fioreDB : Database for Flower Bio-engineering by CRES-T system
fioreDB : Database for Flower Bio-engineering by CRES-T system

Locus Common name Short description
AT1G22490 bHLH094 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein (.1)

>AT1G22490.1 genomic map

>>Show CDS map




Uncut enzymes: ApaI, AscI, BamHI, KpnI, NcoI, NheI, NotI, PvuII, SacI, SalI, SmaI, SpeI
Name Recognition sequence Cut positions
BglII A|GATCT 909, 6299
EcoRI G|AATTC 354, 901, 6485
EcoRV GAT|ATC 4144
HindIII A|AGCTT 83, 743, 1687, 3714, 7570
HpaI GTT|AAC 1496
NdeI CA|TATG 1718, 5486, 6768, 7544
PacI TTAAT|TAA 285
PstI CTGCA|G 2076
StyI C|C[AT][AT]GG 6944
XbaI T|CTAGA 6498
XhoI C|TCGAG 3963


Click here to view TAIR data

>AT1G22490 genomic sequence (4104-4541,5008-5397,6059-6145,) length:7841
aggggttagt atgcagttcg attttttttg ttttttagct caagagaaat 
50
aaaaaatgga ttgtaagttt gtatacatag ttaagcttaa tatgatggtg 
100
acctctattg gaatttagca ttctatagcg taaagaagaa gtataactag 
150
atatggaaag ttttcactaa aacaaaacga aatttatata gatactgtaa 
200
aaaaataaat gaaaaaggga ttattattag agcaaagtag gaccgatgat 
250
cattaatcta gttttaatta ttattagcaa agttaattaa tattatgaga 
300
atctcataag gaattgatcc gggcaagtac acgatactgt atatctcatg 
350
ttagaattcc aggcagcgag atttacggtt aaaccacatg ctaatgtttt 
400
tttttctttt ttcttttgtt ttgttaaagt ttctttacta cttaaaaaaa 
450
tttattttta acatagaaca acgacgacgt ttttagtagg atgcttaact 
500
aatttttttt tataaaaaaa aaaaaattat cttctataaa caattcttaa 
550
acctctaaaa cgctgatttc acagtcacag caattcaatt ctcaattgaa 
600
acgttgaaaa tgtgttagtt ttttcattca gtgactaaat ataacttatg 
650
ccaaaagaat gatttagtcc cgtatatcaa taaataagaa atatatgttt 
700
tcgttggtga acagttcctt gaagtatttt ctgccaaaag ttaagcttgt 
750
ttgtattata taaattaaaa tatagtatgt gaccttagaa ccagtgataa 
800
aatattgcaa atttatttaa acgaaaaaac aaaccatgaa ccaataatag 
850
agaagaaata tgagagtcta ctgacaacca cagtaataaa aaaaaatcat 
900
gaattcacag atcttacgta ttgtaataca ttagtgaaat atgagagtct 
950
ccttaataga gttaaaatgg aaatctccaa attaaactta tttcattttg 
1000
gagttaaaaa tggaaatatc caaattaaac ttatttattt taaaattaaa 
1050
aatgagttag ataaataaag aaacatacta tactattaat attattacgt 
1100
agataatcaa acattactag accaaaaatc ccggaaatac attgaacagt 
1150
caagaaaagc caataacatc taagtaataa gtggattcct accataaatt 
1200
taaaatgata aataaactaa ctaaggcata ggaacagcat ctaatcaaat 
1250
aataaaacaa gagaataatg ggttaatgta tattagatag tgatttgaac 
1300
acgttagaat cgataagtat gcaattaatt agcataggcg gcatagaact 
1350
attgaagaag atacaatggc tagtctatag atataatcaa acatactata 
1400
atcttaatta gtagaacaga aaataaagtc caaccaaaac atctatttta 
1450
gtttttgttt gtttaggatt aaagataact atttaattta agtctgttaa 
