fioreDB : Database for Flower Bio-engineering by CRES-T system
fioreDB : Database for Flower Bio-engineering by CRES-T system

Locus Common name Short description
AT5G41315 MYC6.2, GL3 GLABROUS 3, GLABRA 3, basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein (.1)

>AT5G41315.1 genomic map

>>Show CDS map




Uncut enzymes: ApaI, AscI, BamHI, NcoI, NheI, NotI, SacI, SalI, SmaI
Name Recognition sequence Cut positions
BglII A|GATCT 3131, 3310, 4681
EcoRI G|AATTC 1431, 2203, 8183
EcoRV GAT|ATC 3593, 4499
HindIII A|AGCTT 4524, 5278, 6496, 7741
HpaI GTT|AAC 7037, 7304
KpnI GGTAC|C 5577
NdeI CA|TATG 1710, 8349
PacI TTAAT|TAA 1348, 5183
PstI CTGCA|G 4910
PvuII CAG|CTG 8913
SpeI A|CTAGT 4249, 4848
StyI C|C[AT][AT]GG 4858, 5555
XbaI T|CTAGA 650, 2469, 3315
XhoI C|TCGAG 2726, 6878


Click here to view TAIR data

>AT5G41315 genomic sequence (4002-4123,4465-4746,5326-5422,5520-5591,5912-6745,6830-7264,7340-7411,) length:8924
ttacccttct catagaaaaa tgacaaatgg ttatttgtta gcttgagatt 
50
gtttatacct atattttctt tgtataaaaa gaaacatgtt tctgattttc 
100
cacacaaatg aagaattagt taaatgattt attttttaaa aataaaagat 
150
gatttattat ttacctagac aaagcagaat acaacgggtg taattaatac 
200
atttaatttg tatatcatta attataaaaa tatgattagc atatagttta 
250
ttttacatgt ttaagttatt acaccataca aagaaaatag atttttgtat 
300
taatttatag agttaaaaag tgattttttc ttagcaatca ttcaattaat 
350
aagaacgttt aaattcttca attaacagct actttgtttg ctttttgaaa 
400
tattgaattg ttttgttcgc aatcaaaatc acttttaacc attattcaca 
450
aggttttatc tgcaataata taattaataa aaaaataata ttacagttgc 
500
aaattgttat tttcttaaaa tggagctgat cattttttcc tagttgttat 
550
atgctacaaa ttgttattgt atagtaaaat atctataaat taatattaga 
600
actaaaaagt ttctatttaa aaattagatt ttttagttag taacattctt 
650
ctagaactaa ttacaaataa gaagacaata ccaaaacttt tcgatgcagt 
700
aaaaatatta ggaacaaact ctaacaaaaa tcaatgcaga ttcaaaaaat 
750
gaaataaata tatatatata tatatatata tatatcatat tccactaaat 
800
tttcttgtat gtaatatata tatatatata tatatgataa atttatataa 
850
gtattaattt atcaaaataa tggaattata tgtctatata taactaaact 
900
aaaataatat attaatgttt tatcgaatta attgcatcaa ttttgtacac 
950
taatctaatt taagactata aatatttata gtaattatta atttatcgaa 
1000
tattaattta taaaatattt tgtttttaaa aatattattt tattgattgc 
1050
taagagaaaa gaaaaatata gagattgagg aaacttaaac gaagattgta 
1100
caaatttata gtgtagtatt taaataactt cacaatggta gatacaaata 
1150
ggtagctaaa ttttacttta atattagtag agtctaagta aaataatgct 
