fioreDB : Database for Flower Bio-engineering by CRES-T system
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Locus Common name Short description
AT3G28920 ATHB34, ZHD9 ZINC FINGER HOMEODOMAIN 9, homeobox protein 34 (.1)

>AT3G28920.1 genomic map

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Uncut enzymes: ApaI, AscI, HpaI, KpnI, NotI, PstI, PvuII, SacI, SalI, SmaI
Name Recognition sequence Cut positions
BamHI G|GATCC 4365
BglII A|GATCT 4819, 5832, 6856
EcoRI G|AATTC 4922
EcoRV GAT|ATC 3217
HindIII A|AGCTT 4239, 5284, 5290
NcoI C|CATGG 2613
NdeI CA|TATG 2849
NheI G|CTAGC 4711
PacI TTAAT|TAA 1629, 5364
SpeI A|CTAGT 1237, 1392, 6254
StyI C|C[AT][AT]GG 2606, 2613
XbaI T|CTAGA 1893
XhoI C|TCGAG 4867


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>AT3G28920 genomic sequence (4298-5236,) length:6887
tcttaatatt ttagttagtt atttttttaa aaatcaaatt tcaattatta 
50
ccattctatt ttgttataca cgtttttcct tcaattttct aaaaacttta 
100
tcaatctatt tcataataat tatacacact ccatcatatt aaagtaatct 
150
acactctatt tctatattta atttagtata ttttttaaaa ccaaatttta 
200
gtcttataca ttcaatttta caatactatt taactatcta ttttatcata 
250
ataaagtttg ttttgattct acgaatttta tcttaatgga taagtgctat 
300
gattttatca aaacaatacg tatatcatat caaatttata tcttagttaa 
350
tatttaaaaa tttaacatat aacaaaacat aattaacaac aaacattgtt 
400
taaattatag ttttttatat tacctaatct tgtaagttaa gtttacctca 
450
tttcagttta attttaaatg acttaagttt aataaataaa acagacaata 
500
tatactaaat aaaacagaca atataatttc tatatgccac ttttccaaat 
550
ttttggtggt tttacttatg attatataga ttaaaattct taaaataaaa 
600
cataaatata aatctaataa tattctcatc aggtattcaa aaattcagtt 
650
ttataaagtt attctctttc aaatattttg tgttttcatt taacggataa 
700
aaatattata taatgataaa tacaattttt atctaatttt aatacaattt 
750
ggaaagcatg cgtcaatcgt gagtcttcta gctttttgag gttatccaga 
800
caactaactc aaaatccatt cacaagaaag tcaaaggctg agagaaaaag 
850
agtagatcga cctccaacta tgcaaaatct tccatccaaa acattataca 
900
tttaataata acaaaaatct gaaatttaaa atatataaga atatgcaatc 
950
taatgttggt gttagtgaaa tcgttgtgtc attatccaac ttaaaactca 
1000
catactatat gtttttgacc aaaacaaaat taaaataaga catcgttaaa 
1050
agataaaata aaaatagtga aacttaagtt acaatgaatt gtgaaaatga 
1100
atatatatat atatatatat atatatatat atatatatat atatatatat 
1150
ataatcagga aataaaagat taggttggaa aaaaaaatta taatggaatc 
1200
aaattttgga agagactaag tggaaaaaat agtgaaacta gtttatgtat 
1250
atttctttat atttacacac taaataaatt gtatgaatct tagtgtacaa 
1300
aaaaatagtg aaaggtgact atttttaaaa taataaataa taaaatgatt 
1350
gttttttaaa ttatatttgg acaatgacta ttagtctagt cactagtcta 
1400
tttagtatat ttttcaacta attaaaaaaa aaaaatacgc aggtggtcct 
1450
cgtgtagaga gacaaaaatg gtatttatct ttttaagagt atattattaa 
1500
tggtttttta aaataatttt taaattaaga gacatgtctt ataatgtctt 
1550
ataatagctt ataactaaca aaaatctctt atttaaaaga ctttaaaaca 
1600
ctttagttag atataagaca tattttttaa ttaatagtta tgttaagata 
1650
ccatcaataa aaattgtcta agatggagta atatagtaat ttaatatagt 
1700
ccattgggcc actgaaactt gtccaaaatc gttttacagt atatcactaa 
1750
tttggttcgg gtcagctaaa aatatgttct taatctctcg cggtctaagt 
1800
taatagccac agttagaaac taatgcatta tagctaataa acgtacaaaa 
1850
