fioreDB : Database for Flower Bio-engineering by CRES-T system
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Locus Common name Short description
AT1G35460 bHLH080 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein (.1)

>AT1G35460.1 genomic map

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Uncut enzymes: ApaI, AscI, NcoI, NheI, NotI, SacI, SmaI, XhoI
Name Recognition sequence Cut positions
BamHI G|GATCC 2135, 4258
BglII A|GATCT 2226, 3959
EcoRI G|AATTC 3912, 4132, 4799
EcoRV GAT|ATC 2817, 5141, 6864
HindIII A|AGCTT 3089, 5327, 5510, 6264, 7200, 7667
HpaI GTT|AAC 903, 2644, 5081, 5598
KpnI GGTAC|C 2598
NdeI CA|TATG 2162, 5067
PacI TTAAT|TAA 426
PstI CTGCA|G 5770
PvuII CAG|CTG 4626
SalI G|TCGAC 4562
SpeI A|CTAGT 6411
StyI C|C[AT][AT]GG 1699, 2395
XbaI T|CTAGA 333, 700, 843, 4596


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>AT1G35460 genomic sequence (4176-4631,5118-5252,5353-5418,5760-5828,5938-5991,) length:7686
GGAATGAAGT GTAAGACCAA CGTTGGAACG TCTCTTCCTT TAAGTTGATA 
50
CCGTCAAGTC TCGATGGAGA GGTTTTTTCT ATCGCTTCTC TTGTGTTATA 
100
CCAGTTTTTT GTTTCTGCCA Ttgttgaaca aaaccaaaat ctctcggtcg 
150
attttattcc caaaaagata gagaatcgag gaggatttaa acaaactcct 
200
aaccctaaaa agtctcttgg ttactttatc ctctatttgg tttttacttt 
250
tttttttttg tttagttttc cttatttttg caatctttga tttttcttat 
300
agttaagatt gtatcttatg tctcaccgtt tttctagatg aagaattgat 
350
atgaatgata cattatgcat cctataatta aaaaggcaat tgaataattt 
400
tttacaattc catatatatc ttattaatta aaaacaaaga ttttattttt 
450
tgcaactttt ttttttaaaa aaaaaattgt tttaacgaaa aaatatttgc 
500
acctcgtttc ctttatttta agttattttt atttaaataa attttagttt 
550
tcccttttcc aagatatact attaccaaaa taataataat tacaaatttt 
600
ttttactcaa acatatacat aagcacataa cataattcac aaaaatcaca 
650
attatttgga accaagactc tgtttaggtg tttaatctat tcttccgagt 
700
ctagaaattg gagaggggaa catggaaact tttgtattgt caaaacacaa 
750
aagcaggcac aaagaaaaga atcaaattta aaggttggta gtgttcttaa 
800
gaaactctaa tgatccaaaa gcactcaaga ataaataaat aatctagaag 
850
tttaagtaaa gatcaaacct caaaacgttt tttttttttg aacgagactt 
900
gggttaaccc ctttgttcac ctctttttgc attaaccaat aaaaacatgt 
950
catgtcaaat tatacttaaa ttacataata aattaaaact ataattataa 
1000
tccaaaccga tatataatct cgtttattat aaaatctaaa ccctaattct 
1050
tctttgtaaa cccaaactac catttaaact catttaatcg taaaaaacta 
1100
aactctaatc gtattttcta aatccaaacc gatatttaac ctcgtttaat 
1150
tgtaaaatct aaatctgtta ataaacctaa accaaaattt aacgtgttac 
1200
cctaatcgta ctttctaaac ccaaaccgat atttaacctc gtttaatcat 
1250
aaaatctaaa cccaaaccga tatttaacct cgtttaatca taaaatctaa 
1300
accctgacct tttcaaataa acccaaaccg atacataatt ttgtttttgt 
