Input
| Putative repression domain
|
|
AT5G62320.1 |
not found |
|
Ortholog
| Putative repression domain
| Reverse top hit
| Relation
| Blast score ratio
| Type
|
Sb010896 |
not found in 164aa |
AT1G66230.1 |
1st_not |
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II |
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not found in 488aa |
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not_not |
0.468546637 |
III |
Sb003360 |
not found in 298aa |
AT1G66230.1 |
not_not |
0.468546637 |
III |
Sb005866 |
not found in 311aa |
AT1G66230.1 |
not_not |
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III |
Sb005865 |
not found in 287aa |
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III |
Sb027621 |
not found in 432aa |
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not_not |
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III |
Sb031258 |
not found in 445aa |
AT1G34670.1 |
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III |
Sb016101 |
not found in 245aa |
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III |
Sb010610 |
not found in 342aa |
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III |
Sb023642 |
not found in 418aa |
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0.409978308 |
III |
Sb018705 |
not found in 288aa |
AT4G09460.1 |
not_not |
0.409978308 |
III |
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VPRCPDLNLDLCISPP in 216/452 |
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III |
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AT4G38620.1 |
not_not |
0.405639913 |
III |
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III |
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not found in 356aa |
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0.403470715 |
III |
Sb023923 |
not found in 508aa |
AT4G05100.1 |
not_not |
0.401301518 |
III |
Get sequence file
Get alignment file
Get formatted file made by BOXSHADE
Sequence file prepared (0 sec required). Alignment has started.
CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)
AT5G62320.1 ------------------------------------------------------------
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Sb015849_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb023642_Sorbi1 VGDGNYREKERRQNGATRESSREDVPRAQILTFFFLPYLSFTHSLLRIFTYEANQIRIIQ
Sb023923_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
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Sb031046_Sorbi1 -----------------------------------LPYPNPT-------SQEPNQT----
Sb005866_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb005865_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb031258_Sorbi1 ------------------EGAS------------LASYPVVA-------IDRSIEIGPVQ
Sb010610_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb016715_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb016101_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb003360_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
AT5G62320.1 -----------------MGGR---KPCCDE-VGLRKGPWTVEEDGKLVDFLRARGNCGGG
Sb027621_Sorbi1 FH--------------LSMGR---SPCCDE-NGLKKGPWTPEEDQKLMEYIQKHGHG---
Sb015849_Sorbi1 ------------------MGR---SPCCEK-IGLKKGPWTPEEDQKLLAFIEEHGHG---