1200
ataaaaagca ggataaaaca aaagaggata cgggcttaat gatataatta 
1250
aataaacgag gtctaatgtt cattatgatt ctcatggaga cgcaacaagt 
1300
aataacgaca attttgggaa atgacaaaat tatatagttg atggcttaat 
1350
taacgtcgcc agtgacaata ttgactcttg gtctcttctt tattaattgt 
1400
ttcattaagc caaattaagt ataatttttt gaattcccat ccaaattcat 
1450
gtgattctct acctcctaag atccaccatg atctttgaat caaatcataa 
1500
acaagaagca aatcaaaagc ccattattta catagtttga cttccattga 
1550
cttagatgaa ctatcttacc tttttctgaa ccttgagaat tgagatacat 
1600
ataagatgat gataatatgc cttatgaggt ggaaagtgga accacttatg 
1650
tttcattgtt aaaccaatat agtatatcca aattaaaata ttattttctc 
1700
agctatatcc atatgtcatt tagtatatgg gaaaacatac agttttttaa 
1750
catagaagag aggatacaaa ccagttaata gcaaaatagt gtcatgcttc 
1800
cattgtccta tacatagcat tgaatctctc acatcttctc gtacatgccc 
1850
aaaagtttat gattttaatg gccgtgttta caacattatt tcttctgtgc 
1900
cgtctatgtc aagaaaataa caacatagta tataccctat atatatatat 
1950
atattacttc tttttttaat tagttccgtt tatatatatg aaagaggtct 
2000
tacagaggag ccttaatgct cagatacaat caaataagat aaacatatag 
2050
agacgagtgt tctagtaaga tcagtaaaga tgtggtctaa ttttgttgga 
2100
aattagcaaa ccatagcgaa agataggagt caggagatgg agttgttgaa 
2150
gtgaagatga cgtcttgatc caaaccagca aggcttcatc ggattaggag 
2200
ttgaattccc catttaactt gagttagtat tctgattgaa aataacaata 
2250
tatattagtg ttacataagt ttggatcaga caaattttat attgttgtat 
2300
cgaaagctat accaaatttc ctaaatatta ccctcaaaca tcaacacatc 
2350
cgattaattt accgaaacct ccgatcaaca gcactacgaa tgtttagact 
2400
ttgatcttgt aggggaccga acgtgtatat atattttaat gttttctgac 
2450
gtcaacgtct ctctcttttc tagatgtcag aaaaggaaaa taataagtac 
2500
taatggtcca tttagcaggg ttttatttaa agttatattt taaatagttg 
2550
cataaatact tcgaaaatat aggtttaata gtataagaga attttgaaat 
2600
ataataatat tgtaagtata tgactatagg gagaatcaac gtcgaaaatg 
2650
tccataacat ttttattcat tttaaagatg tgattgcaaa aattaagatt 
2700
gtgtctgtac gtattggggg aactcctcga ggccaaacat taatttcgtg 
2750
tctttctttg tgtttcccaa ttttagtaaa gactgttctt atattatctc 
2800
tttcctcctc aatttatcta ttattgtgtt tgtgactata atttagattc 
2850
atagcgatta gcttcgtttt gacaccaagt aaaaagctga tgattttact 
2900
attattatat atgttaatca tatactctga tttgagacat tatacttttg 
2950
gtcgttttgt gtacttttgg aaaattcata aaacgatgtt actcaccgac 
3000
aataatatat ttcgatcact caaatagtaa taagactgat tagattatac 
3050
aaaatgaaag aaatcatacg atgctggtta gattggactt ggatcacatg 
3100
