Input
| Putative repression domain
|
|
AT5G50480.1 |
not found |
|
Ortholog
| Putative repression domain
| Reverse top hit
| Relation
| Blast score ratio
| Type
|
Os006607 |
not found in 259aa |
AT1G56170.2 |
not_not |
0.470198675 |
III |
Os012186 |
not found in 246aa |
AT5G63470.2 |
not_not |
0.463576158 |
III |
Os025982 |
not found in 250aa |
AT1G56170.2 |
not_not |
0.453642384 |
III |
Os034147 |
not found in 136aa |
AT1G56170.2 |
not_not |
0.443708609 |
III |
Sb004169 |
not found in 255aa |
AT1G56170.2 |
not_not |
0.463576158 |
III |
Sb015279 |
not found in 253aa |
AT1G56170.2 |
not_not |
0.460264900 |
III |
Sb021895 |
not found in 749aa |
AT5G63470.2 |
not_not |
0.460264900 |
III |
Sb023436 |
not found in 328aa |
AT1G08970.2 |
not_not |
0.456953642 |
III |
Gm010283 |
not found in 222aa |
AT3G48590.1 |
not_not |
0.460264900 |
III |
Gm010282 |
not found in 225aa |
AT3G48590.1 |
not_not |
0.460264900 |
III |
Gm021542 |
not found in 271aa |
AT1G56170.2 |
not_not |
0.456953642 |
III |
Gm008069 |
not found in 303aa |
AT1G08970.2 |
not_not |
0.447019867 |
III |
Gm053118 |
not found in 294aa |
AT1G08970.2 |
not_not |
0.447019867 |
III |
Gm027778 |
not found in 237aa |
AT1G08970.2 |
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0.443708609 |
III |
Gm055597 |
not found in 263aa |
AT1G08970.2 |
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0.440397350 |
III |
Gm021377 |
not found in 205aa |
AT1G08970.2 |
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III |
Pt027792 |
not found in 248aa |
AT3G48590.1 |
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0.463576158 |
III |
Pt000315 |
not found in 266aa |
AT1G56170.2 |
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0.460264900 |
III |
Pt036437 |
not found in 258aa |
AT1G56170.2 |
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0.456953642 |
III |
Pt042230 |
not found in 226aa |
AT1G08970.2 |
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0.443708609 |
III |
Pt034313 |
not found in 258aa |
AT1G08970.2 |
not_not |
0.443708609 |
III |
Pt001546 |
not found in 247aa |
AT1G08970.2 |
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0.440397350 |
III |
Pt014120 |
not found in 236aa |
AT1G08970.2 |
not_not |
0.433774834 |
III |
Pp016894 |
not found in 312aa |
AT1G56170.2 |
not_not |
0.463576158 |
III |
Pp036538 |
not found in 231aa |
AT1G56170.2 |
not_not |
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III |
Pp013244 |
not found in 221aa |
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not_not |
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III |
Pp013243 |
not found in 230aa |
AT3G48590.1 |
not_not |
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III |
Pp013245 |
not found in 194aa |
AT3G48590.1 |
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III |
Pp013246 |
not found in 185aa |
AT3G48590.1 |
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0.447019867 |
III |
Pp036540 |
not found in 174aa |
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III |
Pp036539 |
not found in 174aa |
AT1G56170.2 |
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0.437086092 |
III |
Pp005616 |
not found in 232aa |
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0.433774834 |
III |
Pp005482 |
not found in 218aa |
AT1G56170.2 |
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III |
Pp005480 |
not found in 334aa |
AT1G56170.2 |
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III |
Pp005481 |
not found in 260aa |
AT1G56170.2 |
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III |
Sm020043 |
not found in 116aa |
AT1G56170.2 |
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0.417218543 |
III |
Sm021821 |
not found in 94aa |
AT5G63470.2 |
not_not |
0.410596026 |
III |
Get sequence file
Get alignment file
Get formatted file made by BOXSHADE
Sequence file prepared (0 sec required). Alignment has started.
CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)
AT5G50480.1 MAENNNNN----------------------------------------------------
gm055597_Glyma2 ------------------------------------------------------------
Sm021821_Selmo1 ------------------------------------------------------------
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gm008069_Glyma0 MRRNRSHSFCSSTSLSEVLDSQCLRSAASSFREEKDTLVSFSHGACVILEHCIRGPFFIP
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Sb004169_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
gm053118_Glyma1 MSRNRSHSFCSRTSLSEVLDSQCLRSAASSFGE---------------------------
pt034313_POPTR_ ------------------------------------------------------------
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Sb021895_Sorbi1 ---------------SVYTQRECV--TYTSWRS---------------------------
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Sb023436_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
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pt000315_POPTR_ ------------------------------------------------------------
gm021377_Glyma0 ------------------------------------------------------------
pt014120_POPTR_ ------------------------------------------------------------
pp036540_Pp1s31 ------------------------------------------------------------
AT5G50480.1 ---GDNMNND--------------------------NHQQPPSY------SQLP------
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Sm021821_Selmo1 ------------------------------------------------------------
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Os034147_Os09t0 ------------------------------------------------------------
gm010282_Glyma0 -----MENNQQQ------------------------GAQAQS----------------GP
pp013246_Pp1s15 ------------------------------------------------------------
pt042230_POPTR_ ------------------------------------------------------------
Os006607_Os02t0 ------MEP---------------------------SSQPQPVMGVATGGSQAYPPPAAA
pt027792_POPTR_ ------MDNTTT------------------------NHQPQP----------------TA
gm027778_Glyma1 ------MDHQG----------------------HGHGHGQNPSMGVVGNGPQFP-YGSNP
gm008069_Glyma0 SMFASIMDHQ--------------------------GHSQNPSMGVVGSGAQLA-YGSNP
Sb015279_Sorbi1 ------MEP---------------------------SSQPQPVMGV---GSQPY-PAAAS
gm021542_Glyma0 ------MDKSEQTQQQ--------------------QQQQQHVMGVAAGASQMA-Y-SSH
pp005482_Pp1s37 ------MRALAGSFNREFA----------------GAEVWRESL-----AAAVA-MASNQ
pp013243_Pp1s15 -----------------------------------MAAQQHPHI--------------PP
pt001546_POPTR_ ------MDGQ-------------------------------PP-AIVSSTSQLQ-YGTSP
pp036538_Pp1s31 ------------------------------------MAIQHPHM--------------PP
Sb004169_Sorbi1 ------MEP---------------------------SSQPQPAMGVAPGGSQVY--PASA
gm053118_Glyma1 ---GNKMDHQ--------------------------GHSQNPSMGVVGSGAQLA-YGSNP
pt034313_POPTR_ ------MDQQ--------------------------GHGQPPTVGMIGRTAPVP-YGMAS
pt036437_POPTR_ ------MDQSQQTRQQQS--------------------QQQPVV---AGAGQMA-YASTP
pp005481_Pp1s37 ------MRALAGSFNREFA----------------GAEVWRESL-----AAAVA-MASNQ
Sb021895_Sorbi1 ------LGARRRRREASGA----------------AMACSKPCLSFLAEAAAVI-DIGCP
pp013244_Pp1s15 -----------------------------------MAAQQHPHI--------------PP
pp016894_Pp1s40 ------MENRSQLAQQQAQQQQDVQQQQQQQTVNNMMAQQQPQM----QYSQNM-GTQQP
gm010283_Glyma0 -----MENNQQQ------------------------GAQAQS----------------GP
