fioreDB : Database for Flower Bio-engineering by CRES-T system
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Locus Common name Short description
AT2G26580 YAB5 YABBY5, plant-specific transcription factor YABBY family protein (.1.2)

>AT2G26580.2 genomic map

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Uncut enzymes: ApaI, AscI, EcoRI, NcoI, NheI, NotI, SacI, SalI, SmaI
Name Recognition sequence Cut positions
BamHI G|GATCC 6000
BglII A|GATCT 4390, 7582, 7707
EcoRV GAT|ATC 5583
HindIII A|AGCTT 2344, 5094, 6453, 7292, 7741, 7761, 8409
HpaI GTT|AAC 644, 783, 3756
KpnI GGTAC|C 2967, 6824
NdeI CA|TATG 23, 1647, 2902, 6535
PacI TTAAT|TAA 5167, 8382
PstI CTGCA|G 5588
PvuII CAG|CTG 2565, 5287, 5572
SpeI A|CTAGT 3190
StyI C|C[AT][AT]GG 176
XbaI T|CTAGA 1990, 2757
XhoI C|TCGAG 7145


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>AT2G26580 genomic sequence (4215-4286,5205-5324,5973-6081,6173-6221,6328-6403,6963-7031,) length:8863
gagaaaaact tttcataatt ttcatatgct ttgttttttt cttcataatt 
50
ttcatatccg tgtaacataa agtcaatgtc aatattcact tacaagttca 
100
caaccatacg aaggttatca ctgatcagtt atcaccaaat tatttctcaa 
150
atgttccacc acaaatattg caacgcctag gtcattttct agtaaagcgt 
200
aatcaaagaa aatgatgtct ttctatttaa taaacatgtt gcgatgcttg 
250
ttaagtctca tgatttttcc atttaccagt actatcaatg caaatttgtt 
300
tgcaaacaaa cgaacaaggc taaaccaaaa agaaaacaag gataggaaaa 
350
agaggcaaaa attaaagatg gatttgtaag atttcaataa atacagattt 
400
caataaatat cgtagttttt ctttttgtaa aatatcattt tttcttttaa 
450
tcttgtagaa caaaaataat tttggaatac aatgtataat cattttgact 
500
ctttatgtgt cttctcacca tatttttttg tatgtttggg ttgtacttgg 
550
tttacgcgtt tgcgaatata ttctatttgc tttctagttc tagtaaaatc 
600
gaaatctgga tgtagttcgg gagggtaaga aaaactgaat tttgttaaca 
650
aattttttgt ctcatttatt ttctacactt tatcattgtt tcatccacat 
700
ttacaaagaa aactatctgt tgtattatag ttatatgaca aaaataaatt 
750
ttgttcaaat tattatttga taaatcaaaa atgttaacat aacaagtatg 
800
ttactgggaa aaaatcacgt ttctcgacta aattgaatgg tagaaataaa 
850
atcattcaaa ataataaaat ttactatcat tcattgggat cataaatagc 
900
tttgctgttt tcataaatac catttcattg ctatgaaata caatgttttc 
950
cactttataa acttgttgcg atgcctattc tagtgatttt ctgatttttt 
1000
tctcatttgc aatgttgtga gcaaaaaagc gaacaaggct aaaccgaaaa 
1050
gaaaacaagg aaagattaaa gatggatttg taaaacttaa gggaaacttc 
1100
ctctagtgca cattctcttg tttaagacat cactcaggtt tacatcattt 
1150
tcaaggtttc ctcaaataat ttggcgacga gtttaaatat ataaaaaatg 
1200
atgtgaaaat tgaaaaatag gaaatcgccc cctaagtgcg gtggtggaag 
1250
gaggggagaa tgtggggttg caagaagcca taaatgtgat gatacatcga 
1300
tttcatgata actccttgta acacatcaca tgagctattc aacttcgctc 
1350
gactccaaac caatcttcaa ttaatcttca ggtttttcat aataataaag 
1400
ttaaaaatat ttgattgttt ccttcttaat aaagaaccag cctcaaaaaa 
1450
aaaaaaaaaa aaaattagtt agtgcacctg aataatttgg gatcttaatt 
1500
ctttttcact ggaataattg atgaattaat ttagtttttt ataactttaa 
1550
tgaatctctc tctatatgtc ttatagttca agttattgat tttatggtaa 
1600
gacaacaatt aagagaatag atcaatattt caattatata tgtcaacata 
