fioreDB : Database for Flower Bio-engineering by CRES-T system
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Locus Common name Short description
AT2G02540 ATHB21, ZFHD4, ZHD3 ZINC FINGER HOMEODOMAIN 3, ZINC FINGER HOMEODOMAIN 4, homeobox protein 21 (.1)

>AT2G02540.1 genomic map

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Uncut enzymes: ApaI, AscI, HpaI, NheI, NotI, PstI, PvuII, SacI, SmaI, XbaI, XhoI
Name Recognition sequence Cut positions
BamHI G|GATCC 5210
BglII A|GATCT 3396
EcoRI G|AATTC 585, 5959
EcoRV GAT|ATC 143, 618, 1798, 3346, 5877, 6494
HindIII A|AGCTT 5257
KpnI GGTAC|C 5727
NcoI C|CATGG 177, 4944
NdeI CA|TATG 225, 6820
PacI TTAAT|TAA 2950, 3846, 5633
SalI G|TCGAC 5528
SpeI A|CTAGT 4555, 4694, 4795, 6015, 6333
StyI C|C[AT][AT]GG 177, 4633, 4944


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>AT2G02540 genomic sequence (4655-5587,) length:7162
caatagcaat agtggttact ctgctcctag catctcacct tgcccatgct 
50
agaaccgagc cttttcttct ttcaccaaat tcaaaattcc aagccaattc 
100
aaaaccaatt catcgattac tagcttctct aaccgacgcg aagatatccg 
150
tgaaccaaat tcaaactcct tgttttccat ggtacaagca ttgccctcca 
200
gtcctatccc catccccata aacgcatatg ttttctgttt aaaatagtat 
250
tcaatgtttc aataaaaaaa atataataca tgacaaaagc taattttgtt 
300
gtgtaattgt gtatttacgc tatgttataa taattttcgt tttcacattt 
350
aactctggtt tcacaagata tatcatttta tattgtcaat gcgaaacaca 
400
acttatttca acccaaacaa atatgcgctt ttatatacca attggtgtat 
450
tatacataaa ctattcgagt gtaactaaaa cctatcttga ctcaaaagac 
500
ttgagtcaac atattagtat gtgttaattc agaaaccacg tatagtacta 
550
taataaagtg acattatttt acttagccaa tattgaattc ttaaaacgat 
600
gtcgatgtta tgaagtcgat atcgtttcag tataacaacg acgttttact 
650
gaaatacgac acgaccgagg tagcattagc aactaccaac atgtttactc 
700
acaccgtttg gaataatgta ggtttcggct acattctaat attttatgta 
750
gtttagtttt aggaaaaatt gtttatgttt ggaataatat gagtcgtttt 
800
tcactgtcag tgcaaccaaa gtttatgttt tgttttgtaa aaaaagaaga 
850
aaaaaaaaag tttatatttt gtttgatatt ttacttctat aataattaga 
900
gagataaaat aaagtacttt attaataaga gaaatggtat aaattttaat 
950
agttttcgta gtatgtatta gtttttttaa aaaagatata taaaataaaa 
1000
cgtaaagact atatataaat ttatttttct tgattaaagt gtttaatatt 
1050
ttagttttta ctttgaccat gatggaaaac atcattgtct acaaatatcg 
1100
taagcctcaa aatccaaacc aatattaatt caaaatattt tatttaaaaa 
1150
aaaaaatacc atattcagtt tataagaaaa atggttatga ttagctagaa 
1200
cttcaaaaga atcaaacatc catcccaaac caatcgaaat cccaaagagc 
1250
aaaaccattt ttcatcctac actcatcaac aatgatacgt acgtaattat 
1300
gcgatatata attagaactt ttcataagga taatatacta tctatttatt 
1350
tatttcgatt gaaatatatg aacttcttac atgccgaaac agaaattaaa 
1400
tttgatccat gtaaaaaacg gataatatta tagggagagt tgtaccataa 
1450
aatcttgttc gtgaaaactg tttatctcaa tcacgtaagc ggcatataat 
1500
taaatatcgt agattatatt ttcaaaaaat tatataacta acgacacagg 
1550
aaaaaatata tattaaataa tttaccattt tcattaatta tgttttttct 
1600
taataattga ataatttgaa aaatattctt gtggtccctt ttattttatt 
1650
tgtttcttat acctcgaata caagtcgctt ttttttttac atcacctcga 
1700
ataaaagtca cttgacgtgt gaataaatac atagtatgga cgacgggaaa 
1750
ttaaattaaa ttatatggag tatgcattta tttgccatta ttctgatgat 
1800
atcgtaaacc gtaaggtaca aagaaaataa aagagttgtt tttgaaaaag 
1850
ctgctacaat ggaaggaatt ttaccagagt ccagaagaat agacaacaca 
1900