Sb023642_Sorbi1 ARCKKKNKKG---EITEGETR---SFHLEA-SEVEHGGPESEE----VAALAV---GALG
Sb023923_Sorbi1 ------------------MGR---APCCEK-SGMKKGPWTPEEDEKLIAYIKKHGQG---
Sb009095_Sorbi1 ------------------MGR---SPCCEK-AHTNKGAWTKEEDQRLIAYIKAHGEG---
Sb023618_Sorbi1 ----------------FGMGR---QPCCDK-LGVKRGPWTAEEDRKLINFILTNGHC---
Sb018705_Sorbi1 ------------------RGRA--AP-----RRQQQG--RAPEPGQVLAVDRRH------
Sb010896_Sorbi1 ------------------MGR---QPCCEK-VGLKKGPWTAEEDQKLVTFLLSHGHC---
Sb031046_Sorbi1 ---KEKNSAAGHFDRSYGHGRLIHSLHLEA-SEVEHAGPEPQEAVVAVAAAAAAPGGSFL
Sb005866_Sorbi1 ------------------MGR---QPCCDK-VGLKKGPWTAEEDQKLVTFLLANGHC---
Sb005865_Sorbi1 ------------------MGR---QPCCAK-VGLKRGPWTVEEDQKLVTFLLTNGHC---
Sb031258_Sorbi1 CQSR---------LRRAAMGR---SPCCDE-NGLKKGPWTQEEDEKLLHYIQKNGHG---
Sb010610_Sorbi1 ------------------MGR---SPCCEKEAGLKKGPWTPEEDQKLLAFIEQHGHG---
Sb016715_Sorbi1 ------------------MGR---SPCCEK-AHTNKGAWTKEEDQRLVAYIKAHGEG---
Sb016101_Sorbi1 ----------------------------------MRGPWTAEEDKKLISFILTHGRC---
Sb003360_Sorbi1 ------------------MGR---QPCCDK-VGMKKGPWTAEEDQKLVGFLLTHGHC---
:. * :
AT5G62320.1 ----------GGGWCWRDVPKL--AGLR--------------------------------
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Sb015849_Sorbi1 --------------SWRALPAK--AGLQ--------------------------------
Sb023642_Sorbi1 EAQAAAEAEPG-------LPLH---GLHRHHGLLLLARRRRRADAEVQVEVGALERLPLA
Sb023923_Sorbi1 --------------NWRTLPKN--AGLA--------------------------------
Sb009095_Sorbi1 --------------CWRSLPKA--AGLL--------------------------------
Sb023618_Sorbi1 --------------CWRAVPKL--AGLL--------------------------------
Sb018705_Sorbi1 --------------EW-------WSGFF---------QLGRGSHGEVAVL----------
Sb010896_Sorbi1 --------------CWRLVPKL--AGLL--------------------------------
Sb031046_Sorbi1 DAQAAAEAEAAAMAGLQHLPLDDDGGLEVQ--LLVFLLLARRADAEIEVEVGAPGHL---
Sb005866_Sorbi1 --------------CWRAVPKL--AGLL--------------------------------
Sb005865_Sorbi1 --------------CWRAVPKL--AGLL--------------------------------
Sb031258_Sorbi1 --------------SWRTLPRL--AGLN--------------------------------
Sb010610_Sorbi1 --------------CWRSLPAK--AGLR--------------------------------
Sb016715_Sorbi1 --------------CWRSLPKA--AGLL--------------------------------
Sb016101_Sorbi1 --------------CWRAVPKL--AGLL--------------------------------
Sb003360_Sorbi1 --------------CWRVVPKL--AGLL--------------------------------
*:
AT5G62320.1 ---------------RCG--KSCRL-----RWTNY-LRPD--------LKRGLFTEEEIQ
Sb027621_Sorbi1 ---------------RCG--KSCRL-----RWTNY-LRPD--------IKRGKFTQEEEQ
Sb015849_Sorbi1 ---------------RCG--KSCRL-----RWTNY-LRPD--------IKRGKFSLQEEQ
Sb023642_Sorbi1 PVAGGVVVLMMIAADRGG--RRRR------RLVVL-LQPEHGALILLTVTRGRRRLERDG
Sb023923_Sorbi1 ---------------RCG--KSCRL-----RWTNY-LRPD--------IKRGRFSFEEEE
Sb009095_Sorbi1 ---------------RCG--KSCRL-----RWMNY-LRPD--------LKRGNFTDDDDE
Sb023618_Sorbi1 ---------------RCG--KSCRL-----RWTNY-LRPD--------LKRGLLTDAEEQ
Sb018705_Sorbi1 ---------------REGAHEQGRVDQGGGRAAGG-VHPG---------ARGRVLALAAQ
Sb010896_Sorbi1 ---------------RCG--KSCRL-----RWTNY-LRPD--------LKRGLLSEEEEA
Sb031046_Sorbi1 ---------------NDG--RRHRLD----RLMLWRLRCDGGV--------GFVGLERDG