aaaaaatatt gttttatctt cttctgataa tctgattcct gatctagaaa 
1900
aatgtggttc catcattctt tcgaccaaga aaatagaata attctttatc 
1950
atcaaacaaa aaaaacaata aagaaaactt agtccccaac ataatataca 
2000
tcttattctc ataatagaca tcattaacca taatttttat gcaccgaatc 
2050
tgtatatcta atccatgtac agaaatattt gtagtacgaa attcaaaata 
2100
cacatagatg cacataattt atttgtgaca aaaaacgaag aaggcaaaga 
2150
ttgttatatc ggacgtaata tgtggtttaa tatttcacgt accacttaac 
2200
tgatgtttga tggtggtgta cgaaccgatt gagagataat taaaaaaaaa 
2250
aatcgaagga tcatattttt cgtgtttggt taccgatcga taggttgaat 
2300
ttctcggtcc aatgatgcaa tcattcgttg gaaaataatt tgtgatttca 
2350
gaatccaaaa acatgcgtac aatacgacct tcttatttgc caattcattt 
2400
gtatagtgat tattctcatc actatggttt agtcatcatt ggctttgttc 
2450
tgaaatgttt ttctttattt tttttggttt tagccgtatt ttgcttgttc 
2500
gaaagaagga gcaagttgtg atgctcttga tgtgatcgcc cagaagaaac 
2550
tttggccacc gacttcgttt ttctcggcga tggtcgcttg gtacgaacac 
2600
attggccttg gcccatggcg tttgcttgat tgtttgtaca caccaccgca 
2650
catgacagag aatcatcaaa atttgaatat tttaaataat aaatataaat 
2700
tacatatatt tagtaagttc cgatactaat ttagatttta gtctatgacc 
2750
ttgaatgacg gtagttttta gacattaggt cttagtttta aacccaaaag 
2800
accgaatttg atataggatc tatttatggt aaccgaagaa tttaactgca 
2850
tatgactaaa gacatgactg gtttaattgc agcggacggg gctgtggttt 
2900
cgcttgcggt tgcggaaatt tgcggaagcg agatattgtg gtttcaagcg 
2950
ttttaaacga ctaatttaac gtttcaaaat agatgcattt gcagaaatct 
3000
tatgactaga tgcaataata attaaataaa taaaaaagat ccaaaataaa 
3050
tataatatat aggattagat acaaatatga aaagatatat acagaattat 
3100
atatatttat cttaattaca aatatgttga ttatttatta ttattttaat 
3150
attttaattc aaccgctacc atccacaact acaaacgttt gcgggaagga 
3200
gtttttgaaa tgtattgata tcgagcgatc cgagcagtat cccgcgattt 
3250
atatgattat tgtcaatcac taacaattgt taccacatgt aaatgatgcg 
3300
tttgcatgta gtagaaggag aaccaatcaa ccccttaact gatgatggct 
3350
gaatttattt taaaggtggc tgaatgactt caaatgataa ccactgaatt 
3400
tatttgagat tattcatttt tcaatatagt tacctgctgg taacatatat 
3450
ttcctccatt cataataata tcgttttaaa tatttttata taaattatta 
3500
atatatatta tattttaaaa accaaactga ttcatacttt atagatttta 
3550
cattgaaaat ttagaacaat acttattttg gaaaaaatct ttaaacaaca 
3600
aaacagaata agtatttttt ttaatattat tttgtgaaaa acaactattt 
3650
agtttacaat aatacctaat agtataagta aacttttaca aagttgttcg 
3700
gtaattacat tgtaatagtc aaatatacaa aatgctaaac atattttaac 
3750
agaaggaaca aatattagaa taaagtaaaa agaagccaac ttcaaaaaaa 
3800
aacaagaagt gtcacaatgc atgagaatat taattataat tggactgtct 
3850
ttaggtttaa gacatttatt actctatata tatttcccca ctccctatta 
3900
caggtcccac ttttaaccat acatttaacc atagttaaat catcaaaccc 
3950
tacctttctc tgttaaacat cttcaagctc tgtcctttta ttttaaatat 
4000
atttattatt cacatttatt aacattttta tatctctccc tattaaatta 
4050
ttttattctc tcttagcaac attcatcaac cagagcagat tcactatcat 
4100
catcttataa cacatcttct tcctctaaag tttattttct taaacttatt 
4150
acaaaaaaca tgatcttcaa aagttgattt aatctctttt tatccatctt 
4200
cttcttcatt tctcaatatc aaacttttct ttttttgtaa gcttaacata 
4250
aaccctaata ttttcttgat ttttttcaag aaaataaaaa cataaagATG 
4300
CTTGAAGTTA GATCAATGGA TATGACTCCA AAATCACCAG AACCCGAATC 
4350