1500
cagtgtaata tattgaaata tacgtcatta atgagtgttg taataaaatg 
1550
taaacacaaa gatgaagaaa aagctaacag tgataactga aatgattcgg 
1600
aggatgcatg agaaaacaag cccattggaa aattgtaagc tgtgttcttg 
1650
gaaaagtact tgagagttga gagacaagaa aaatagaagc ttgtgaggtt 
1700
acatggactt ttctggacat atgctcatgg cttctcctct caattgtttt 
1750
tacttttttc agaaaagaaa aaacatctct ttaaacgtct gcatcaaaaa 
1800
caaaactctg ctatgatcga tagaaaataa atatcactcg tgcgaaaata 
1850
tctacatgtt aaacgatgaa ctaaaatgat taaaaagtaa taaacataaa 
1900
ggatgatcga aacaaatttt taaatattaa ataataatcg accaattaat 
1950
tttgagtttg atgatgtaca aataacatta ggtacacgta ttcaaaggag 
2000
acaagattac tatagcttaa attcaatttg aagtgcatac aacaagattc 
2050
tttgtatcat catgaaaagt ttgtcctgca gttttatgtt cacatattat 
2100
ttattttttc ggcaaattgg ttcagatttt aagattccaa gtgtccgacc 
2150
aaatttgatt acaaaacgca gcctagtcac atctatctaa ttctttaaat 
2200
tttgttttca tatcaaaatt gatttctact attatatatt cccagagtga 
2250
ttagatcaga ataatcaaaa gatgccacct aatttatata cataactttt 
2300
ttggtttttg atgttgaaaa gtagtgacaa aagattttta atagaccatc 
2350
attttataac atgcaagtaa atatctcgat ttaaatatat ttttaataac 
2400
atcacgaaac aaatttgtta aaacctgaca taaagtgatc cccaccggcc 
2450
aaaataaatc ttctattggt tgtgtatttt ctgacaaaca tttgttttaa 
2500
agatttttaa ttttaatcgg atacttaacc atatatttga tatggaaata 
2550
cattatattt ttgtttaaag taaaataata gaacatgagt gtaactagac 
2600
gacccccaac ctgcaaacag attatttggt cttgtggact ggtctactac 
2650
tatctcacgt gcaaacttga cgctgcaatg tatacattta tctatatgca 
2700
tctatgtatc taaatagtaa ttagtaacca tagataatgg atctaattcc 
2750
acgaagttgg atagatattc taaggtaata tctggtagaa ttttaatttt 
2800
caaaccaaaa aaattgttac cagatgtgaa tgcgtagaac taaaaattaa 
2850
ttggcgtaga ccgtcctaac tggaaactca aataactttg tttacaagta 
2900
gcatgtaact gtatatatat aatgctttag aatttttatg gtccaattga 
2950
aaatttcaca ttttcgtttt attgtatcac tcacttgtcc gactgacgta 
3000
gaattgcacg tcttaatttt tttttggcga aaacgctaat ccgcaacaaa 
3050
aaaatttgtt aaagtagtcc gtaacttttt ttttggttaa agtaatccgc 
3100
aacatgacat attagtacta acgaactatt gttttttcta ttaatttttt 
3150
gctatattta gaattttaag tagtttagcc atcaccatct gtgtatcctt 
3200
acactataca tattcggaaa aactcgaaag aggttttaac tggttatgat 
3250
caccaccagc agtccagcac cagttttctt tcactcgaac gtcaatataa 
3300
attcactgcc cactatatca gctttaccat ttcttaataa attatttatt 
3350
atttatttga ttttgaacta agaaagatta tgggttttta ggaatagttc 
3400
caaacaatta acatcttaat aataaaatta ctatataata aaactaattt 
3450
atattaaaaa cattatgaac aatttttttc tttattttct taacctctaa 
3500
ttattatgaa caagttattt aaatacaatt gggatgatta ttacaagtgc 
3550
actttatatc tccttttcag tgttttttat atatatattg gtgacaaata 
3600