Sb005866_Sorbi1 ---------------RCG--KSCRL-----RWTNY-LRPD--------VKRGLLSSEEER
Sb005865_Sorbi1 ---------------RCG--KSCRL-----RWTNY-LRPD--------VKRGLLSSEEER
Sb031258_Sorbi1 ---------------RCG--KSCRL-----RWTNY-LRPD--------IKRGKFSQEEEQ
Sb010610_Sorbi1 ---------------RCG--KSCRL-----RWTNY-LRPD--------IKRGKFTLQEEQ
Sb016715_Sorbi1 ---------------RCG--KSCRL-----RWINY-LRPD--------LKRGNFTQEEDE
Sb016101_Sorbi1 ---------------RCG--KSCRL-----RWTNY-LRPD--------LKRGLLSTAEEQ
Sb003360_Sorbi1 ---------------RCG--KSCRL-----RWTNY-LRPD--------LKRGLLSDDEER
. * . * * :: *
AT5G62320.1 ------LVIDLHARLGNRWSKIAVELPG--------------------------------
Sb027621_Sorbi1 ------TILQLHSVLGNKWSAIAKHLPG--------------------------------
Sb015849_Sorbi1 ------TIIQLHALLGNRWSAIATHLPN--------------------------------
Sb023642_Sorbi1 --YVGRVLVD--GAVCHRVDPPAQQLPPDVRVPVVLDLVVR------PSRQPS-----SD
Sb023923_Sorbi1 ------TIIQLHSILGNKWSAIAARLPG--------------------------------
Sb009095_Sorbi1 ------IIIKLHALLGNKWSLIAGQLPG--------------------------------
Sb023618_Sorbi1 ------VVIDLHGKLGNRWSKIAAKLPG--------------------------------
Sb018705_Sorbi1 GGGP--------AALRQELQAAVDELPP--PGPQARQLHRRRGRAHHPPAQPPRQQVVSD
Sb010896_Sorbi1 ------LVIDLHAQLGNRWSKIAARLPG--------------------------------
Sb031046_Sorbi1 GDGAGAGVGD--GAVRDGVDAPAKQLPPDVRVPVVLDLVVR------PPREPR-----GD
Sb005866_Sorbi1 ------TVIDLHEQLGNRWSKIASQLPG--------------------------------
Sb005865_Sorbi1 ------TVIDLHEQLGNRWSKIASQLPG--------------------------------
Sb031258_Sorbi1 ------TILHLHSVLGNKWSAIATHLPG--------------------------------
Sb010610_Sorbi1 ------TIIQLHALLGNRWSSIATHLPK--------------------------------
Sb016715_Sorbi1 ------LIIKLHQILGNKWSLIAGRLPG--------------------------------
Sb016101_Sorbi1 ------LVIDLHAKLGNRYTKLHAKLPG--------------------------------
Sb003360_Sorbi1 ------LVIDLHAQLGNRWSKIAAQLPG--------------------------------
: . .**
AT5G62320.1 ----------RTDNDIKNYWNTHIKRKLIRMGIDPNTHRR----------FDQQKVN---
Sb027621_Sorbi1 ----------RTDNEIKNFWNTHLKKKLIQMGFDPMTHRPRTDFFAALPQLIALANL-R-
Sb015849_Sorbi1 ----------RTDNEIKNYWNTHLKKRLAKMGIDPVTHK----------------SL---
Sb023642_Sorbi1 QGPFVAEEAVELDDEL-----VLLFREVAALEVGAEVVDP--------PEAAALAAA-QE
Sb023923_Sorbi1 ----------RTDNEIKNYWNTHIRKRLLRMGIDPVTHAPRL-------DLLDLSALLKP
Sb009095_Sorbi1 ----------RTDNEIKNYWNTHIKRKLLSRGIDPQTHRP----------LSGGAAA--G
Sb023618_Sorbi1 ----------RTDNEIKNHWNTHIKKKLIKMGIDPVTHEP----------LDRKTSS---
Sb018705_Sorbi1 RRAAAGPDG-QRDQEL-------LEHAHQAQAPGPR-HRP--------------------
Sb010896_Sorbi1 ----------RTDNEIKNHWNTHIKKKLKKMGIDPVTHRP----------LAQPLAP---
Sb031046_Sorbi1 ERPLVAEEAVQLDDEV-----VLVGGEVAALEVGAEVVDP--------AEAAALAAA-HQ
Sb005866_Sorbi1 ----------RTDNEIKNHWNTHIKKKLRKMGIDPVTHKP----------LHQPAS----
Sb005865_Sorbi1 ----------RTDNEIKNHWNTHIKKKLRKMGIDPVTHKP----------LHQPASP-PP
Sb031258_Sorbi1 ----------RTDNEIKNFWNTHLKKRLIQMGFDPMTHRPRTDFFAALPQLIALAAL-RQ
Sb010610_Sorbi1 ----------RTDNEIKNYWNTHLKKRLAKMGIDPVTHKP----------RADLGAS---
Sb016715_Sorbi1 ----------RTDNEIKNYWNTHIKRKLIARGIDPRTHQP----------ASAGAVA--P
Sb016101_Sorbi1 ----------RTDNEIKNHWNTHIKKKLIKMGLDPATHQP----------LSNSNAT-SS
Sb003360_Sorbi1 ----------RTDNEIKNHWNTHIRKKLLRMGIDPVTHLP----------LQEPPAPPPP
. *::: : ..
