fioreDB : Database for Flower Bio-engineering by CRES-T system
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Locus Common name Short description
AT4G01460 bHLH057 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein (.1)

>AT4G01460.1 genomic map

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Uncut enzymes: ApaI, AscI, EcoRV, KpnI, NheI, NotI, PstI, PvuII, SalI, SmaI, XhoI
Name Recognition sequence Cut positions
BamHI G|GATCC 4817
BglII A|GATCT 1201, 5409, 5883, 7535
EcoRI G|AATTC 3594, 3617, 4452, 7569
HindIII A|AGCTT 4208, 5121, 5444, 5736, 6750
HpaI GTT|AAC 6200
NcoI C|CATGG 2892
NdeI CA|TATG 2419, 3363, 4295
PacI TTAAT|TAA 1549, 3821
SacI GAGCT|C 4879
SpeI A|CTAGT 2178, 2214, 5556
StyI C|C[AT][AT]GG 2841, 2892, 2898, 2904, 3933
XbaI T|CTAGA 5182


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>AT4G01460 genomic sequence (4575-5012,5114-5512,5828-5938,) length:7686
aacgcatcag aaggaagaaa atccaaagtg aaagatgata cactttgagt 
50
ttagtttaat aaaatacatg gattacttac tctacgtatt actctgatat 
100
gcatgaaaag agatattgac tctattaggc ttattttgtc tctgctacgg 
150
aaaatctagt tttatcgcat tatactgaaa atattataat ttaaagagta 
200
cggattgaat gatgataaaa aaaaagtggt ttaaggtttt aaacagaaga 
250
aggcgcagta ttaaaataaa taaataaaaa tagattttat tactgttatt 
300
ctatcattcc gacaaagttc cgattaatat gtaattgtcg aatttttttt 
350
atttttctaa cggatttttg ataaagtatt gttttcggaa tttcgtcaga 
400
atcccgtcaa aaaaaattca accaaacatt tctttgaaaa tttttgttgg 
450
aaatggttat gttttcttgt agtatattaa ctattgtagt gttataagtt 
500
ttatcgcaga gatataaaaa aaaaacaatt accctacttt ttttgtaatc 
550
cttatatctc atttttgtac aaaaggaact cttgtagaca tctgctaaaa 
600
attatcagaa agaaaaaaaa atgttacaag aaaacattat taccagtaaa 
650
ttgccaatac aaatattcaa actatcagtt ttgtttgcaa ccctacttcc 
700
tagatttata agatgcgaga ttaatattca acttgctaca acctcgtatt 
750
atataatttt tgacagtaac taatacactc tgtgtttttt tataattatg 
800
atattacttt ttttgaaata aaattgagaa acaaaactgt gaaggggacg 
850
gggaatcaag catttgacct catcgacaaa tcgacataag gatttgagtt 
900
ttcacctttt gttgttccaa cttcttttcg ttttagttgt ccaaaacggc 
950
ctagtttcat aatatgttag ataaaataca tggtgttata tggtcaaata 
1000
ttgtggaaga ctagctacag tagaaactct ataaattaat actcgataaa 
1050
ttaataaaca cgataaatta ataaatttta ccggtcccaa gtcgggccaa 
1100
tgtaaaaagt aaccaaaatc gataagataa taagataata ttttttttga 
1150
aatccctata taaaattata gtcccaataa tattataaat taataatcat 
1200
agatcttaag tatatatttt aagactaatt aatttttata tgaaattttt 
1250
gttcaaagta caattacaac tctttttaaa atataactgg tatgatctct 
1300
gttgtactca cataactatt tgcgtatttg atctgtcata gttgattttg 
1350
taaaatcttt tatttgaaaa agcattgcta agatttgtgt aaataaaaat 