1650
tgaatggatt atgttttttt aacactctat ttgaatgttg aaaaggcgat 
1700
caagggaaat taggttacta ctgtgatgta tgtcaaggtt gtagtagaaa 
1750
ttagacagac aatagtaaca agtaaaaact agctacagta aaacctctat 
1800
aaattaataa tgttaggact acgaaatttt attaatttgg agaggtatta 
1850
atttatcgat aaattaataa atattaattt atagagagat tttcctaatt 
1900
tggtaacttt taaaaaaatt ctataagatt tttttcatta tagaaaatat 
1950
tttcctagaa ccagttacaa gtaaaatata ataataatgt ctagaaaaca 
2000
ataccaaaaa atttgatcca ataaaatatg aaaactatag tcaaacaaag 
2050
aacaaatatg aatttaagca aaaatatatt ataaatatat tttaaagaat 
2100
ttttttactt ataatatata tatatatata gttgatatat ttatacaatt 
2150
attaatttat gatattgata ggaacatata tttacataga attttcaaaa 
2200
caattattat cttattaatt tatcgatttg tgtcactttt tacactggtc 
2250
ccaactcagg accggaaaat tttattaatt tacagaggtt attaatttat 
2300
agagtattaa tttatagagg ttacactgta tatgtgtagt tagaagcttt 
2350
ttagtcatca catgatttaa atttatttct aagatgaaat agacaatctt 
2400
taatttatat atataaatat tatttgggtt actcgtataa aggtctacca 
2450
cttttcagat gtttagaact ctctcttcct ttctctatct aacaaaccct 
2500
aatgtccatc caatcagtta tccaaactaa aagaagtgga ctctaacaaa 
2550
ccctaatgtc taatcagctg tccaaaatag catttggctc atccctaact 
2600
aaacctgaaa tatatcaaaa agttaattac caatgaaagc atataaaaaa 
2650
catttggcca cttgctttca tgctggtccc agcttttgca cccttccgta 
2700
gccacactac tcttctcctt tttttttcct ctttccccat ttctatgaaa 
2750
tagttgtcta gattttacga gtctgcacat cctcatatat ttttttattg 
2800
atttggtgat ccaattttta atatgaaaga atgaaaaaaa tattggggtc 
2850
tttttaaaaa tgtaagtctt aaaaaaaaaa atattagaga gaaccatata 
2900
tcatatgaaa atgttgattt cagtttatca attaggatga taaaactatt 
2950
tagtgtatta ttaaatggta ccttcgaaaa tttacataat tttttcttaa 
3000
tttgtgtgaa ttttgtttat aattaatgat actcttagga aaagtgaaag 
3050
agagtgagta gctttttatt tatttctgat ttgcatttat attcaagatt 
3100
tagaaatgaa taatacaggt aaaattttca tctattgcta accataaatg 
3150
ccaagtttta aacaatcaac ctttttataa ttcagcagta ctagtctact 
3200
aaacaatcat acattcgaca aaagaaaaaa ttcaacccta aatttgattg 
3250
aagtatccca cgaataatgt cgaagaggaa atgttctcat ctaccttttt 
3300
tgttgctgtt gttgtcatca acgttctcat ataccaatct ttctttatac 
3350
catcgatatt atagtatctc aatttagtgt tcttggaagg aaggccgaca 
3400
tacaatattc tcgcgcatac aaatattctt ccattactac atacaacatc 
3450
ttgcatatag ccgactcccc ctggattggt tgtataacat tatgattcaa 
3500
aatattgttt aggcaatcat cacttttaaa aagaattata tatcgaactt 
3550
aaattttgta aattgcttta acataaatat atatatatat atatatatat 
3600
attttttttt tttcttagta attttatttt caccataata gatataaacg 
3650
atgtatagta aatcattgac gaaaatattt tttctacaat tttttatcta 
3700
ttccataaca tttagtttcg tctcttttaa ataaaatata tcgtttttta 
3750
ttgccgttaa ctaatgttat aacaaaactg gtacattact acatttttaa 
3800
aaaaattact taactactat gtccatctca gtatttcgat aagaattttt 
3850
ttttttctta tggtacgcaa ccccatgagt gaagggaccc tactcgttaa 
3900
aagacataga acatatagcc tacatggaaa ttcccaaatc cttcacattg 
3950
catataataa ttttgcccct ttaactctca tcctctcctt aggcttatgt 
4000
attatcttcc catttattca attaccttta tgatcacttg gaatagttgt 
4050
