|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Get sequence file Get alignment file Get formatted file made by BOXSHADE Sequence file prepared (0 sec required). Alignment has started. CLUSTAL format alignment by MAFFT FFT-NS-2 (v7.475) AT5G67300.1 ---------------------MA------------------------------------- gm011952_Glyma0 --------------------MIAVA-----RKD--------------------------- Sb023051_Sorbi1 ----------------------------GGRGP--------------------------- gm047970_Glyma1 ------------------------------------------------------------ gm008871_Glyma0 ---------------------MASA------KD--------------------------- gm029895_Glyma1 ------------------------------------------------------------ Sb026904_Sorbi1 PPIETSQSSRANRNLISSHTAIASAIAIGGTSSSSNSRPIHPVPCSCVSGSQQYGSGVVG pt037616_POPTR_ ---------------------MAIT-----RKE--------------------------- Os006758_Os02t0 ---------------------MGME------AE--------------------------- gm039420_Glyma1 ---------------------MVSSS--GKSRE--------------------------- pt016180_POPTR_ ---------------------MASS-----RKD--------------------------- AT5G67300.1 -DRIKGPWSPEEDEQ--------LRRLVVKYGPRNWTVISKSIP---------------- gm011952_Glyma0 MDRIKGPWSPEEDEA--------LQKLVERHGPRNWSLISRSIP---------------- Sb023051_Sorbi1 ---DQGPLEPRGGRGPAAAGGPPRRPQLVTHQPLHPGSLRQVVPPPVVQPAVAAGGAPPL gm047970_Glyma1 MDRVKGPWSPEEDEA--------LRRLVQAHGPRNWSVISKSVP---------------- gm008871_Glyma0 MDRIKGPWSPEEDEA--------LRRLVQTYGPRNWSVISKSIP---------------- gm029895_Glyma1 MDRIKGPWSPEEDEA--------LQKLVEKHGPRNWSLISKSIP---------------- Sb026904_Sorbi1 VRQDKGAVEPRGGRGAAAARGAPRRAELDGDRARDPGPVGEVVPAPVVQPAVPAGGAPPL pt037616_POPTR_ MDRIKGPWSPEEDEA--------LQKLVQKHGARNWSLISKSIP---------------- Os006758_Os02t0 CDRIKGPWSPEEDEA--------LRRLVERHGARNWTAIGRGIP---------------- gm039420_Glyma1 MDRVKGPWSPEEDEA--------LRALVQAHGPRNWSVISKSIP---------------- pt016180_POPTR_ VDRIKGPWSPEEDEA--------LQRLVQTYGPRNWSLISKSIP---------------- :*. .*. .. : : . . : . :* AT5G67300.1 -GRSGK--SCRLRWCNQ------LSPQVEHRPFSAEEDETIARAHAQFGNKWATIARLL- gm011952_Glyma0 -GRSGK--SCRLRWCNQ------LSPQVEHRAFTPEEDETIIRAHARFGNKWATIARLL- Sb023051_Sorbi1 HARGGRHHPPRARKVRQQVGHHRAPPLRPHRQRHQEPLELHAQAQVL--------RRFR- gm047970_Glyma1 -GRSGK--SCRLRWCNQ------LSPQVAHRPFSPDEDEAIVRAHARFGNKWATIARLLN gm008871_Glyma0 -GRSGK--SCRLRWCNQ------LSPEVERRPFTAEEDEAILKAHARFGNKWATIARFL- gm029895_Glyma1 -GRSGK--SCRLRWCNQ------LSPQVEHRAFTAEEDDTIIRAHARFGNKWATIARLL- Sb026904_Sorbi1 HARGGRRDPGRARAPGKPLGRDRAPPSRPHRQRRQEPLELVAQAEAR--------HRHL- pt037616_POPTR_ -GRSGK--SCRLRWCNQ------LSPQVEHRPFTPDEDDTIIRAHARFGNKWATIARLL- Os006758_Os02t0 -GRSGK--SCRLRWCNQ------LSPQVERRPFTAEEDAAILRAHARLGNRWAAIARLL- gm039420_Glyma1 -GRSGK--SCRLRWCNQ------LSPQVAHRPFSQEEDEAIIMAHAKFGNKWATIARLL- pt016180_POPTR_ -GRSGK--SCRLRWCNQ------LSPEVEHRPFSAEEDDTIIRAHARIGNKWATIARLL- .