fioreDB : Database for Flower Bio-engineering by CRES-T system
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Locus Common name Short description
AT5G39760 ATHB23, ZHD10 ZINC FINGER HOMEODOMAIN 10, homeobox protein 23 (.1)

>AT5G39760.1 genomic map

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Uncut enzymes: ApaI, AscI, KpnI, NheI, NotI, PstI, PvuII, SalI, SmaI, XbaI, XhoI
Name Recognition sequence Cut positions
BamHI G|GATCC 3278, 3303, 4209
BglII A|GATCT 5223
EcoRI G|AATTC 2484, 2583, 4355, 4775, 6010
EcoRV GAT|ATC 982, 2375, 4913, 5989
HindIII A|AGCTT 821, 1295, 5162, 5173
HpaI GTT|AAC 5108, 5648, 6329
NcoI C|CATGG 58, 208, 3717
NdeI CA|TATG 2070
PacI TTAAT|TAA 2453, 5218, 6873
SacI GAGCT|C 1157
SpeI A|CTAGT 1530, 3632
StyI C|C[AT][AT]GG 58, 208, 2562, 3717, 3738


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>AT5G39760 genomic sequence (4127-5131,) length:6914
TCTGAATCAT CAGACCCAAT CTTTGAACCC TAGCCAGTTT TCGCTGTTTA 
50
TGTATAACCA TGGAGACAAT ACTCTGTCTC AGATCCCAGT CTCTGCATCA 
100
AATTTCAATC AGGATTATTT CTCAGCGTTA CTTGAACAAT CTGAGTTGAA 
150
GAGTCAGATA ATGAAGCAGG ATCTTTGTGG TTATGAGCAG AACATGTGCA 
200
TGAGTAACCA TGGAGATGCT ACGCTCTCTC AAATCCCACT CTCTGCATCA 
250
AATCTCAATC AAGATTTCTC AGCCTTACTA CAAGACGAAT CTGGCTTGAT 
300
GCAACAGGAG CTTTGTGGTT ATGATCAGAA CATGTTTATG AACAACAACA 
350
ACTTTCAACA TTCTTTTGTC TCAAACACAC AAGATCACTC TGCTCCTGTG 
400
GTACAAGAAT CTGTGAACAA CAACTATGGG TTGATGCCGC ATGTTCCTTG 
450
TGGTTATGAT CAGAACCTGT TCACGAGTGA TATTACCAAC AACAACCTTC 
500
TTATCAACAA CTCGATGTTT CTCTGAtaac aaagctcatg tcaagagagt 
550
gtgaaactgt tttttcatct tcaagaattt taatatgttt gttgtggatg 
600
ttttattttg ctaagtattg cataacgcat aatgttttct tgtatcaagc 
650
tatattttac tatgtgaacg tccaatttat caagtgaata tatattccac 
700
cgcatcaaaa agttatcaat tatttggtat atagcttcgt gaaaatatca 
750
aaccaaatca cttattttaa gaaaagcaca aaaaggatta aggataatag 
800
aagaacagtg tcctaactta aagcttcaga gtccatatta tcactccata 
850
tttagggaca catatttcaa ctttttacac tccaccatag ttaggtatgt 
900
gagcctaaca aagttctcaa tccacaaagg aacttcctcg atccctgttt 
950
ggtttagaca gagacatgag atgttgcttg agatatctgg aaaactcttc 
1000
aactttgaac atccactaag atcaattcag atatttgaag ttagcaccag 
1050
tgggaagaga ctctacattt ttccttttca tcaattctaa aagtcttcac 
1100
cttttaccaa aacttctgaa cactaaaagg acagaggaga ctctcaaagt 
1150
tttattgagc tctcatatcc ttaaaccgga aagaaccaca taatcttcac 
1200
tactaataga atcaggagat aaaggccaag aggagagtga aggagtcatc 
1250
acaagacaaa caataaatag cagtctgaat ataatttaat tgtgaagctt 
1300
gcaaacatta ttagtgtcca aaaaacagca cttgttttca tgtttactga 
1350
aatagtaatg cttatgttgt tccgtttaaa gaacatgtga tgatcgcaca 
1400
gagaagagag aatcactgaa atagtgttga aaaaagagaa tgttacatac 
1450
ctatgatgag aaaagacaaa gacaaagcgc actgtggagg aatcagaact 
1500
tagcctgcat tgtaaaccgc atgatcaaga ctagttaccg gtacacagtg 
1550
ttcctgactt cttcaacgtt gtccttatct gtcaacattt cacatttatg 
1600
ttcatgtact tgttaaaaga ccctaataag ctacctactt gatgttgcta 
1650
ctatagagtg aagcaatttg gtgtatacct cctgcatcaa tcatgataca 
1700
atagtgacat tggaaacctc tatggaaaga gaaagtgcat gtgctgctaa 
1750
atactatcca actaaccata aacaagttgg agataattca gcttattata 
1800
acatataact ggtgtttcac tacggaacac atgtgcttag ttctacttat 