Sb023436_Sorbi1 ---------------------------------------KAPSSSS---------SSSAP
pp036539_Pp1s31 ------------------------------------------------------------
Os012186_Os03t0 ------MDNQQ-----------------------------------------------LP
pp005480_Pp1s37 ------MRALAGSFNREFA----------------GAEVWRESL-----AAAVA-MASNQ
pp005616_Pp1s15 ------------------------------------MATQHAHV--------------PP
Sm020043_Selmo1 ------------------------------------------------------------
pp013245_Pp1s15 ------------------------------------------------------------
pt000315_POPTR_ ------MDQSEQTQQQQSQ----------------QQQQQQPVMGVAASAGQVA-YASTP
gm021377_Glyma0 ------MDQNQH------------------------GQPTQEAVG------------KNQ
pt014120_POPTR_ ------MDQQ-------------------------------------------G-YGTNP
pp036540_Pp1s31 ------------------------------------------------------------
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gm055597_Glyma2 YQASHIT-----------------------GS--PGMVVASPGTIQSTGQPA-------A
Sm021821_Selmo1 ------------------------------------------------------------
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Os034147_Os09t0 ------------------------------------------------------------
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pp013246_Pp1s15 ------------------------------------------------------------
pt042230_POPTR_ -----MM-----------------------GPSATGSL-------QSPTQPAVLT--ASS
Os006607_Os02t0 YPPQAMV------------------------PGAPAV-------VPPGSQPSAPFPTNPA
pt027792_POPTR_ YPTQSITTTP----------P------LPPAGGAPSST----------------------
gm027778_Glyma1 YQASHMT-----------------------GS--PGM-----------------------
gm008069_Glyma0 YQPGQIT-----------------------GP--PGSVVTSVGTIQSTGQPA-------G
Sb015279_Sorbi1 YAAPTMV------------------------AGAPA--------VPPGSQPAAQFP-NPA
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pp005482_Pp1s37 HGLASLS------------------------SAKPQSS------AGATTTAQQSF-----
pp013243_Pp1s15 SSAPQMS------------------------HPGAVMP------L--QMHYPQAQQ----
pt001546_POPTR_ YQPNQML-----------------------AASNPGSV---------TGQPV-------G
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Sb004169_Sorbi1 YPPAATV------------------------A-APAV-------ASAGLQSAQPFQANPA
gm053118_Glyma1 YQPGQIT-----------------------GP--PGSVVTSVGTIQST--PA-------G
pt034313_POPTR_ YQPNQMM-----------------------GPSATGSV-------QSPTQPAVLA--AAS
pt036437_POPTR_ YQTAPMV-----------------------ASGTPSIA------IPSPTQSPATF-----
pp005481_Pp1s37 HGLASLS------------------------SAKPQSS------AGATTTAQQSF-----
Sb021895_Sorbi1 LLPGRVPGRNMPGRHHRRRLPHRRIVVRHPGGRRPARG-----ATPDDAGPGRREAEGAA
pp013244_Pp1s15 SSAPQMS------------------------HPGAVMP------L--QMHYPQAQ-----
pp016894_Pp1s40 YQGSQTVG---------------------GPDTSPSQG------GQMQGQSPAAYPA---
gm010283_Glyma0 YPGGAGGSA--------------------GAGAGAGAA----------------------
Sb023436_Sorbi1 NPPPRLA-----------------------TGHNPSCP----------------------
pp036539_Pp1s31 ------------------------------------------------------------
Os012186_Os03t0 YAGQPAA----------------------AGAGAPVPG------VPGAGGPPAVP-----
pp005480_Pp1s37 HGLASLS------------------------SAKPQSS------AGATTTAQQSF-----
pp005616_Pp1s15 SSTAQMS-----------------------PHAAPTIR------LQQQMHYPNHA-----
Sm020043_Selmo1 ------------------------------------------------------------
pp013245_Pp1s15 ------------------------------------------------------------
pt000315_POPTR_ YQTAPMV-----------------------ASGTPSIA------IPSQTQPPATF-----
