fioreDB : Database for Flower Bio-engineering by CRES-T system
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Locus Common name Short description
AT5G15160 BNQ2, BHLH134, PRE2 BASIC HELIX-LOOP-HELIX PROTEIN 134, BANQUO 2 (.1)

>AT5G15160.1 genomic map

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Uncut enzymes: ApaI, AscI, BamHI, EcoRV, KpnI, NdeI, NheI, NotI, PvuII, SacI, SalI, SmaI, XhoI
Name Recognition sequence Cut positions
BglII A|GATCT 2394, 6380
EcoRI G|AATTC 3280
HindIII A|AGCTT 2875, 4492, 4806, 5200, 5351
HpaI GTT|AAC 6292
NcoI C|CATGG 287
PacI TTAAT|TAA 5499
PstI CTGCA|G 1462, 1876
SpeI A|CTAGT 1208, 1980, 5812
StyI C|C[AT][AT]GG 287, 4263
XbaI T|CTAGA 3263, 3948, 4651


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>AT5G15160 genomic sequence (4096-4224,5007-5162,) length:6882
acctgtaaac ccggacacaa actgtgatct ttccctctta attgtgcttt 
50
gtcaacagGC AAAACAAGAG ACGAAAGACG AGGTAGAGAA GAGGAGTAAG 
100
CTAGTGACAA TGACCTGGCA AGGAGACCGA GATTTGCCTG AGATAATCTC 
150
ATTACCAGTT CCTTATCAAC TACCTCCTAA GCCATACTCA CCCGAAGgta 
200
ttttccctat tcattatcca gcaaatataa cttctttctt tctcaagtta 
250
ttaacgtttt tactggcatt gtgattttca gATGTTCCAT GGTCATGGGA 
300
CCGAGGCTAC TCGAAGAAAG ATGTGTATGG ACAAGTCTGG CCAAGATAGt 
350
tgatgatagc tttagtagct ctatgacttg agacttgaga gagtggcttt 
400
atgggtttta ctcactcaga tattgaagac tttataatct ttaatttaat 
450
gctaagcgat gaacaaccag acggataaac aaaaattagt gtgaaactga 
500
ttgaagtctg tggattaatc cggattagtc caccaatgga taggattagt 
550
attgataaag ttcttttaat ttttagtatg tgaaagaaaa ttgacctgtc 
600
ggcttcagtc tgccgtacca acgaggttga aaggttaaaa atctcgtggg 
650
ccaaatagag aattttacgg gttggctcat ttttaatttt gtatatatgt 
700
gaagtcatat taggcaagtg gtttaattag gcaagtggct catatatatg 
750
ttaaaaattt gtaattcttt tgcttgttgg cattttactt ttgtccgagg 
800
aaattgaatt tgattaagct atcacatgtg ttgaagagca tagtgtaaag 
850
tccaaacata attagcataa gtgataagta cgaaccacaa acacaaaaca 
900
atagacatag aaattggaga cataaggtat tttttcatat tattatgaca 
950
gaagtgtgtc gttggttaca agaaagtgag aaacctacga ttttaattcg 
1000
agacagaaaa tcaagaacga aaacaaaaat gaagaagaaa ttttggtggt 
1050
ttatattcga tagacattta gaatacaaac agatgcagac aaggattcac 
1100
aatcaatgtc tacattgcca agaacacccg tccctctctt tgatgatttg 
1150
gccttttatc atatctatca attattttaa gataataaca ttcataagtt 
1200
atttgctact agtttttgat atgcaattta gtcctcgaat cttgagaaga 
1250
gccaatcaca attatgatat tgattaagaa cgatctttct tctgaccatt 
1300
cacaacttgc cacgtcagta ctcaaaagtt tggataattt tatccagtgc 
1350
cttgagactt aggatagtat gcagtagtag tgtcttgaca attgatatag 
1400
tatcaacatg ctcgtttata ttcttttatg gaacgaggga agattaatga 
1450
ttttttactc tctgcagaca agtgcctgat tagttgtgat taaagatgcc 
1500
gcagaattaa atcatatcat tattttggat actgttaatt ttcatgagat 
1550
ttgaaaatat ttgacaatga atgtattggc tcaagtaagt tctttggaaa 
1600
aaaaggttct ttgagtattt ttttaggtct cgtcttatct cagatataag 
1650
atttcaagta tcttgagatg atgaaatttt cagtttttta tttatcaaat 
1700
tttcacttca aaacaaatag ataaaatggg tcgattgact atgtccttgt 
1750
gtattaaatt ttattttgtc ttatttgtta tatgatattt cttacatgca 
1800
tgcatcattt agtttgacta tatagacttt ggataaaatt ttgttttaaa 
1850
