Input
| Putative repression domain
|
|
AT5G62320.1 |
not found |
|
Ortholog
| Putative repression domain
| Reverse top hit
| Relation
| Blast score ratio
| Type
|
Gm002162 |
not found in 286aa |
AT4G22680.1 |
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III |
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not found in 264aa |
AT4G22680.1 |
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III |
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not found in 274aa |
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III |
Gm046978 |
not found in 274aa |
AT4G12350.1 |
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0.475054229 |
III |
Gm031703 |
not found in 336aa |
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III |
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not found in 336aa |
AT1G66230.1 |
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III |
Gm040536 |
not found in 328aa |
AT1G66230.1 |
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0.459869848 |
III |
Gm048630 |
not found in 331aa |
AT1G66230.1 |
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III |
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III |
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III |
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not found in 313aa |
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III |
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AT3G02940.1 |
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III |
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0.416485900 |
III |
Gm037130 |
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III |
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LERCPDLNLELTISPP in 173/253 |
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III |
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LERCPDLNLELTISPP in 170/246 |
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III |
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AT4G21440.1 |
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III |
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AT4G21440.1 |
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III |
Gm005016 |
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III |
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LERCPDLNLELTISPP in 140/210 |
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III |
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SFPHHQLNLDLSIGLP in 203/301 |
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III |
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SVPHHQLNLDLSIGLP in 210/302 |
AT4G38620.1 |
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III |
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III |
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III |
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AT3G61250.1 |
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III |
Gm051030 |
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III |
Gm050405 |
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III |
Gm013657 |
HERCPDLNLELTISPP in 157/235 |
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III |
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III |
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III |
Gm011553 |
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AT5G14340.1 |
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III |
Get sequence file
Get alignment file
Get formatted file made by BOXSHADE
Sequence file prepared (0 sec required). Alignment has started.
CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)
AT5G62320.1 ------------------------M----------------GGRKPCCDEV-GLRKGPWT
