Input
| Putative repression domain
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AT5G56930.1 |
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Ortholog
| Putative repression domain
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Sb025311 |
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Ib |
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Get alignment file
Get formatted file made by BOXSHADE
Sequence file prepared (0 sec required). Alignment has started.
CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)
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Sm003448_Selmo1 ------------------------------------------------------------
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pp005936_Pp1s38 ILLSTSADVLPGIGSSSCNLVANSSPRSSPAQSISPLPEHLESVFTDLANVPGSEPSTTA
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Sm003448_Selmo1 ------------------------------------------------------------
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pt006358_POPTR_ LQLDEET--LCQNNKISSEVSKPVDNCEE---SS----LSRTNGLEVNNEMQQKEIQSDK
pp005936_Pp1s38 -ELDSMVSRSFQSNT-ASELSVSIVNSSTNIATSSGDQIIVTTGEHEKLEVKVQELEHE-
Sm003448_Selmo1 ------------------------------------------------------------
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Sm003448_Selmo1 ------------------------------------------------------------
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Sm003448_Selmo1 ------------------------------------------------------------
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Sb025311_Sorbi1 LNRDAI----------------------VRGDAQIPVTRAQAVTYDDVVDWN--------
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Sm003448_Selmo1 ------------------------------------------------------------
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Sb025311_Sorbi1 ---------------------KKRKRTQTEQRKAKKTKNKRINRALQQIADGVRRPKLTR
pt006358_POPTR_ ---------------------KKKRGPPSKEKKAKKKEKERKKRAEKNRQLGVKRMKLLP
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Sb025311_Sorbi1 VI-KPK--KPCYFYDHGKCQQGNNCKYSHDFTPSTKSKPCTHFACGSCLKGEGCPYDHEL
pt006358_POPTR_ VL-NQKPVSPCRHFLKGRCREGQKCKFSHDAIPLTKSEPCHHFARHKCMKGDNCPYDHQL
pp005936_Pp1s38 NTFKPK-VPLCKFYIKGRCTLGGKCTFSHDVVPVTKSDPCKFFMVNRCLKGDDCPFSHTL
Sm003448_Selmo1 --------------MKGRCSKGKSCTFSHEEVPDTKLYLCKYFLTRCCLKGDECPFSHDT
:*:* * .* :**: * ** * .* *:**: **:.*
AT5G56930.1 SKYPCNNFITKGFCYRGDSCLFSHKGTPQSASDT-------------PSA-----NVTVS
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Sb025311_Sorbi1 SKYECHNYKNNGMCARGDKCKFSH------------------------------------
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Sm003448_Selmo1 AKFPCKFFISLGFCKDGERCKFSHAS----------------------------------
.: * : . * * *. * ***
AT5G56930.1 STKITAA--------SFSPQKTKKQSVRDAIAKLPAIQARVSSSVAFLKPSSHSNQRNSS
gm040522_Glyma1 AHHLTTIMAL-----LLVEHK-----VTNTVQKQPT----PPKGISFINLAKLSPSLSSL
Sb025311_Sorbi1 --------------------------VMRTTEGTPTQD--AKTSDVSLAYEKTNLREHTR
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Sb025311_Sorbi1 SQKNTTVHNGAPSSSILRNL---------TGVSSKSQNVSNRI----------PKGVQFR
pt006358_POPTR_ KTSSPSLKSNVF-------VKVGNQIDQCASVTV---QSCNEI-PRKIPSVVAPKGINFL
pp005936_Pp1s38 TMNSAQTETSGWDVSLLKPLHQGTGSNASTSMTAQSLQNTREIHPAATRSNFTQNQVSTM
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:
AT5G56930.1 SLDKT-------------------------SQED-TVKASSASKPNTDNS----------
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pt006358_POPTR_ SFGKAPLDKCSSTMKLKSLAFNQGNGVNLFSSKNFAVHEEACSSSNKDNSVLVGKETHQS
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.
AT5G56930.1 --------DSQTLKQSQQGSF-LPLGPPKGISFL----SFASEEQKT----------LNR
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Sm003448_Selmo1 ---------------------------------------------------------QTL
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gm040522_Glyma1 QEGKKSSD------------------NSQSS-------------KGQKALLSTLAFAAEH
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.
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BoxShade v3.31 C (beta, 970507) Output
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