AT5G62320.1 -----------EEET---------------------------------------------
Sb027621_Sorbi1 --QLVEQRPWDDHTARIQVEAVQAAKLQCLQNLLQSAASIATSPSSSSI-----------
Sb015849_Sorbi1 SGTLTGTTN--NKSAKAAASLSHMAQ---WESARLEA-----------------------
Sb023642_Sorbi1 AGGLGQRAP---------ATLAVRLD------VRHEAVVLLLGP----------------
Sb023923_Sorbi1 AAAAYYPTQADLDTLRALEPLANYPD---L--LRLASTLLSSGPPAIGD-HHQNGQLLPW
Sb009095_Sorbi1 SGLTTSSTAG----FPAQAPAPTRPA---RPVIIIPPNVMFARPAPSEDGHSSSGGSTD-
Sb023618_Sorbi1 SPATTSQSAKSDEATKQQSPEND-------------------------------------
Sb018705_Sorbi1 ----------------ADAPRARSQS-----RRRHGSRRRRGAPPGGG------------
Sb010896_Sorbi1 -------------------PLTQQPR---LVRFLQ-------------------------
Sb031046_Sorbi1 SGRLGQRPP---------APFAVRAD------VRHQAVVLLLGP----------------
Sb005866_Sorbi1 PPPLTRQEQ----DTGGGSPEKEEKE---KEKAVVAAT------PSVG------------
Sb005865_Sorbi1 PPPLTRQEQE-EKDT-GGSPEEEEEE---E---IVTAI-------TAG------------
Sb031258_Sorbi1 HLQLGDQQ--------------QAAKLQYLQSLLQSAATTISS-----------------
Sb010610_Sorbi1 SGSAAGAGA--GARYRAAAHLNHTAS---WESARLEA-----------------------
Sb016715_Sorbi1 APGAAASAA---------APSSHRQHGDDKAAAVVRSSGCSSRDS-SGDDDSTSGSSV--
Sb016101_Sorbi1 QSTVTDESAK-SSDFREELSLKDDSH---R------------------------------
Sb003360_Sorbi1 PPPPPEQEP----DDQEEEPQQQEQQ---AGKLMQEG--------GAG------------
AT5G62320.1 ------------------ILVNDP------------KP-------LSETEVS--------
Sb027621_Sorbi1 NTNTIPSDLE--QIGL----LSPPQM-----SSLSTLPS----PSFLESISGQDIAAAGQ
Sb015849_Sorbi1 --EARLARESKIR-----TATPTPT------ALHA-QP-----TNVPASAASP-------
Sb023642_Sorbi1 --------RALVGVRLL-AARRPPHDGGVVVRSAGRAPNQSDAATLPAAFLVLPF-----
Sb023923_Sorbi1 ILQAQMAQQAAAAMA---QQVAPPP------QQQA-EQ------FMQAGAACQ-------
Sb009095_Sorbi1 --APRCPDL---NLDLD-LSVGPPC------S----PP------KTPAAAVT--------
Sb023618_Sorbi1 -------DVVVMR------DV--PA------DGC--SP--------TESSTN--------
Sb018705_Sorbi1 -------------------AAAPPRGR----RRRPGGPGQ--APRREAGARGVVIRRRRQ
Sb010896_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb031046_Sorbi1 --------RALVRVRLL-AARRPPHR--------------------PASCLAFRF-----
Sb005866_Sorbi1 -HETFCADEVLMAHLLD--DIVLP------------PP--------ATSNSGL-------
Sb005865_Sorbi1 -HDASCTDEVPMALLLDDMDIVLPG------DDVVGAQ--------AAACVG--------
Sb031258_Sorbi1 ------SDTEAPALGLGAICCSPPQ--------LTTTPL----DSCTAPVSSS-------
Sb010610_Sorbi1 --EARLAREAKLR-----AIVSPPP------APAP-GP-----GTGPAFISG--------
Sb016715_Sorbi1 ---PHQHQLVVGGIDLN-LSLSPPT------S----QP------SSPAAAN---------
Sb016101_Sorbi1 -------------------EV--P---------------------LSTDSSE--------
Sb003360_Sorbi1 -ED----DVAPMVQPHE--TIMAP------------PPP----PTTAASNCG--------
AT5G62320.1 -------------VALKNDTSA---------------------------------VLSGN
Sb027621_Sorbi1 LPDIQI---PSSFFEQQP----TS----------------NDANQHSDFTPK--SSVEGE
Sb015849_Sorbi1 CLDVLHGWQGAKIDLESPTSTLTFTGSNSGMLPTPRTNRLEVSESNSVMWHQRSDELEGE
Sb023642_Sorbi1 ---------GSRRRFSSPSSPLGC-----------------------------VAGGSGG
