Input
| Putative repression domain
|
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AT5G67190.1 |
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|
Ortholog
| Putative repression domain
| Reverse top hit
| Relation
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| Type
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Os023742 |
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III |
Get sequence file
Get alignment file
Get formatted file made by BOXSHADE
Sequence file prepared (0 sec required). Alignment has started.
CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475)
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:
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* *: .. *:
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Sb030094_Sorbi1 AD-----AAASAVPRRAHAEVGQVGGGDPGAAQAHAHLAGVLRHGRGGGARLRHGRVLPS
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gm047992_Glyma1 ------YTTPMAAAR--------------AYDTAVFYL-------RGPTARL--------
Os023742_Os06t0 ------YSTAVAAAR--------------AYDTAVFYL-------RGRSARL--------
::. *..* *
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Os019236_Os04t0 ----------NFPEEISSLASLSEGGGASEPRE---------------------------
pt001651_POPTR_ ----------NFPEFLAGENFSCGG-----------------------------------
Sb030094_Sorbi1 RPVGAAQLPRRDPLAV-AVGGRARGRGDRPRRRWWRRRHAVRGVHPEEGHRGGVPRGRAP
gm011914_Glyma0 ----------NFPELLAAEGPAASD-----------------------------------
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. *
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Os019236_Os04t0 -------------------PDGGTLSAASIRKKAIEVGSRVDALQTGMM-VAPTTHHRER
pt001651_POPTR_ --------------------SYGDMSAASIRKRATEVGARVDAFETAL------------
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gm011914_Glyma0 --------------------A--VMSAASIRKKATEVGARVDALHRQ-------------
gm047992_Glyma1 -------------------AAAGNMSADSIRRKATQVGARVDALQTAL------------
Os023742_Os06t0 -----------------------ELTAAVIRKKAAEVGARVDAQHSVVGAAAPVP-----
.: ::
AT5G67190.1 ---QNNRHRVFGQNRDSDVDNKNFHRNYQNGEREEEEEDEDDKRLRSGGRL-LDR-VDLN
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:
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BoxShade v3.31 C (beta, 970507) Output
AT5G67190.1 |
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