*.*: . * * : .* :* : *.. * AT5G67300.1 NGRTDNAVKNHWNSTLKRKC-----------------GGYD-HRGYDGS-----EDHRPV gm011952_Glyma0 SGRTDNAIKNHWNSTLKRKC-ASFMMA------------------GDEAV---AVSPRPL Sb023051_Sorbi1 RRRRCGKRR---CSGCRRRAPAQAHQQRRTPGALLQ------PRKPVRVRPQRLQPPQPS gm047970_Glyma1 NGRTDNAVKNHWNSTLKRKKCSAVSDD-----------------VTD---------RPPL gm008871_Glyma0 NGRTDNAIKNHWNSTLKRKC-SEPLSE-----------------------------PRPL gm029895_Glyma1 HGRTDNAIKNHWNSTLKRKC-SSTMID-------------------DNT--------QPL Sb026904_Sorbi1 QRR----------GGYRR--PRGAAVQAREP---CW------PREPDGVGSQR---PQPR pt037616_POPTR_ YGRTDNAIKNHWNSTLKRKC-SSMAEDGN----FCNREGYDGNLDGDNT--------QPL Os006758_Os02t0 PGRTDNAVKNHWNSSLKRKL----------------------ATATDGG-----EIDRPC gm039420_Glyma1 NGRTDNAVKNHWNSTLKRKS-SAVSDDD---------------VVTH---------RQPL pt016180_POPTR_ NGRTDNAIKNHWNSTLKRKC-SSMFDD-----------------LNDDA------QQQPL * . :* * AT5G67300.1 KR---------------SVSAGSP-PVVTG--------LYM---SPGSPTGSDVSDSSTI gm011952_Glyma0 KR---------------SFSAGAAVP------------------PPGSPSGSDFSESS-A Sb023051_Sorbi1 LRHAVSRFCCRCRRHLPAAAAAARVPPRAARGR-------RGR-APGGAASCAAAAFSSS gm047970_Glyma1 KR---------------SASVGPA---------------HL---NPGSPSGSDLSDPS-L gm008871_Glyma0 KR---------------SATVS------------------------GSQSGSDLSDSG-L gm029895_Glyma1 KR---------------SVSAGAAIPVSTG--------LYMNPPTPGSPSGSDVSESS-L Sb026904_Sorbi1 LR----------RRR-------AGVPPRPARRRLRRHQLHRRR-APSSAPASSSSRRLRG pt037616_POPTR_ KR---------------SVSAGSGVPVSTG--------LYM---SPGSPSGSDVSDSS-L Os006758_Os02t0 KR---------------VS------P------------------GPGSPTGSERSELS-H gm039420_Glyma1 KR---------------SNSVGPA---------------HL---NPASPSVSDLSDPG-L pt016180_POPTR_ KR---------------SASLGAGS----G--------LHL---NPSSPSGSDLSDSS-I * .. . . : AT5G67300.1 PIL-----PSV------ELFKPVPR--------PGAVVLP-------LPIETSSSS---D gm011952_Glyma0 PGVV-SVSPSH-------VFRPVP-------------VRPI--------VETASSQDDAD Sb023051_Sorbi1 SSSAAAAAASGD----LLVAVPLPARAG-----PAARTIPSDGTASTSCTDTSASGSSSS gm047970_Glyma1 PAL---SNPSP-----------------------SAHYRPN------L-METASSA---C gm008871_Glyma0 PII---LARSV-----------------------SVTVAPSN----HLAETASSSV---T gm029895_Glyma1 PV----ASSSH-------VFRPVPR---------TVKVLPP--------VETTSSS---N Sb026904_Sorbi1 PAHLALAFAAGAGPPVGVVGVPPRQRAE-----PLPGAVP-------------------- pt037616_POPTR_ PG----LSSSYN----YNIYRPVAR---------TGAVMPP--------VETTSSSDNNN Os006758_Os02t0 GGC---GSGSGG----GQVFRPVPRPGGFDAISAADVVRPP--------RRRDDNDDDGD gm039420_Glyma1 PAL---SNPSP-----------------------SAHYMPN------L-METASSA---P