Sb023923_Sorbi1 MPDLVH-------MNSNPTTVQQQ-----------------LAAAHQDMAAAACHSMQPP
Sb009095_Sorbi1 ----------------TPTSQQQEMQRAT-------------------------------
Sb023618_Sorbi1 -------------TVSTGGSSSSS---------------------------------SGG
Sb018705_Sorbi1 QQHRQQ-RRRQRRGATVPRPQPQPRPVRG------------------------LAAAGGG
Sb010896_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb031046_Sorbi1 ---------RFGYRF---------------------------------------AVWSGG
Sb005866_Sorbi1 TND---------TTASSPDSSSSSSSSSS-------------SSPSSYSASVPAAASSSG
Sb005865_Sorbi1 -------------TVYSPESSSSS---------------------SSYSAS--AAALSGG
Sb031258_Sorbi1 ----LL---PCTFPEAAPPVSSEE----------------DEANNHQQQQTAGLSSSYGG
Sb010610_Sorbi1 --------------LESPTSTLSF------------------SESAQLFANAPPHDTHGT
Sb016715_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb016101_Sorbi1 -------------QSSWPESSTNGCDQ---------------------------------
Sb003360_Sorbi1 -------------SAAVSSASAGSASVVS-------------PSCSSSSASAPAVT----
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Sb027621_Sorbi1 NGTPKTLLL-----SE-NSLPPLTDF----------------------------------
Sb015849_Sorbi1 EN----------------------DWQIFSKHQVLELDSKEREDDFIGCEEPWFSGMAG-
Sb023642_Sorbi1 W-----------------------------------------------------------
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Sb009095_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb023618_Sorbi1 H-----------------DQDPLVKWLL------------EEEPP--TGDEPWLNFSGSV
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Sb005866_Sorbi1 GSSGAD-------DGEWPEWPQVMEW-----------------------PESTMWL----
Sb005865_Sorbi1 SSSSSV-------DGECPDWLPMMDW-----------------------PEPIWQL----
Sb031258_Sorbi1 LGSADDVFACHGGSSS-SSLPPLTDL----------------------------------
Sb010610_Sorbi1 -----------------------------PRHALTPPRSYEEAFGELQPQQQRFGDAAA-
Sb016715_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb016101_Sorbi1 ------------------DPELLVNW------------------PDLLMDEPWLNFMSS-
Sb003360_Sorbi1 -------------------GVEATEW-----------------------PEPVYLFG---
AT5G62320.1 ------ENDEGGGGDAAGELTMLLSGDITSSCS-------------------------SS
Sb027621_Sorbi1 ------PISNLG-----------------DACG--------ASSCDGSS----------I
Sb015849_Sorbi1 --------------VGSGFTSMLFDVSNEHDASECWG-----ESNNGHTEHSNQASDEED
Sb023642_Sorbi1 -------------------LLLLLLLRVRSRCE--------PRPKLG-------------
Sb023923_Sorbi1 SNNNNNNNNNVG-------------SGVSTPSSSPVARLNHSTSTTTTTYGGASASTSND
Sb009095_Sorbi1 -------------------ICLCYHLGVRSGDA--------CSCKTAASPAG--------
Sb023618_Sorbi1 ------DVDEFS--------------SIAAGP---------------------------E
Sb018705_Sorbi1 -----RPPRRGG-------------VRLRG------------------------------
Sb010896_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb031046_Sorbi1 -------------------------RRLR-------------RAGRGASSAIG-------
Sb005866_Sorbi1 --------DDV----------------VTTGP----------------------------
