Input
| Putative repression domain
|
|
AT5G62320.1 |
not found |
|
Ortholog
| Putative repression domain
| Reverse top hit
| Relation
| Blast score ratio
| Type
|
Sb023618 |
not found in 488aa |
AT4G22680.1 |
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III |
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not found in 298aa |
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0.468546637 |
III |
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not found in 311aa |
AT1G66230.1 |
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III |
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not found in 287aa |
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III |
Sb027621 |
not found in 432aa |
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III |
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not found in 445aa |
AT1G34670.1 |
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III |
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not found in 245aa |
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not found in 342aa |
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not found in 418aa |
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0.405639913 |
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Sb023923 |
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III |
Get sequence file
Get alignment file
Get formatted file made by BOXSHADE
Sequence file prepared (0 sec required). Alignment has started.
CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)
AT5G62320.1 ------------------------------------------------------------
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Sb016715_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
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Sb031046_Sorbi1 ---KEKNSAAGHFDRSYGHGRLIHSLHLEA-SEVEHAGPEPQEAVVAVAAAAAAPGGSFL
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Sb005866_Sorbi1 ------------------MGR---QPCCDK-VGLKKGPWTAEEDQKLVTFLLANGHC---
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Sb023618_Sorbi1 ----------------FGMGR---QPCCDK-LGVKRGPWTAEEDRKLINFILTNGHC---
Sb015849_Sorbi1 ------------------MGR---SPCCEK-IGLKKGPWTPEEDQKLLAFIEEHGHG---
Sb031258_Sorbi1 CQSR---------LRRAAMGR---SPCCDE-NGLKKGPWTQEEDEKLLHYIQKNGHG---
Sb027621_Sorbi1 FH--------------LSMGR---SPCCDE-NGLKKGPWTPEEDQKLMEYIQKHGHG---
Sb016715_Sorbi1 ------------------MGR---SPCCEK-AHTNKGAWTKEEDQRLVAYIKAHGEG---
:. * :
AT5G62320.1 ----------GGGWCWRDVPKL--AGLR--------------------------------
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Sb023923_Sorbi1 --------------NWRTLPKN--AGLA--------------------------------
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Sb016101_Sorbi1 --------------CWRAVPKL--AGLL--------------------------------
Sb031046_Sorbi1 DAQAAAEAEAAAMAGLQHLPLDDDGGLEVQ--LLVFLLLARRADAEIEVEVGAPGHL---
Sb003360_Sorbi1 --------------CWRVVPKL--AGLL--------------------------------
Sb005866_Sorbi1 --------------CWRAVPKL--AGLL--------------------------------
Sb010610_Sorbi1 --------------CWRSLPAK--AGLR--------------------------------
Sb009095_Sorbi1 --------------CWRSLPKA--AGLL--------------------------------
Sb018705_Sorbi1 --------------EW-------WSGFF---------QLGRGSHGEVAVL----------
Sb023618_Sorbi1 --------------CWRAVPKL--AGLL--------------------------------
Sb015849_Sorbi1 --------------SWRALPAK--AGLQ--------------------------------
Sb031258_Sorbi1 --------------SWRTLPRL--AGLN--------------------------------
Sb027621_Sorbi1 --------------SWRALPRL--AGLN--------------------------------
Sb016715_Sorbi1 --------------CWRSLPKA--AGLL--------------------------------
*:
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Sb023923_Sorbi1 ---------------RCG--KSCRL-----RWTNY-LRPD--------IKRGRFSFEEEE
Sb023642_Sorbi1 PVAGGVVVLMMIAADRGG--RRRR------RLVVL-LQPEHGALILLTVTRGRRRLERDG
