fioreDB : Database for Flower Bio-engineering by CRES-T system
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Locus Common name Short description
AT5G15210 ATHB30, ZFHD3, ZHD8 ZINC FINGER HOMEODOMAIN 8, ZINC FINGER HOMEODOMAIN 3, homeobox protein 30 (.1)

>AT5G15210.1 genomic map

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Uncut enzymes: AscI, EcoRV, NheI, NotI, SacI, SalI, SmaI
Name Recognition sequence Cut positions
ApaI GGGCC|C 6483
BamHI G|GATCC 4395, 4642
BglII A|GATCT 6907
EcoRI G|AATTC 2985
HindIII A|AGCTT 2479, 6704
HpaI GTT|AAC 1019, 3572, 6105
KpnI GGTAC|C 6388
NcoI C|CATGG 3901
NdeI CA|TATG 1770
PacI TTAAT|TAA 2725
PstI CTGCA|G 1502
PvuII CAG|CTG 1505
SpeI A|CTAGT 1015
StyI C|C[AT][AT]GG 3901
XbaI T|CTAGA 4199
XhoI C|TCGAG 773, 1604


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>AT5G15210 genomic sequence (4319-5134,) length:6928
acggcacggc aaagcacgga ccgtaggacc attgaaatgc gatttcaaat 
50
aaaaagattt gaaagcatgt gatccatcac atggatattg attattactg 
100
tctaacaaaa taaacttgta gatcgtgtcc agttgttctt caaacacatg 
150
cgtatagaaa atgtataaca ttttgttatt aatgttacaa gaaataaaag 
200
ataatgatca tccatcattc atgatgtcat cttgttcaca cttgcacaaa 
250
cctaataagt tatatacaag acatttttct agtttggtta gattaggttt 
300
cttttccaaa aaccgaacta tcaacttttt tttgtgtcaa aattttcaaa 
350
aattaaataa aattgactgt ctaaaaaatc acaaaagact atgcaaattt 
400
ctctttagta atatatcaat tttgatccaa atgaaaatgt aggggtcgtt 
450
atgtaaacaa atgaaaacat gaggaccctc cgggcgtgta tagttcacac 
500
ttgacaaata ggggttttgg agttaggccc ttccatccta atcgcgcttc 
550
cgtcgccgac gccattttac tcgccgtcgt catctccggc cacgcttgtc 
600
atcgttcgca attaatcgaa atcgaaattt tccggtaagt atcctccttt 
650
cttattaccg tatcattcga gagttggaat cggatcggaa atgtaattgg 
700
ttttgaggtc aataggttaa tacgtttgtg acaatggtgg agtttcgagt 
750
gtgaatgaaa aaactccatt tgctcgagaa gatttgatga aatggtttgt 
800
atagtattga tttgattcta cttgaatgat taatgtttga attgctcttt 
850
gttgcttgca gattcctgaa aaaaATGAAT TTCTTAAACT CAGCAGCATC 
900
CATTTGCAGA AGAGTTAGTT TGAGGGAACT GATCACTGAG GTTCCTGCTT 
950
ATAGTGGCAG TAGCATTTCC Ggtatagatt tgcgcttttc aaaatctata 
1000
ttttgatgat cttaactagt taactcattt gtgtaattgt tgctgttgtt 
1050
cttgttttgg ggatgttaaa gATGGTTCTT CAAGTGGCTT GAGTTTGGTC 
1100
TTCAAGCGTT GGGCTACTAA GAAAACTGCT GGTTCTACAA AGAACGGTCG 
1150
TGACTCTAAT CCCAAGTTTC TCGGTGTTAA GAAATTCGGA GGAGAGgtaa 
1200
gaaaataaat aacaagcgag ataagatttt gataatcaaa tcagtcttgg 
1250
tctgtgtgaa gaaaataatg tttgcctgtg tgtgtgtgtg attttgcagA 
1300
GTGTGATACC AGGAAACATC ATAGTTCGTC AACGGGGAAC TCGGTTTCAT 
1350
CCTGGAGACT ATGTGGGGAT TGGTAAGGAC CATACTCTGT TTGCATTGAA 
1400
GGAAGGACGA GTCAGGTTCG AGAAAAGCAA GATTACAGGA CGCAAATGGA 
1450
TTCATGTTGA TCCAACAGGT GGTCATGTTC TTCACCCTAT CTACACAAAA 
1500
GCTGCAGCTG CTCAATCGAC TAAGTTGAAG ACAGCTTCAT AGtcgtgaat 
1550
actgattgca acaatctaaa cgtggttttc atttccttta gatcatgtga 
1600
tctctcgagt aaaagatgat gctatcttag agcagaacca ctcaattcaa 
1650
taacatctgc tgttttgttt ccctctagtc tttgtctgga ttttgatgaa 
1700
gggctttgtt tggattcaac aaatcaagtt ttattcggaa atagatgtta 
1750
atcaagtctg agtttctctc atatgtgtta cgcaaaacag acaagtaaca 
1800
gtctgagata atgttttccc ggcccgttat aaactcatcg aataatgggc 