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gm013657_Glyma0 -----------------------------------------MGRSPCCEKA-HTNKGAWT
* **.:: .:*.*:
AT5G62320.1 VEEDGKLVDFLRAR-GNCGGGGGGWCWRDVPKLAGLRRCGKSCRLRWTNYLRPDLKRGLF
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gm003821_Glyma0 PEEDQKLIDHIQKH-GHA-------SWRALPKLAGLNRCGKSCRLRWTNYLRPDIKRGKF
gm044064_Glyma1 IEEDHKLMNFILNN-GIH-------CWRSVPKLAGLLRCGKSCRLRWINYLRPDLKRGGF
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gm005016_Glyma0 KQEDQKLIDYIQVH-GEG-------CWRSIPKAAGLHRCGKSCRMRWLNYLRPGIKRGIF
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gm050405_Glyma1 PEEDQKLLAYIEEH-GHG-------SWRALPAKAGLQRCGKSCRLRWTNYLRPDIKRGKF
gm010386_Glyma0 KEEDERLINYIKLH-GEG-------CWRSLPKAAGLLRCGKSCRLRWINYLRPDLKRGNF
gm013657_Glyma0 KEEDHRLISYIRAH-GEG-------CWRSLPKAAGLLRCGKSCRLRWINYLRPDLKRGNF
:** * .: * ** :* *** *******:** *** *.:*** :
AT5G62320.1 TEEEIQLVIDLHARLGNRWSKIAVELPGRTDNDIKNYWNTHIKRKLIRMGIDPNTHRR--
gm020389_Glyma0 TLEEEETIIQLHSILGNKWSAIATRLPGRTDNEIKNYWNTHIRKRLLRMGMDPVTHRP--
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gm031703_Glyma1 SEYEEKMVIDLHAQLGNRWSKIASHLPGRTDNEIKNHWNTHIKKKLKKMGIDPVTHKP--
gm014734_Glyma0 SQEEEQTILHLHSILGNKWSAIATHLPGRTDNEIKNFWNTHLKKKLIQMGFDPMTHQP--
gm051311_Glyma1 TEMEEDQIIQLHSCLGNRWSKIASHFPGRTDNEIKNHWNTKIKKRLKLLGLDPLTLKP--
gm000818_Glyma0 SQEEEQTILDLHAVLGNKWSAIASHLPGRTDNEIKNFWNTHLKKKLIQMGYDPMTHQP--
gm032378_Glyma1 SEEEEQLIINLHAVLGNKWSAIAGHLPGRTDNEIKNFWNTHLKKKLLQMGLDPVTHRP--
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gm008427_Glyma0 SLEEDQLIIKLHSLLGNKWSLIAGRLPGRTDNEIKNYWNTHIRRKLLSRGIDPATHRP--
gm048630_Glyma1 SEYEEKMVIDLHAQLGNRWSKIASHLPGRTDNEIKNHWNTHIKKKLKKMGIDPVTHKP--
gm046978_Glyma1 TEAEEQLVIDLHARLGNRWSKIAARLPGRTDNEIKNHWNTHIKKKLLKIGIDPVTHEP--
gm000327_Glyma0 SEEDERIIINLHSVLGNKWSKIATHLPGRTDNEIKNYWNTHIRKKLLKMGIDPETHKP--
gm041391_Glyma1 SFEEEETIIQLHSILGNKWSAIASRLPGRTDNEIKNYWNTHIRKRLLRMGIDPVTHSP--
gm002162_Glyma0 TQAEEQLVIDLHARLGNRWSKIAARLPGRTDNEIKNHWNTHIKKKLLKMGIDPVTHEP--
gm016618_Glyma0 SLEEEDVIIQLHSILGNKWSAIAARLPGRTDNEIKNYWNTHIRKRLLRMGIDPVTHTP--
gm025474_Glyma0 SEDDERIIINFHSVLGNKWSKIAAHLPGRTDNEIKNYWNTHIRKKLLKMGIDPETHKP--
gm044298_Glyma1 TEEEEQLIINLHSVIGNKWAKIATHLPGRTDNEIKNYWNTNLRKKLLQMGIDPETHKP--
gm030520_Glyma1 TEEEDELIIKLHSLLGNKWSLIAGRLPGRTDNEIKNYWNTHIRRKLLNRGIDPATHRP--
gm018805_Glyma0 TFEEEETIIQLHSILGNKWSAIASRLPGRTDNEIKNYWNTHIRKRLLRMGIDPVTHRP--
gm046979_Glyma1 TEAEEQLVIDLHARLGNRWSKIAARLPGRTDNEIKNHWNTHIKKKLLKIGIDPVTHEP--
gm005868_Glyma0 TLEDEKLIIQLHGILGNRWAAIASQLPGRTDNEIKNLWNTHLKKRLICMGLDPQTHQPLA
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gm032581_Glyma1 TEEEDELIIKLHSLLGNKWSLIAGRLPGRTDNEIKNYWNTHIRRKLLNRGIDPATHRP--
gm035059_Glyma1 SLQEEQTIIQLHALLGNRWSAIATHLPKRTDNEIKNYWNTHLKKRLTKMGIDPVTHKP--
gm051030_Glyma1 SLQEEQTIIQLHALLGNRWSAIATHLPKRTDNEIKNYWNTHIKKRLTKMGIDPVTHKP--
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gm044064_Glyma1 TEMEEDQIIELHSGLGNRWSKIASHFPGRTDNEIKNHWNTRIKKRLKLLGLDPVTHKP--
gm015390_Glyma0 TEEEDELIINLHSLLGNKWSLIAARLPGRTDNEIKNYWNTHIKRKLYSRGIDPQTHRP--
gm017748_Glyma0 TLEEEKLIIQLHGILGNRWAAIASQLPGRTDNEIKNLWNTHLKKRLICMGLDPQTHQPLA
gm005016_Glyma0 AEDEEDLIIKLHALLGNRWSLIAGRLPGRTDNEVKNYWNSHIRRKLIKMGIDPNSHKP--
gm004994_Glyma0 SEYEEKMVIDLHAQLGNRWSKIASHLPGRTDNEIKNHWNTHIKKKLKKMGIDPATHKP--
gm050405_Glyma1 SMQEEQTIIQLHALLGNRWSAIATHLPKRTDNEIKNYWNTHLKKRLDKMGIDPVTHKP--
gm010386_Glyma0 TEEEDELIINLHSLLGNKWSLIAARLPGRTDNEIKNYWNTHIKRKLYSRGIDPQTHRP--
gm013657_Glyma0 SLEEDQLIIKLHSLLGNKWSLIAGRLPGRTDNEIKNYWNTHIRRKLLSRGIDPATHRP--
: : ::.:*. :**:*: ** .:* ****::** **:.::::* * ** :
AT5G62320.1 -------------FD-QQ------------------------------------------