1400
tggattaaac ttcatgttta cgtttacgtt cacgttaatg tcgtggatat 
1450
acaaacacaa tatattttga aaaataaatt taaaaagtca aagaaaaata 
1500
aaaaactaac ataattatat atacaaacaa caaagcatat agaaaattaa 
1550
ttaaaaacat tttaaaaaga atatagtatt gtattttaca taaatatttt 
1600
tataaattaa tatttattaa cttatacgat aaattaataa atattaattt 
1650
ataggataaa ttaatatcac tataaattaa taaaatttca tggtcccaac 
1700
attattaatt tatagagttt ctactgtata tggttgagtg acttatatga 
1750
taatcttgca atttttttaa tgtggagagt agatttacaa aaatattaga 
1800
ttttaaaatt tgttttgcaa ttttctcttt actaatctta ggtccaacca 
1850
aaccatttca agtcattttc ttgttatctg taatacatta tatatctaaa 
1900
aacttcaaaa ttaatttgat tagtttgctt aactaacaga aaatattgaa 
1950
tgatacattt attacagatg aaataatgaa tttttatttg tggccaattg 
2000
cataatggat gtgagattgt atagacatat ttaacttgtc aactctacat 
2050
gccttctgga aacaagtcaa atcgaataaa gtaaactgag agacaattca 
2100
tggaattgat ctaaacacaa gtgggtaaac ccattaccat tttcctcgct 
2150
cgtctaaatt cctatatgtt ctcatttact agtatcgtat cttctttttt 
2200
ttttcttaaa caaactagta ccgtatcttc ggttatatgg atggtacata 
2250
gaactataaa ttgtaaaatc atattctaca tacttacttt gacgataaat 
2300
aagtgctatt tcgggtctaa tgttacacgt agggaactac ctaagaaaat 
2350
gtggttcgcg tgtctaatgc aaactgattt ccattcgaac ctataatggc 
2400
tgaagaaata gctatccaca tatgatatgt tgataatgat atatattata 
2450
gatattcttg tgtttagcta agtaatatat aaaaatttac tccacttttt 
2500
tctcaattgg tatgtgacat gctcttattg ggtggataat gtactagaca 
2550
aaacttgtaa tttttttttt ctttatctat aataatataa aaacattttg 
2600
tgtgttatat tttcatacat ctattttcct ttcttcataa ttcgtttggc 
2650
ctatttttca aatgtagtct attcaatttt attaggttgc atgtgagttt 
2700
tggactcact tatgcatggt acaaaatcca agttcttaaa agactttgag 
2750
gtagaataaa aatctgtagt ttgggagaag gaaacaaaaa taaaaaggta 
2800
aatttctttt gggggagagt actgttgttt gccctacaga ccaaggcact 
2850
gaaatcgagt tggtattatt aggatactta acgtttggca cccatggcct 
2900
tggccttggc catgtgcatt gttcgtcctc ttcttaaagg gtactattgt 
2950
cattcttaat ttttatagca ctaagtcaac acaccatatt gggaaatact 
3000
taaagaccca taatgtactt gttctagctc gattaaaaga gaaaaaacaa 
3050
agtaaatgaa aagttgaagt aaaagacatg aaaacccttt ttggattgga 
3100
gaaaactaat tctctaaaga tagaaaagaa aaagaggaag aagcaagaga 
3150
ggcttggtct tcttttctga tcctgaaact gtcttaataa gagtgagaag 
3200
tactgttcat ggaagacgtg tccccaccaa acaaaactgt cttcactgcc 
3250
ctcttcaata atacttttac gggacccctc ctagtcccaa cgcacaatct 
3300
cattgtgtct atacagagtt atattatata tatacactta atttctaata 
3350
gttgtagcaa aacatatggt aagaaaatga aataaatacg gttaatatat 
3400
tattattttt tggtcaaaac ggttaatata tatgtaacac caatgaagcc 
3450
aacatatcca aacacagaag aagatttttg gatgatgatt taaacatgta 