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Sb018705_Sorbi1 ---------------REGAHEQGRVDQGGGRAAGG-VHPG---------ARGRVLALAAQ
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Sb016715_Sorbi1 ---------------RCG--KSCRL-----RWINY-LRPD--------LKRGNFTQEEDE
. * . * * :: *
AT5G62320.1 ------LVIDLHARLGNRWSKIAVELPGRTDNDIKNYWNTHIKRKLIRMGIDPNTHRR--
Sb005865_Sorbi1 ------TVIDLHEQLGNRWSKIASQLPGRTDNEIKNHWNTHIKKKLRKMGIDPVTHKP--
Sb023923_Sorbi1 ------TIIQLHSILGNKWSAIAARLPGRTDNEIKNYWNTHIRKRLLRMGIDPVTHAPRL
Sb023642_Sorbi1 --YVGRVLVD--GAVCHRVDPPAQQLPPDVRVPV-----------VLDLVVRP-SRQPSS
Sb016101_Sorbi1 ------LVIDLHAKLGNRYTKLHAKLPGRTDNEIKNHWNTHIKKKLIKMGLDPATHQP--
Sb031046_Sorbi1 GDGAGAGVGD--GAVRDGVDAPAKQLPPDVRVPV-----------VLDLVVRP-PREPRG
Sb003360_Sorbi1 ------LVIDLHAQLGNRWSKIAAQLPGRTDNEIKNHWNTHIRKKLLRMGIDPVTHLP--
Sb005866_Sorbi1 ------TVIDLHEQLGNRWSKIASQLPGRTDNEIKNHWNTHIKKKLRKMGIDPVTHKP--
Sb010610_Sorbi1 ------TIIQLHALLGNRWSSIATHLPKRTDNEIKNYWNTHLKKRLAKMGIDPVTHKPRA
Sb009095_Sorbi1 ------IIIKLHALLGNKWSLIAGQLPGRTDNEIKNYWNTHIKRKLLSRGIDPQTHRP--
Sb018705_Sorbi1 GGGP--------AALRQELQAAVDELPPPGPQARQ----LHRRR---GRAHHPPAQPPRQ
Sb023618_Sorbi1 ------VVIDLHGKLGNRWSKIAAKLPGRTDNEIKNHWNTHIKKKLIKMGIDPVTHEP--
Sb015849_Sorbi1 ------TIIQLHALLGNRWSAIATHLPNRTDNEIKNYWNTHLKKRLAKMGIDPVTHK---
Sb031258_Sorbi1 ------TILHLHSVLGNKWSAIATHLPGRTDNEIKNFWNTHLKKRLIQMGFDPMTHRPRT
Sb027621_Sorbi1 ------TILQLHSVLGNKWSAIAKHLPGRTDNEIKNFWNTHLKKKLIQMGFDPMTHRPRT
Sb016715_Sorbi1 ------LIIKLHQILGNKWSLIAGRLPGRTDNEIKNYWNTHIKRKLIARGIDPRTHQP--
: . .** * .:
AT5G62320.1 ----------------------FDQQKVNEEETILVNDPKPL------SETEVSVALKND
Sb005865_Sorbi1 ----------------------LHQPASP-------PPPPPL------TRQEQEE---KD
Sb023923_Sorbi1 DLLDLSALLKPAAAAYYPTQADLDTLRALEP---LANYPDLLRLASTLLSSGPPAIG-DH
Sb023642_Sorbi1 D----QGPFVAEEAVE------LDDELVL-----LFREVAALEVGAEVVDPPEAAAL---
Sb016101_Sorbi1 ----------------------LSNSNA--------------------TSSQSTV---TD
Sb031046_Sorbi1 D----ERPLVAEEAVQ------LDDEVVL-----VGGEVAALEVGAEVVDPAEAAAL---
Sb003360_Sorbi1 ----------------------LQEPPAPP------PPPPPP------PEQEP------D
Sb005866_Sorbi1 ----------------------LHQPAS----------PPPL------TRQEQ------D
Sb010610_Sorbi1 DLGASSGSAAGAGAG---------------------------------ARYRAAAHL-NH
Sb009095_Sorbi1 ------------------------------------------------LSGGAAA-----
Sb018705_Sorbi1 QV----------------------------------------------VSDRRAAAG-PD
Sb023618_Sorbi1 ----------------------LDRK----------------------TSSSPAT---TS
Sb015849_Sorbi1 ---SLSGTLTGTTNN---------------------------------KSAKAAASL-SH
Sb031258_Sorbi1 DFFAALPQLIALAALRQHLQ--LGDQQ-------------------------QAAKL---
Sb027621_Sorbi1 DFFAALPQLIALANLR---Q--LVEQRPWDDHT-----------ARIQVEAVQAAKL---
Sb016715_Sorbi1 ------------------------------------------------ASAGAVA-----
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Sb005865_Sorbi1 T-GGS------PEEEEEEE---IVTAI-TAGHDASCTDEVPMALLLDDMDIVLPGD----
Sb023923_Sorbi1 HQNGQLLPWILQAQMAQQAAAAMAQQ-------------------------VAPP-----
Sb023642_Sorbi1 AAAQE------AGGLGQRAPATLAVRL----------DVRHEAVVLL----LGPRALVGV
Sb016101_Sorbi1 ESAKS------SDFREELSLK---------------DDS-----HRE-----VPL-----
Sb031046_Sorbi1 AAAHQ------SGRLGQRPPAPFAVRA----------DVRHQAVVLL----LGPRALVRV
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Sb005866_Sorbi1 TGGGS------PEKEEKEKEKAVVAATPSVGHETFCADEVLMAHLLD--DIVLP------
Sb010610_Sorbi1 TASWE------SARLEAEARLAREAKL----------------------RAIVSP-----
Sb009095_Sorbi1 -----------GSGLTTSSTAGFPAQ--------------------------APA-----
Sb018705_Sorbi1 GQRDQ---ELLEHAHQAQAPGPRHRPA----------D--------------APRARSQS
Sb023618_Sorbi1 QSAKS------DEATKQQSPE---------------NDDV--VVMRD-----VPAD----
Sb015849_Sorbi1 MAQWE------SARLEAEARLARESKI----------------------RTATPT-----
Sb031258_Sorbi1 --------QYLQSLLQSAATTISS------------SDTEAPALGLG-AICCSPPQ----
Sb027621_Sorbi1 --------QCLQNLLQSAASIATSPSSSSINTNTIPSDLE--QIGL-----LSPPQMS--