1850
acaactaaca cacacagaat gcttatgcag cccacataga gctacttctt 
1900
acctctctct ctttctcact gtaaaataaa aatgaaggaa ttaaaaatat 
1950
agaataaaca tagttttaaa ctaatttgga aatacatttg tctaacatta 
2000
aaataattta taccaataag tttatactta gttacttgct aaatcaaata 
2050
aagtgatgat tagtgattac atatgcctat gattacaaac aagtgtaact 
2100
atgatttatg cttcgaaccc aatcattttg agacgttaga aaggggtaat 
2150
ttggggtctt caaacttcct tcttgaattt gtctatttta tactcaagtc 
2200
ctcggatggg ctgttctgaa atcactatag ttgcatgtgt gcaataaccc 
2250
ggcccataaa aattaatgcc aattgtatta ttccattagc ccattaagtc 
2300
atcaatcatt accactaaat ctgctataag attagcttct ctacctctaa 
2350
agtctaacca aaaagaaagt cgaagatatc ttcatcgttt gcatgtaatc 
2400
tcctttacat gaccatgaag tccttctacc cattatgttt tgggattgca 
2450
ttaattaaga acagaatagc actctcccca aaagaattct ttggagccgc 
2500
aattatttaa gcaaaacatt gtccgtggat gattctttac gaacgggccg 
2550
tgatagttgt gccaaggaac atctctgtgg gagaattcaa agctagtagg 
2600
attcaagctc aaatggactt attaagctag gtagaaataa tagaaagatt 
2650
gaaatgaaat cgcttataaa aactttatta tgatgcaatt aatagaaaag 
2700
aaaaaagact ttaacttgtc aacaagaata caatgattca aaattgatat 
2750
ttttataagg ggtttgtgca aaaaaaaatc ataattaagt cgctaatttt 
2800
ttcaacttta ccattaatct ctacaaaata cataataatc ctataaaata 
2850
caaaataaga cgcaatatag ccctatacat atattgtaaa tgtttctatg 
2900
atcacataca tttgcttttt aaaattgtga aagtagagtt ggactcctcg 
2950
tctcgaagat tttaatttga tatattattt atcaaaattt taaaaattta 
3000
actataacaa aaaaatgaag ctatattgca tattattttt gatttcatac 
3050
aattattttg cattttttta gagatagatg ataaatttgt aaaaattgac 
3100
gtctttgaaa gttatttttg cacaaaattc cttttataaa gaaaaagaaa 
3150
aaaatttgtt ttgagacaac tcttaagatt accttacaat acattgatat 
3200
ttaaaaacaa atttatatga atctctagta gctatcaccc tagttacatt 
3250
ggctaatgga tttctcataa tagttttgga tcctctaata atctctagtt 
3300
ttggatcctc taataatctc tagtatatga aggacggaat ttcgatcatt 
3350
gctctcaact tgttcatcaa aatctagcaa aattgacatt ttccgtcgaa 
3400
tatcacccat ataaacttaa ccatagtgga aacctaaaaa ttcaccccca 
3450
acttttacaa gaaagtgatc tttctcattc cttcatttga aaggtttgac 
3500
cttaacgttt ttgttgtagt cgaaggagta tctttcacaa cattgctgat 
3550
cttagaacaa atgtaaccca ttattaccat aagacttatt ttttcttttt 
3600
cagttttgac ttgtgccttt atgtttaaga cactagtagc cacatttatt 
3650
acgctttttc accgcaaaat ttaacacgca ctctctttgt cgatcccaca 
3700
aactccatct acctaaccat ggttaaaaat catcaaacct tggttccctt 
3750
gattaaaata tccctaaatc caagtctctt tattatttca tttaaaatca 
3800
taaatttagt ttaatacaat tgtccttttt caaaatatta tttctttatt 
3850
tgcttcagca acagtcgtca tagtcatcat atcattttct tcttttcctc 
3900
ctctaaacga atattaccaa taaaaaatca agtggaaaat atgtaatatt 
3950
aaaaaatctc caacagctta agaagttaga acctttttac ttatctttat 
4000
ttcttcttct tcttcatttt tctattcaca ttctctgaaa ctcataccat 
4050
attttcaaag ctcttaaccc aaaaacccta agtctttttt ttcttcaaat 
4100
tattggttat attaatgttt taagctATGA TGGATATGAC TCCTACAATA 
4150
ACAACAACAA CAACACCAAC TCCTAAATCA CCCGAACCCG AATCCGAAAC 
4200
TCCGACCCGG ATCCAACCGG CGAAACCCAT TTCCTTTAGC AACGGCATCA 
4250
TCAAACGCCA CCACCACCAC CACCATCCTC TCCTCTTTAC TTACAAAGAA 
4300
TGTCTCAAAA ACCACGCGGC GGCTTTAGGT GGTCACGCTC TCGACGGTTG 
4350