gm021377_Glyma0 YQSNPMM-----------------------APTNPPSE----------------------
pt014120_POPTR_ YQPNQMP-----------------------AASNPGSV---------PGQPA-------G
pp036540_Pp1s31 ------------------------------------------------------------
AT5G50480.1 -------------------------------QLRNYWIEQMET-----------------
gm055597_Glyma2 ----TQLGQHQLA-------YQQ-QQQQLQQRLQAFWANQYQEIKK--------------
Sm021821_Selmo1 ------------------------------------------------------------
Os025982_Os06t0 ----QLSAQHQLVYQQAQQFHQQ-LQQQQQRQLQQFWAERLVDIEQ--------------
Os034147_Os09t0 ----------------------------------MFWAEQYREIEA--------------
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pp013246_Pp1s15 ---------------MQPQLHY---QQIQKQQLSQFWQQQMQEMEQ--------------
pt042230_POPTR_ ----AHLAQHQLAYQ---HIHHQ-QQQQLQQQLQTFWANQYQEIEQ--------------
Os006607_Os02t0 ----QLSAQHQLVYQQAQQFHQQ-LQQQQQQQLREFWANQMEEIEQ--------------
pt027792_POPTR_ ------------------PFHH--LLQQQQQQLQMFWSYQRQEIEQ--------------
gm027778_Glyma1 ---------HM---------HQQ-QQQQLRQRLQAFWANQYQEIEK--------------
gm008069_Glyma0 ----AQLGQHQLAYQ---HIHQQ-QQHQLQQQLQQFWSSQYQEIEK--------------
Sb015279_Sorbi1 ----QLSAQHQMVYQQAQQFHHQ-LQQQQQQQLREFWTTQMDEIEQ--------------
gm021542_Glyma0 -----SSSAHQLAYQQAQHFHHQ-QQQHQQQQLQMFWSNQMQEIEQ--------------
pp005482_Pp1s37 -----QQGKHQMQGQGQMNSHM------QHQQLQMFWQQQNQEMEQLNEKSSKSELLMTH
pp013243_Pp1s15 -----QMMPQLGDQQMQPQLHY---QQIQKQQLSQFWQQQMQEMEQ--------------
pt001546_POPTR_ ----AQLAQHQLAYQ---QIHQQ-QEQQLQQQLQSFWANQYKEIDK--------------
pp036538_Pp1s31 -------------GQQQTQLHY---QQIQKQQLSQFWAQQMQEMEQ--------------
Sb004169_Sorbi1 ----HTSAQHQIVYQQAQQFHQQ-LQQQQQQQLQQFWAERMAEIEA--------------
gm053118_Glyma1 ----AQLGQHQLAYQ---HIHQQ-QQHQLQQQLQQFWSNQYQEIEK--------------
pt034313_POPTR_ ----AQLAQHQLAYQ---HIHQQ-QQQQLQQQLQTFWANQYQEIEQ--------------
pt036437_POPTR_ -----SNSPHQLTYQQAQHFHHQ-QQQQQQQQLQMFWTIQMQEIEQ--------------
pp005481_Pp1s37 -----QQGKHQMQGQGQMNSHM------QHQQLQMFWQQQNQEMEQLNEKSSKSELLMTH
Sb021895_Sorbi1 GLLLGLLAGHDVD----------------------------EEVEDVG------------
pp013244_Pp1s15 -------------QQMQPQLHY---QQIQKQQLSQFWQQQMQEMEQ--------------
pp016894_Pp1s40 ----------ALAQQQQVQLSYQHLQQHHQQQLQMFWANQMSEIEQ--------------
gm010283_Glyma0 ------------------PFQH--LLQQQQQQLQMFWSYQRQEIEH--------------
Sb023436_Sorbi1 ------------------RIHGS------------------QQIQH----PSAA------
pp036539_Pp1s31 ----------------------------------------MQEMEQ--------------
Os012186_Os03t0 --------------------HHH-LLQQQQAQLQAFWAYQRQEAER----AS--------
pp005480_Pp1s37 -----QQGKHQMQGQGQMNSHM------QHQQLQMFWQQQNQEMEQLNEKSSKSELLMTH
pp005616_Pp1s15 --------PH---QQQQLQLHY---QQIQKQQLAQFWAQQTQEMEE--------------
Sm020043_Selmo1 ----------------------------------------MQEVQE--------------
pp013245_Pp1s15 ------MMPQLGDQQMQPQLHY---QQIQKQQLSQFWQQQMQEMEQ--------------
pt000315_POPTR_ -----SNSPHQLTYQQAQHFHH----QQQQQQLQMFWTNQMHEIEQ--------------
gm021377_Glyma0 -----TIGPYVTSSFPREKQHA--PQDIYQEQLNNFWAKQCQEIEE--------------
pt014120_POPTR_ ----AQLEQHQLAYQ---QIHQQ-QQQQLQQQRQSFWTNQYKEIDK--------------
pp036540_Pp1s31 ----------------------------------------MQEMEQ--------------
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gm055597_Glyma2 VTDFKNHSLPLARI------------KKIMKA------------DEDVRMISAEAPVIFA
Sm021821_Selmo1 --DFKTHQLPLARI------------KKIMKA------------DEDVKMISAEAPVLFA