ctaatggtat tctagtcaac attgcttcaa agatctaata gtcaaggaaa 
3150
caaatttttt ttttttggta tcagtgggga tattaagtga gggaaacatt 
3200
ttttttcaag aatagatggg tgaaaagttc agccttgacg tgataacatt 
3250
ttaactttaa aatcagtgtt ggaagagaca cacaatgatt caatattccc 
3300
aaaaaaaaga gatctctaga accacaaaga gactgaatag agaatttatt 
3350
gaagacaaga ccacaacaat ggacattgta gttcattgtc ttaaaaaaag 
3400
gttgttcttc ccaaatgagg aactaatcaa tcaacttcaa gataaaaaga 
3450
ggaacaatca atcaacatca gcgttttgct tttttcctct acttttgtat 
3500
cctttttttt tctcataaat cattaaaaaa ttataagtac tttttatttt 
3550
cgtcataaat gtcttgtgtt ttgttctgta cacaacaaag atgatatcgt 
3600
catattcaaa gaaaaaaagg attcgtagac agttcttcta gtctttcgag 
3650
ttcaagctca aacaacaaca aaattaatat tcaaaacaac attaataaaa 
3700
aaaaagtatg gagtgaccaa agaaaaaaaa aactctcaaa catttctctg 
3750
tttgttccgg cgaaaacggc aactgtttca tcaaatgaca aacacaaaaa 
3800
ccttaacatc tagtttgtat cctctctgat acttcaaaaa aaatgtaaag 
3850
agttacaagt ttcccttttt ctttcttttt taggctataa atttaacata 
3900
gtatcttatt tctttctaaa tcaggacaaa aagtttgatt tttttctttt 
3950
cttttctttt tccctgtgtg tggtttcatg ggatataggg atgaagaaac 
4000
aATGGCTACC GGACAAAACA GAACAACTGT GCCAGAGAAT CTGAAGAAAC 
4050
ACCTCGCAGT TTCAGTTCGA AACATTCAAT GGAGTTATGG TATCTTTTGG 
4100
TCTGTCTCTG CTTCTCAGTC TGGgtaagtt tcttaaatca tattcattga 
4150
acactagata ttggagattt tgaaagatat tgatgaagta aatttcttga 
4200
ttttaattgg aaaattagat aaaacttatg tgttcacttc aaatcaaaac 
4250
tagtgtttag ttctacaact caagacaagg ttctctaggt ttttcttgat 
4300
tccattgatt ttttcttata aactcatata aggtttcttg atcttcttta 
4350
aaagttcaat tttttttctc ttcttcttga agttcttgat tagttcaaga 
4400
aaatgttttg tttgttttct ttattcgatt tgatatttgt ttttgttttt 
4450
ctatatataa aaagAGTTTT AGAATGGGGA GATGGATACT ATAATGGAGA 
4500
TATCAAAACG AGGAAGACGA TTCAAGCTTC GGAGATCAAA GCTGATCAGC 
4550
TTGGTCTACG GAGGAGCGAG CAGCTTAGCG AGCTTTACGA GTCTCTCTCC 
4600
GTCGCTGAAT CTTCTTCTTC AGGCGTTGCT GCCGGATCTC AAGTCACCAG 
4650
ACGAGCTTCC GCCGCCGCAC TTTCACCGGA AGATCTCGCC GACACCGAGT 
4700
GGTACTATTT GGTTTGTATG TCTTTCGTCT TCAACATTGG TGAAGGgtaa 
4750
ttccgtcttt tcctctatca gcattgacat ttattatgtg tcatgatcgt 
4800
gttgatcttt gccagtttta aacaacgtgc caaaatatac ttttaatact 
4850
agtaggtcca aggatttcga cttttatggt tcagtttagg tttgttagat 
4900
ttcagggttc tgcaggaaaa aagtatgagc tagaaccaat tttttagttt 
4950
cagtttggtt tcaaaattta atgtccggat ttggtcggtt tcagattaca 
5000
aaagaaaaag ttaaaacata attaatttta aataataatg tgtatatata 
5050