1350
ggcaaattag attttataat taaattaaat tcttttataa ttattaggtg 
1400
tcacatttta attggctaga ataaaggagg tgaataaagg aggtgaaccc 
1450
aaatattttt cttttttttc gtcaaaaact tattgaatta atttgaattg 
1500
tcaatacata gaagttcatc aagccaaata ggcagaatga cagaatgagc 
1550
caaaaacaag agttgactat aagctagtat agctaaatga tgggctacat 
1600
tattacattc tctcttaata aatttgaaaa gaacatgtcg aatttttttc 
1650
ctccaaaagc aaatgtcttt gttggttata ttactctggg tagtgtatcc 
1700
ttggatagat ttgatacgaa cttcattatc tccttcaaaa attaccaacc 
1750
tacatcctcg tatccatgtt tgttgcattg cgacaaggag cgcctttgtt 
1800
tcagctatta acggagatgt tgtgccatta ggatcacttg atctccatgc 
1850
ctttgccatt ccatctttgt ctcgtattat ccacccacga cgagcttgag 
1900
aagatgtctc atcaaaactt gcataaaaat tgcattttac ataggggatt 
1950
ttcggttttg aacaatgaag aatttctctt ggtagcgtgc ttgtactctt 
2000
tcgggaagag tcggttgtgc cattactgaa aatccacttc tttgtttctg 
2050
cttgagcttt caataccact ttcgaacatg attctctata gttattaaaa 
2100
cccagattat tcctcgcttt tcacattcgc caaaggatcc aaaaaggaag 
2150
aactttatgc tcatatgttg aacttggtga ttgaaaacca tcaatgagtt 
2200
tagctatgtt ggcctctaaa tcatcagatc tagttgacca taaaaaacac 
2250
gtgtattgga aagcctccaa gtcatagtag aaaatggaca tgtgaataaa 
2300
gcatggttga ttgtttcatc tccatttcga catttaggac gtatcagatc 
2350
gatgtgcata ccttttgtgt tcagccgaac acacgtagct agagccttgg 
2400
ataaaacaca ccatcaaaaa tgtttaattt tagggagaat ggtaatttcc 
2450
atattttgct cttcatcgtt gtagatccat gcgggatgga aggataaact 
2500
tgattatctc cagggtcatg agtaagtagc caataacctg atttgactgt 
2550
gtaaatacca gagacagaat aattccaaat tatacgatct ggaccagggt 
2600
accgagataa atgaatacca tgaataaatt tgtgatcatt tgggttaaca 
2650
atttgattta ttgcatctgt atcccagaac cgatatgcac ccctgttcaa 
2700
aatatgttta tttattttgt cgtctgtgtg agctgaatcc atctgtaatg 
2750
gacgtggagg atgtgagtct accaagttgt cctgtcccat cctaattgtg 
2800
ttgccatctt taacttgata tcgtgttcct ttttacctca aaacgtttta 
2850
gaaggagaag aacaacacat ttggggctgg agatgaagat gatgaatttc 
2900
tataaagaag tccaagcatt aaattttgga ttttactatt ttatcttcca 
2950
tctcaaaaaa ttatagacta atcatagaaa atcaaaataa aaataattta 
3000
attcttatat acatatattg taaacgtttt aacggtcaca ttcattagat 
3050
tttaaaattt aaaggtttag ttgaactctc tgtcactaaa gcttaaattt 
3100
gacatattat taatattaat caacatttta caaccttaac tgtagcgaaa 
3150
aatggtttaa ttgcatacta ttttaacttt gtagagttaa tctgcattgg 
3200
ctaaaggtga aatgtaaata tgcaaaaatt ggtgagttgg aggtttagtt 
3250
ttcacaaaac tctaaattac ttttagagca aactggtcga aatctacacc 
3300
attttttaaa aaaaatttgg gattgtatat gaaattctaa aatgcattcc 
3350
actcgacttt atattttcga tcttgtataa aattgctctg gtttttgatg 
3400
gatttatgaa taccagtaga ccgcgatcac atctcaattt acttaatttt 
3450