3500
tatatgttag tgtgaatctt caaagtttct gtttaagtag aattattttt 
3550
atagataaag tattttatat gttttttggt cgagccaaat atcgaattcc 
3600
ttcatcaaag tctatcgaat tccttatatt taccaaagta aaattcgtta 
3650
agaacaaaaa tcaaagagta ttgtcccgaa agaaaattat tttgaaggcc 
3700
caaagaggac aaggtcataa atatttgatc tggaggacag gacacccacg 
3750
tatatttttg tccaaaattt aggttaaaaa aagaagaaga aaggttatct 
3800
gtttcacgga ttaaatattt aattaataat acatacatat attactgtat 
3850
gtgtgcgtgt aaaatactaa atatcgacga ctatatatat aactagataa 
3900
tttagctata gtatagtatt tttatttttc acccttggtt tttttataca 
3950
tatatgcacc gaacctcttc ttcttctctt cctcgtcttc tctcctttta 
4000
tatatgtgga aaactgcatt tattaagaac agtttagaaa gtgtcaaccc 
4050
ctaaaggaat gtttttagtt tagaggaaag agagagaaga agaagcagca 
4100
gcagaagttg ttaatttgaa gactatttga ggaaagacac ctatatctaa 
4150
atactcaaag ttacaaaaat attacttcag aaaacagttc cattagagag 
4200
actcataaag cttctcatgt aagcctctct tgtaatttat tctcatatac 
4250
agaatactgt tttgtgcatt tactcttctt cttcctcctc ctttcatatg 
4300
attaacattc aatgcaaaat tcttgtaaat tcattttaca atagcttatc 
4350
caaattctgc tacttttatt attgtttcct ctcgctgcga cattctttat 
4400
ttctcatcat ttaatgttct ctcctcgtac atcctctttg ttctgtctta 
4450
agaattcacc taccaaacca tttatttctc atacccactt taagatttag 
4500
tagatttttg ttttcttgtc aaaatggtat cctaaaacta atctctcttg 
4550
tttttttctt tgttgaagct aattATGAGT GGATTGATGA GTTTTGGTGA 
4600
ATTAGAAGAC CAATTTGGTC AGATTTCAGA CACTACTATG GAAGAGAAGA 
4650
TACCATTTCT GCAAATGCTT CAATGCATAG AACACCCTTT TACAACAACA 
4700
GAACCAAATC AGTTTCTCCA ATCACTTCTC CAGATCCAAA CCCTAGAATC 
4750
AAAGAGCTGT CTCACCCTTG AAACAAACAT CAAAAGAGAT CCGGGTCAAA 
4800
CAGATGACCC GGAAAAGGAT CCAAGAACAG AAAACGGAGC AGTAACGGTC 
4850
AAAGAAAAAA GAAAACGGAA ACGTACAAGA GCTCCAAAGA ACAAAGACGA 
4900
AGTTGAAAAC CAAAGGATGA CTCACATTGC CGTCGAACGT AATCGAAGAC 
4950
GACAAATGAA CGAACACTTA AACTCTCTCC GATCTCTCAT GCCTCCTTCG 
5000
TTTCTTCAAC GGgtaacaaa atgttttaag ggttcattaa acaagaacgt 
5050
aatttttttt tcttttcaag aacgtaattt agctttaaca agaaaacgtt 
5100
tttgtttctc tagGGTGACC AAGCTTCGAT TGTAGGAGGG GCAATAGATT 
5150
TCATCAAGGA ACTAGAGCAA CTCTTGCAAT CTCTAGAAGC TGAGAAACGA 
5200
AAGGATGGAA CTGATGAAAC TCCTAAAACG GCGTCGTGTT CTTCATCTTC 
5250
GTCTCTTGCA TGCACTAACT CTTCTATTTC TAGCGTGTCT ACGACGTCGG 
5300
AAAATGGATT TACGGCGAGA TTCGGCGGTG GAGATACGAC AGAAGTGGAG 
5350
GCTACGGTGA TACAGAACCA TGTGAGCTTA AAAGTTCGGT GTAAGAGAGG 
5400
AAAACGACAG ATCTTAAAAG CTATTGTCTC GATTGAAGAA CTAAAGCTTG 
5450
CGATTCTACA TCTCACTATC TCTTCTTCCT TTGACTTTGT CATCTACTCT 
5500
TTCAATCTCA AGgtaatttt cttaatcatc tcttaaacta tcagtttcaa 
5550
tttccactag tttaagcatt attataaata gtcttatgta actagcaatt 