tgcattagta tgtttaactc tattctacat ctaataaatt ttattaattc 
5100
ggtttggttg cagtatattt gtgttcgatt cgagtttagt tcggtttatt 
5150
tatcatcaca aaagtttgtt tctgtccgga ttaattaaaa aattcgtttc 
5200
attttggtct ttatgaacac ggctaattaa ctttcaataa ttatgaatat 
5250
gttaggaaga aaaaatgtgg aaaaattaag cttagaatgc attgctgctt 
5300
tctaaatgaa cctgtctttt tgcagAATGC CTGGACGGAC GTTTGCAAAC 
5350
GGTGAACCGA TATGGTTGTG CAACGCTCAT ACGGCGGATA GTAAAGTGTT 
5400
TAGCCGTTCT CTTCTAGCAA AAgtaagttg tagtattgat gtagttgcta 
5450
tgtaacactt ttttgcgatt tgaaaacact aaaatcgttc gtttttgttt 
5500
gcgttttgtg gtggtttagA GTGCTGCGGT TAAGACAGTG GTTTGCTTCC 
5550
CGTTCCTTGG AGGAGTCGTT GAGATTGGTA CCACAGAACA Tgtaagccaa 
5600
tatttgtgtt ttctgcttcc aatgttttag aataattatt atgaaaatcc 
5650
tttattaaga aaaaaagaat aattataaaa ttaccacaat gtattctaac 
5700
atttcaattt gacccttcaa tctgtcgaat aacggtatag acaccaagaa 
5750
cacacaaact aatattttag tagtctcgat ttttaaagat ttccacggtt 
5800
tggttatgac aaaacgcgaa aatacggctt ttgtactttt tactagctcg 
5850
ttggtatagt tataattgaa aactttttca aggctttttc ttggtgtgtt 
5900
tcgtctcgta gATTACGGAA GACATGAATG TAATACAATG CGTGAAGACA 
5950
TCATTCCTCG AAGCCCCTGA TCCGTACGCT ACAATATTAC CAGCAAGATC 
6000
CGATTATCAC ATCGACAACG TTCTTGATCC GCAACAGATT CTAGGCGACG 
6050
AGATTTACGC GCCTATGTTC AGTACGGAGC CTTTTCCAAC AGCTTCTCCG 
6100
AGCAGAACTA CCAACGGTTT CGATCAAGAA CATGAACAAG TAGCAGATGA 
6150
TCATGATTCT TTCATGACCG AAAGAATCAC TGGAGGAGCT TCTCAGGTGC 
6200
AAAGCTGGCA GCTCATGGAC GACGAGCTTA GTAACTGCGT TCACCAGTCG 
6250
CTAAATTCCA GCGATTGCGT CTCTCAAACG TTTGTTGAAG GGGCGGCTGG 
6300
ACGGGTTGCT TACGGTGCAA GAAAGAGTAG AGTTCAAAGA CTAGGGCAAA 
6350
TTCAAGAGCA ACAGAGAAAT GTGAAGACAT TGTCATTTGA TCCAAGAAAC 
6400
GACGACGTTC ATTACCAAAG TGTGATCTCA ACGATTTTTA AGACCAACCA 
6450
TCAGTTAATT CTCGGACCGC AGTTTCGAAA CTGCGATAAA CAGTCAAGCT 
6500
TCACTAGGTG GAAGAAATCA TCGTCATCAT CATCAGGAAC CGCCACGGTC 
6550
ACGGCACCAT CACAAGGAAT GTTAAAGAAA ATTATTTTCG ATGTTCCGCG 
6600
AGTGCACCAG AAAGAGAAGT TAATGTTGGA CTCACCAGAA GCCAGAGATG 
6650
AAACTGGGAA CCATGCGGTT TTAGAGAAGA AGCGCCGCGA GAAATTGAAC 
6700
GAACGGTTCA TGACCTTGAG AAAAATCATT CCGTCAATCA ACAAGgtata 
6750
tttatataat cgattcttca aaatttcaaa tccatatata tcgcgaggta 
6800
actaatctta tgtttaacat tttcgatagA TCGATAAAGT ATCGATTCTT 
6850
GACGATACGA TAGAGTATCT TCAAGAACTC GAGAGACGGG TTCAAGAACT 
6900
AGAATCTTGC AGAGAATCAA CCGATACAGA GACTCGTGGG ACGATGACGA 
6950
TGAAGAGGAA GAAACCATGC GACGCAGGAG AAAGAACATC AGCTAATTGC 