1850
caacattcta agcctcaggc tctggcccgt caacgcggct agatccgttc 
1900
attgaatcag aaacatattt atcctatcgg gtttaaaatt tcaattaaaa 
1950
tttcaaacat aaatttctct catattatca tatatggacg aaccagcttt 
2000
gtttttggca taatgtgaaa tcaagagcca acttgtttta gccattaaag 
2050
tttcctcaaa tacttctcaa gttgccatgc acatcaatat ttagtttttg 
2100
aattattatt ttcttgtaat tttacacatt cctattcaaa aacaatacaa 
2150
ttaaaataaa atcatttcgt ttataacaca aaaaaaggaa gaagaagatg 
2200
tcattgtttt tttctttatt cacaaatctt aagaacagtc catattaatg 
2250
catactaacc acccatgcga tacattcatc gtatatgata aatccttcca 
2300
attgcatttg cacacataca taaagtagga tatgtgtata tataaaacat 
2350
atacaggcat aacatataat agattttaga aagaaagaaa aaatcacaga 
2400
tagatcatca aataattgcg tcagataata tatcctgaaa aaaaaaaact 
2450
aattaatatt atccttgtta tgggcataaa gcttatttaa tgtcggtttg 
2500
ccttattctt cctaactaaa gagtaaaaag ccttataact atttctaaaa 
2550
caataatata tgtgttatat tattttgttg tctatgaaat ctatagataa 
2600
tcgtagtgcg gtaacaataa gaccaatcaa caatcaagtt atatctaaat 
2650
gcttgaaatg ttgatacggt ggttccctat tttggctatg gtaagtcgtg 
2700
caagtcgtaa tatataccta cattaattaa agtataatgt taaagttcaa 
2750
tgtatttgag aagaagagaa ttgtcttcca taacagacga acatggtttg 
2800
attaggtagc gccatgttgc aagatatgta cgcgtgttag ctgtttttgg 
2850
tatttagaca atttcatatc atcattagtc aaaagaaaga aaaagtttta 
2900
agagttgaga tttacaatta cgttactact ataagaaaac agacgacatt 
2950
ttagaaaccc gttaaaattc aaaattttga cggagaattc aaccgttgga 
3000
tttagagcat caaaattaaa acttccataa aatttgtctg aattttttga 
3050
taaaatttat cggtcatatt ttagcaaatc tcctaaaaaa attggtatac 
3100
tatcaattat ttatggagtt tttgctttga attgttagtt tatcacttat 
3150
tattagtaat ggatttgcaa acgatcttag gtttggtcta cacctctctg 
3200
attaaagact tttttataca gctttaaaga agtttggagt aaacggcatc 
3250
gttcttcacc actgctcgtg tcagcttttt tagttgtggt ctccttttct 
3300
taaggccact ttaaccgtca acatgtatag tcaataaaca tttttgagtt 
3350
aattagtgga gtagttgaga agtaaataaa ttaagctagt catagttttt 
3400
tttgcaaaaa tttggtagta gagtaacttt taagattgta agttgatagt 
3450
tttttcgaca taagattgaa gacaaaccat gaactataaa actagggaag 
3500
gtcgagattt taacattttt ggataaacat tgcttttgat caacaatacg 
3550
aaatattaac ttttgtcttt agttaacatc attgaatcaa caacccgaat 
3600
caaccttaat tatattcatg ctttacttcc acacgaaatt ttcagcttaa 
3650
ataaggagaa aaaaaaataa aaaaaaataa cgagaaataa taataattga 
3700
aatttgaaag gtagcaaaaa agattaatat tgatataaaa ttggagtata 
3750
tattattaaa gttgtcaacg tcatggagat acaaatttag caaaaagaaa 
3800
aagacatgac tcacattaga tgctgttcta tgaactctat ttattagcct 
3850
atatttatta cacttatctt ttttcattaa ccctagatgg ggtcaacaaa 
3900
ccatggttaa aaaaaaatat tcaaccaaaa aaaaaaaaac acataatgat 
3950
tatgaatctc aaccacacaa cttggatttc tcattatcaa cagtcttcaa 
4000
cttctcatct ctttcttcct ccatgagaga cttgagtaaa taatacatag 
4050
ttttaaattt ccccttttct aatcttatct ctcccaaata cataaaccca 
4100
tcccaaagat ttcgagttta caatttaaaa acagttttgt ttagtgcaat 
4150
ctttacctta tctttacttc tatcatctat tcttcttctt cctccatctc 
4200
tagaaaatta taatacttct tgtttcttaa atcttatttg tattacaata 
4250
accaaaaccc aagtttacaa aacatttctt cttcttgttt ttcgaaaccc 
4300
taaatgtttt gagttgtcAT GGATGTAATA GCTACTACAA CTACTATAGT 
4350
ATCCGACTTG GATTCACGAC AACCCGAAAT CGAAGCTCCG ATCCGGATCC 