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gm031703_Glyma1 -------------LS-NK----TEQTQAQPD---------EQQT--HQPLQ-EQ------
gm014734_Glyma0 ----RTD----LVST-LPYLLALANMTDLMD----HQTL-DEHAVRLQAEAVHLAKLQYL
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gm032378_Glyma1 ----RSDHL-NLLSN-LQQLLAATNIVSNLT-----NTWDTNNALRLQSDATQLAKLQLL
gm029651_Glyma1 -------------LN-KQ--VSSKD-SSSSE---------E-----NLPQA---------
gm008427_Glyma0 -------------LN-DDKVL---------------------------------------
gm048630_Glyma1 -------------LS-NK----TEETQAQPD---------E-QT--HQPLQ-EQQQQQHQ
gm046978_Glyma1 -------------LK-KQAAASSQDSSSSPA---------E-----HLPQP---------
gm000327_Glyma0 ----RTD-L-NHLMS-LSQLLGTSNLSSAMN-----TTW-GNNPLGLQPDITQLAKIQLL
gm041391_Glyma1 ----RLD-L----LD-INSIL-NASFYGSSQI-------NIQRLLGMHQ--------YMV
gm002162_Glyma0 -------------LN-KQ--VSSKD-SSSPA---------E-----HFSQV---------
gm016618_Glyma0 ----RLD-L----LD-MSSIL-RSMLGNPSLL-------NMQGLLGAQV---------LM
gm025474_Glyma0 ----RTD-L-NHLMS-LSQLLGMSNLSSAIS-----TAW-GNKPLGLQPDITQLAKIQLV
gm044298_Glyma1 ----RTD-F-NHLLN-LSQLLGLSNLGTS-T-----SPW-TN-PLGLQADVTQIAKLQLL
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gm018805_Glyma0 ----RLD-L----LD-LSSIL-SSTLYGSTQM-------NIQRLLGTNT---------VV
gm046979_Glyma1 -------------LK-KQAAASSQDSSSSPA---------E-----HLPQP---------
gm005868_Glyma0 SPHNPND---------KAHASSSTSTRHMAQW--------ESARLEAEARLSREPHLYY-
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gm037130_Glyma1 ----RLD-L----LD-INSIL-NASFYGSSQI-------NIQRLLGMHQ--------YVV
gm032581_Glyma1 -------------LN-EAASA--ATVTTAT------------------------------
gm035059_Glyma1 ----KNDAL----LSSDGQSKTAANLSHMAQW--------ESARLEAEARLVRESKILVL
gm051030_Glyma1 ----KNDAL----LSSDGQSKTAANLSHMAQW--------ESARLEAEARLVRESKIRS-
gm003821_Glyma0 ----RID----DIFTGLSHLIALANLKELLD-----QPL-EQNLARLQ----ELAKLQCL
gm044064_Glyma1 -------------IE-QK--------ENTDE---------NTNKTNPHPSI-------FG
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gm017748_Glyma0 SPHNLND---------KAHA-SSTSTRHMAQW--------ETARLEAEARLSREPHF---
gm005016_Glyma0 ----HQS-FPRPHVS-SADHQ-GASTSESI------------------------------
gm004994_Glyma0 -------------LP-NA----NEQNQNQTR---------QDQQLHHQPVELEEP-----
gm050405_Glyma1 ----KNDAL----VSTEGPSKSAANLSHMAQW--------ESARLEAEARLVRESKLRSS
gm010386_Glyma0 -------------LN--ASAT-PATTATATAV----PSANSSKKINNNNNNI----DNDI
gm013657_Glyma0 -------------LN-DSSHQEPAAVS---------------------------------
AT5G62320.1 -----------KVN---------------------------------------------E
gm020389_Glyma0 NP------EVLKLA--------------------------------------S--SLFPS
gm040536_Glyma1 -N-----QQPLQVD------------------------------------------FDPK
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gm051311_Glyma1 GS-----EQGVENK---------------------------------------SLDMHST
gm000818_Glyma0 QQ------HLLLLQ--------------------------------------ASLT-DA-
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gm051030_Glyma1 --------HSLQHQLGSSSSTFASSSSASTSASALNNNNKPEAQRPPPPPSRSSLDVLKA
gm003821_Glyma0 QQ------HLLQPQ--------------------------------------ASLNIDA-
gm044064_Glyma1 GS-----EENVEIK---------------------------------------SLENGGT
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gm050405_Glyma1 SHSS----SSLHHTLIGTSAVSSSSSSA-----------------PMIPP--SSLSLDHA
gm010386_Glyma0 NNN----NNGFQLV--------------------------------------SNSAYANT
gm013657_Glyma0 ---------------------------------------------------------APP
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gm040536_Glyma1 D-D-------PNKE----PET-SLESSTITEEAILEDQIITP-LFDKM---ELMNGFCTD
gm031703_Glyma1 K-E-------QNKEPE-KPES-SIESLTITEEAKEEDQIMTP-LFDSW---ELMNEFCTD
gm014734_Glyma0 Y-D-------QSATTNMEPAAFSLLNSISNVKE------------------NPVMLQPAD
