1s70 SLFDIVS-ETGPTPI-LEEPTTKAVPDMSAPLHQLSL----GPNSTYPGVFYDPNSSHGF Sb021158_Sorbi1 SLFDMVPDESMDLP-----PLPGSQEPETSVLNQAPL-----P----------------- ****:*. * . : .: * AT5G47390.1 -----APSILEIEECESMDSTNSTTGEPTATAAAASSSSRLEETTQLQSQLQPQPQLPGS gm011445_Glyma0 ------PPPLD-EECESMDSTNSNDGEPAPSKPENTHP---------------------S Os037028_Os10t0 ------PPREE-EEVDSMESDTSAVAESSSASAIMPDN------------LQS------T pt011546_POPTR_ -------PPLD-EECESMDSTNSNDGEPPPPKPDCSQS---------------------A pp024115_Pp1s70 IRPFMLPPTSLAVPIMSMGPVALGASEQIPETSAVNFN------GDAARAMRPM-----G Sb021158_Sorbi1 ------PP-VE-EEVESMESDTSAVAESSTASALMPES------------LQP------N . ** . .* . . AT5G47390.1 FPILYPTYFSPYYPFPFPIW---PAGYVPEPPKKEETHEILRPTAVHSKAPIN--VDELL gm011445_Glyma0 YPMLYPAYYSPVFPFPLPYW----SGYSPEPTKKEETHEVLKPTAVHSKSPIN--VDELV Os037028_Os10t0 YPVIVPAYFSPFLQFSVPFW----QNQKDEDGPVQETHEIVKPVPVHSKSPIN--VDELV pt011546_POPTR_ YPVVYPSYFSPFFPFSFPFW----SGHSAEPTKT-ETHEVLKPTAVHSKSPIN--VDELV pp024115_Pp1s70 IPVSGPSG-AMGIPYPFPMFSMLPRGY--NRPVNSADSKVLRPTAKLSTEPLNVGVDETK Sb021158_Sorbi1 YPMIVPAYFSPFLQFSVPFW----PNQEDGGDLPQETHEIVKPVAVHSKNPIN--VDELV *: *: : :..* : . ::::*.. *. *:* *** AT5G47390.1 GMSKLSLAES-NKHGESDQSLSLKLGGGSSSRQSAFHPNPSSDSSDIK---SVIHAL gm011445_Glyma0 GISKLSLGESIGDSGPS--TLSRKLIEEGPSRQSAFHATP--TCGDMN--GSAIHAV Os037028_Os10t0 GMSKLSIGES-NQETVS-TSLSLNLVGGQN-RQSAFHANP----------PTRAQA- pt011546_POPTR_ GMSKLSLGESIGQDGPS--SLSQKLLEGSP-RQSAFHANPASNSSSMNRSSSPIHAV pp024115_Pp1s70 DMSQLNLGLS----TPEPSQLTLKLLDQPSRSSSAFHVST----SSINSSSNAIGVV Sb021158_Sorbi1 GMSKLSIGEP-GQETVS-TSLSLNLLGGQN-RQSAFHANP----------QTRAQA- .:*:*.:. . . *: :* .**** .. . .
|