7000
GCAAATAATG AAACAGGAAA TGGGAAGAAG GTGTCGGTTA ACAATGTTGG 
7050
TGAAGCCGAG CCAGCAGATA CCGGTTTTAC TGGTTTAACC GATAATTTAA 
7100
GGATCGGTTC GTTTGGTAAT GAGGTGGTTA TTGAGCTTAG ATGTGCTTGG 
7150
AGAGAAGGAG TATTGCTTGA GATAATGGAT GTGATTAGTG ATCTCCATTT 
7200
GGATTCTCAT TCGGTTCAAT CCTCGACCGG AGACGGTTTG CTCTGCTTAA 
7250
CCGTCAATTG CAAGgtatac tctctaacct acttttggct taaccaggat 
7300
ttggttaacc tagattgaca tgaaatgtgt tggtttcagC ACAAGGGGTC 
7350
AAAAATAGCG ACACCAGGAA TGATCAAAGA AGCACTTCAA AGGGTTGCAT 
7400
GGATCTGTTG Aagactactt agttaaaatt gacagcaaag aaaaaacatt 
7450
cccggtttgg tttctattct ttggttttct tctaaccggg ttttaggaat 
7500
taatgttatg tttatcattt gttttttgtt ttttttttgt gtcttttttt 
7550
ccgttgctta acgtaggtga agaggaacat acactatgcg tattttgttt 
7600
gaggtagatt attttaaggg tattagtaat agtaatagcc agtttagatg 
7650
attttgtgtt cttttgttgt ttaagcacaa ggttgatgtg aaattacggg 
7700
gaaaaaaaca ttaatgtgta aatgaaaatt agtggtcaaa aagcttcaca 
7750
cgaaacggga gaagattctg cattttggca ttttcatgga taacaaagag 
7800
gtaaagttta tgataagaaa tccagattaa tttccttaac tgggtcataa 
7850
atgatttcat tgaaataaca tagtgaaaat caacaaaaat aaatgctgta 
7900
atatcttatt tttacaaatt tagaggtgtt gaccaaatta ctttctaatt 
7950
tgctttatgt aattttacct atctagtcat gtcttattat gttttactta 
8000
ccaactcatg ttattctttt cgtttaatat caaggatatt tcaaacccaa 
8050
actgaaaata atcttcatat attaatggaa aaccagagta ctcttatctt 
8100
atcatttaaa atctttgtgt tgacaaaaaa atcttaaaca atagtataaa 
8150
aacatgaatc ttattccttt aaattctaag gtgaattcta atttactttc 
8200
taatttgtgt aaaaatataa aatatagaaa aatgggtaaa cttgattatc 
8250
aagaaaaaga tccaaattgg aaagctaaaa tattgttatt tagaaggtag 
8300
aaccaaaatt aatgactaaa aatatttttc tttgaataaa atatacctca 
8350
tatggaaaat attttttcag acaaaaacat aactcctttc ctttttaaca 
8400
gcaaaaccga aaacataaat tcaaagatac atgtcgattt tacacacaaa 
8450
gtgtgcgatc agacaagact caagggagag atcgagaatg gtgaagatgg 
8500
cctgaaaatt cttctctccg gtaagaactt gcatttacat gtttttatat 
8550
atatctcgga tatttttctt aactatgtgt gtacttctta gttctcgaaa 
8600
atgtagttta caatagtttc tcttttgaat taagtcgaga taatcgcaat 
8650
actactcggg ttttactaga tgcattctct atttacctgt gttacagaga 
8700
tgaatcctta atcttgtatt tatggatatg ctttaaacag ttttccaatt 
8750
aatattggtt tatatttgtt atctcctcgc ctaatattcc attgtttaga 
8800
agaacactcc catcttttta caaagttgat gatgtgctga tccgtaatcc 
8850
atttcgatct acaacagact tgtgttgttt atagttatcc atgttgtgtt 
8900
tttttattct tgcagctgta tgaa
8950