catcttttct ttagttttat ttttcttttc gtttttgatc tctgcgggag 
3650
catttatttt tggtcaactg tgagagcatc aaaaaaaaaa aaaaaaaaat 
3700
taatagcctc acaaagcttc tctcaattcc ctttttaaat aaatcacacc 
3750
actttgtttg atcctcatat ttcggttttc actctcatat ctttcttttg 
3800
tatatttatt tttgttgaag attcactctc ctattcttcc tccatgccgg 
3850
tgagttcttg agaatttaat attttgtaaa tcaatttaca aaaaatcttc 
3900
atataactaa taccatgctt agtttccttt agtgggctta acccttttgc 
3950
ctttatttcc ccctcgagac aaaaaggaga gcgacaaaca cttcctgtct 
4000
aaattttgtt ttctctcctt ctctctccct ctctcggttt ctcaatcttt 
4050
cttatttttt ccataattct gaatttttct tttcaacaat ctccggctaa 
4100
aaaATGCCCT TAGAGGCTGT CGTATACCCG CAAGATCCAT TCGGATATCT 
4150
CTCCAATTGC AAAGATTTTA TGTTCCACGA CTTATACTCT CAAGAAGAGT 
4200
TCGTAGCTCA AGATACGAAG AACAACATTG ATAAGTTAGG GCATGAACAG 
4250
AGCTTTGTGG AACAAGGTAA GGAGGACGAT CATCAATGGC GAGACTATCA 
4300
TCAGTATCCT TTGTTGATCC CTTCGTTGGG AGAAGAGCTT GGTCTTACCG 
4350
CCATTGATGT GGAGAGTCAT CCTCCTCCAC AGCACCGGAG GAAGAGGAGG 
4400
AGAACGAGAA ACTGCAAGAA CAAGGAAGAG ATCGAGAACC AGAGAATGAC 
4450
TCACATCGCC GTCGAGAGAA ATCGCCGGAA ACAGATGAAC GAGTATCTGG 
4500
CTGTGCTCCG TTCTCTAATG CCGTCGTCGT ATGCTCAAAG Agtaacttac 
4550
taattcaatg tttatatatg ctatatatca tttggtcagg gtcattctta 
4600
ggtatatgtg tctttgtttt attacttgct tggctgtagt actcatttct 
4650
ccataatata ttaacacaaa agaatagaat gaaaatgact gagaatatat 
4700
attgatgttt ttatacaata tattaacaag aaaatccacc gtaaatatgg 
4750
aagggtgacg cgtttatata catactaata atctttgctg ttacatattt 
4800
taatgtattt tttaaaataa aatattatgt gtcaccaaaa attagaacga 
4850
gtatgattga gaatattggg atatgtttta gaacaatttc gtaataaact 
4900
taagcaatta gcaatgatac gtgtgtgtgt atatttatac attcaaagat 
4950
tttttcaatc tttatgataa ctatatgatc tgacatgagc gggttttggt 
5000
ggtaaagGGA GATCAAGCGT CGATAGTAGG AGGAGCTATA AACTACGTGA 
5050
AGGAGTTAGA GCATATTTTA CAATCTATGG AGCCGAAGAG AACTAGGACT 
5100
CATGATCCCA AAGGAGACAA GACTAGCACT AGCTCGTTAG TGGGTCCATT 
5150
CACAGATTTT TTCAGCTTCC CACAATATTC TACAAAGTCA TCATCAGATG 
5200
TACCGGAAAG CTCATCTTCA CCGGCGGAGA TAGAGGTTAC GGTGGCAGAA 
5250
AGCCATGCGA ACATCAAGAT AATGACGAAG AAGAAACCGA GGCAGCTTCT 
5300
TAAGCTCATA ACTTCTTTAC AAAGCCTAAG GCTCACTCTT CTTCATCTCA 
5350
ATGTCACCAC TCTCCACAAC TCCATTCTCT ACTCCATCAG CGTCAGGgta 
5400
cgtacatttt caacttctca tcattacttt gtttgctttt ggggtaatca 
5450
tgagattaaa gtgagtaatg actgtgtgtg tggtgcatat ggtttcactt 
5500
tgttgattta tttttttgtc tcttattgtt ggggggaaat tttggattag 
5550
tactattgtg gttatgcctg ggctttaaaa aggttgtgaa gaaaaattaa 
5600
aatcattctc tttgtttttt tcttacctcc tttgggtact tagggctggg 
5650
gcctcaatag ttgtgggtca aactcataat catcattttg attattattt 
5700
ttgtcaataa taaattgcgt atcttaatcg tgcctgtaag aatcagggga 