tttactgtag aaataataac atttaaactc ttagtgtttt aattagaaac 
3500
tgaaaatact gaaaaaatga tttttgggtg atattttttg aataccagaa 
3550
aattttaggg taaaacccgt aatcttccat gcacaaaact acaacatgta 
3600
atattacttt cgttctgtgc atcactcaaa ttagcgacct ctaaactttg 
3650
cctagagttt ttttaccaca tatccaaaaa gacattgtag ttttgaagct 
3700
gaatttgaat cttccaacat gtaatataca tattaaaaaa aaaaaaaaac 
3750
agcttcagcc agaaaaaagg tcacattttt tcatttttgg aggtggtctc 
3800
tccttttagc ctccgaacgt atacctcact cgctacagtt gcgcgtagac 
3850
gaataataaa tagaaaccat atccactgaa aaataaagaa caaacagtga 
3900
cgtaaaagct agaattcaat gtaatgcacc gcacgaaacc tctcacttat 
3950
ccaccgttag atcttagtca aaagtcaaca aaacacaaat ccaacgattc 
4000
tgtttttgta tccgtgtaaa ttaatcacac ggtagttttt gatgaaaaga 
4050
caacaatcgg agaacaatct ggtctgctgc taaaatttaa taaattgttt 
4100
tgtctaattg tctccaccca taaaaaagcg cgaattcaat tcaccgacta 
4150
aagacattct ccggtggaga ccccgATGCA ATCCACTCAT ATAAGCGGCG 
4200
GAAGTAGCGG TGGTGGTGGT GGAGGAGGAG GAGAGGTGAG TCGAAGTGGA 
4250
TTATCTCGGA TCCGTTCAGC TCCAGCTACT TGGATTGAAA CCCTACTCGA 
4300
AGAAGATGAA GAAGAAGGTT TAAAACCTAA CCTTTGTTTA ACAGAGCTGC 
4350
TTACTGGTAA TAATAACTCT GGAGGAGTGA TAACGAGTCG TGACGACTCG 
4400
TTCGAGTTCC TGAGTTCTGT TGAGCAAGGA TTGTATAATC ATCATCAAGG 
4450
TGGTGGCTTT CACCGTCAGA ATAGTTCTCC GGCTGATTTT CTTAGTGGGT 
4500
CTGGTTCTGG GACTGATGGG TATTTCTCTA ATTTTGGTAT TCCGGCGAAT 
4550
TATGACTATT TGTCGACCAA CGTTGATATT TCTCCGACTA AACGGTCTAG 
4600
AGATATGGAA ACACAGTTTT CTTCTCAGCT Ggtaagactc tgtttccatt 
4650
aaattcagat aaaaatgcga actttaatgg aaagataaac ttttttttgt 
4700
tgcttacttt aatgtcaagt tgtgtgaatt tgtggtcaaa atggtgaggt 
4750
taggttctat tttggggatt gatacggttt tagtttaatt gggtgtttga 
4800
attcttcagt tgtggagaca ataaagatgt aaaagagttg tcttgtctaa 
4850
tttgacaact tgcatttgtt tgaaacaaat tcccctgcaa gttgcagttg 
4900
ttttttcttt gtttccctgt ggctgtgaaa gtgaatgttg cataaagttt 
4950
gtattagtag atgggcaaac aaaaagagcc ttcattggtt agatatgtat 
5000
cgatcttgta actttagaag tttctgaatc atgacttttg tgaaatgaaa 
5050
catgttttca tgtgtgcata tggtttgtga gttaactaat aactcttccc 
5100
ttttggtttg tgagtagAAA GAAGAGCAAA TGAGTGGTGG GATATCAGGA 
5150
ATGATGGATA TGAACATGGA CAAGATTTTT GAGGATTCAG TTCCTTGTAG 
5200
GGTTCGTGCT AAACGTGGTT GTGCTACTCA TCCTCGTAGC ATTGCTGAAC 
5250
GGgtaattac ttaaaagttt gtgctagatg ctttgcagta ctaattctgt 
5300
ttctgcctca ttcttgtttt gtcattaagc ttttctctgt tcattttgtt 
5350
agGTGAGAAG AACGCGAATA AGTGATCGGA TTAGGAGGCT GCAAGAGCTT 
5400
GTTCCTAACA TGGATAAGgt aaattctttt tacaaggcag attggtttta 
5450
agttttcttt gaagttttta aaaagaatta ccaaatgggt ccaagattag 
5500
atatgcttaa agcttaaggt tagagcatta ttgtgaaggc attattggtt 
5550