tgaagtacaa tacccgtttt taaggcaagt gtctgttcgg gttgatatat 
4100
atatatatag agagagagag agagactata tcttttcacc tatataattg 
4150
ctctcttctt ctatctaaat cttcaacaca aacatcttgt ttggtcctat 
4200
ttctcagatc gatcATGGCT AACTCTGTGA TGGCAACCGA ACAGCTCTGC 
4250
TACATCCCTT GCAACTTTTG CAACATAATT CTTGCGgtat aattgctata 
4300
catatatatc tattatatct gctgttatat tatatataat ggatctatgc 
4350
ttctccaaat atcgtatata taaagatata atcaagcata gatctacctt 
4400
taatttcctt tgtactatat attggtttct gataaagagt ggtgaagctc 
4450
ttttcatcag ttccactatc ttacaaatgt tcaaagttct tattcattta 
4500
aatctgtttt aatttatttt tgtcagtgac aaatatttca tttagcttat 
4550
ggtgccagag agaagtcacc atccttctgc tatacatgac ttttttcagc 
4600
atcatataga tttattttct gctcttttcc tactttcctc aaaggaaaat 
4650
cctattacga gcattttact taccatttta agttatgact cataagataa 
4700
cctattttaa aatggccatg catatatttg tgttcctttt cttttttttt 
4750
ttgtcaaaaa tatgtgtgtt cctattcact aatctataac aaattgcgca 
4800
tattgaaaat ggagtcactt ccggatctta aatggtggct acagcaaaac 
4850
ttcaaaagag aagataatca tctctcaagc aactactttt gtttaatgtc 
4900
ataagattag attgcattat ttctattttg ccttctaaac ccataaagaa 
4950
cttaacatgt tacccaaaaa aaaaaaaaaa cccataaatg ataggaatat 
5000
ctgatctata ttaacaagac aagcaacaac tttttctccc ttgtctaatg 
5050
ataattatct tataacaaat tttagtagca taaattttag tataagcttt 
5100
tcgtcgatct atgtcttatg gatcatctag taaacagatc caattttcca 
5150
agaaagaaga tcaattaatt aatatttgag gttgtgtttg gctaaaacgt 
5200
gtagGTGAAT GTCCCATGCA GCAGCCTGTT CGACATCGTG ACCGTCCGAT 
5250
GCGGTCACTG CACCAATCTG TGGTCTGTAA ACATGGCAGC TGCTCTTCAG 
5300
TCGCTTTCAC GCCCTAATTT CCAGgtaaca tctctctcct caattgtgaa 
5350
gggtttattg taaatttaaa aaaaaaaaaa aaaaaacttg aaccaaccct 
5400
ctgaaattta gggctctttt gtttgttttg aaaaacgaat gatagacaga 
5450
aatctgagcc tctagttgca tgtttctgtc tccagccgcc gtctacatct 
5500
acatagcccc aaagaattta atattactta aatattttac tcttttcaag 
5550
tcatgtttaa gtttattttt ccagctgtta ctgatatctg cagccttttc 
5600
gtaattgctt tttcttcata gagccctagc ttttgtttga tctattactg 
5650
ctgtcggtta cttactctat gatttgattg acatgaatgt tagggtttct 
5700
ggtttcatag gtttgttttg ttttctataa aatatatata tcagattcct 
5750
ttctttaaag gttttgtctt ttagacttta actactctta aatatgaatg 
5800
aaatatcttt tagttggtcc actttctttt ttctcttttc atttccgaaa 
5850
ctagacaata catacatgat tgctactcaa tcctattgat tcaccatttt 
5900
tggtctgaaa aatcaaagaa aaggccaagt gattaaatac tctaaacttc 
5950
ttagcattta tacttttatc agGCAACAAA CTATGCAGTA CCAGAGTATG 
6000
GATCCTCCTC AAGAAGCCAC ACAAAAATCC CTTCAAGAAT TTCAACTCGT 
6050
ACCATAACTG AGCAACGGAT TGTAAACCGT Cgtaagtatt gcttactata 
6100
taaacctaaa gaagtaaaca tgaaaagtaa tttgtgtact gtatatgcta 
6150
aaattattat attgtctttc agCTCCGGAG AAGCGGCAGC GAGTACCTTC 
6200
TGCGTACAAT CAATTCATAA Agtaacaaaa acattttaga catacatata 
6250
tctatatatc tatataatgt tcaaatctgt taagaaagag gttattgatt 
6300
tgtgtgttta tattaaaacc tttgaagAGA GGAAATTCAG AGGATTAAGG 
6350
CGAATAATCC AGACATAAGC CACAGAGAAG CATTCAGCAC TGCTGCCAAG 
6400
AATgtaagtt tttatttctt ttatatgttc aaacagtttt ataaagtact 
6450