5750
ccaacctaaa gaaacgaaac acgaatatgt gtctatctat atccacgaat 
5800
tgtatacgtg gtgttgtgta tttatatatg tttatgtata tgtttatgta 
5850
ctgtggatat atgttcggtg gtcacataat tgtagatgag atatgtacgg 
5900
acaacgaagt gagtccacca tttgtttcag gagatattta gcaaatagaa 
5950
agatattttg ttatagttat ctacatcctt ctaattttgt ttgttgcaac 
6000
ttttttcaag aattgttatg tatatcttta tttcttaaga gaaaatgtgt 
6050
tggttcagGT TGAAGAAGGA AGCCAACTGA ATACCGTGGA CGACATTGCA 
6100
ACAGCTTTGA ATCAAACCAT AAGGAGGATT CAAGAAGAGA CATAAttcag 
6150
caaatagatt ataattaact tgttttattt ttattttatt ttgaaataac 
6200
tgaaatcagt tttctaattt tttttttttt tcactattcc tctaatcctc 
6250
cctatgtaag ttgcattttt gtctcttgta atgaatcaat ggtcataaag 
6300
atctgaacaa aaaaattgaa taaaagaaaa tggtttaagt cgataagtat 
6350
gtgacattgg gcgctaatag ccgttaggcc tacgcctaat gtacttctca 
6400
gtgtttttag ggttgtgttt agtgtataat tataatgatt aatagtatga 
6450
ttgattaatt tttgaattta ttttcttcaa agatgaattc gtctttttct 
6500
agaactttta aagtttgtgg gttcaacttt taatccgtta atcactaaat 
6550
tttagcatgc tcctacgata gtggaggtta tacctttggc tttgaatgca 
6600
aacaaattct ttctatctag taacccaaga aaataaaatt gaaaataaaa 
6650
aatttgatat acaaggttgt atctttatta taaaaaaaaa catttagccg 
6700
accataacac acatgtataa ctaactattc gtgggaaatc aaactatttt 
6750
cacctcgata tatgaaccat atgatggaca acttacaaac ccactaaacc 
6800
ttccaaaagg accaaaacta agtaaatatt ttgaatatac gtagtttagt 
6850
atagttcaag tttaaaacct tatttttgaa gtggatgatc atcctcattt 
6900
aacatacttt ttaattatcc aacattggtc taagaatata ttaccaaggc 
6950
ttttcaagaa aaagatcaaa atgtaaaatt ttcttttatc aagttaaaaa 
7000
ataaaataaa aattattcgt ttagaaaaga aactaagcaa gaatcaaaat 
7050
taaaaactcg ctagtacttc acaaaaaaaa gaataaaaat gattttctct 
7100
gtaacatcaa actcttaaaa gattatttct tggtaatata tattttattt 
7150
aaagttaaag taagggaaga aaaaaccaaa aaaatacata ataagatttg 
7200
tttaccaatt accggattta tttttcagcg atagcatgtg aaaagattta 
7250
acaaaaaaaa agatagcatg tgaaaagaaa agaaaaaact gagcggtgat 
7300
cataataaca aacaatgttt tgtagataaa ttggaacaca aaatcagcgg 
7350
tacgtgtgaa tcatggaaga agagagatga tgatcattgt cttatcatga 
7400
agacccatca aagcacatgg agcctcagtc gataaaagga aaaaaagagt 
7450
agaactgtac gtattattag aacttagaag aacaaaaaaa aagaagtaaa 
7500
aagtaaaagc tatagatatg atttttgttt ttgacctagc ctacatatga 
7550
tttaaacatc ctatgtgaaa agcttttcat taaatcttaa taaaaaaaca 
7600
cctcaaaata tagccgactg ttctcttcag cagcttttta tgttttgagc 
7650
ttatagattc acactatctt gcagctttct ctttatattt ttgttaagac 
7700
ttattcagtt ttctttgttt attgtatata atttgtaaga ccatctccat 
7750
ccgtgagaaa ctcattttta taaaataata taaattttat tattatttta 
7800
ttatttaatt ttttaattat tatttgaacc aatcaaaaca a
7850