Sb005865_Sorbi1 --------EDV----------------VTA------------------------------
Sb031258_Sorbi1 ------SDAHAG-------SLLQVDGSMRSATA--------SSSFGGGSS--------CS
Sb010610_Sorbi1 --------------PGFVLAGVLLDSSVAGADQQRFA-----ASSTDASVSVSEQQEEED
Sb016715_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb016101_Sorbi1 -------NDELG--------------NVEG------------------------------
Sb003360_Sorbi1 -------MDGI----------------MDAG-----------------------------
AT5G62320.1 SSL-WMKYGE---------F--------------GYEDLELGC----FDV----------
Sb027621_Sorbi1 PFPSWPELF-------------------DEQFI--------------CEFV---------
Sb015849_Sorbi1 KNY-WNGVLDMVNSEL------------------TPQSPPLV------------------
Sb023642_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb023923_Sorbi1 AAA-AAALFNMQLSEL-------------------------------LDVSDYM------
Sb009095_Sorbi1 -------------------FRFLRP----------------------LEEGQYI------
Sb023618_Sorbi1 LLP-WD--------------------GATDWLL-DYQDFGLGDSATLVDGYMVNNSSNGA
Sb018705_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb010896_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb031046_Sorbi1 -----------------------------------------------LEN----------
Sb005866_Sorbi1 ATA-WE--FE-------------------DPFVITYQRIDLFDDH--DDQQETWNNDDGR
Sb005865_Sorbi1 RTP-WE--FE-------------------DPFV--YQRIALF------DHQETF------
Sb031258_Sorbi1 PLP-WPELFF----------------PDDDPFI--------------TDFL---------
Sb010610_Sorbi1 KGY-WSSILNMVNSSM------------------SSSSSSLTSDAV-TDPAMYLPAAAAA
Sb016715_Sorbi1 ------------------------------------------------------------
Sb016101_Sorbi1 ALP-WD--------------------GTTDWLL-DYQDFGMCSSNS-VDN-STFHASNGS
Sb003360_Sorbi1 ----WAGLFPSTGAGAGGCF----GLGGVDPFD-QYPGVGVGGAG--FDQ------DDGH
AT5G62320.1 ----
Sb027621_Sorbi1 ----
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Sb018705_Sorbi1 ----
Sb010896_Sorbi1 ----
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Sb005866_Sorbi1 VELF
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Sb031258_Sorbi1 ----
Sb010610_Sorbi1 EF--
Sb016715_Sorbi1 ----
Sb016101_Sorbi1 NF--
Sb003360_Sorbi1 WM--
BoxShade v3.31 C (beta, 970507) Output
AT5G62320.1 |
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Sb031046_Sorbi1 |
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Sb005866_Sorbi1 |
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Sb005865_Sorbi1 |
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Sb031258_Sorbi1 |
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Sb010610_Sorbi1 |
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A |
A |
A |
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Sb016715_Sorbi1 |
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Sb016101_Sorbi1 |
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A |
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AT5G62320.1 |
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