Input
| Putative repression domain
|
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AT5G67060.1 |
not found |
|
Ortholog
| Putative repression domain
| Reverse top hit
| Relation
| Blast score ratio
| Type
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Os031789 |
not found in 246aa |
AT5G67060.1 |
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not found in 453aa |
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not found in 242aa |
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not found in 241aa |
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not found in 282aa |
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II |
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0.415662650 |
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AT5G67060.1 |
1st_1st |
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Ib |
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Get alignment file
Get formatted file made by BOXSHADE
Sequence file prepared (0 sec required). Alignment has started.
CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)
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:
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Sm015306_Selmo1 AAALGCGD-----AHHGQLPDL----DELIQASGVDAVGSSSSDGEGVDHQHQHQHQQHE
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Sb023369_Sorbi1 ------QMPSS--------------------------------------------SPS--
Sm015306_Selmo1 AVH---ASASS----------ATSSASSDAGLCPLGTSSSGATSVMQQAQAIQPGEPWAH
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pp026599_Pp1s55 EKALAFQESFGGYNVEVASTVGLTATYSDSLTIPSLMQPSPQPFLRSSGNCGAASPVDLD
pt018003_POPTR_ RGV--------------GELPGTANDYAT-------------PSRKK------------N
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AT5G67060.1 NMAAMREMIF-----------------------RIAVMQPIH-IDPEAVKPPKRRNVRIS
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Os031789_Os08t0 GPAAMREMIF-----------------------HIAALQPVN-IDPETVRPPKRRNVRIS
Sb023369_Sorbi1 GGGALQGLHLGLEELDVVDGLVQHGRRVHLGAPRHEALQGADALADALPPQPRRHALRVF
Sm015306_Selmo1 GMANMRETLY-----------------------RMAVWRPITATDCLGGSKPKRRNVRIS
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gm001899_Glyma0 SVAAMREMIF-----------------------RVAVMQPVH-IDPESIKPPKRRNVKIS
gm011924_Glyma0 SMAAMREMIF-----------------------RIAVMQPVH-IDPESIKPPKRRNVKIS
:: : : *:*: :::
AT5G67060.1 KDPQSVAAR---------HRRER------ISERIRILQRLVPGGT----KMDTASMLDEA
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gm011924_Glyma0 KDPQSVAAR---------HRRER------ISERIRILQRLVPGGT----KMDTASMLDEA
*.: * * * :* :. ::* :* * * : *::: .
AT5G67060.1 IHYVKFLKKQVQSLEEQ-AVVTGGGGGGGG---------------------RVLIGGGGM
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Sm015306_Selmo1 IHYVKYLKSQVQAMEMLEQSS-------GDQP---------------LLRNSSSAASLAS
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pt036263_POPTR_ IHYVKFLKKQVQSLEQA-GA-------------------------------NTPNGWFWL
pt038588_POPTR_ IHYVKFLKTQVQSLERF-QAN----------------------------RPTTTTG-IGF
pp026599_Pp1s55 IHYVKFLKLQLQTLEQI-GNN-------GCDPRSFLEQGGATEELANLVRPFDLNCTAAF
pt018003_POPTR_ IHYVKFLKTQVQSLERA-QAN----------------------------RPTATTG-IGF
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gm011924_Glyma0 IHYVKFLKKQVQTLEQA-GANTSPHSNTNSPN-------------------NHVVGAAGF
: .: : :: :*
AT5G67060.1 T-------AASGG----------------------GGGG------------GVVMK-GCG
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Sb023369_Sorbi1 -----GSGRVQGGRRRCVVLLCWVPG---------GGGRDRRHV-WRRR-----------
Sm015306_Selmo1 T----ATAASQTA----------APGICHLYNAHSGSGLLNGSIFWPQQF-------SMD
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pt018003_POPTR_ -----PVAMTSGSY---------LP---------VGKGCHQQPAH--HHHHQNVQH-YGD
gm001899_Glyma0 -----PT-TVSNA----------------------NNN-----V----NY-SSFVK-SCQ
gm011924_Glyma0 -----PLGMSSNY----------------------SNN---SSV----NYSSLLMKGGCQ
AT5G67060.1 TVGTHQMVGNAQILR----------------------------------------
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pt038588_POPTR_ A------------------------------------------------------
pp026599_Pp1s55 A------------------------------NQ-------DDCPM----------
pt018003_POPTR_ A------------------------------------------------------
gm001899_Glyma0 PYPML--------------------------------------------------
gm011924_Glyma0 PCQMFGS-TSKQLLS----------------------------------------
BoxShade v3.31 C (beta, 970507) Output
AT5G67060.1 |
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