4400
AGCCCGCGAA GCCTATTTCT TTCTCAAACG GCAAACGCTG CCACCACCAT 
4450
CATCTTGCAT CTGAAGCGGT TGCGGTTGCG ACTTATAAAG AATGTCTAAA 
4500
GAATCACGCA GCAGGTATCG GCGGTCACGC TTTAGACGGA TGCGGCGAGT 
4550
TTATGCCGTC ACCGTCGTTT AACTCCAATG ACCCCGCTTC ACTAACGTGC 
4600
GCTGCTTGTG GTTGCCACCG TAACTTCCAC CGCCGTGAGG AGGATCCATC 
4650
TTCTCTCTCT GCCATCGTCC CTGCGATCGA ATTTCGACCT CACAACCGTC 
4700
ACCAGCTTCC TCCACCGCCT CCTCCTCATC TGGCGGGGAT TCGTAGTCCA 
4750
GACGACGATG ATTCAGCTTC TCCACCGCCG ATCTCGTCTT CTTACATGCT 
4800
TCTCGCACTC TCTGGAGGAA GAGGAGGAGC TAACACGGCG GTTCCAATGT 
4850
CTAGGAAACG TTTTAGGACG AAGTTTAGTC AGTATCAGAA GGAGAAGATG 
4900
TTCGAGTTCT CGGAGAGAGT TGGGTGGAGG ATGCCGAAAG CTGATGACGT 
4950
GGTGGTTAAG GAGTTTTGTC GGGAGATTGG AGTTGATAAA AGCGTTTTCA 
5000
AAGTGTGGAT GCATAACAAC AAGATTTCAG GACGCAGCGG CGCTAGAAGA 
5050
GCTAACGGCG GAGTAGTAGT AGGAGGAGTA GGAGATAGTC GTCAGAGTGT 
5100
TGTTCCGACA AATGGGTCGT TTTCTTCGAC GTGAggaaaa gaatggaaag 
5150
cgttgaaaaa gcgtcgtcgt tttagaggct aattcttttt tggtttttct 
5200
tctctgtgtt ttgaagattt tttattttta gtcaacgggt caaaatcttt 
5250
tttctattcc actttgtttt gttatgtctt gtagtttgta ctcttgttag 
5300
tagtttatct ttgttagaga ggtgatttga gttgtatctt tcgaccaaat 
5350
gtgagaagaa agataaatga gtaacctcct aaaaccgaat aacaaagtca 
5400
attaatccaa ttgttttcta aattctatat cagtttgctt ttttattttt 
5450
actttttttc tttatataga aatttatgaa agaaatgagg gaatttgttg 
5500
caattatgtg acattactag atttttaacc cgcggtatac cgcaaggaca 
5550
attttttttt ttttaagtta gtatatataa aagtttacaa attgtatcta 
5600
tctataaaat atttttattt tatagtttac aattgttatt aagtaaaaaa 
5650
aactatttat tttattaatg ttgatcttat ttatgatatg tttataaatc 
5700
attgtctaaa tattttgtaa ttttgtaata attaactgct ataaaatatc 
5750
tatgtgggtt gatgcgtata atggaattgt tatagtcatg caaaaaaagc 
5800
aatatcaaaa atgataattt tgtaattttt aaatgatgtt aaatatttta 
5850
gaagttttat tttagtaact aatcgtgtag ttattgtaga gagattttga 
5900
gaagatagtt aaatgtcaaa tatttaattc gaaaatttac tttctaatta 
5950
tcaaaaataa ttattaaatg ccagtgacaa ccactgtaaa taagtctcaa 
6000
cttgaagatt tatttcatat agtggctgca aaaatgtata tgtagataac 
6050
tcaaaaacat gaaaacacag ttactatttt gtgtgtttat tttcgatgct 
6100
agtagttaac acctgtttgt ttatttgttg aaatggtaaa agatacaact 
6150
aagagttggt aagattaggc actacgttag gttaatatga ttggagacac 
6200
cactcactta taatatattc ttgctgttct attaaggcaa gactggtaaa 
6250
acatctcaac aaaatattgc aattatttgt ttttacgata taatcttttt 
6300
tttttcatca acttttttaa tgatataatc taaatgccaa aagacatgta 
6350
aaatgacatt tttttttttg ttcaaatgac atttctaggt accactattc 
6400
agtgcataaa aataatttta tgattaagaa aataaattcg agcccaagcg 
6450
caagactcaa aaataaatcg acatctcaaa acgggcccaa tataaagcca 
6500
taattcgtaa aggcccaata taaagcctta attcgtaaag gcccaataaa 
6550
gaaagtgaga gtgtagcgtt agggttttaa gaaatcctat aaattagttc 
6600
attcgtctct ttcgttcctc tctgcgtgcc ctagttattc agatcgccga 
6650
atttgcagta aggagacgaa aatATGGTGC ACGTTTGCTA CTACCGCAAC 
6700
Tgtaagcttc ttctctcctt ttcgtcgttt atatcacagc tcattttcga 
6750
ttcgatctac gtagtgattt ctctcaatat caaatgatag attagggatt 
6800
atctgaggtt tttgattgtg ttatatatat agattgtgaa tctgggttgt 
6850
tgtaactttt gaggttttag tttctgaaat gaatcaatct tagatacgag 
6900
cctcaaagat ctaaccttta tgctgata
6950