CGGCGAATTC ATGCCGTCTC CGTCGTCAAT CTCCTCCGAT CCAACTTCTC 
4400
TCAAATGTGC TGCTTGTGGC TGCCACCGTA ATTTCCACCG CCGTGATCCA 
4450
GATAACAACA ACGACTCTTC CCAAATCCCT CCTCCTCCTT CCACCGCCGT 
4500
AGAGTATCAA CCTCACCACC GTCATCATCC ACCACCACCA CCACCTCCTC 
4550
CACCACCACG TAGTCCTAAC TCAGCTTCTC CTCCACCAAT CTCTTCCTCT 
4600
TACATGCTCT TATCTCTCTC CGGTACTAAT AACAACAACA ACAACTTAGC 
4650
TTCTTTCTCC GATCTTAACT TCTCCGCCGG AAACAACCAC CACCACCACC 
4700
ACCAACATAC TCTTCACGGA TCTCGTAAAA GATTCCGAAC AAAATTCAGC 
4750
CAGTTTCAGA AAGAGAAGAT GCATGAATTC GCCGAACGTG TTGGTTGGAA 
4800
GATGCAAAAA CGTGACGAAG ACGATGTTCG TGATTTTTGC CGGCAGATCG 
4850
GAGTTGATAA AAGTGTTCTC AAAGTTTGGA TGCATAACAA CAAAAACACC 
4900
TTTAACCGCC GTGATATCGC CGGAAACGAG ATCCGGCAAA TCGATAACGG 
4950
CGGAGGAAAC CACACTCCGA TTCTCGCCGG CGAGATTAAT AACCATAACA 
5000
ATGGACACCA CGGTGTCGGA GGAGGAGGAG AGCTTCACCA GAGTGTTAGT 
5050
AGCGGCGGTG GTGGCGGAGG ATTTGATAGT GATAGCGGCG GAGCTAACGG 
5100
TGGTAACGTT AACGGATCAT CGTCGTCGTG Aagttaaaga tgagagtgtc 
5150
aggttaataa gaagcttaga gtaagcttat tcgtattatc atcgttaata 
5200
actttctatt aaatattaat taagatcttt agctttgttt gtttttgcat 
5250
tattattagt tttgatttaa tgttctttac cacgtcggtg tctcgctcga 
5300
tgaggaataa taccataaca atgttcgaat tatatcattt gttgtaaaca 
5350
tttctattaa tgaaccctga aatgtgacta agtactccaa taaatggtac 
5400
acttttgatg tggtaatctt gtttcggatg aagaaacaaa aagattaata 
5450
aacgagtgaa acatgattag ttactataaa tattcatttg gtttcttatc 
5500
ttttaaagta ctcttcttaa ttttatttgc aaccaaacta gatgtagtag 
5550
gtgtactttt tttctttctt agatcctctt aattttattt tattttttta 
5600
ttctatatca aatgattagc catcattagt atattagtag cattgttgtt 
5650
aacacccagt gttttcacgt ccgacccgga ccgtccggtc cgaccggttg 
5700
aaccgtgacc cgaacacttt tccggtttgg gtttagtatt aaaatccaac 
5750
aagttcaaaa ccgaaaaaac ccacaaaaac tcatcattaa cccgtgaccc 
5800
gatgaaccag ttgaactggc cggatgtggg ttttaaaaaa ttctcttgat 
5850
tttggaataa aatatgagat tttagacttt attcaatcaa tttttagata 
5900
tttttcagtt cttaaaccca tttgatgttt aagattttga tgaagacttc 
5950
acaatgccgc cttaaaaaat gaatcgaatg gtgagtgaga tatccgatat 
6000
tagttgtgtg aattcacgat gttttattag tttatttcca tcattgctga 
6050
ttttttacta tatttgttac ggtattagac atttagttgg atttaaaaaa 
6100
tttcatcact ttattattat tgtttgatta tatatttata tttttttttg 
6150
atgtaaatga ttatttttgt tttaaaattt ataagaactc taaaaactct 
6200
aaaatctcta ttaatattaa atttattaaa taaattttaa tcaattgacc 
6250
cgtagtctaa tctaattaac ccgatgatcc aatgatccaa aaggtagtcc 
6300
gattcactgg gttggtttta aaaatattgt taacaccatt tcctctttaa 
6350
tctatgtcat tgtcatggat tcattccgat aacccatttt tggtatatat 
6400
gcttagtttt gattattctc atttgagaag tacaaaccag catatacctt 
6450
tttatactta gagattgaat tagtacaatt catactaaag tttgatataa 
6500
ctattattat atcacatcgt agcatccata aaatctatac aacttctaaa 
6550
taagggttta aggcgtggca ctaacacaaa tgattgagtt gatgaataat 
6600
ttaacaataa ctttccattt ggggaaacgt agggatgagt actgatatgt 
6650
cggctctcac aataaagaat gagattagga tattatgggt atctcccata 
6700
cgggtttgtt acaattattt aagcaattca ttactactat ttctttattt 
6750
aatttatata acgcatttag tcaagtcaca aatatctttc cgtattatct 
6800
tggtggggac aaaacttttg cacaagctga ggttatggcc ctaactgcca 
6850
tataccatgt gcaccacttg ttaattaata gtattattta tttttgtatc 
6900
aatttagcca tcaa
6950