Sb016715_Sorbi1 -----------PAPGAAASAA-------------------------------APS-----
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Sb005865_Sorbi1 ---DVVGAQ----AAACVG-----TVYSP--------------ESSSSS--------S--
Sb023923_Sorbi1 -------PQQQAEQFMQAG----AACQMP--DLVHM-------NSNPTTVQQQLAAAH--
Sb023642_Sorbi1 RLLAARRPPHDGGVVVRSA------------------------GRAPNQSDAATLPAAFL
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Sb031046_Sorbi1 RLLAARRPPHR--------------------------------------------PASCL
Sb003360_Sorbi1 -------PPPPTTAASNCG-----SAAVS--------------SASAGSASVVSPSCS--
Sb005866_Sorbi1 -------PP----ATSNSGLTNDTTASSP--------------DSSSSSSSSSSSSPS--
Sb010610_Sorbi1 -------PPAPAPGPGTGP----AFISG---------------LESPTSTLSF-------
Sb009095_Sorbi1 -------PTRPA---------------------------------RPVIIIPPNVMFA--
Sb018705_Sorbi1 R--RRHGSRRRRGAPPGGG-----AAAPP--------RGRRRRPGGPGQAPRREAGARGV
Sb023618_Sorbi1 ------------------------GCSPT--------------ESSTNTVSTGGSSSS--
Sb015849_Sorbi1 -------PTALHAQPTNVP----ASAASPCLDVLHGWQGAKIDLESPTSTLTFTGSNSGM
Sb031258_Sorbi1 ---LTTTPLDSCTAPVSSS--------------LLP---CTFPEAAPPVSSEEDEANNH-
Sb027621_Sorbi1 --SLSTLPSPSFLESISGQ---DIAAAGQLPDIQIP---SSFFEQQP----TSNDANQH-
Sb016715_Sorbi1 -------SHRQHG------------------------------DDKAAAVVRSSGCSS--
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Sb031046_Sorbi1 AFRFRFGYRF-----------A----VWSGG-------------------RRLR------
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Sb018705_Sorbi1 VIRRRRQQQHR-QQRRR---------QRRGATVP-------RPQPQ--------------
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Sb015849_Sorbi1 -LPTPRTNRLEVSESNSVMWHQ-RSDELEGEEND-------WQIFSKHQVLELDSKERED
Sb031258_Sorbi1 ------------QQQQTAGLSSSYG--GLGSADDVFACHGGSSSSSLPPLTDL-------
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Sb031046_Sorbi1 ---------RAGRGAS--------SAIGLEN-----------------------------
Sb003360_Sorbi1 --------PEPVYLF------------GMDGIMDAG----------WAGLFPSTGAGAGG
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Sb031258_Sorbi1 --------SDAHAGSLLQVDGSMRSATASSSFGGGSS---CSPLP-WPELFF--------
Sb027621_Sorbi1 --------PISNLG----------DACGASSCDGSS-----IPFPSWPELF---------
Sb016715_Sorbi1 ------------------------GGIDLNLSLSPP-----TSQP--S-----SPAAAN-
AT5G62320.1 ----------------GYEDLELGCFDV--------------------------------
Sb005865_Sorbi1 -------DPFV------YQRIALF----------DHQETF--------------------
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Sb023642_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb016101_Sorbi1 ----GTTDWLL-----DYQDFGMCSSNS------VDNSTFHASNGSNF------------
Sb031046_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb003360_Sorbi1 CFGLGGVDPFD-----QYPGVGVGGAGF------DQ------DDGHWM------------
Sb005866_Sorbi1 -------DPFV----ITYQRIDLFDDHD------DQQETWNNDDGRVEL-----------
Sb010610_Sorbi1 VSVSEQQE----EEDKGYWSSILNMVNS----SMSSSSSSLTSDAVTDPAMYLPAAAAAE
Sb009095_Sorbi1 TPTSQQQEMQRATICLCYHLGV-----------RSGDACSCKTAA---------SPAGFR
Sb018705_Sorbi1 VRLRG-------------------------------------------------------
Sb023618_Sorbi1 ----GATDWLL-----DYQDFGLGDSATLVDGYMVNNS----SNGAKL------------
Sb015849_Sorbi1 EHSNQASD----EEDKNYWNGVLDMVNS----ELTPQSPPLV------------------
Sb031258_Sorbi1 ----PDDDPFI----TDFL-----------------------------------------
Sb027621_Sorbi1 ------DEQFI----CEFV-----------------------------------------
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Sb023923_Sorbi1 FNMQLSELLDVSDYM
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Sb010610_Sorbi1 F--------------
Sb009095_Sorbi1 FLRPLEE----GQYI
Sb018705_Sorbi1 ---------------
Sb023618_Sorbi1 ---------------
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Sb031258_Sorbi1 ---------------
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Sb016715_Sorbi1 ---------------
BoxShade v3.31 C (beta, 970507) Output
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