pt016180_POPTR_ PGV----NSSP-------VFRPPVK--------TASLVPPS------LSIDVSSPT---V : * AT5G67300.1 D------PPT--SLSLSLPG---ADVSEESNRSHESTNINNTTSSRHNHNNTV------- gm011952_Glyma0 DA----GPAT--SLSLSLPG---VESAEISNRATT----VPVMPVNTVAAP------APV Sb023051_Sorbi1 DAAAAATSPT--ESEVAVPAAA--GAGDEPHVAAAGGS---------S----AV------ gm047970_Glyma1 D------PAT--SLSLSLPG---F------GSGSNP----VCAPRPVSVSPPS----PP- gm008871_Glyma0 D------PAT--LLSLSLPG---FDSC----DGANNG------PGP-NQGPSC----GP- gm029895_Glyma1 D------PPT--SLSLSLPGVGVVDSSEVSNRTTEPIHFTPPMPHRSNTMPLL------- Sb026904_Sorbi1 ---------------LALPVAAVYSSTRRPSFAAGGGG---------SLSVVVV------ pt037616_POPTR_ D------PPT--SLSLSLPG---ADSSEVSNQVGEPSQ----LPKSNTVTPLLTGRNAPA Os006758_Os02t0 D-----DPLTSLSLSLSLPGFH-HDSARSH---------FQELPSP-SRSPSP----PPS gm039420_Glyma1 D------PAT--SLSLSLPG---F-----------------TVPQP--VSPPP----PPL pt016180_POPTR_ D------PPT--SLSLSLPG---SITCQAPGSGSSSGS-HVVNPTPMVQTPAA----PP- :::* AT5G67300.1 --SFMPFSGGFRGAIEEMG--------KSFPGNGGEFMAVVQ--EMIKAEVRSYMTEM-Q gm011952_Glyma0 -----PAEVGLGA--------------LNL---SGEFMAVMH--EMIRKEVRSYMEQQ-K Sb023051_Sorbi1 -QLGVPAD--------DAGDDPDR---------GPELHVRVGLRPARRRRLRARRDQAHD gm047970_Glyma1 --PAEPVEQRGK---------------QMF---NAEFLRVMQ--EMIRKEVRSYMSGM-E gm008871_Glyma0 -FQEIPMLGSQK---------------QLF---SQEFMKVMQ--EMIRVEVRNYMSVL-E gm029895_Glyma1 -----PMMTSVSATVMAP---------FNF---SAEFRSVMQ--EMIRKEVRSYIELH-N Sb026904_Sorbi1 -VVVVPVQRRAGG--RDAGDDPCR---------GAQVHVRRG--PTRRLRSRRRRRGGHA pt037616_POPTR_ -QEVSPAVGGLSGSV-------------GF---NTEFMSVMQ--EMIRKEVRNYMMEH-S Os006758_Os02t0 PPAASPSA-------------------YPF---NADLVSAMQ--EMIRTEVRNYMAGV-- gm039420_Glyma1 PLPAETVEERGK---------------QMF---NAEFLRVMQ--EMIKKEVRSYMSGMEE pt016180_POPTR_ -QAAVAVQQQEQVSFLQQKNPGSRLENQFF---SAEFLAVMQ--EMIRKEVRNYMSGI-E . . :. : . * AT5G67300.1 --RNNGGGF----VGGFID-------------NGMIP------MSQIGVGRIE------ gm011952_Glyma0 --N-GMMCFQGMEMMEGFR-------------NVSV--------KRIGISRVDS----- Sb023051_Sorbi1 --GHGQDRVVSA-DSSSRRPRSGRNRRSIRGGHRVYE-PRTACTNQTEAVPCRAVRCGK gm047970_Glyma1 --QKNGFRI----PTEAIG-------------NAVV--------KRMGISNIE------ gm008871_Glyma0 --R-NGVCM----QTDAIR-------------NSVL--------ERMGIGRVE------ gm029895_Glyma1 --Q-NGMCFQAA-VNDGFR-------------NASV--------KRIGISRVDS----- Sb026904_Sorbi1 --AAGGGR-------HARR-RGARRRR-----HTAVE-EENPKPNQTKSDRINAKHCVN pt037616_POPTR_ GVG-GGMCYQGM-SGEGFR-------------NVAVN-------NRVGLVKLSSEKWTG Os006758_Os02t0 --GLRAGCGPGA-VAESFM-------------PQLVDGVMRAAAERVGVVTRQ------ gm039420_Glyma1 --QKNGFRM----QTEAIG-------------NAVV--------KRMGISNIE------ pt016180_POPTR_ --Q-NGLCL----GTEAIR-------------NAVV--------KRIGISRIE------ .:
|