cttaaggtag gagctagtgc ttagccgtaa agtaaaggaa tttggatgtt 
5600
aactgttgat gattgtgaag gcattattgg aacttcaaaa ctacttactc 
5650
cttaatccat aaactatggt tgtgcagtct tttagaagat tcaatgcatg 
5700
atagtccggg agagttataa cgcgaagatt cgtttttttt tgtattttct 
5750
ttgttgcagC AAACCAACAC TGCAGACATG TTGGAAGAAG CTGTGGAGTA 
5800
TGTGAAGGCT CTTCAAAGCC AGATCCAGgt ttatctacag atactaattg 
5850
attagaaaca caaatttatg tttaataaaa tatgttagga ttttggattt 
5900
ttttgatcat tttatttggt tttgatgatg gattcagGAA TTGACAGAGC 
5950
AGCAGAAGAG ATGCAAATGC AAACCTAAAG AAGAACAATA Atgtatcctt 
6000
taggatttga tatatctgta ttttattttt gtactatcta aaaatggtga 
6050
tgatctgttc gaaaattcga aacatgatct tatatattga actagaaaaa 
6100
atagatatat atgaatttta gctgtaaaat ttttgtacaa taaggagaaa 
6150
aagatttaga agagtcaata aaaagatgat gtttacaagt cgagaatata 
6200
tattttgtta gttttgttta tcaatttatg ctcaaggttt cagctttata 
6250
acattattaa gtaaagctta tttagttttt gtgagaagtg acaaaaaaag 
6300
gtccattgaa agcaaattta tgaacgaata aaagaatatt cggagaaact 
6350
tagctaaact tgtgacaatt ggccaccatt cccacaattg tcacacagac 
6400
acaaactcac actagtagta gtcgtagcca tgtgcattaa gcagtacaca 
6450
gtttttctta gaaaaatgtt taatctaaag aaagcaatat cttattgtca 
6500
acgatagttg aaaacgaaat taaaattgat tgggtggttc tgcgacatgc 
6550
actatatttt tcaagttaat gtttttgata ctacaggtta ttttgtatca 
6600
gatgattatt gaagtaacta tacattaata ttactaatgc aaattagtaa 
6650
ttgattgttt taatataatt ttaggcttaa taattattga agtaactata 
6700
caataatact actaatgcca aaatattaca attgtttatt tttttgttat 
6750
ttttaataaa ttttctttaa tttataattt tttttatcat ttactttatt 
6800
taaatttttg ttacactttg cgccgttctc tgatagccgc atcctcccag 
6850
gcactattcc cgagatatct tgatttgcgc cgttctctga tgtcagtggt 
6900
gctatggatc gccgcgttgg atattctact atcgtttttg ttgtatctct 
6950
tctctttatg cgtgctcaat tcttgttcaa agtcaaacca catgagttga 
7000
tccaaaactt gctcatatct gataatgtag actcgctgga gttgattccg 
7050
actccccctt gttttccttg tggcaactct cttcatggtg cctaagcaaa 
7100
gatccagtct tcaactctgt atctttcctc ctttcaactg gttacccctc 
7150
aaattctact catgttacat cccattctta gttcttgact tccccgataa 
7200
agcttcctcc tcgtttggtg gtgatgttgt tcccctacca ttttttttaa 
7250
aggttccagc gatatttagt ctcctctttg ctacttattt ttgcgacggt 
7300
gatacctcat gtagtattgg tgcctagctt tgggccttgc aacgtttggg 
7350
ccaattgttg gcttcttggc tattgggttt ttttttagtg gaaaaggtca 
7400
tctctcccca ttctatttgt cttagccctt taagaaattg tctttccctc 
7450
ttttgtcctc aactcgctat cctctgattc tccaattgtc gattcaccgg 
7500
atacttctca gatttctttc atcgacacat ctgatatttc tctacttccc 
7550
ctgtccacgt ctatggcagg tcATGTCTAG TCTCGAACCA TCATTGTTAG 
7600
ATCGATTCCC TCCTATTTGT GGCAAAGATT ATGCACTAGA TACTTTTCTG 
7650
TCTGCTGTTA AGGCGAAAGC TTGTTGCTTC CAGACT
7700