tagaaacaag aagaaaacaa aagaaaaaga taaaagtatc tcaatttttg 
1950
ttttttttgt attataaaat aaaagcccac aaggtcacaa ggaaattata 
2000
aactaagaaa gtgaactgct cttatttctt aattgtgttt tgtgtaatta 
2050
agacttgaat ggtcattagc aattgccgca atttggtagt tagtgcttct 
2100
tttacgaatc aataaaaatg agattagtcc ccactcacct agaggaacaa 
2150
ccgccaccgt agttgagaca acaacttgtc gtgtttgtta gaacttttct 
2200
aaaacgaatt aagtttgtcg attagaacaa ttatacctaa aaggtcaaaa 
2250
catgaaaatg aaacatattt tttgaccgtc aaaaagaaaa atatatctta 
2300
aaacattagt catcaagaag cagaaataat aatcttaagc aagaaagtaa 
2350
tagttttcag gtaaaatctt aatatgtatt ggtgatttga tgttttcatt 
2400
tgtttgattt taaagaaata taaaaatagg gattagtgat aattaagtcg 
2450
aaaatgtaaa gcaataaaaa aaatctattt accaagactt actatatata 
2500
cttttaggcc aaaatttaca attctgccac ccaagagcaa ttgttcatat 
2550
atcatctata acatagagtc taattttaca acactgatag cccgcaatat 
2600
aaaccaaaaa ctttatatta tcaaaactta ataataatcg agattttggt 
2650
cttaacaaaa ctcgtaacaa actttggttt atgaatatat ttcagtaact 
2700
atattatcag ttgattatga tatttttatt ttattgttta tcttttgatt 
2750
ctttctcaca attgtatgtt ccagaaaacg gatgatcatg gtatataagt 
2800
gcacatattt ggtaggacca ataattaata gtaacttcaa gtaaatcata 
2850
taaattcaca agcatgacat gacaacctct tgaagctaat atcatacgtg 
2900
acataattaa tggcgaaggc cgaagggtaa aggaacaata tgtgttttta 
2950
attaactagc ttaacaagtt aaggctttat agtaatgttt agaacattct 
3000
ttcgttttga attagtatca atctcacact tttaaatttt aagatggtaa 
3050
aaaatattat tattatacct tactaccaaa tttttagtta tttaatgttt 
3100
tggaacaaag atgagatatt gttatttatt atgactttct ctttgttatc 
3150
tacttcaata ctcttcccac taattatctg acacgtttct acactgttgt 
3200
aaatttgatg tctgatagtg caagacaagc aatctcccat aatcctaatt 
3250
cttggctctc ttcttttttt tctttccctt tactgataat ttgttttggg 
3300
tgaatatgaa aatcttagag catccacatt actcatacct ttgtagatat 
3350
ctcaaaaata aattaaaatt aaattaaaga cagcttctat tttagagatc 
3400
taaaatgtct ttctaaagac actattacac aattaaaaac attaaattat 
3450
ctttttctat tatttttaat ttaaagacac cctcaaagta tcaccaatga 
3500
agaatgagga tggtcttata ttcaatataa ccttcaattc atcaatgact 
3550
gcgatatatc aatattataa aatgacattt catgagtaaa aatgtatata 
3600
aaaatgaata actacttatc ttataaagtc taatttagtg attgttgttg 
3650
tttcttcaaa ttttaaatta aatgatgtag ctttttttgt ttcaaataat 
3700
ttagctacac tttttctttt ccatattttg atcacaattg tattgttttt 
3750
gtctatatat tatcacccaa attttaattt ggtagagaca ttattgaata 
3800
aaatatccta tatatgaatt aataaaatga aaactaggtg taattaatta 
3850
atgatctttt ttctctttgt ctgtagaaaa gtgaggaaat aattagctat 
3900
ggctatggct ctcatgtgtc tttctcatgc tttattggct ttcactacta 
3950
atactctaag cccttagttt aagaagtgcc ttcacatcca aaacccacct 
4000
gcaattctct ctttctctct ctctctctct ctctctttat cttctttctt 
4050
caaagtctat cactttataa aaccctaatt aaatctctaa actccttagc 
4100
ctctctctat tctcagaacc ttgtggttat tctcaagaaa ggtttcattt 
4150
tgagataaag tttgctgctc tttctggttg tgggtatgtg ctcttaactt 
4200
cttcagtcaa ttttttcatt tggtttaaat agaacaattt tgttttggtg 
4250
atacaataaa gattgtcttc ttgattatca tcaacctctc acttggaata 
4300
agacctttct ttctcaagtg ggtttgtcag cttttgctta agcaggcttg 
4350
caataagttt ttcttttctt ttgtactttt tcgttttgtt ctctatcttt 
4400
atggaccttc taaaattagg gtttttcttt ttgtttggag gaaataatta 
4450
aaaaaatggg gttaatgagt agtgaagaaa gctcttgcct ttttgtagct 
4500
taatcatttg aattttactc attaattatc tttactcttg tttttttctt 