CGAAACTCCG ACCCGGATCC AACCAGCTAA ACCAATCTCT TTCAGTAACG 
4400
GAATCATCAA ACGCCACCAC CACCACCACC ACAACAACAA CAAAGTCACT 
4450
TACAAAGAAT GTCTCAAGAA CCACGCGGCG GCGATTGGTG GTCACGCGCT 
4500
TGACGGTTGC GGCGAATTTA TGCCGTCTCC TTCGTCAACA CCTTCCGATC 
4550
CAACTTCTCT CAAGTGTGCA GCTTGTGGTT GTCACCGTAA CTTCCACCGC 
4600
CGTGAAACTG ACGATTCCTC CGCCGTTCCA CCACCGTCTC TTCTTCCATC 
4650
TTCAACAACA ACCGCCGCAA TTGAGTATCA GCCTCATCAC CGTCATCATC 
4700
CTCCTCCTCC GCTAGCTCCT CCGTTACCAC GTAGTCCTAA TTCATCTTCT 
4750
CCGCCGCCTA TCTCTTCCTC CTACATGCTT TTAGCTCTCT CCGGTAATAA 
4800
TAAAACCGCA CCGTTCTCAG ATCTAAACTT CGCCGCCGCG GCTAACCATC 
4850
TCTCCGCCAC GCCTGGCTCG AGGAAGCGAT TCAGGACGAA GTTTAGCTCA 
4900
AATCAGAAAG AGAAGATGCA TGAATTCGCC GATCGAATCG GTTGGAAGAT 
4950
TCAGAAACGT GACGAAGACG AAGTTCGTGA TTTTTGCCGT GAGATCGGAG 
5000
TTGATAAAGG TGTTCTCAAA GTTTGGATGC ATAATAACAA AAACTCCTTC 
5050
AAATTCTCCG GCGGAGGAGC AACCACCGTG CAGAGAAACG ATAACGGTAT 
5100
CGGCGGCGAG AACAGTAACG ATGATGGAGT TCGCGGTTTA GCTAACGACG 
5150
GTGACGGTGG TGGTGGGAGA TTTGAGAGTG ATAGTGGAGG AGCTGATGGT 
5200
GGCGGAAACG TAAACGCCTC GTCGTCTTCG TCGTGAagaa gaaaacatca 
5250
tgtcgttttg cagggaaaga gttataataa tggaagctta agctttgttt 
5300
ttagctttag atcatagaga gtaagcactg gtattattat cgttaatacg 
5350
ttttattaat attaattaaa ctcttttagc tcttttttaa ttttccaatt 
5400
ttattataat ttcattacca cgacgttgtc ttatttttcc atttaaagta 
5450
agtttatatc aacaaattgg attatgttat aataagtcaa ttttggttaa 
5500
tttaatgaac cctaatgagg aaaattttat aactttaatg ttttttttaa 
5550
taatatgttt tttggcttct tatcttaaaa gcattttgtc tttttaaatt 
5600
gtaacgttcc caaaggtttc ataatacttt tccactaatg gaaagattat 
5650
atgaactaat cacccgaatt agtcacaaca ctataggtca atttaggtaa 
5700
tcaaacgaac cctaaaatgt gagtcccaaa cataaataaa ctattgcaat 
5750
ttagttaatt atttaatatt atttgatggt ttcttatctt gaagagtact 
5800
ttgtcgctta atttaatatg cgatcaaact aagatctagg tgtccttttc 
5850
ataaatctct ctttattctt tgagaaaaga gacaggtttt gttttatata 
5900
ttaattattc taataatata ttttgcaatg attagttatc ttggtgtcta 
5950
attaacaaaa gattcatcgg ataattcatt ttaatttcct cattaatcca 
6000
tttctttatc atccttacat tcccactatc cgtttttggt atatatgctc 
6050
aagtgttcga tattcttaaa gtgcaaacta caaataagta tatattatat 
6100
aattgggatc taactattat tattaaagtg ctatatagtg ttaatttagg 
6150
gcgtggaact aatcattaac tttacgaata atttaaataa ctttctaact 
6200
gggaaacgta gaaatgcagc cgtgattatg cgataggctt aagacaatta 
6250
gatactagtc gtgattaata aatgtcggct taccaaacat aaaatattaa 
6300
taaaactgta attagattag aatattgcat gagaaagcac aaaatatgtt 
6350
atgtagtatg cttttggtgt ctaggattta attcttagag aatacgtttt 
6400
gtctaattag ctagatttat ggataaaact atctaaagat gtataatata 
6450
atgtagatag aatatctggg tttctatgtg aattgtcaat taaatttgac 
6500
ctatgaatga atatatgcaa tgaattttat attacaatag aattgtttgt 
6550
tgtgcattcg tttgtaaata ctaaataggt agtactatta attatgtttt 
6600
ataaaaaaag aaaattttgg attatattat cattatggtt ttagaaaatc 
6650
aaattatttg ttgaatgatg ttgtaataga ataaaaatct aaacagtgat 
6700
aattcacttg attacagaaa tttatcgaaa aaatctgagg ttcaagtttt 
6750
tacttaagaa aaatggttta cgtttttaat aagttttact aattaagggg 
6800
tttttgggtc aaaactaagg gttggttcaa tatatatgga gagagatttt 
6850
ggtaaagatc tatacattat atatatatat atatatt
6900