ataagctttt tttagccaaa agaaatatct taagttttag taaccaataa 
6500
agaattattg cggcctcctt atttaattat agtacatatg tcatagtaga 
6550
tgtttttttt attattatta ttttttattt ttttatagtt ttttacaaat 
6600
tcgacttgga gaccttatga tttggaagat actccattta attttatgag 
6650
ttgtgtttga aaacatattt taagactaaa cacgtagaga acattcttaa 
6700
caaatttgta aataaataaa tttaactcta ttctctagga tttaaatatt 
6750
ataggtatat atataatttt ctaataagtt tatatcgagt cactcatacg 
6800
agttgtgtag aaagttaatc acgggtacca attttaaatt aaaaataaga 
6850
ataattatat gatcttaaat ttatacaact ctgataaaag attgggcttt 
6900
gacatctttg aagaaaacta gatttagtaa tattctgatt aaattgggtt 
6950
cacactttgt agTGGGCACA CTTTCCTCAT ATTCACTTTG GTCTAATGCT 
7000
GGAGAGTAAC AAGCAAGCTA AGATAGCCTA Ataatgtaag tgctctgttc 
7050
tattcatcaa ttgttttaga gattcacctt agttataaat tttattttta 
7100
ttgtaaacta acataaattt tacttttatc tgtcttgttt tagtctcgag 
7150
attaatggta atataagtgt tggagacttc gaagtaacaa gagctgagaa 
7200
ggcaactata tgtattgtat gatctttgga accgtatgta tgtaagtgaa 
7250
gatgtctatc tttaaaacca tctatagtta taatttagta aaagcttctt 
7300
ttaatttatt tctatggccc ttgttgtatg gttcgtctca caagatttat 
7350
gagttctttc ggatatatga atctaaaata aaaaatatgt aatctatatt 
7400
atggtaaacc tatcttatac ttgaattata aatagtaaat attacaataa 
7450
gtattttttt tctttaacga tgtagcaaat tctctatgag ttagtggttt 
7500
tgtatcttgt aacacggaaa cattatttta gctttcggga tacggttgtg 
7550
gttctaattc ttatactgaa tcatacacac gagatctaat tacgatgtag 
7600
caaattccct atgagttagt ggttttgtat cttgtaacac ggaaatatta 
7650
ttttagcttt cgggatacgg ttgtggttct aattcttatt ctgaatcata 
7700
tacacgagat ctaattatat ttgactccaa aatactgacc aagcttcttt 
7750
ttgattttca aagctttgat ggtgtataag aagtccttat aaattttttc 
7800
tttcggatct tctaacaggg aaacaatact ttagtacttt agatttgaga 
7850
ttcggtttta gttctaattc ttatacttac ttatacacat gagttcactc 
7900
tcgaataaat gactctcatt tatcctaatt tgttagttat aacaattttc 
7950
attgattgat ttaattgata aataatattt ttggtgtttt tcctatttat 
8000
cattttgatg catttatcta actcttgagt aaatgattca ttctaatttt 
8050
aattacattg tctaaaacat atttaaattt acatacacta ataagaaatt 
8100
gttatcttta acgtattttt taataaataa aaaaaatagt gttaatttag 
8150
tataattaga tatttgcctt aaaataaacc gtaaactcaa ctaatataca 
8200
ttgttactaa ttctatatat attagtatat aaaaacatga aataaattct 
8250
tatattatat tatttaattt gtatacttta ataaaatcaa aaatttcatt 
8300
aaaattctaa tgattttatg tataagaata aatttatacg acttatacaa 
8350
ctaaatttaa ataagttaat ttaaataatt taattaataa gttaaattaa 
8400
aatatttaaa gcttaattat ataatcaaac tatattaaaa tatttttatt 
8450
tattttaata tagtgaatat atctatgaga gatttcgaag acacttgtca 
8500
ttcactatat taaaatactt gaaattattt gagtaaattg aaattagtga 
8550
atgacaaatg tcttcgaagt ctctcgtaga tatttcaact aagaacctca 
8600
tccaactctg tattgtgctc tttatgttcc ttttatgtat cttgtatatt 
8650
tgtatgacca atacacaagt atgtacaaaa tgaatgactt ttatggtttc 
8700
atttccccat cacgtttttt cttttgataa aaggaggact cgacttacac 
8750
agtgcaaaca aatagaaaag aaatgaaaaa accatttaca ccacaatact 
8800
tgttcaaatg gagttctttc tgaatacaaa gctccaatag atcaaaagag 
8850
aattaggcgt ttg
8900