5600
tttgactttt tgaggaaaat taaggaatct tcattttgaa atgtttggta 
5650
cttaagaaaa ttaaaatgca tgagaaacca taatagaaaa tatctacaat 
5700
tatgtgtgtg tgtgtgtatt tttttccttc actctaagct tagaaaattt 
5750
tagtttaatt ttttagtaag ttgctaattt ttgtttagtt ttggagagat 
5800
gagaaatgaa tggtgttgtg catgcagATG GAAGATGGTT GTAAATTAGG 
5850
ATCAGCAGAT GAGATAGCGA CAGCCGTTCA TCAGATCTTC GAGCAAATCA 
5900
ACGGTGAAGT CATGTGGTCA AATCTTAGTC GAACTTAGtt gacttttgac 
5950
tcctagtaac gtgtgtaaac tttaggttac aaagaaaagg gacgtgatat 
6000
aaataagaaa aaccaaagag gtgaaatttt gggagtttta attattatct 
6050
tatacttttt ggattttaga ttagtagcaa actcgcagtg ttctacgatg 
6100
acattattat tggtcacatg aaggtttagg ttattattgc ctgtaatttt 
6150
tgaatataaa ctaacctatg agttcagttt gaccccgaaa acgaaaaaag 
6200
ttaaccatga gtaatattta cttccattta taaatgtttc ccacttagta 
6250
ataatgttaa gaaattgact ttagacgtcc gtattagaat ggttacggaa 
6300
atggaaacaa atacaattaa agatgaaaca tcattattac taagaagaag 
6350
tcgccttcac acttcgcaac ctctttttat attttgcata tacgttttat 
6400
taatactctc atatcgtcca tgcgtctgac aaatctacgc ttgataaaaa 
6450
aggtacagct acaacataaa tttaaaggta ttcttttgca tcaacgtcta 
6500
ctgactaaaa atacttgttt attgtataat gactctagtt ttacttttaa 
6550
caacgaagag aaaggtggca gaattttttt aatattccaa tggtaaaaaa 
6600
gcatcgtaaa aggaagccta tggtcagagt ctcattgaca catcggtctc 
6650
gcttgtaata cgtaaaactc agcctatctc actcacatta cttttttcga 
6700
aattttaatt catatatcgg tttccgcata tatttaactt ttgtattcaa 
6750
agcttattaa aaaatcggga aaaatctaaa catcataagc aaaacaaatc 
6800
cgatcaatat gtttaaattc tgtaatacaa gaacaatata aacaaaaaca 
6850
tattattcag aaagcaatga tacattattt gaatattgtg tgtaagagtg 
6900
aacgacaaga tcatacgtca gagataatcg actggtaaca actctgatct 
6950
tttccaactt ttggtcaaag tcaaaccatt tggtcatttt tacagtaaat 
7000
tattgagtaa tatgtcattt actcatttct tttgaggaaa actctttttt 
7050
tatcagaaaa caaaaacaaa ttactcattt tcgttttggg ctcaagacaa 
7100
aagtccttct tttaaaaata ttagcccagt taatctatac aggcccatta 
7150
aagcccatac taaaagagcc gagcgttcca ccgcgtgaga ttgacgtgcg 
7200
tgtatttacg cgttaatgtt tcgcgtggta tttgtttatt tgaataaaga 
7250
ttccttagct ttattcttag taggtcctca tgagtcatat tcgtgaaatt 
7300
gaggtttttg aacgaactcg gggctttgat tcgaagtcga aagttttgat 
7350
tttatattgt gatttctaag tcgaaggatg tgttactttg gtgttttttt 
7400
tatttgattt tttaaaaaga atatttgata gttgtaaaga gtttttgtat 
7450
atgtttaatt tttaaataga gaaatggtca acgtagcaca attaacttgt 
7500
aatagagaat tgctcaacgt agcacaatta gtgtagatct ttaaaattaa 
7550
atcatcgagc gaattttaga attctcccaa atagttgtta tctgcaaatg 
7600
tcatgttatt tacaattctt gatacataaa atagttagtt ttccatgtgg 
7650
taaaaacaat aaaacatacg accaatcgac cattga
7700