Os025982_Os06t0 TTDFKNHSLPLARI------------KKIMKA------------DEDVRMISAEAPVIFA
Os034147_Os09t0 TTDFKNHNLPLARI------------KKIMKA------------DEDVRMIAAEAPVVFA
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pp013246_Pp1s15 VNDFKTHQLPLARI------------KKIMKS------------DEDVKMIAAEAPVLFS
pt042230_POPTR_ TTDFKNHSLPLARI------------KKIMKA------------DEDVRMISAEAPIIFA
Os006607_Os02t0 TTDFKNHSLPLARI------------KKIMKA------------DEDVRMISAEAPVVFA
pt027792_POPTR_ VNDFKNHQLPLARI------------KKIMKA------------DEDVRMISAEAPILFA
gm027778_Glyma1 VTDFKNHSLPLARI------------KKIMKA------------DEDVRMISAEAPVIFA
gm008069_Glyma0 VTDFKNHSLPLARI------------KKIMKA------------DEDVRMISAEAPVIFA
Sb015279_Sorbi1 TTDFKNHTLPLARI------------KKIMKA------------DEDVRMISAEAPVVFA
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pp005482_Pp1s37 LTEFKNHQLPLARI------------KKIMKS------------DEDVKMIAAEAPVLFA
pp013243_Pp1s15 VNDFKTHQLPLARI------------KKIMKS------------DEDVKMIAAEAPVLFS
pt001546_POPTR_ VTDFKNHSLPLARI------------KKIMKA------------DEDVRMISAEAPVIFS
pp036538_Pp1s31 VNDFKTHQLPLARI------------KKIMKS------------DEDVKMIAAEAPVLFS
Sb004169_Sorbi1 TTDFKNHNLPLARI------------KKIMKA------------DEDVRMISAEAPVVFA
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pt034313_POPTR_ TADFKNHSLPLARI------------KKIMKA------------DEDVRMISAEAPVIFA
pt036437_POPTR_ TTDFKNHSLPLARI------------KKIMKA------------DEDVRMISAEAPVIFA
pp005481_Pp1s37 LTEFKNHQLPLARI------------KKIMKS------------DEDVKMIAAEAPVLFA
Sb021895_Sorbi1 ARDGRGDVVPLQGA------------ALVLLGVQP--GPDGELEDEELAGLGEQHGRLGG
pp013244_Pp1s15 VNDFKTHQLPLARI------------KKIMKS------------DEDVKMIAAEAPVLFS
pp016894_Pp1s40 ANDFKNHQLPLARI------------KKIMKA------------DEDVRMISAEAPVLFA
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Sb023436_Sorbi1 SSHGRPRCLPSGGVPSRRGRRRGRLRAAALRAARSCRG------PAGGRRAAAAAADVLG
pp036539_Pp1s31 VNDFKTHQLPLARI------------KKIMKS------------DEDVKMIAAEAPVLFS
Os012186_Os03t0 ASDFKNHQLPLARI------------KKIMKA------------DEDVRMISAEAPVLFA
pp005480_Pp1s37 LTEFKNHQLPLARI------------KKIMKS------------DEDVKMIAAEAPVLFA
pp005616_Pp1s15 VNDSKTHQLPLARI------------KKIMKS------------DEDVKMIATEAPVLFS
Sm020043_Selmo1 VMDFKTHSLPLARI------------KKIMKA------------DEDVRMISGEAPVLFA
pp013245_Pp1s15 VNDFKTHQLPLARI------------KKIMKS------------DEDVKMIAAEAPVLFS
pt000315_POPTR_ TTDFKNHSLPLARI------------KKIMKA------------DEDVRMISAEAPVIFA
gm021377_Glyma0 TTDLRTHSLPYARI------------KKIMKA------------DRDVRMVSAEAPVLFA
pt014120_POPTR_ VTDFKNHSLPLARI------------KKIMKA------------DEDVKMISAEAPVIFA
pp036540_Pp1s31 VNDFKTHQLPLARI------------KKIMKS------------DEDVKMIAAEAPVLFS
. : :* : . . : .
AT5G50480.1 KACEMFI-----VDLTMRSWLKAEENKRHTLQKSDISNAVASSFTYD----FLLDVVPKD
gm055597_Glyma2 RACEMFI-----LELTLRSWNHTEENKRRTLQKNDIAAAITRTDIFD----FLVDIVPRE
Sm021821_Selmo1 KACELFI-----LELTFRAWMHTEENKRRTLQRNDVAGAISRADIFD----FLVDIVPRE
Os025982_Os06t0 KACEIFI-----LELTLRSWMHTEENKRRTLQKNDIAAAITRTDMYD----FLVDIVPRD
Os034147_Os09t0 RACEMFI-----LELTHRGWAHAEENKRRTLQKSDIAAAIARTEVFD----FLVDIVPRD
gm010282_Glyma0 KACELFI-----LELTIRSWLHADENKRRTLQKNDIAAAITRTDIFD----FLVDIVPRD
pp013246_Pp1s15 KACEMFI-----LELTLRSWIHTEENKRRTLQRNDIAGAITRGDIFD----FLVDIVPRD
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: : .. : : . * :: :
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AT5G50480.1 |
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