aaaaaaataa aaaaataaaa tttgtctgca gagttgtgga ttatgggtaa 
1900
ttagttccac atatttcacc tattgaaaga tgcattctaa tgtatcaatt 
1950
ttgaacggtg gtactggtac atcgacgaca ctagtatgaa caattatgat 
2000
ataaattaaa ctcactggtt tttgcaaatg ttctaactat aaaaacattt 
2050
ttctttgaaa attgttatct cactaccgta gtaaaacgat ggagataaga 
2100
aaagcgagag gtcatgtggg agagggcgtg aaggatgggg atgctccctg 
2150
attagagggg ggaaagagtg tcctatcatc acatgggagg ttaaactggt 
2200
tcttatttat aacttcaaaa tattaaaaca taaatagtcc cacctttgtg 
2250
tgctcatcag caaacatttt tctttaatgt ccaatttatc acaccatctc 
2300
cttgttttct aatacatatc atacatctac taatcatcat tcattcatat 
2350
cttttgcata tatcatcatc ttcatcatca tcatcacgtg tttagatcta 
2400
gcaaatggtt tgttgttatt tatgaccaaa acaacattac catgtagtat 
2450
ttatataaat cctaaataaa aattgaaact cactgataca attaaaatta 
2500
aagtatttgt acaaaattac atattgacga atgttagttg gaaatcacct 
2550
gtctaagttt tttagaacaa gtgctcaaag atattgggtt cgacaattga 
2600
tgaaattcca cttaggcatt acatataaat aaatatcgta agcatataca 
2650
ctatcaattg aggtacacgt gatcgagctt ggactaaaag tgtaagacta 
2700
gcccctccct attggctagg atagataccg tacgttccct caaattgacc 
2750
taagtccatt gtttttgttt acccgtatct atataactga accacaaaat 
2800
cttcttggtt ttacgcatca caacgatcat aaaataatga tatactcata 
2850
taggtatatc ttgagtatat agacaagctt tacactagct tgtataataa 
2900
gataaataga gtggtgatat tttaatgttg cattgtttca gtacttgaaa 
2950
tcagaatcgt ttcccacttg aaaaattagt ttctctttga tcatagcata 
3000
tctaacaaga catattagtc gagcttttgg atagttgtcg tttggtctta 
3050
aaaaataatg atacattctc acaaactctc accgtacctc aaggctcaag 
3100
caaagctagg acatgctatt aaggaactgt aactactata gctgattatc 
3150
acaaagtctc acctcaatat atataaagat tttaatgact agaataatta 
3200
taagttttga gataaattat caatgtatcc aagtgaaagt attgtttggt 
3250
attttctgtc aatctagata ttcatttgcg aattcctaat tgacgaaaaa 
3300
taacagatat tataatgtta ctaattaaca aaaaataaat ctttgaaaag 
3350
atttacatca ttgaaatact acaatattaa aaatataata gcattataat 
3400
atcgacaata cttataatac tcatataata atataataag aagattttaa 
3450
atgtacataa tacaaattat tgcaaaaaga tttccagtaa tagatactaa 
3500
gttctactaa agtttttgaa actttttagg aaaagcaaga ttttgttgga 
3550
gactttggat taatgtaatt ttcaaaagag aagaagatgg tttttttttt 
3600
tctgaatata agaaaataga agatatatat ctatcttcgg tgtatttatt 
3650
gttgataaat atgctgtctt tttttaaagt aaatagataa aagttagaca 
3700
gacttttttt ttgtcttatg tatctttttc tctagttttt tataaatcaa 
3750
ctttaaatta atcatcaaat aatagtaata ttagacacat atatacatca 
3800
cgatctgata aatttgtaaa ttcacgtgtc atgtatccaa gactccaatt 
3850
ctaaaccact gttctctctt gtgcacttgt catcggcata tccaacaccc 
3900
ctatttaaga ttatttgtat tactctcgct ctctctctct ctctctatct 
3950
agaagtggtc ctagctctct atataacacc atttcttctc cttctttctt 
4000
ctccctttct ttcgacaagc acaaacaaag ccatcaagag aagaaagcct 
4050
tttcttggat tcacatatat ataagaatat tttttcaaat caaacATGTC 
4100
TTCTAGCAGA AGGTCGAGAC AAGCAAGCTC ATCATCAAGA ATTAGCGATG 
4150
ACCAGATCAC TGATCTCATC TCAAAGCTCC GACAGTCCAT TCCGGAGATT 
4200
CGCCAGAACC GTCGTTCCAA CACGgtaaat cttttcaaaa gttactgtgt 
4250
ttcttctatg taccaaggtt ttggcatagt cacataagtt ttactttgat 
4300
gatatttatt tagggttagc tattatgttt aatagagaat cacgcatata 
4350