4550
cctaactagt ttctttgtcc ccaaaccaag aaacactttg caaaacccaa 
4600
aaaaagtttt aaatataaaa tcgtgtttat ttccttggca gatagatcaa 
4650
aagaATGGAG ATTGCAAGTC AAGAAGATCC TATTCCAATA AACACTAGTT 
4700
ATGGTAATAG TGGAGGTGGG CATGGGAACA TGAACCATCA TCATCATGCC 
4750
AATTCTGCAC CATCATCTCT CAACATTACT ACTTCAAACC CACTACTAGT 
4800
CTCCTCAAAT AGTAATGGTC TTGGTAAAAA TCATGATCAT TCTCATCATC 
4850
ATCATGTGGG TTACAACATC ATGGTTACCA ACATCAAGAA AGAGAAGCCT 
4900
GTGGTGATAA AGTACAAGGA ATGCCTAAAG AACCATGCAG CTACCATGGG 
4950
AGGCAATGCC ATTGATGGTT GTGGAGAGTT TATGCCAAGT GGTGAAGAAG 
5000
GTTCCATTGA AGCTCTCACT TGCTCAGTTT GCAACTGCCA TAGAAACTTT 
5050
CATAGAAGAG AAACCGAAGG TGAAGAGAAA ACATTCTTTT CCCCTTACCT 
5100
CAACCACCAC CAACCACCTC CGCAGCAGAG AAAACTCATG TTCCACCACA 
5150
AGATGATCAA ATCACCATTA CCACAACAAA TGATAATGCC TATTGGCGTT 
5200
ACAACCGCTG GATCCAACTC AGAGTCAGAG GATCTTATGG AGGAAGAAGG 
5250
CGGAGGAAGC TTGACATTCC GGCAGCCACC ACCACCACCA TCACCGTATA 
5300
GTTACGGACA TAATCAGAAG AAAAGGTTTA GGACAAAGTT TACACAAGAG 
5350
CAAAAGGAGA AGATGATTAG TTTTGCGGAA AGAGTTGGTT GGAAGATTCA 
5400
GAGACAAGAG GAATCTGTTG TTCAACAGCT TTGTCAAGAG ATTGGAATTA 
5450
GGAGAAGAGT TCTTAAAGTT TGGATGCACA ACAACAAACA AAATCTCTCC 
5500
AAGAAGAGCA ACAACGTTAG TAACAATGTC GACCTTTCTG CTGGTAATAA 
5550
CGACATTACT GAAAATCTTG CTTCTACTAA TCCTTAGtta agttcagatt 
5600
gttgttatat aacttcactc atgtgattac ttaattaatt aagtactttc 
5650
ttatcgtatg gttaatgttt tctcctttct cggctaatca ttgtttaggt 
5700
agctttataa acatgtgttt tattagggta cctataatct tggttttgga 
5750
gcgtgtaaga taagtttttg atgttttctt ataatgtatg tttaagaaaa 
5800
ttcttggcga tttaaccaat gcattgggat gtgcactgtt attatttact 
5850
tcgaatcatt agactttgta gttcgtgata tcatttgtca cgtttactat 
5900
ttatgtgagt agcagaattt tagattctca taggtaactc tttttgtttt 
5950
tgttttttga attctgatat ttattaaagg aagtgtatca tacaaagtcc 
6000
ataacaaaat taatactagt tacctaaatc ttacgccggt cttgttttga 
6050
tttgtcttgt ttcttttttg tcgttgtttt gatttaacaa aatatttttt 
6100
tttgatttgt cttgtttttt aaacatccgg tcttgctttg attctattat 
6150
tttgttttct agtttgaaaa aatattttca ttctcatgat cgaaaaataa 
6200
attgcacgga aaacaaagag agcaataaat tacgatttct atcaatggag 
6250
agagttggag attgtcctgg cgagtgtaag tcaagtccta atatgtatga 
6300
cgtattaggt tgagtaaatg tttggttggt gtactagtaa actcatttat 
6350
ggaccttttc ttttatttga acaattatgt gcatttactt tatgtgactt 
6400
cttggcatat tgcaagtcgt gtaatgtgat atgggataaa atatgtcatg 
6450
catcaaaatg gagttacgat tttaagatgt tgttgttcct tgtgatatca 
6500
catgtttcat ttattgtaat attaaatgta acattttcac ttgttgtttt 
6550
atagtagtat aattttttat gcctatagtt tatcactcga tttcagtaaa 
6600
acatcaataa tgaattgcgt attgcgtatt tcgtggaaga taaaaattca 
6650
attaactgac atagtttatt gattgccatt actattattt tgttattgaa 
6700
acgtcatttt attcaaatat atttttatct ccttcaagat tgacatagca 
6750
ttatagcact ataacaatat aaaatatata tatatatata tatatatata 
6800
taaattatcc aactctttac atatgatcga tacatcatca ctttaacatt 
6850
tatcatgtgt ctattaaata attaatgtaa acttttcaat ttttaattta 
6900
taagttaatg ataaatttat tatttaattt tatatatgat tttattttac 
6950
atatttactg tactattact aaatttattt aaatattaca tgatttttca 
7000
ataaattttt caataaattt atttaaatat tttattttaa tagttttttc 
7050
atactcgaag atttttttgt aatccaaact caaagtatga gtgtataata 
7100
gtcgtgaatt agttaatgat ttgagtagtt tattttttaa attgatattt 
7150
atataataaa tc
7200