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gm051030_Glyma1 W-NSGG--WLESNEGN------GGIVSNVGVS---------GDLES-----PTSTLSFSE
gm003821_Glyma0 --D-------PNYTIN------STINSTFMMNK------------------GTINV--SN
gm044064_Glyma1 K-E------MAKTEGK-REEN-N--KVINWDDTSE--------LLNNF---EMLCSK-LD
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gm004994_Glyma0 V-D-------PNKEPE-KPET-SLESSTITEEAKEEDQIITP-LFDTM---ELMNGFCTD
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gm051030_Glyma1 NAPPIM----NG------------IGGENNNN----NDSAMPM--------IEFV--GNS
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gm005016_Glyma0 SPP-----------------------------------LNLDL----------TI-----
gm004994_Glyma0 EVP------------------------------------IIEP--------HEIL-----
gm050405_Glyma1 NAPPI-------------------------------NITS--V--------IEFV--GSS
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gm013657_Glyma0 RCP----------------------------------DLNLEL----------TI-----
AT5G62320.1 ------------------------------------------------------------
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gm035059_Glyma1 -------EFTMNMEGTWA-SESLRTSG-----------------SH---DDDIV------
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gm017748_Glyma0 ------------------------------------------------------------
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gm010386_Glyma0 -------NPEKLKPEPQE-HDDQ----------------------KPQVLYKWYG-NITS
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gm031703_Glyma1 LEDLLLPDFEWSDDYND-TN------------FDNNNNS-S-MALWDDDFIRSWNLLIND
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gm005868_Glyma0 -----FLWGVKKIVSDS---------------SSSSSELHH-------------------
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gm035059_Glyma1 -EEG-FTNLLLKTNSED---------------PNLSSEGGG-------------------
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gm003821_Glyma0 -KDMIQ------LSQGE---IYPDSPWLLSC-SSTTPSS-P-------------------
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AT5G62320.1 GEFGYEDLELGCF---DV------------------------------------------
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gm025474_Glyma0 SNTIFDDWEKLL--DDETSG-----------SYWKEILDLTS----------TSASPILW
gm044298_Glyma1 STT-FEAWEKFLIDDDESSG-----------SYWKEILERRKACNFVSVGNLTSSFYILQ
gm030520_Glyma1 ---AAAAAYDFL---------------GMKTSGVWDCTRLEMK-----------------
gm018805_Glyma0 SYVSSNNLLRF---------------------EIPDMLCV--------------------
gm046979_Glyma1 QDFGIHDFGFTCF--NEIESHALQTIGMKEEGH---------------------------
gm005868_Glyma0 DSCD-------------------------------TSLQLLL--------DFPMNNDMSF
gm011553_Glyma0 DNFNSLE-KDFLF--------------LDNRQ----------------------------
gm037130_Glyma1 QSYDSSNMLKF---------------------EIPDILDVNEFM----------------
gm032581_Glyma1 A-AAAAAAYDFL---------------GMKTNGVWDCTRLEMK-----------------
gm035059_Glyma1 QSNN-----------DDGGDGSNNDFYEDNNNYWNSILNLVN--------SSPSHPPMF-
gm051030_Glyma1 ESKN-----------GDGGGGTNSDFYEDNNNYWNSILNLVN--------SSPSHSPMF-
gm003821_Glyma0 SSLVAPP-------VTEVSLSTN---VEDNCTIWPELLLEDPLFKMIS------------
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gm005016_Glyma0 --------------------------------------DLNC------------------
gm004994_Glyma0 ED-DDSD-ENQVF---DASLTQFSKMFMESESWGYGLF----------------------
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gm044298_Glyma1 LDISTFLVEE
gm030520_Glyma1 ----------
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gm005868_Glyma0 LE--------
gm011553_Glyma0 ----------
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gm003821_Glyma0 ----------
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BoxShade v3.31 C (beta, 970507) Output
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