caagtataca acatgttaga atagtgcatt atagtcatag aagtacgtgt 
4400
gggagactgc attttgaagt ttctaaaatt acttttgacc attaaccgga 
4450
ctttgaggag aggggaacat attttcccta acttcagcat taagcttcta 
4500
gttaatttta cttttattat tgattaacta cattgaatgt gagacgacta 
4550
tattgcttca cggaccatca attcaataca tttatgtaca gcaccgacta 
4600
atttttatat ttggttttct tagtttctat ataacaagaa aagtacgaac 
4650
tctagaaaaa taagaaaaag ctggtttcta taaatggaag catcgttttc 
4700
ttatagtaca cacaaccaat cagatttgtt ctcaatttca aaacaatgtg 
4750
ttggttaagt tatgagcatt tttatttttt tgataaagta tgggcatttt 
4800
atcttaagct ttaggtttaa cttttaacct atgcatagtg tagtatgtca 
4850
agcaactagc gtcaatatat tttcttacat tattaacacg catcataact 
4900
tcaagctaag acttgtttct gttgttgtta aagcaagcta agacttgttt 
4950
gaatatttat attgaatcct tactataaaa tgtacaattg tgaaaattgt 
5000
ttgtagGTAT CAGCGTCGAA AGTGTTACAA GAGACTTGCA ACTACATAAG 
5050
AAACTTGAAC AAGGAAGCCG ATGACCTCAG TGATCGATTG ACTCAGCTTC 
5100
TGGAATCCAT TGATCCTAAT AGCCCACAAG CCGCAGTTAT TAGGAGCTTG 
5150
ATTAATGGAT AAttaagata taaattgatt agttgtgctt tatatatata 
5200
agcttaaaat ctcgttggga ggttgatcca tcagggtgtt gcataattat 
5250
atatctattt tatgtttctt atatattatt tacaatccta tctagttagg 
5300
gttcatattt tgaccctttt ttggtttaac gtcatgcatg caattccatt 
5350
aagcttaaaa attataataa ataagatttc gagtaattat ttaatttaaa 
5400
tccttttata ttatattgta agtgtgtcca tttgtatgtg tgttaatgcg 
5450
ttatacaaat ggatatacta tataagtata tatggcaccc aagaggttaa 
5500
ttaatttcaa agttaattta gacttatctt cgaaatagat agaaaagttg 
5550
attaatacta tcatttaaag cgtacatgat tatcaatttt gcatgaaaac 
5600
gtaataggat gactcaaacc taccagactc acataaaaaa taatatctca 
5650
accattatac cactatacat tgttacaaat tacaaactac agaatgaaac 
5700
aaaatctata tttattagct tctcacatat taaaaaaaat aaaaaatcca 
5750
acaaatgttt ttgaaaacag acccatcgtg cattatattt gataataaag 
5800
ataacattta cactagtttg ctataaaatt tagtatttaa ttacctacaa 
5850
taattttaca tatatatata tatatatatc tgtataaaat tccctaaaat 
5900
atttgaaggt ttagaaaaca ggtatatgaa gtttaaacat gcgtatcata 
5950
caatctagtt agtgtaagta tttacagtca aaatgtatga accccgcgat 
6000
gaaaagtaag atgagtgagc agtttttaga aaactcttcg gctgatatat 
6050
cacacgaatc ttgcttatta atgttgcaag aaggacacaa taaagtaaca 
6100
cgatttttgg caacaaaaaa aagaagtata tataattagt acaaagttca 
6150
ccataaatta aatcacattc taaaaaggag tttgtcgtct tttgttagca 
6200
gatgtgaaat atagatgacg ttaatactta tatttgtcgg agaactggga 
6250
tcatgagcca caaattttgc ataaattagc gtagtactta agttaacttc 
6300
tcacatttta tacaaatata tatatataaa tatgagacag ggatgtgacc 
6350
tttttttttt ttttaatatg gagtcatgga gatctttcat gatttgttac 
6400
ttaccggttg ttttaagaat ttgtggactt ctctcttcca tagatacact 
6450
gtccaatttt tttatttttt tttgtattta aatatttata taaataagtt 
6500
gtttataata aaccactaaa atatacattt acaggatgca acggtaaagt 
6550
agttaaatcg gttgagtcgt tgagaatgga tataatagtt tttagcttat 
6600
aataacaact aacgtgaatt ttttggctag gaaattttag taaatgtgga 
6650
ctttttaaca taaaaccttt gacttttttg gttacgcgcg taagacccta 
6700
attgattaag taatttgcta tagtgtagtt ttatttagag gacataaatt 
6750
tccatttcca tgatctgaaa agatttgaat tttcgaccta aacttcaggg 
6800
cactaaccac tggtcatata tatagcatga tgatttttgt ttttgtgttt 
6850
tttttgtcgt tagcaaatgt actcgaataa aa
6900